MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 51524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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36002	NC_009482	ATG	2	6	1552218	1552223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242885
36003	NC_009482	GTG	2	6	1552248	1552253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242885
36004	NC_009482	CAG	2	6	1552345	1552350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242886
36005	NC_009482	C	6	6	1552365	1552370	0 %	0 %	0 %	100 %	148242886
36006	NC_009482	CAA	2	6	1552378	1552383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148242886
36007	NC_009482	GCT	2	6	1552390	1552395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242886
36008	NC_009482	ACT	2	6	1552498	1552503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242886
36009	NC_009482	GAG	2	6	1552504	1552509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148242886
36010	NC_009482	CG	3	6	1552528	1552533	0 %	0 %	50 %	50 %	148242886
36011	NC_009482	CTG	3	9	1552555	1552563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242886
36012	NC_009482	CAG	2	6	1552600	1552605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242886
36013	NC_009482	CCAG	2	8	1552606	1552613	25 %	0 %	25 %	50 %	148242886
36014	NC_009482	CGG	3	9	1552690	1552698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242886
36015	NC_009482	GCAA	2	8	1552703	1552710	50 %	0 %	25 %	25 %	148242886
36016	NC_009482	CCAC	2	8	1552736	1552743	25 %	0 %	0 %	75 %	148242886
36017	NC_009482	CAGCC	2	10	1552750	1552759	20 %	0 %	20 %	60 %	148242886
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36019	NC_009482	CTG	2	6	1552813	1552818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242886
36020	NC_009482	TGC	2	6	1552827	1552832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242886
36021	NC_009482	AC	3	6	1552848	1552853	50 %	0 %	0 %	50 %	148242886
36022	NC_009482	TGC	2	6	1552854	1552859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242886
36023	NC_009482	GGC	2	6	1552875	1552880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242886
36024	NC_009482	GCC	2	6	1552885	1552890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242886
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36027	NC_009482	CTG	2	6	1552972	1552977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242886
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36032	NC_009482	GGC	2	6	1553125	1553130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242886
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36044	NC_009482	CAC	2	6	1553408	1553413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242886
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36053	NC_009482	AGAC	2	8	1553581	1553588	50 %	0 %	25 %	25 %	148242886
36054	NC_009482	CCAAC	2	10	1553626	1553635	40 %	0 %	0 %	60 %	148242886
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36098	NC_009482	GGA	2	6	1555486	1555491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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36100	NC_009482	CCCT	2	8	1555545	1555552	0 %	25 %	0 %	75 %	148242890
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36110	NC_009482	TAC	2	6	1556033	1556038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242890
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36112	NC_009482	CAC	2	6	1556071	1556076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242890
36113	NC_009482	CGC	2	6	1556122	1556127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242890
36114	NC_009482	CAG	2	6	1556137	1556142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36115	NC_009482	T	7	7	1556178	1556184	0 %	100 %	0 %	0 %	148242891
36116	NC_009482	GCA	2	6	1556275	1556280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242891
36117	NC_009482	AGC	4	12	1556310	1556321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242891
36118	NC_009482	CAG	2	6	1556348	1556353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242891
36119	NC_009482	CAC	2	6	1556360	1556365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242891
36120	NC_009482	GCA	2	6	1556419	1556424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242891
36121	NC_009482	GCC	2	6	1556439	1556444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242891
36122	NC_009482	TGG	2	6	1556467	1556472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242891
36123	NC_009482	GGC	2	6	1556510	1556515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242891
36124	NC_009482	CTCA	2	8	1556534	1556541	25 %	25 %	0 %	50 %	148242891
36125	NC_009482	CTCA	2	8	1556675	1556682	25 %	25 %	0 %	50 %	148242891
36126	NC_009482	AGC	2	6	1556702	1556707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242891
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36128	NC_009482	CTG	2	6	1556765	1556770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242891
36129	NC_009482	GCA	3	9	1556806	1556814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242891
