MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 51524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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38502	NC_009482	CAG	3	9	1659803	1659811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243011
38503	NC_009482	GCT	2	6	1659931	1659936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243012
38504	NC_009482	TGA	2	6	1659960	1659965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243012
38505	NC_009482	AAG	2	6	1659972	1659977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243012
38506	NC_009482	TGA	2	6	1659979	1659984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243012
38507	NC_009482	CTG	2	6	1660078	1660083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243012
38508	NC_009482	ACCA	2	8	1660184	1660191	50 %	0 %	0 %	50 %	148243012
38509	NC_009482	CAG	2	6	1660231	1660236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243012
38510	NC_009482	GCC	2	6	1660362	1660367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243013
38511	NC_009482	GAG	2	6	1660473	1660478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243013
38512	NC_009482	CAGCC	2	10	1660479	1660488	20 %	0 %	20 %	60 %	148243013
38513	NC_009482	GTT	2	6	1660538	1660543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148243013
38514	NC_009482	A	6	6	1660727	1660732	100 %	0 %	0 %	0 %	148243014
38515	NC_009482	AAGC	2	8	1660739	1660746	50 %	0 %	25 %	25 %	148243014
38516	NC_009482	CAAT	2	8	1660760	1660767	50 %	25 %	0 %	25 %	148243014
38517	NC_009482	ATG	2	6	1660826	1660831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243014
38518	NC_009482	CAGT	2	8	1660901	1660908	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38519	NC_009482	GGC	2	6	1660913	1660918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38520	NC_009482	TCG	2	6	1660924	1660929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38521	NC_009482	ACC	2	6	1660962	1660967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38522	NC_009482	CTTC	2	8	1660969	1660976	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38523	NC_009482	CAG	2	6	1661004	1661009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38524	NC_009482	CTAT	2	8	1661051	1661058	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38525	NC_009482	CAA	2	6	1661059	1661064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38526	NC_009482	CGA	2	6	1661066	1661071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38527	NC_009482	CAGGT	2	10	1661133	1661142	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
38528	NC_009482	GCA	2	6	1661149	1661154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38529	NC_009482	GGT	2	6	1661236	1661241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243015
38530	NC_009482	CAG	2	6	1661302	1661307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243015
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38532	NC_009482	GCG	2	6	1661364	1661369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243015
38533	NC_009482	CGG	2	6	1661486	1661491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243016
38534	NC_009482	CA	4	8	1661505	1661512	50 %	0 %	0 %	50 %	148243016
38535	NC_009482	CA	3	6	1661560	1661565	50 %	0 %	0 %	50 %	148243016
38536	NC_009482	GCA	3	9	1661590	1661598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243016
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38551	NC_009482	CGA	2	6	1662514	1662519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243018
38552	NC_009482	TGA	2	6	1662625	1662630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243018
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38555	NC_009482	ATGG	2	8	1662761	1662768	25 %	25 %	50 %	0 %	148243018
38556	NC_009482	TTCC	2	8	1662805	1662812	0 %	50 %	0 %	50 %	148243018
38557	NC_009482	TGC	2	6	1662865	1662870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243018
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38565	NC_009482	CGC	2	6	1663176	1663181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38566	NC_009482	CTG	2	6	1663192	1663197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243019
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38613	NC_009482	TAGC	2	8	1665486	1665493	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38614	NC_009482	T	6	6	1665561	1665566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38615	NC_009482	G	6	6	1665613	1665618	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
38616	NC_009482	CTGG	2	8	1665671	1665678	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38617	NC_009482	AACT	2	8	1665773	1665780	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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38619	NC_009482	ACC	2	6	1665846	1665851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243022
38620	NC_009482	CTTC	2	8	1665853	1665860	0 %	50 %	0 %	50 %	148243022
38621	NC_009482	GCG	2	6	1665890	1665895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243022
38622	NC_009482	TGC	2	6	1665901	1665906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243022
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38627	NC_009482	CTG	2	6	1666106	1666111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243022
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38678	NC_009482	CCA	2	6	1668037	1668042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243022
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38721	NC_009482	GCC	2	6	1669552	1669557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243023
38722	NC_009482	AGG	2	6	1669565	1669570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243023
38723	NC_009482	CTG	2	6	1669573	1669578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243023
38724	NC_009482	CCGC	2	8	1669590	1669597	0 %	0 %	25 %	75 %	148243023
38725	NC_009482	TGC	2	6	1669622	1669627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243023
38726	NC_009482	TTC	2	6	1669747	1669752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243024
38727	NC_009482	GC	3	6	1669909	1669914	0 %	0 %	50 %	50 %	148243024
38728	NC_009482	CTG	2	6	1669916	1669921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243024
38729	NC_009482	CTG	2	6	1669958	1669963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243024
