MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 51524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
37501	NC_009482	ACC	2	6	1616086	1616091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37502	NC_009482	CCAT	2	8	1616157	1616164	25 %	25 %	0 %	50 %	148242956
37503	NC_009482	TTGA	2	8	1616216	1616223	25 %	50 %	25 %	0 %	148242956
37504	NC_009482	GCG	2	6	1616229	1616234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242956
37505	NC_009482	ATCA	2	8	1616462	1616469	50 %	25 %	0 %	25 %	148242956
37506	NC_009482	CTG	2	6	1616480	1616485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242956
37507	NC_009482	GCT	2	6	1616498	1616503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242956
37508	NC_009482	CAG	2	6	1616510	1616515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242956
37509	NC_009482	CAG	2	6	1616600	1616605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242956
37510	NC_009482	CAC	2	6	1616623	1616628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242956
37511	NC_009482	CTG	2	6	1616696	1616701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242956
37512	NC_009482	AGCC	2	8	1616707	1616714	25 %	0 %	25 %	50 %	148242956
37513	NC_009482	AGC	2	6	1616720	1616725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242956
37514	NC_009482	AGC	2	6	1616749	1616754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242956
37515	NC_009482	CGA	2	6	1616773	1616778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242956
37516	NC_009482	TTCGC	2	10	1616793	1616802	0 %	40 %	20 %	40 %	148242956
37517	NC_009482	GCA	2	6	1616876	1616881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242956
37518	NC_009482	C	6	6	1616925	1616930	0 %	0 %	0 %	100 %	148242956
37519	NC_009482	CCA	2	6	1616987	1616992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242956
37520	NC_009482	CGA	2	6	1617001	1617006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242956
37521	NC_009482	CTG	2	6	1617008	1617013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242956
37522	NC_009482	GTG	2	6	1617020	1617025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242956
37523	NC_009482	AGC	2	6	1617214	1617219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242956
37524	NC_009482	AAG	2	6	1617224	1617229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148242956
37525	NC_009482	GTG	2	6	1617245	1617250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242956
37526	NC_009482	CGGA	2	8	1617337	1617344	25 %	0 %	50 %	25 %	148242956
37527	NC_009482	CTG	2	6	1617377	1617382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242956
37528	NC_009482	ATG	2	6	1617410	1617415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242956
37529	NC_009482	CAC	2	6	1617448	1617453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242956
37530	NC_009482	TGG	2	6	1617474	1617479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242956
37531	NC_009482	CGG	2	6	1617508	1617513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242956
37532	NC_009482	GGC	2	6	1617536	1617541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242956
37533	NC_009482	TGC	2	6	1617564	1617569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242956
37534	NC_009482	GCT	2	6	1617571	1617576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242956
37535	NC_009482	TGG	2	6	1617615	1617620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242956
37536	NC_009482	CCG	2	6	1617627	1617632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242956
37537	NC_009482	CGG	2	6	1617637	1617642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242956
37538	NC_009482	ACC	2	6	1617683	1617688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242957
37539	NC_009482	CAT	2	6	1617715	1617720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242957
37540	NC_009482	ATC	2	6	1617725	1617730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242957
37541	NC_009482	GGGA	2	8	1617766	1617773	25 %	0 %	75 %	0 %	148242957
37542	NC_009482	GTG	2	6	1617783	1617788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242957
37543	NC_009482	CGCAG	2	10	1617809	1617818	20 %	0 %	40 %	40 %	148242957
37544	NC_009482	CTG	2	6	1617848	1617853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242957
37545	NC_009482	GTG	2	6	1617885	1617890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242957
37546	NC_009482	CTC	2	6	1617925	1617930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37547	NC_009482	ACAA	2	8	1617934	1617941	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
37548	NC_009482	TTTG	2	8	1617965	1617972	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37549	NC_009482	CGC	2	6	1618023	1618028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242958
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37551	NC_009482	GCC	2	6	1618045	1618050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242958
37552	NC_009482	GCT	2	6	1618061	1618066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242958
37553	NC_009482	CTT	2	6	1618069	1618074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148242958
37554	NC_009482	GGT	2	6	1618102	1618107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242958
37555	NC_009482	GAT	2	6	1618171	1618176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242958
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37557	NC_009482	GGC	2	6	1618210	1618215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242958
37558	NC_009482	ACG	2	6	1618259	1618264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242958
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37563	NC_009482	GCC	2	6	1618442	1618447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242958
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37566	NC_009482	CACC	2	8	1618512	1618519	25 %	0 %	0 %	75 %	148242958
37567	NC_009482	CAC	2	6	1618522	1618527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242958
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37569	NC_009482	CAGC	2	8	1618539	1618546	25 %	0 %	25 %	50 %	148242958
37570	NC_009482	TGG	3	9	1618662	1618670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242958
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37587	NC_009482	CAG	2	6	1619328	1619333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242958
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37589	NC_009482	GGC	2	6	1619422	1619427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242958
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37599	NC_009482	CGT	3	9	1619831	1619839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242959
37600	NC_009482	GAC	2	6	1619862	1619867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242959
37601	NC_009482	GCC	2	6	1619913	1619918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242959
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37606	NC_009482	GCA	3	9	1620227	1620235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242960
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37616	NC_009482	CGG	2	6	1620793	1620798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242960
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37649	NC_009482	GGA	2	6	1622199	1622204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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37720	NC_009482	TTCTG	2	10	1624723	1624732	0 %	60 %	20 %	20 %	148242964
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37730	NC_009482	GGC	2	6	1625180	1625185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242965
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37991	NC_009482	AGC	3	9	1635783	1635791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242977
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37997	NC_009482	CCAC	2	8	1635969	1635976	25 %	0 %	0 %	75 %	148242977
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