MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 51524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35502	NC_009482	GGC	2	6	1532281	1532286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242850
35503	NC_009482	CTG	2	6	1532310	1532315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242850
35504	NC_009482	CCA	2	6	1532316	1532321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242850
35505	NC_009482	C	6	6	1532332	1532337	0 %	0 %	0 %	100 %	148242850
35506	NC_009482	GTG	2	6	1532374	1532379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242850
35507	NC_009482	GATCCC	2	12	1532392	1532403	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148242850
35508	NC_009482	CGG	3	9	1532412	1532420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242850
35509	NC_009482	GCG	2	6	1532459	1532464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242850
35510	NC_009482	AAGCCG	2	12	1532471	1532482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242850
35511	NC_009482	GCC	2	6	1532522	1532527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242850
35512	NC_009482	GCCA	2	8	1532587	1532594	25 %	0 %	25 %	50 %	148242850
35513	NC_009482	CAG	2	6	1532601	1532606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242850
35514	NC_009482	GC	3	6	1532637	1532642	0 %	0 %	50 %	50 %	148242850
35515	NC_009482	GGC	3	9	1532665	1532673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242850
35516	NC_009482	GCAGC	2	10	1532712	1532721	20 %	0 %	40 %	40 %	148242850
35517	NC_009482	GTG	2	6	1532737	1532742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242850
35518	NC_009482	CCA	2	6	1532798	1532803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242850
35519	NC_009482	TGG	2	6	1532807	1532812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242850
35520	NC_009482	GCA	2	6	1532844	1532849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242850
35521	NC_009482	CAG	2	6	1532897	1532902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242850
35522	NC_009482	GCG	2	6	1532968	1532973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242850
35523	NC_009482	GCC	2	6	1532974	1532979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242850
35524	NC_009482	CAG	2	6	1533005	1533010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242850
35525	NC_009482	GTG	2	6	1533013	1533018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242850
35526	NC_009482	GCG	2	6	1533035	1533040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242850
35527	NC_009482	GCT	2	6	1533150	1533155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242850
35528	NC_009482	AGA	2	6	1533159	1533164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148242850
35529	NC_009482	CTGAG	2	10	1533165	1533174	20 %	20 %	40 %	20 %	148242850
35530	NC_009482	CAC	2	6	1533204	1533209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242851
35531	NC_009482	TAGA	2	8	1533213	1533220	50 %	25 %	25 %	0 %	148242851
35532	NC_009482	CAC	2	6	1533240	1533245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242851
35533	NC_009482	GGT	2	6	1533297	1533302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242851
35534	NC_009482	CA	3	6	1533307	1533312	50 %	0 %	0 %	50 %	148242851
35535	NC_009482	CAG	3	9	1533492	1533500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242851
35536	NC_009482	GCC	2	6	1533523	1533528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242851
35537	NC_009482	ATC	2	6	1533538	1533543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242851
35538	NC_009482	CCA	2	6	1533560	1533565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242851
35539	NC_009482	CGC	2	6	1533639	1533644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242851
35540	NC_009482	CACCGC	2	12	1533645	1533656	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	148242851
35541	NC_009482	GTC	2	6	1533678	1533683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242851
35542	NC_009482	GCT	2	6	1533690	1533695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242851
35543	NC_009482	CAG	2	6	1533707	1533712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242851
35544	NC_009482	AGC	2	6	1533724	1533729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242851
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35546	NC_009482	GCAAA	2	10	1533781	1533790	60 %	0 %	20 %	20 %	148242851
35547	NC_009482	AGC	2	6	1533808	1533813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242851
35548	NC_009482	ATTG	2	8	1533821	1533828	25 %	50 %	25 %	0 %	148242851
35549	NC_009482	CCG	2	6	1533846	1533851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242851
35550	NC_009482	CCA	2	6	1534069	1534074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242852
35551	NC_009482	TGG	2	6	1534087	1534092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242852
35552	NC_009482	CAC	2	6	1534097	1534102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242852
35553	NC_009482	GCC	2	6	1534152	1534157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242852
