MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 51524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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36503	NC_009482	CAG	2	6	1571717	1571722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242906
36504	NC_009482	CAA	2	6	1571760	1571765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148242906
36505	NC_009482	GCT	2	6	1571768	1571773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242906
36506	NC_009482	GCC	2	6	1571785	1571790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242906
36507	NC_009482	CCGG	2	8	1571835	1571842	0 %	0 %	50 %	50 %	148242906
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36511	NC_009482	GGTGTT	2	12	1572024	1572035	0 %	50 %	50 %	0 %	148242907
36512	NC_009482	CAG	2	6	1572052	1572057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242907
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36517	NC_009482	GCT	3	9	1572231	1572239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242907
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36524	NC_009482	ACC	2	6	1572525	1572530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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36733	NC_009482	CGT	2	6	1582813	1582818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242919
36734	NC_009482	GAA	2	6	1582922	1582927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148242920
36735	NC_009482	CG	3	6	1582947	1582952	0 %	0 %	50 %	50 %	148242920
36736	NC_009482	GTT	2	6	1582989	1582994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148242920
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36739	NC_009482	TGC	2	6	1583096	1583101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242920
36740	NC_009482	CCG	2	6	1583118	1583123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242920
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36744	NC_009482	CTG	2	6	1583278	1583283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242920
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36747	NC_009482	TTGT	2	8	1583574	1583581	0 %	75 %	25 %	0 %	148242920
36748	NC_009482	CTGAG	2	10	1583591	1583600	20 %	20 %	40 %	20 %	148242920
36749	NC_009482	GGC	2	6	1583611	1583616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242920
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36752	NC_009482	AC	3	6	1583643	1583648	50 %	0 %	0 %	50 %	148242920
36753	NC_009482	AGCTC	2	10	1583667	1583676	20 %	20 %	20 %	40 %	148242920
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36762	NC_009482	ACC	2	6	1583935	1583940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242920
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36790	NC_009482	CCA	2	6	1585044	1585049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242920
36791	NC_009482	AGG	2	6	1585075	1585080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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36822	NC_009482	TGA	2	6	1586564	1586569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242922
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36824	NC_009482	TGC	2	6	1586651	1586656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242922
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36829	NC_009482	GCT	2	6	1587120	1587125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242922
36830	NC_009482	GC	3	6	1587161	1587166	0 %	0 %	50 %	50 %	148242922
36831	NC_009482	GCT	2	6	1587201	1587206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242922
36832	NC_009482	ACG	2	6	1587245	1587250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242922
36833	NC_009482	GAG	2	6	1587262	1587267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148242922
36834	NC_009482	ACA	2	6	1587288	1587293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148242922
36835	NC_009482	CCA	2	6	1587305	1587310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242922
36836	NC_009482	CTG	2	6	1587325	1587330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242922
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36839	NC_009482	GCT	2	6	1587417	1587422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242922
36840	NC_009482	CTG	2	6	1587427	1587432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242922
36841	NC_009482	GCT	2	6	1587509	1587514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242922
36842	NC_009482	TGC	2	6	1587548	1587553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242922
36843	NC_009482	GCG	2	6	1587572	1587577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242922
36844	NC_009482	TCA	2	6	1587653	1587658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242922
36845	NC_009482	CGC	2	6	1587683	1587688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242922
36846	NC_009482	TGA	2	6	1587741	1587746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242922
36847	NC_009482	TC	3	6	1587825	1587830	0 %	50 %	0 %	50 %	148242922
36848	NC_009482	CG	3	6	1587968	1587973	0 %	0 %	50 %	50 %	148242922
36849	NC_009482	CCT	2	6	1587990	1587995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148242922
36850	NC_009482	CTAT	2	8	1588071	1588078	25 %	50 %	0 %	25 %	148242922
36851	NC_009482	CGG	2	6	1588183	1588188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242922
36852	NC_009482	CGGCCT	2	12	1588242	1588253	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148242922
36853	NC_009482	GAGC	2	8	1588305	1588312	25 %	0 %	50 %	25 %	148242922
36854	NC_009482	ACC	2	6	1588324	1588329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242922
36855	NC_009482	GATGAG	2	12	1588360	1588371	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	148242922
36856	NC_009482	GCGTTG	2	12	1588396	1588407	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148242922
36857	NC_009482	CGC	2	6	1588435	1588440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242923
36858	NC_009482	TCG	2	6	1588467	1588472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242923
36859	NC_009482	GTG	2	6	1588473	1588478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242923
36860	NC_009482	CAC	2	6	1588492	1588497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242923
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36862	NC_009482	GCA	3	9	1588648	1588656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242923
36863	NC_009482	TGG	2	6	1588672	1588677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242923
36864	NC_009482	CTC	2	6	1588715	1588720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148242923
36865	NC_009482	GAA	2	6	1588733	1588738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148242923
36866	NC_009482	TCC	2	6	1588749	1588754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148242923
36867	NC_009482	ATCG	2	8	1588835	1588842	25 %	25 %	25 %	25 %	148242923
36868	NC_009482	TGA	2	6	1588879	1588884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242923
36869	NC_009482	TCC	2	6	1588896	1588901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148242923
36870	NC_009482	GAT	2	6	1588928	1588933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242923
36871	NC_009482	TGG	2	6	1588981	1588986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242923
36872	NC_009482	GCA	2	6	1588993	1588998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242923
