MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 51524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
40001	NC_009482	CAG	2	6	1726939	1726944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243088
40002	NC_009482	CCA	2	6	1726993	1726998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243088
40003	NC_009482	TGCGC	2	10	1727065	1727074	0 %	20 %	40 %	40 %	148243089
40004	NC_009482	GAT	2	6	1727090	1727095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243089
40005	NC_009482	CAGA	2	8	1727117	1727124	50 %	0 %	25 %	25 %	148243089
40006	NC_009482	GCT	3	9	1727158	1727166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243089
40007	NC_009482	TTG	2	6	1727185	1727190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40008	NC_009482	TGAT	2	8	1727196	1727203	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40009	NC_009482	CCAG	2	8	1727235	1727242	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40010	NC_009482	CAA	2	6	1727251	1727256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40011	NC_009482	A	6	6	1727255	1727260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40012	NC_009482	CCG	2	6	1727265	1727270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40013	NC_009482	TGG	2	6	1727283	1727288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40014	NC_009482	CGC	2	6	1727324	1727329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40015	NC_009482	CAG	2	6	1727360	1727365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40016	NC_009482	CTG	2	6	1727382	1727387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40017	NC_009482	AGTC	2	8	1727423	1727430	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40018	NC_009482	AC	4	8	1727503	1727510	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40019	NC_009482	ACG	2	6	1727599	1727604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243090
40020	NC_009482	CCT	2	6	1727636	1727641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243090
40021	NC_009482	AGCCAA	2	12	1727748	1727759	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	148243090
40022	NC_009482	TGC	2	6	1727767	1727772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243090
40023	NC_009482	CGCC	2	8	1727783	1727790	0 %	0 %	25 %	75 %	148243090
40024	NC_009482	GCG	2	6	1727800	1727805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243090
40025	NC_009482	CTGG	2	8	1727884	1727891	0 %	25 %	50 %	25 %	148243090
40026	NC_009482	AAC	2	6	1727954	1727959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243090
40027	NC_009482	CTG	2	6	1727961	1727966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243090
40028	NC_009482	ACCCAA	2	12	1727984	1727995	50 %	0 %	0 %	50 %	148243090
40029	NC_009482	T	6	6	1728006	1728011	0 %	100 %	0 %	0 %	148243090
40030	NC_009482	CGC	2	6	1728020	1728025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243090
40031	NC_009482	CAA	2	6	1728027	1728032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243090
40032	NC_009482	GCG	2	6	1728061	1728066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243090
40033	NC_009482	A	6	6	1728089	1728094	100 %	0 %	0 %	0 %	148243090
40034	NC_009482	GCT	2	6	1728184	1728189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40035	NC_009482	ATC	2	6	1728196	1728201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40036	NC_009482	GGCTG	2	10	1728204	1728213	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
40037	NC_009482	GA	3	6	1728249	1728254	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40038	NC_009482	CCA	2	6	1728276	1728281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40039	NC_009482	CAG	2	6	1728417	1728422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243091
40040	NC_009482	AGC	2	6	1728478	1728483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243091
40041	NC_009482	GTCA	2	8	1728695	1728702	25 %	25 %	25 %	25 %	148243091
40042	NC_009482	CT	3	6	1728779	1728784	0 %	50 %	0 %	50 %	148243091
40043	NC_009482	ATT	2	6	1728848	1728853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148243091
40044	NC_009482	TGA	2	6	1728893	1728898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243091
40045	NC_009482	TCAG	2	8	1728908	1728915	25 %	25 %	25 %	25 %	148243091
40046	NC_009482	TTG	2	6	1728922	1728927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148243091
40047	NC_009482	GAA	2	6	1728951	1728956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243091
40048	NC_009482	TGA	2	6	1729049	1729054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243091
40049	NC_009482	CCT	2	6	1729068	1729073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243091
40050	NC_009482	TTG	2	6	1729087	1729092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148243091
40051	NC_009482	AGA	2	6	1729119	1729124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243091
40052	NC_009482	CTG	2	6	1729143	1729148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243091
40053	NC_009482	GAGG	2	8	1729176	1729183	25 %	0 %	75 %	0 %	148243091
40054	NC_009482	TCAA	2	8	1729186	1729193	50 %	25 %	0 %	25 %	148243091
40055	NC_009482	AAC	2	6	1729278	1729283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243091
40056	NC_009482	ATTT	2	8	1729287	1729294	25 %	75 %	0 %	0 %	148243091
40057	NC_009482	CTT	2	6	1729308	1729313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243091
40058	NC_009482	TTG	2	6	1729329	1729334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148243091
40059	NC_009482	ACA	2	6	1729414	1729419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243092
40060	NC_009482	TGT	2	6	1729428	1729433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148243092
40061	NC_009482	TTG	2	6	1729463	1729468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148243092
40062	NC_009482	CTC	2	6	1729477	1729482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243092