36130	NC_009482	CGG	2	6	1556846	1556851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242891
36131	NC_009482	GGC	2	6	1556863	1556868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242891
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36133	NC_009482	CT	3	6	1556877	1556882	0 %	50 %	0 %	50 %	148242891
36134	NC_009482	CCA	2	6	1556926	1556931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242891
36135	NC_009482	GGGC	2	8	1556967	1556974	0 %	0 %	75 %	25 %	148242891
36136	NC_009482	GCA	2	6	1557007	1557012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242891
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36138	NC_009482	GCG	2	6	1557041	1557046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242891
36139	NC_009482	AC	3	6	1557067	1557072	50 %	0 %	0 %	50 %	148242891
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36144	NC_009482	CAG	2	6	1557245	1557250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242891
36145	NC_009482	CG	3	6	1557256	1557261	0 %	0 %	50 %	50 %	148242891
36146	NC_009482	GATC	2	8	1557262	1557269	25 %	25 %	25 %	25 %	148242891
36147	NC_009482	GGAT	2	8	1557285	1557292	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
36148	NC_009482	CCT	2	6	1557294	1557299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36149	NC_009482	CAC	2	6	1557328	1557333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242892
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36151	NC_009482	AGC	3	9	1557395	1557403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242892
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36153	NC_009482	CGG	2	6	1557460	1557465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242892
36154	NC_009482	CGC	2	6	1557466	1557471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242892
36155	NC_009482	GATC	2	8	1557504	1557511	25 %	25 %	25 %	25 %	148242892
36156	NC_009482	GCA	3	9	1557531	1557539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242892
36157	NC_009482	CCA	2	6	1557567	1557572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242892
36158	NC_009482	ACCGCC	2	12	1557623	1557634	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	148242892
36159	NC_009482	ACC	2	6	1557635	1557640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242892
36160	NC_009482	TGG	2	6	1557678	1557683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242892
36161	NC_009482	CACAC	2	10	1557704	1557713	40 %	0 %	0 %	60 %	148242892
36162	NC_009482	GCA	2	6	1557753	1557758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242892
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36172	NC_009482	CCCA	2	8	1558136	1558143	25 %	0 %	0 %	75 %	148242892
36173	NC_009482	CGC	2	6	1558183	1558188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242892
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36178	NC_009482	CAG	2	6	1558384	1558389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242892
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36184	NC_009482	CAC	2	6	1558627	1558632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242892
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36188	NC_009482	TGC	2	6	1558736	1558741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242892
36189	NC_009482	CAC	3	9	1558870	1558878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242892
36190	NC_009482	GCC	3	9	1558885	1558893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242892
36191	NC_009482	CAC	2	6	1558930	1558935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242892
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36193	NC_009482	GGC	2	6	1559020	1559025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242892
36194	NC_009482	GAG	2	6	1559045	1559050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148242892
36195	NC_009482	CAG	2	6	1559103	1559108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242892
36196	NC_009482	GCC	2	6	1559127	1559132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242892
36197	NC_009482	CAA	2	6	1559134	1559139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148242892
36198	NC_009482	CCG	2	6	1559162	1559167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36199	NC_009482	GAT	2	6	1559245	1559250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242893
36200	NC_009482	GCA	2	6	1559276	1559281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242893
36201	NC_009482	GGT	2	6	1559301	1559306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242893
36202	NC_009482	GGC	2	6	1559362	1559367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242893
36203	NC_009482	CAC	2	6	1559368	1559373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242893
36204	NC_009482	GGC	2	6	1559414	1559419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242893
36205	NC_009482	TGCT	2	8	1559504	1559511	0 %	50 %	25 %	25 %	148242893
36206	NC_009482	GA	3	6	1559520	1559525	50 %	0 %	50 %	0 %	148242893
36207	NC_009482	GCG	2	6	1559573	1559578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242893
