MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 51524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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38002	NC_009482	GGC	2	6	1636166	1636171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242977
38003	NC_009482	CAG	2	6	1636178	1636183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242977
38004	NC_009482	AGA	2	6	1636198	1636203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148242977
38005	NC_009482	GAC	2	6	1636234	1636239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242977
38006	NC_009482	GCA	3	9	1636240	1636248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242977
38007	NC_009482	GTC	2	6	1636286	1636291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242977
38008	NC_009482	GGC	2	6	1636340	1636345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242977
38009	NC_009482	CGG	2	6	1636393	1636398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242977
38010	NC_009482	GGC	2	6	1636463	1636468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242977
38011	NC_009482	TGA	2	6	1636519	1636524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242977
38012	NC_009482	CGATCG	2	12	1636531	1636542	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148242977
38013	NC_009482	ATC	2	6	1636602	1636607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242977
38014	NC_009482	TGC	2	6	1636813	1636818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242977
38015	NC_009482	GTC	2	6	1636865	1636870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242977
38016	NC_009482	CACC	2	8	1636966	1636973	25 %	0 %	0 %	75 %	148242977
38017	NC_009482	TGC	2	6	1637028	1637033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242977
38018	NC_009482	TCG	2	6	1637052	1637057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242977
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38022	NC_009482	TGC	2	6	1637298	1637303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242978
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38025	NC_009482	AG	3	6	1637501	1637506	50 %	0 %	50 %	0 %	148242978
38026	NC_009482	CTGG	2	8	1637537	1637544	0 %	25 %	50 %	25 %	148242978
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38032	NC_009482	GGC	2	6	1637802	1637807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242979
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38034	NC_009482	GATCA	2	10	1637886	1637895	40 %	20 %	20 %	20 %	148242979
38035	NC_009482	GC	3	6	1637896	1637901	0 %	0 %	50 %	50 %	148242979
38036	NC_009482	T	6	6	1637921	1637926	0 %	100 %	0 %	0 %	148242979
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38049	NC_009482	ACC	2	6	1638605	1638610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242980
38050	NC_009482	GCT	2	6	1638621	1638626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242980
38051	NC_009482	CAG	2	6	1638632	1638637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242980
38052	NC_009482	AAAG	2	8	1638679	1638686	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38053	NC_009482	CCA	2	6	1638762	1638767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242981
38054	NC_009482	AGC	2	6	1638809	1638814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242981
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38059	NC_009482	GAG	2	6	1638978	1638983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38060	NC_009482	G	6	6	1638988	1638993	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
38061	NC_009482	CAG	2	6	1639080	1639085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38062	NC_009482	GC	3	6	1639094	1639099	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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38104	NC_009482	CAAG	2	8	1640974	1640981	50 %	0 %	25 %	25 %	148242984
38105	NC_009482	GC	3	6	1640988	1640993	0 %	0 %	50 %	50 %	148242984
38106	NC_009482	CGGC	2	8	1641015	1641022	0 %	0 %	50 %	50 %	148242984
38107	NC_009482	GCC	2	6	1641050	1641055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242984
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38230	NC_009482	CTG	2	6	1647122	1647127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242989
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38232	NC_009482	TGG	2	6	1647222	1647227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242989
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38234	NC_009482	CAC	2	6	1647271	1647276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242989
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38322	NC_009482	AGGGC	2	10	1650714	1650723	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
38323	NC_009482	CTCG	2	8	1650768	1650775	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38324	NC_009482	A	6	6	1650824	1650829	100 %	0 %	0 %	0 %	148242994
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38330	NC_009482	GGT	2	6	1651114	1651119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242994
38331	NC_009482	ACA	2	6	1651143	1651148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148242994
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38338	NC_009482	CCA	2	6	1651335	1651340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242995
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38342	NC_009482	GA	3	6	1651508	1651513	50 %	0 %	50 %	0 %	148242995
38343	NC_009482	TGC	2	6	1651679	1651684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242995
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38346	NC_009482	TC	3	6	1651782	1651787	0 %	50 %	0 %	50 %	148242995
38347	NC_009482	GGC	2	6	1651808	1651813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242995
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38350	NC_009482	CCA	2	6	1651944	1651949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242995
38351	NC_009482	CGA	2	6	1652054	1652059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242996
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38378	NC_009482	GC	3	6	1653691	1653696	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38379	NC_009482	CAA	2	6	1653705	1653710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38380	NC_009482	C	6	6	1653744	1653749	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
38381	NC_009482	CT	3	6	1653755	1653760	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38382	NC_009482	AGCCA	2	10	1653761	1653770	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
38383	NC_009482	A	6	6	1653832	1653837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38384	NC_009482	GCA	2	6	1653953	1653958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38385	NC_009482	GCCT	3	12	1653976	1653987	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38386	NC_009482	GCA	2	6	1654021	1654026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242999
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38389	NC_009482	TCC	2	6	1654197	1654202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148242999
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38398	NC_009482	GA	3	6	1654524	1654529	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38399	NC_009482	GCTT	2	8	1654581	1654588	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38400	NC_009482	GTG	2	6	1654589	1654594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38401	NC_009482	CAC	2	6	1654611	1654616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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38425	NC_009482	GAG	2	6	1655702	1655707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38426	NC_009482	GCA	2	6	1655910	1655915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243002
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38439	NC_009482	GGT	2	6	1656506	1656511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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38448	NC_009482	GTC	2	6	1656916	1656921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38449	NC_009482	CT	3	6	1656923	1656928	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38450	NC_009482	CTG	2	6	1656931	1656936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38451	NC_009482	CT	3	6	1657032	1657037	0 %	50 %	0 %	50 %	148243006
38452	NC_009482	GGT	2	6	1657045	1657050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243006
38453	NC_009482	GCT	2	6	1657052	1657057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243006
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38458	NC_009482	CATGG	2	10	1657298	1657307	20 %	20 %	40 %	20 %	148243007
38459	NC_009482	TCG	2	6	1657329	1657334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243007
38460	NC_009482	CGA	2	6	1657366	1657371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243007
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38463	NC_009482	AGGG	2	8	1657488	1657495	25 %	0 %	75 %	0 %	148243008
38464	NC_009482	TGG	2	6	1657541	1657546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243008
38465	NC_009482	CTC	2	6	1657578	1657583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243008
38466	NC_009482	CAA	2	6	1657610	1657615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243008
38467	NC_009482	GCT	2	6	1657694	1657699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38468	NC_009482	TCAA	2	8	1657745	1657752	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38469	NC_009482	GGCA	2	8	1657779	1657786	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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38487	NC_009482	ACCT	2	8	1658751	1658758	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38488	NC_009482	CCAA	2	8	1658788	1658795	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38489	NC_009482	CTA	2	6	1658876	1658881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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38491	NC_009482	TGA	2	6	1658951	1658956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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