35554	NC_009482	GC	3	6	1534181	1534186	0 %	0 %	50 %	50 %	148242852
35555	NC_009482	A	7	7	1534205	1534211	100 %	0 %	0 %	0 %	148242852
35556	NC_009482	CGGC	2	8	1534216	1534223	0 %	0 %	50 %	50 %	148242852
35557	NC_009482	GCC	2	6	1534240	1534245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242852
35558	NC_009482	GCA	2	6	1534336	1534341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242852
35559	NC_009482	GCA	3	9	1534390	1534398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242852
35560	NC_009482	TGC	2	6	1534437	1534442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242852
35561	NC_009482	GCA	2	6	1534477	1534482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242852
35562	NC_009482	GGCA	2	8	1534525	1534532	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35563	NC_009482	CAAAG	2	10	1534559	1534568	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
35564	NC_009482	GAC	2	6	1534620	1534625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242853
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35566	NC_009482	TGC	3	9	1534684	1534692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242853
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35569	NC_009482	CCAG	2	8	1534708	1534715	25 %	0 %	25 %	50 %	148242853
35570	NC_009482	GCA	2	6	1534721	1534726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242853
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35572	NC_009482	GC	3	6	1534784	1534789	0 %	0 %	50 %	50 %	148242853
35573	NC_009482	TCA	2	6	1534792	1534797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242853
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35583	NC_009482	GTG	2	6	1535029	1535034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242853
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35600	NC_009482	GCT	2	6	1535501	1535506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242853
35601	NC_009482	GATG	2	8	1535513	1535520	25 %	25 %	50 %	0 %	148242853
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35603	NC_009482	ACCA	2	8	1535562	1535569	50 %	0 %	0 %	50 %	148242853
35604	NC_009482	TGC	2	6	1535585	1535590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242853
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35615	NC_009482	GAA	2	6	1535894	1535899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148242853
35616	NC_009482	GGC	2	6	1535952	1535957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242853
35617	NC_009482	CG	3	6	1535986	1535991	0 %	0 %	50 %	50 %	148242853
35618	NC_009482	AGA	2	6	1536029	1536034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148242853
35619	NC_009482	CTG	2	6	1536081	1536086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242853
35620	NC_009482	GGT	2	6	1536107	1536112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242853
35621	NC_009482	CAC	2	6	1536125	1536130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242853
35622	NC_009482	GCC	2	6	1536135	1536140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242853
35623	NC_009482	GC	3	6	1536152	1536157	0 %	0 %	50 %	50 %	148242853
35624	NC_009482	GAT	2	6	1536176	1536181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242853
35625	NC_009482	CAAG	2	8	1536227	1536234	50 %	0 %	25 %	25 %	148242853
35626	NC_009482	CTT	2	6	1536245	1536250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148242853
35627	NC_009482	CAA	2	6	1536260	1536265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148242853
35628	NC_009482	CGC	2	6	1536270	1536275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242853
35629	NC_009482	GC	3	6	1536317	1536322	0 %	0 %	50 %	50 %	148242853
35630	NC_009482	TGG	2	6	1536325	1536330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242853
35631	NC_009482	CAC	2	6	1536363	1536368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242853
35632	NC_009482	GCT	2	6	1536377	1536382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242853
35633	NC_009482	GCT	2	6	1536443	1536448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242853
35634	NC_009482	TCA	2	6	1536506	1536511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35635	NC_009482	GCC	2	6	1536542	1536547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242854
35636	NC_009482	TCCTC	2	10	1536576	1536585	0 %	40 %	0 %	60 %	148242854
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35638	NC_009482	CGC	2	6	1536650	1536655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242854
35639	NC_009482	T	6	6	1536690	1536695	0 %	100 %	0 %	0 %	148242854
35640	NC_009482	GC	3	6	1536740	1536745	0 %	0 %	50 %	50 %	148242854
35641	NC_009482	GGGC	2	8	1536748	1536755	0 %	0 %	75 %	25 %	148242854
35642	NC_009482	TCAG	2	8	1536776	1536783	25 %	25 %	25 %	25 %	148242854
35643	NC_009482	GTG	2	6	1536795	1536800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242854
35644	NC_009482	ATC	2	6	1536911	1536916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242854
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35646	NC_009482	CAA	2	6	1537027	1537032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148242854