36873	NC_009482	TTG	2	6	1589043	1589048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148242923
36874	NC_009482	TCC	2	6	1589058	1589063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148242923
36875	NC_009482	GAT	2	6	1589117	1589122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242923
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36877	NC_009482	CCG	2	6	1589142	1589147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242923
36878	NC_009482	GAG	2	6	1589193	1589198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148242923
36879	NC_009482	GTG	2	6	1589283	1589288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242923
36880	NC_009482	GCG	4	12	1589315	1589326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242923
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36883	NC_009482	AGCG	2	8	1589389	1589396	25 %	0 %	50 %	25 %	148242923
36884	NC_009482	TCG	2	6	1589409	1589414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242923
36885	NC_009482	GTC	2	6	1589424	1589429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242923
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36888	NC_009482	CTG	2	6	1589510	1589515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242923
36889	NC_009482	GA	3	6	1589598	1589603	50 %	0 %	50 %	0 %	148242923
36890	NC_009482	TCAGGG	2	12	1589631	1589642	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148242923
36891	NC_009482	CCA	2	6	1589674	1589679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242923
36892	NC_009482	GGA	2	6	1589716	1589721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148242923
36893	NC_009482	TCA	2	6	1589763	1589768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242923
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36899	NC_009482	TCC	2	6	1590144	1590149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148242924
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36902	NC_009482	CT	3	6	1590374	1590379	0 %	50 %	0 %	50 %	148242925
36903	NC_009482	CA	3	6	1590405	1590410	50 %	0 %	0 %	50 %	148242925
36904	NC_009482	CAG	2	6	1590427	1590432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242925
36905	NC_009482	ACCA	2	8	1590492	1590499	50 %	0 %	0 %	50 %	148242925
36906	NC_009482	AGA	2	6	1590549	1590554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148242925
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36908	NC_009482	AGC	2	6	1590617	1590622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242925
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36910	NC_009482	TCA	2	6	1590668	1590673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242925
36911	NC_009482	AGA	2	6	1590714	1590719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148242925
36912	NC_009482	GCC	2	6	1590759	1590764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242925
36913	NC_009482	GCA	2	6	1590845	1590850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242925
36914	NC_009482	GCT	2	6	1590867	1590872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242925
36915	NC_009482	CGT	2	6	1590903	1590908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242925
36916	NC_009482	CAC	2	6	1590940	1590945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242925
36917	NC_009482	GCA	2	6	1590951	1590956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242925
36918	NC_009482	GGAA	2	8	1591233	1591240	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36919	NC_009482	CAGG	2	8	1591248	1591255	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36920	NC_009482	TTGT	2	8	1591260	1591267	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
36921	NC_009482	TGG	2	6	1591276	1591281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36922	NC_009482	CAAGGC	2	12	1591351	1591362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242926
36923	NC_009482	AG	3	6	1591375	1591380	50 %	0 %	50 %	0 %	148242926
36924	NC_009482	GCG	2	6	1591404	1591409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242926
36925	NC_009482	CAG	2	6	1591442	1591447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242926
36926	NC_009482	TAC	2	6	1591469	1591474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242926
36927	NC_009482	AGA	3	9	1591647	1591655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148242926
36928	NC_009482	CGC	2	6	1591664	1591669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242926
36929	NC_009482	GAC	2	6	1591957	1591962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242927
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36931	NC_009482	CGC	2	6	1592008	1592013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242927
36932	NC_009482	GCG	2	6	1592063	1592068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242928
36933	NC_009482	CAG	2	6	1592096	1592101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242928
36934	NC_009482	TGT	2	6	1592141	1592146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148242928
36935	NC_009482	GAG	2	6	1592172	1592177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148242928
36936	NC_009482	AGC	2	6	1592178	1592183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242928
36937	NC_009482	CAG	3	9	1592189	1592197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242928
36938	NC_009482	CCAG	2	8	1592218	1592225	25 %	0 %	25 %	50 %	148242928
36939	NC_009482	GCAATC	2	12	1592238	1592249	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148242928
36940	NC_009482	CAG	3	9	1592282	1592290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242928
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36942	NC_009482	CAC	2	6	1592321	1592326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242928
36943	NC_009482	CAG	2	6	1592333	1592338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242928
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36947	NC_009482	CCA	2	6	1592440	1592445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242928
36948	NC_009482	CTT	2	6	1592450	1592455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148242928
36949	NC_009482	GAT	3	9	1592456	1592464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242928
36950	NC_009482	GCA	3	9	1592470	1592478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242928
36951	NC_009482	GAA	2	6	1592554	1592559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148242929
36952	NC_009482	ATC	2	6	1592578	1592583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242929
36953	NC_009482	GAA	2	6	1592617	1592622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148242929
36954	NC_009482	CAG	2	6	1592632	1592637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242929
36955	NC_009482	AGCAA	2	10	1592668	1592677	60 %	0 %	20 %	20 %	148242929
36956	NC_009482	GCTGC	2	10	1592682	1592691	0 %	20 %	40 %	40 %	148242929
36957	NC_009482	AGC	2	6	1592775	1592780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242929
36958	NC_009482	GCT	2	6	1592802	1592807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242929
36959	NC_009482	CCA	2	6	1592850	1592855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242929
36960	NC_009482	GCT	2	6	1592986	1592991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242929
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