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36209	NC_009482	GGCC	2	8	1559691	1559698	0 %	0 %	50 %	50 %	148242893
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36212	NC_009482	CTG	2	6	1559854	1559859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242893
36213	NC_009482	GGT	2	6	1559863	1559868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242893
36214	NC_009482	GCT	2	6	1559909	1559914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242893
36215	NC_009482	CAG	2	6	1559928	1559933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242893
36216	NC_009482	GCA	2	6	1559936	1559941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242893
36217	NC_009482	GCC	2	6	1559948	1559953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242893
36218	NC_009482	GCA	2	6	1560002	1560007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242893
36219	NC_009482	CAG	2	6	1560018	1560023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242893
36220	NC_009482	GGC	2	6	1560030	1560035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242893
36221	NC_009482	TGC	2	6	1560135	1560140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242893
36222	NC_009482	GGCAGG	2	12	1560142	1560153	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	148242893
36223	NC_009482	GGGC	2	8	1560192	1560199	0 %	0 %	75 %	25 %	148242893
36224	NC_009482	GCA	2	6	1560218	1560223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242893
36225	NC_009482	TGC	3	9	1560241	1560249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242893
36226	NC_009482	CCA	3	9	1560315	1560323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242893
36227	NC_009482	GCC	2	6	1560352	1560357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242893
36228	NC_009482	GCA	2	6	1560363	1560368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242893
36229	NC_009482	ACC	2	6	1560431	1560436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242893
36230	NC_009482	GCT	2	6	1560471	1560476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242893
36231	NC_009482	ACG	2	6	1560617	1560622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242894
36232	NC_009482	CCA	2	6	1560711	1560716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242894
36233	NC_009482	CATC	2	8	1560720	1560727	25 %	25 %	0 %	50 %	148242894
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36235	NC_009482	CTG	2	6	1560748	1560753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242894
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36247	NC_009482	GGGAA	2	10	1561033	1561042	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
36248	NC_009482	GCA	2	6	1561066	1561071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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36340	NC_009482	GCA	2	6	1565147	1565152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242899
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36343	NC_009482	GCTG	2	8	1565277	1565284	0 %	25 %	50 %	25 %	148242899
36344	NC_009482	GCT	2	6	1565313	1565318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242899
36345	NC_009482	GCCGAA	2	12	1565323	1565334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242899
36346	NC_009482	CTG	3	9	1565356	1565364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242899
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36348	NC_009482	GCG	2	6	1565447	1565452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242899
36349	NC_009482	GCT	2	6	1565457	1565462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242899
36350	NC_009482	GCC	2	6	1565523	1565528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242899
36351	NC_009482	CTG	2	6	1565557	1565562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242899
36352	NC_009482	GCC	2	6	1565585	1565590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242899
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36356	NC_009482	TGC	2	6	1565777	1565782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242899
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36373	NC_009482	GCT	2	6	1566365	1566370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242900
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36384	NC_009482	CTG	2	6	1566699	1566704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242900
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36395	NC_009482	TGC	3	9	1567129	1567137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242900
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36397	NC_009482	TGCCGG	2	12	1567157	1567168	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148242900
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36399	NC_009482	CGC	2	6	1567198	1567203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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36407	NC_009482	TGG	2	6	1567610	1567615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242901
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36409	NC_009482	CCG	2	6	1567658	1567663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242901