35647	NC_009482	GC	3	6	1537059	1537064	0 %	0 %	50 %	50 %	148242854
35648	NC_009482	AGT	2	6	1537120	1537125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242854
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35650	NC_009482	TG	3	6	1537222	1537227	0 %	50 %	50 %	0 %	148242854
35651	NC_009482	AAG	3	9	1537242	1537250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148242854
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35653	NC_009482	CTGC	2	8	1537339	1537346	0 %	25 %	25 %	50 %	148242854
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35655	NC_009482	CTGG	2	8	1537578	1537585	0 %	25 %	50 %	25 %	148242855
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35666	NC_009482	TGG	2	6	1537994	1537999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242855
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35669	NC_009482	GCC	2	6	1538059	1538064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242855
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35672	NC_009482	CA	3	6	1538183	1538188	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35673	NC_009482	GCATG	2	10	1538219	1538228	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
35674	NC_009482	T	6	6	1538291	1538296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35675	NC_009482	CGA	2	6	1538400	1538405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35676	NC_009482	TACAAC	2	12	1538440	1538451	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35677	NC_009482	GCAA	2	8	1538458	1538465	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
35678	NC_009482	AGC	2	6	1538497	1538502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35679	NC_009482	GAT	2	6	1538516	1538521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242856
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35683	NC_009482	GCT	2	6	1538644	1538649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242856
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35687	NC_009482	TCA	2	6	1538800	1538805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242856
35688	NC_009482	A	6	6	1538874	1538879	100 %	0 %	0 %	0 %	148242856
35689	NC_009482	CTC	2	6	1538884	1538889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148242856
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35704	NC_009482	ATG	2	6	1539338	1539343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242856
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35710	NC_009482	GCT	2	6	1539554	1539559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242856
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35712	NC_009482	GCT	2	6	1539589	1539594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35713	NC_009482	CGG	2	6	1539658	1539663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242857
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35715	NC_009482	GCCG	2	8	1539781	1539788	0 %	0 %	50 %	50 %	148242857
35716	NC_009482	GAA	2	6	1539793	1539798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148242857
35717	NC_009482	CCAATC	2	12	1539846	1539857	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
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35719	NC_009482	ACC	2	6	1540066	1540071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35720	NC_009482	G	6	6	1540092	1540097	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
35721	NC_009482	T	6	6	1540099	1540104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35722	NC_009482	CAGT	2	8	1540140	1540147	25 %	25 %	25 %	25 %	148242858
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35725	NC_009482	CAGC	2	8	1540213	1540220	25 %	0 %	25 %	50 %	148242858
35726	NC_009482	TCT	2	6	1540285	1540290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148242858
35727	NC_009482	TGA	2	6	1540327	1540332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242858
35728	NC_009482	TGA	2	6	1540456	1540461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242858
35729	NC_009482	GCA	2	6	1540492	1540497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242858
35730	NC_009482	GTG	2	6	1540499	1540504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242858
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35732	NC_009482	GCC	2	6	1540577	1540582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242858
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35745	NC_009482	CCG	2	6	1541447	1541452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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35845	NC_009482	CCAG	2	8	1546177	1546184	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35846	NC_009482	GAT	2	6	1546294	1546299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242871
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35848	NC_009482	CAG	2	6	1546457	1546462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35849	NC_009482	TG	3	6	1546477	1546482	0 %	50 %	50 %	0 %	148242872
35850	NC_009482	TTGG	2	8	1546486	1546493	0 %	50 %	50 %	0 %	148242872
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