MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 51524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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37003	NC_009482	GAG	2	6	1594672	1594677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148242931
37004	NC_009482	GTG	2	6	1594696	1594701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242931
37005	NC_009482	GCC	2	6	1594723	1594728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242931
37006	NC_009482	CAC	2	6	1594773	1594778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242931
37007	NC_009482	GC	3	6	1594810	1594815	0 %	0 %	50 %	50 %	148242931
37008	NC_009482	CAG	2	6	1594828	1594833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242931
37009	NC_009482	GGCC	2	8	1594881	1594888	0 %	0 %	50 %	50 %	148242932
37010	NC_009482	GAG	2	6	1594940	1594945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148242932
37011	NC_009482	TAA	2	6	1595034	1595039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148242932
37012	NC_009482	AGC	2	6	1595046	1595051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242932
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37014	NC_009482	GC	3	6	1595076	1595081	0 %	0 %	50 %	50 %	148242932
37015	NC_009482	GAG	2	6	1595128	1595133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148242932
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37019	NC_009482	CGG	2	6	1595241	1595246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242932
37020	NC_009482	TGA	2	6	1595331	1595336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242932
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37042	NC_009482	GAG	2	6	1596384	1596389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148242934
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37099	NC_009482	CCA	3	9	1598800	1598808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242935
37100	NC_009482	CAG	3	9	1598818	1598826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242935
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37105	NC_009482	TGC	2	6	1599000	1599005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242935
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37230	NC_009482	TGG	2	6	1603874	1603879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242939
37231	NC_009482	CCT	2	6	1603898	1603903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148242939
37232	NC_009482	GCG	2	6	1604051	1604056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242939
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37235	NC_009482	TGT	2	6	1604127	1604132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148242940
37236	NC_009482	G	6	6	1604137	1604142	0 %	0 %	100 %	0 %	148242940
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37328	NC_009482	GGC	2	6	1608402	1608407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242945
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37331	NC_009482	CAG	3	9	1608591	1608599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242945
37332	NC_009482	GCA	2	6	1608671	1608676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242945
37333	NC_009482	GTG	2	6	1608724	1608729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242945
37334	NC_009482	GGGGC	2	10	1608777	1608786	0 %	0 %	80 %	20 %	148242945
37335	NC_009482	GTG	2	6	1608868	1608873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37336	NC_009482	GTG	3	9	1609036	1609044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242946
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37338	NC_009482	CG	4	8	1609086	1609093	0 %	0 %	50 %	50 %	148242946
37339	NC_009482	GCT	2	6	1609107	1609112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242946
37340	NC_009482	CAG	2	6	1609122	1609127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242946
37341	NC_009482	GTG	2	6	1609240	1609245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242946
37342	NC_009482	ATC	2	6	1609268	1609273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242946
37343	NC_009482	CGT	2	6	1609308	1609313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242946
37344	NC_009482	GAAGTG	2	12	1609318	1609329	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	148242946
37345	NC_009482	ACC	2	6	1609387	1609392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242946
37346	NC_009482	TGG	2	6	1609403	1609408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242946
37347	NC_009482	CTG	2	6	1609414	1609419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242946
37348	NC_009482	G	6	6	1609425	1609430	0 %	0 %	100 %	0 %	148242946
37349	NC_009482	CCG	2	6	1609466	1609471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242946
37350	NC_009482	CTCGCC	2	12	1609477	1609488	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	148242946
37351	NC_009482	GTG	3	9	1609516	1609524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242946
37352	NC_009482	CAG	2	6	1609530	1609535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242946
37353	NC_009482	GCG	2	6	1609549	1609554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242946