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36416	NC_009482	CTG	2	6	1567915	1567920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242901
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36423	NC_009482	CTG	2	6	1568065	1568070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242901
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36445	NC_009482	GCC	2	6	1568818	1568823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242902
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36450	NC_009482	CTG	2	6	1569060	1569065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242902
36451	NC_009482	GCCAT	2	10	1569070	1569079	20 %	20 %	20 %	40 %	148242902
36452	NC_009482	GAT	2	6	1569090	1569095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242902
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36454	NC_009482	CCA	2	6	1569149	1569154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242902
36455	NC_009482	TGC	2	6	1569182	1569187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242902
36456	NC_009482	CTG	2	6	1569256	1569261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242903
36457	NC_009482	CAC	2	6	1569364	1569369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242903
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36459	NC_009482	T	6	6	1569385	1569390	0 %	100 %	0 %	0 %	148242903
36460	NC_009482	GCG	2	6	1569440	1569445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242903
36461	NC_009482	GTC	2	6	1569457	1569462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242903
36462	NC_009482	CAGG	2	8	1569503	1569510	25 %	0 %	50 %	25 %	148242903
36463	NC_009482	CGG	2	6	1569636	1569641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242904
36464	NC_009482	GCA	2	6	1569661	1569666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242904
36465	NC_009482	TC	3	6	1569721	1569726	0 %	50 %	0 %	50 %	148242904
36466	NC_009482	GCA	2	6	1569738	1569743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242904
36467	NC_009482	GGC	2	6	1569757	1569762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242904
36468	NC_009482	CTG	3	9	1569771	1569779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242904
36469	NC_009482	C	6	6	1569879	1569884	0 %	0 %	0 %	100 %	148242904
36470	NC_009482	GCA	2	6	1569894	1569899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242904
36471	NC_009482	GCC	2	6	1569918	1569923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242904
36472	NC_009482	GGC	2	6	1569934	1569939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242904
36473	NC_009482	CG	3	6	1569976	1569981	0 %	0 %	50 %	50 %	148242904
36474	NC_009482	CAG	2	6	1570016	1570021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242904
36475	NC_009482	TCA	2	6	1570032	1570037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242904
36476	NC_009482	GGC	2	6	1570040	1570045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242904
36477	NC_009482	CACC	2	8	1570048	1570055	25 %	0 %	0 %	75 %	148242904
36478	NC_009482	GCA	3	9	1570159	1570167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242904
36479	NC_009482	GCC	2	6	1570241	1570246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242904
36480	NC_009482	GCA	2	6	1570288	1570293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242904
36481	NC_009482	CAGC	2	8	1570423	1570430	25 %	0 %	25 %	50 %	148242904
36482	NC_009482	GCG	2	6	1570442	1570447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242904
36483	NC_009482	GC	3	6	1570601	1570606	0 %	0 %	50 %	50 %	148242904
36484	NC_009482	TGC	2	6	1570699	1570704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242904
36485	NC_009482	CGGC	2	8	1570736	1570743	0 %	0 %	50 %	50 %	148242904
36486	NC_009482	TCC	2	6	1570746	1570751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148242904
36487	NC_009482	CCGG	2	8	1570803	1570810	0 %	0 %	50 %	50 %	148242904
36488	NC_009482	GCCA	2	8	1570833	1570840	25 %	0 %	25 %	50 %	148242904
36489	NC_009482	GTT	2	6	1570858	1570863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148242904
36490	NC_009482	GCT	2	6	1571021	1571026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242905
36491	NC_009482	T	6	6	1571124	1571129	0 %	100 %	0 %	0 %	148242905
36492	NC_009482	ATTGC	2	10	1571322	1571331	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
36493	NC_009482	CTGG	2	8	1571357	1571364	0 %	25 %	50 %	25 %	148242906
36494	NC_009482	CGC	2	6	1571376	1571381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242906
36495	NC_009482	GCCC	2	8	1571410	1571417	0 %	0 %	25 %	75 %	148242906
36496	NC_009482	GCCA	2	8	1571493	1571500	25 %	0 %	25 %	50 %	148242906
36497	NC_009482	GCA	2	6	1571527	1571532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242906
36498	NC_009482	CGGGG	2	10	1571565	1571574	0 %	0 %	80 %	20 %	148242906
36499	NC_009482	GCG	2	6	1571584	1571589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242906
36500	NC_009482	CTG	2	6	1571652	1571657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242906

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