40063	NC_009482	CTT	2	6	1729483	1729488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243092
40064	NC_009482	CCT	2	6	1729553	1729558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243092
40065	NC_009482	ATC	2	6	1729571	1729576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243092
40066	NC_009482	CAC	2	6	1729648	1729653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243092
40067	NC_009482	ATT	2	6	1729682	1729687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148243092
40068	NC_009482	CAT	2	6	1729848	1729853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243092
40069	NC_009482	CT	3	6	1729856	1729861	0 %	50 %	0 %	50 %	148243092
40070	NC_009482	CTATTT	2	12	1729879	1729890	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	148243092
40071	NC_009482	CAAATC	2	12	1729911	1729922	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	148243092
40072	NC_009482	CTG	2	6	1730050	1730055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243092
40073	NC_009482	GCA	2	6	1730058	1730063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243092
40074	NC_009482	AACT	2	8	1730098	1730105	50 %	25 %	0 %	25 %	148243092
40075	NC_009482	A	6	6	1730150	1730155	100 %	0 %	0 %	0 %	148243093
40076	NC_009482	CAA	2	6	1730184	1730189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243093
40077	NC_009482	TCA	2	6	1730207	1730212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243093
40078	NC_009482	TC	3	6	1730339	1730344	0 %	50 %	0 %	50 %	148243093
40079	NC_009482	AATT	2	8	1730366	1730373	50 %	50 %	0 %	0 %	148243093
40080	NC_009482	T	8	8	1730454	1730461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40081	NC_009482	A	6	6	1730531	1730536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40082	NC_009482	TGAT	2	8	1730565	1730572	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40083	NC_009482	GCA	2	6	1730575	1730580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40084	NC_009482	TCG	2	6	1730596	1730601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243094
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40086	NC_009482	TGT	2	6	1730666	1730671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148243094
40087	NC_009482	ATAA	2	8	1730674	1730681	75 %	25 %	0 %	0 %	148243094
40088	NC_009482	CCGCCA	2	12	1730699	1730710	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	148243094
40089	NC_009482	CTC	2	6	1730736	1730741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243094
40090	NC_009482	GCA	2	6	1730762	1730767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243094
40091	NC_009482	CAT	2	6	1730776	1730781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40092	NC_009482	A	8	8	1730806	1730813	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40093	NC_009482	AAT	2	6	1730845	1730850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40094	NC_009482	TGA	2	6	1730910	1730915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40095	NC_009482	GTG	2	6	1730956	1730961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243095
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40099	NC_009482	GC	3	6	1731405	1731410	0 %	0 %	50 %	50 %	148243096
40100	NC_009482	AAG	2	6	1731462	1731467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40101	NC_009482	GTT	2	6	1731471	1731476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40102	NC_009482	CAGC	2	8	1731487	1731494	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40103	NC_009482	ACC	2	6	1731531	1731536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243097
40104	NC_009482	GCT	2	6	1731566	1731571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243097
40105	NC_009482	TCA	2	6	1731616	1731621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243097
40106	NC_009482	GCA	2	6	1731629	1731634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243097
40107	NC_009482	GCA	2	6	1731653	1731658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243097
40108	NC_009482	CGG	2	6	1731683	1731688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243097
40109	NC_009482	TGCC	2	8	1731693	1731700	0 %	25 %	25 %	50 %	148243097
40110	NC_009482	TGCCA	2	10	1731729	1731738	20 %	20 %	20 %	40 %	148243097
40111	NC_009482	TGC	2	6	1731850	1731855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243097
40112	NC_009482	GCA	2	6	1731869	1731874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243097
40113	NC_009482	TGC	2	6	1731898	1731903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243097
40114	NC_009482	CCGCT	2	10	1731998	1732007	0 %	20 %	20 %	60 %	148243097
40115	NC_009482	TGC	2	6	1732018	1732023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243097
40116	NC_009482	CGT	2	6	1732039	1732044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243097
40117	NC_009482	CAC	2	6	1732086	1732091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243098
40118	NC_009482	A	6	6	1732184	1732189	100 %	0 %	0 %	0 %	148243098
40119	NC_009482	AGC	2	6	1732201	1732206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243098
40120	NC_009482	TGG	2	6	1732282	1732287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243099
40121	NC_009482	TGCAA	2	10	1732359	1732368	40 %	20 %	20 %	20 %	148243099
40122	NC_009482	AGGC	2	8	1732451	1732458	25 %	0 %	50 %	25 %	148243099
40123	NC_009482	TTC	2	6	1732459	1732464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243099
40124	NC_009482	TTCA	2	8	1732534	1732541	25 %	50 %	0 %	25 %	148243099
40125	NC_009482	ACCC	2	8	1732654	1732661	25 %	0 %	0 %	75 %	148243099
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40128	NC_009482	CTG	2	6	1732741	1732746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243099
40129	NC_009482	GGC	2	6	1732753	1732758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243099
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40132	NC_009482	CCA	2	6	1732853	1732858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243099