37354	NC_009482	GCA	2	6	1609637	1609642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242946
37355	NC_009482	GCT	2	6	1609653	1609658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242946
37356	NC_009482	GCA	2	6	1609659	1609664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242946
37357	NC_009482	GCGG	2	8	1609667	1609674	0 %	0 %	75 %	25 %	148242946
37358	NC_009482	GAT	2	6	1609690	1609695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242946
37359	NC_009482	ACG	2	6	1610036	1610041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242946
37360	NC_009482	TGG	2	6	1610048	1610053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242946
37361	NC_009482	TGG	2	6	1610078	1610083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242946
37362	NC_009482	GCTG	2	8	1610085	1610092	0 %	25 %	50 %	25 %	148242946
37363	NC_009482	GC	3	6	1610097	1610102	0 %	0 %	50 %	50 %	148242946
37364	NC_009482	CTGG	2	8	1610124	1610131	0 %	25 %	50 %	25 %	148242946
37365	NC_009482	AGC	2	6	1610148	1610153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242946
37366	NC_009482	AGC	2	6	1610231	1610236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242946
37367	NC_009482	TGC	2	6	1610303	1610308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242946
37368	NC_009482	TGG	2	6	1610378	1610383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242946
37369	NC_009482	GTG	2	6	1610414	1610419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242947
37370	NC_009482	TGA	2	6	1610422	1610427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242947
37371	NC_009482	ACC	2	6	1610455	1610460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242947
37372	NC_009482	CG	3	6	1610544	1610549	0 %	0 %	50 %	50 %	148242947
37373	NC_009482	T	7	7	1610550	1610556	0 %	100 %	0 %	0 %	148242947
37374	NC_009482	TTG	2	6	1610584	1610589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148242947
37375	NC_009482	GGT	2	6	1610600	1610605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242947
37376	NC_009482	ACA	2	6	1610644	1610649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148242947
37377	NC_009482	AGA	2	6	1610765	1610770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148242947
37378	NC_009482	TCA	2	6	1610782	1610787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242947
37379	NC_009482	ATCC	2	8	1610804	1610811	25 %	25 %	0 %	50 %	148242947
37380	NC_009482	CG	3	6	1610834	1610839	0 %	0 %	50 %	50 %	148242947
37381	NC_009482	GCT	2	6	1610849	1610854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242947
37382	NC_009482	GCCA	2	8	1610858	1610865	25 %	0 %	25 %	50 %	148242947
37383	NC_009482	GCA	2	6	1610887	1610892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37384	NC_009482	GGC	2	6	1610973	1610978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242948
37385	NC_009482	CTG	2	6	1611039	1611044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242948
37386	NC_009482	GCA	2	6	1611088	1611093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242948
37387	NC_009482	GGC	2	6	1611096	1611101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242948
37388	NC_009482	TGG	3	9	1611136	1611144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242948
37389	NC_009482	TTC	2	6	1611249	1611254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148242948
37390	NC_009482	CTG	2	6	1611297	1611302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242948
37391	NC_009482	ATCTTG	2	12	1611318	1611329	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	148242948
37392	NC_009482	ATC	2	6	1611330	1611335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242948
37393	NC_009482	GCT	2	6	1611353	1611358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242948
37394	NC_009482	CCTTGC	2	12	1611385	1611396	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	148242948
37395	NC_009482	TGA	2	6	1611412	1611417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242948
37396	NC_009482	TGA	2	6	1611550	1611555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242948
37397	NC_009482	TGG	2	6	1611601	1611606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242948
37398	NC_009482	TGG	2	6	1611631	1611636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242948
37399	NC_009482	CGA	2	6	1611662	1611667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242948
37400	NC_009482	CGAAG	2	10	1611790	1611799	40 %	0 %	40 %	20 %	148242949
37401	NC_009482	ACC	2	6	1611832	1611837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242949
37402	NC_009482	CTT	2	6	1611868	1611873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148242949
37403	NC_009482	TGC	2	6	1611903	1611908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242949
37404	NC_009482	GC	3	6	1611928	1611933	0 %	0 %	50 %	50 %	148242949
37405	NC_009482	GGAT	2	8	1612010	1612017	25 %	25 %	50 %	0 %	148242949
37406	NC_009482	CTCC	2	8	1612039	1612046	0 %	25 %	0 %	75 %	148242949
37407	NC_009482	AGA	2	6	1612064	1612069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148242950
37408	NC_009482	GAT	2	6	1612099	1612104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242950