38730	NC_009482	AAGCCG	2	12	1669968	1669979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243024
38731	NC_009482	CGG	2	6	1670013	1670018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243024
38732	NC_009482	GGC	2	6	1670028	1670033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243024
38733	NC_009482	GCA	2	6	1670038	1670043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243024
38734	NC_009482	GCT	2	6	1670220	1670225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243024
38735	NC_009482	AGCA	2	8	1670253	1670260	50 %	0 %	25 %	25 %	148243024
38736	NC_009482	CAT	2	6	1670293	1670298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243024
38737	NC_009482	TGG	2	6	1670349	1670354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243024
38738	NC_009482	GGT	2	6	1670404	1670409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243024
38739	NC_009482	GGCT	2	8	1670411	1670418	0 %	25 %	50 %	25 %	148243024
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38742	NC_009482	GTG	2	6	1670545	1670550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243025
38743	NC_009482	CTG	2	6	1670617	1670622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243025
38744	NC_009482	CTG	2	6	1670641	1670646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243025
38745	NC_009482	GCC	2	6	1670653	1670658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243025
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38747	NC_009482	GCC	2	6	1670703	1670708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243025
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38752	NC_009482	GCT	2	6	1670799	1670804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243025
38753	NC_009482	TGG	2	6	1670808	1670813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243025
38754	NC_009482	CTGG	2	8	1670814	1670821	0 %	25 %	50 %	25 %	148243025
38755	NC_009482	GCC	2	6	1670866	1670871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243025
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38760	NC_009482	GCA	2	6	1670961	1670966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243025
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38762	NC_009482	GCAGGA	2	12	1671102	1671113	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	148243025
38763	NC_009482	TGC	3	9	1671143	1671151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243025
38764	NC_009482	TGA	2	6	1671162	1671167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243025
38765	NC_009482	TGG	4	12	1671195	1671206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243026
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38769	NC_009482	GCA	2	6	1671350	1671355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243026
38770	NC_009482	AAC	2	6	1671357	1671362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243026
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38788	NC_009482	TGG	2	6	1671874	1671879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243027
38789	NC_009482	TTG	2	6	1671993	1671998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148243027
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38799	NC_009482	GTT	2	6	1672325	1672330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148243027
38800	NC_009482	ATG	2	6	1672335	1672340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243027
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38802	NC_009482	CAA	2	6	1672372	1672377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243027
38803	NC_009482	CAC	2	6	1672429	1672434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243027
38804	NC_009482	ATC	2	6	1672455	1672460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243027
38805	NC_009482	GAC	2	6	1672493	1672498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243027
38806	NC_009482	CCG	2	6	1672609	1672614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38807	NC_009482	GGA	2	6	1672638	1672643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243028
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38810	NC_009482	CG	3	6	1672822	1672827	0 %	0 %	50 %	50 %	148243028
38811	NC_009482	CAC	2	6	1672837	1672842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243028
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38821	NC_009482	G	7	7	1673413	1673419	0 %	0 %	100 %	0 %	148243029
38822	NC_009482	CCAT	2	8	1673500	1673507	25 %	25 %	0 %	50 %	148243029
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38828	NC_009482	CAAA	2	8	1674046	1674053	75 %	0 %	0 %	25 %	148243029
38829	NC_009482	GCC	2	6	1674091	1674096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243029
38830	NC_009482	TCC	2	6	1674141	1674146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38831	NC_009482	GGAT	2	8	1674228	1674235	25 %	25 %	50 %	0 %	148243030
38832	NC_009482	ATC	2	6	1674333	1674338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243030
38833	NC_009482	GCCGA	2	10	1674388	1674397	20 %	0 %	40 %	40 %	148243030
38834	NC_009482	TGC	2	6	1674463	1674468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243030
38835	NC_009482	CTC	2	6	1674471	1674476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243030
38836	NC_009482	TGG	2	6	1674491	1674496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243030
38837	NC_009482	TCA	2	6	1674656	1674661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243030
38838	NC_009482	T	6	6	1674752	1674757	0 %	100 %	0 %	0 %	148243030
38839	NC_009482	CCA	2	6	1674791	1674796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243030
38840	NC_009482	TGG	2	6	1674865	1674870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243030
38841	NC_009482	GCA	2	6	1674907	1674912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243030
38842	NC_009482	CCA	2	6	1674968	1674973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243030
38843	NC_009482	GCT	2	6	1675013	1675018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243030
38844	NC_009482	CCTG	2	8	1675216	1675223	0 %	25 %	25 %	50 %	148243030
38845	NC_009482	CCA	2	6	1675235	1675240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243030
38846	NC_009482	GCT	2	6	1675241	1675246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243030
38847	NC_009482	GGCG	2	8	1675293	1675300	0 %	0 %	75 %	25 %	148243030
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