40133	NC_009482	G	6	6	1732912	1732917	0 %	0 %	100 %	0 %	148243099
40134	NC_009482	CG	3	6	1732938	1732943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40135	NC_009482	CTTGGG	2	12	1733048	1733059	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148243100
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40142	NC_009482	GGCA	2	8	1733342	1733349	25 %	0 %	50 %	25 %	148243100
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40223	NC_009482	GCTTGG	2	12	1736671	1736682	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148243102
40224	NC_009482	CTGAT	2	10	1736857	1736866	20 %	40 %	20 %	20 %	148243102
40225	NC_009482	AAC	2	6	1736874	1736879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243103
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40227	NC_009482	TGC	2	6	1736903	1736908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243103
40228	NC_009482	TCAA	2	8	1736912	1736919	50 %	25 %	0 %	25 %	148243103
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40230	NC_009482	ATC	2	6	1737001	1737006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243103
40231	NC_009482	CA	3	6	1737019	1737024	50 %	0 %	0 %	50 %	148243103
40232	NC_009482	AGC	2	6	1737031	1737036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243103
40233	NC_009482	GTT	2	6	1737065	1737070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148243103
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40235	NC_009482	TCA	2	6	1737219	1737224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243103
40236	NC_009482	TGC	2	6	1737229	1737234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243103
40237	NC_009482	TCA	2	6	1737311	1737316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243103
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40255	NC_009482	CAT	2	6	1738419	1738424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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40300	NC_009482	ATTT	2	8	1741235	1741242	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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40310	NC_009482	ACC	2	6	1741897	1741902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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40346	NC_009482	AGCG	2	8	1743363	1743370	25 %	0 %	50 %	25 %	148243109
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40355	NC_009482	CAG	2	6	1743759	1743764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243109
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40463	NC_009482	GTA	2	6	1748543	1748548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243114
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40468	NC_009482	GCA	2	6	1748784	1748789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243115
40469	NC_009482	CTC	2	6	1748839	1748844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243115
40470	NC_009482	GCT	2	6	1748854	1748859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243115
40471	NC_009482	CGT	2	6	1748886	1748891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243115
40472	NC_009482	AGC	2	6	1748942	1748947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243115
40473	NC_009482	GAC	2	6	1748952	1748957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243115
40474	NC_009482	GGC	2	6	1748965	1748970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243115
40475	NC_009482	TGC	2	6	1748983	1748988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243115
40476	NC_009482	GGC	2	6	1749063	1749068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243115
40477	NC_009482	GCC	2	6	1749157	1749162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243115
40478	NC_009482	CAA	2	6	1749172	1749177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243115
40479	NC_009482	GGCG	2	8	1749189	1749196	0 %	0 %	75 %	25 %	148243115
40480	NC_009482	GCT	2	6	1749243	1749248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243115
40481	NC_009482	CTGC	2	8	1749260	1749267	0 %	25 %	25 %	50 %	148243115
40482	NC_009482	TCA	2	6	1749284	1749289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243115
40483	NC_009482	CCA	2	6	1749309	1749314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243115
40484	NC_009482	GCAA	2	8	1749351	1749358	50 %	0 %	25 %	25 %	148243115
40485	NC_009482	TGC	2	6	1749372	1749377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243115
40486	NC_009482	CCAACT	2	12	1749390	1749401	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	148243115
40487	NC_009482	CAG	2	6	1749439	1749444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243115
40488	NC_009482	CG	3	6	1749445	1749450	0 %	0 %	50 %	50 %	148243115
40489	NC_009482	CAG	2	6	1749495	1749500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243115
40490	NC_009482	CGC	2	6	1749579	1749584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243115
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40492	NC_009482	GCA	2	6	1749692	1749697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243115
40493	NC_009482	GGC	2	6	1749700	1749705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243115
40494	NC_009482	GCG	2	6	1749747	1749752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243115
40495	NC_009482	TCC	2	6	1749773	1749778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243115
40496	NC_009482	G	6	6	1749787	1749792	0 %	0 %	100 %	0 %	148243115
40497	NC_009482	GCA	2	6	1749809	1749814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243115
40498	NC_009482	GCT	2	6	1749868	1749873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243115
40499	NC_009482	ACC	2	6	1749966	1749971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243116
40500	NC_009482	CAA	2	6	1750053	1750058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243116

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