37409	NC_009482	GC	3	6	1612106	1612111	0 %	0 %	50 %	50 %	148242950
37410	NC_009482	AGC	2	6	1612139	1612144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242950
37411	NC_009482	GCT	2	6	1612167	1612172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242950
37412	NC_009482	GGT	2	6	1612195	1612200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242950
37413	NC_009482	CAC	2	6	1612236	1612241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242950
37414	NC_009482	TGAG	2	8	1612271	1612278	25 %	25 %	50 %	0 %	148242950
37415	NC_009482	CGT	2	6	1612362	1612367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242951
37416	NC_009482	GCA	2	6	1612464	1612469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242951
37417	NC_009482	CAAT	2	8	1612514	1612521	50 %	25 %	0 %	25 %	148242951
37418	NC_009482	ACC	2	6	1612533	1612538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242951
37419	NC_009482	GGC	2	6	1612548	1612553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242951
37420	NC_009482	TCC	2	6	1612592	1612597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148242951
37421	NC_009482	CAA	2	6	1612621	1612626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148242951
37422	NC_009482	GCCA	2	8	1612633	1612640	25 %	0 %	25 %	50 %	148242951
37423	NC_009482	TGG	2	6	1612783	1612788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242952
37424	NC_009482	GCG	2	6	1612888	1612893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242952
37425	NC_009482	GCA	2	6	1612913	1612918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242952
37426	NC_009482	GCT	2	6	1612967	1612972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242952
37427	NC_009482	GCT	2	6	1613007	1613012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242952
37428	NC_009482	GCTG	2	8	1613113	1613120	0 %	25 %	50 %	25 %	148242952
37429	NC_009482	TGA	2	6	1613147	1613152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242952
37430	NC_009482	TGG	2	6	1613161	1613166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242952
37431	NC_009482	CAG	2	6	1613176	1613181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242952
37432	NC_009482	CTGGTG	2	12	1613214	1613225	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148242952
37433	NC_009482	CAC	2	6	1613243	1613248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242952
37434	NC_009482	G	6	6	1613273	1613278	0 %	0 %	100 %	0 %	148242952
37435	NC_009482	CTG	2	6	1613307	1613312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242952
37436	NC_009482	CT	3	6	1613327	1613332	0 %	50 %	0 %	50 %	148242952
37437	NC_009482	ACA	3	9	1613348	1613356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148242952
37438	NC_009482	G	7	7	1613396	1613402	0 %	0 %	100 %	0 %	148242952
37439	NC_009482	GATC	2	8	1613408	1613415	25 %	25 %	25 %	25 %	148242952
37440	NC_009482	TGG	2	6	1613418	1613423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242952
37441	NC_009482	GCT	2	6	1613472	1613477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242952
37442	NC_009482	ACC	2	6	1613505	1613510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242952
37443	NC_009482	GTG	2	6	1613520	1613525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242952
37444	NC_009482	CGG	2	6	1613565	1613570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242952
37445	NC_009482	CAA	2	6	1613576	1613581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148242952
37446	NC_009482	CGC	2	6	1613591	1613596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242952
37447	NC_009482	CGG	2	6	1613649	1613654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242952
37448	NC_009482	GGC	2	6	1613700	1613705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242952
37449	NC_009482	GCA	2	6	1613723	1613728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242952
37450	NC_009482	GGT	2	6	1613786	1613791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242952
37451	NC_009482	GATG	2	8	1613828	1613835	25 %	25 %	50 %	0 %	148242952
37452	NC_009482	GCT	2	6	1613860	1613865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242952
37453	NC_009482	AGCC	2	8	1613954	1613961	25 %	0 %	25 %	50 %	148242952
37454	NC_009482	GGT	2	6	1614023	1614028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242952
37455	NC_009482	AGG	2	6	1614061	1614066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148242952
37456	NC_009482	AACC	2	8	1614093	1614100	50 %	0 %	0 %	50 %	148242952
37457	NC_009482	AAG	2	6	1614133	1614138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148242952
37458	NC_009482	CTGC	2	8	1614146	1614153	0 %	25 %	25 %	50 %	148242952
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37460	NC_009482	CGC	2	6	1614276	1614281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242953
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37499	NC_009482	CGC	2	6	1615885	1615890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242955
37500	NC_009482	A	6	6	1616072	1616077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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