MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 51524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34003	NC_009482	CTTG	2	8	1472971	1472978	0 %	50 %	25 %	25 %	148242784
34004	NC_009482	ACCCC	2	10	1473022	1473031	20 %	0 %	0 %	80 %	148242784
34005	NC_009482	GCA	2	6	1473108	1473113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242784
34006	NC_009482	GCT	2	6	1473124	1473129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242784
34007	NC_009482	CTA	2	6	1473372	1473377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242784
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34009	NC_009482	C	7	7	1473483	1473489	0 %	0 %	0 %	100 %	148242784
34010	NC_009482	CTG	2	6	1473535	1473540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242785
34011	NC_009482	CCT	2	6	1473608	1473613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148242785
34012	NC_009482	GCT	4	12	1473669	1473680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242785
34013	NC_009482	GCA	2	6	1473699	1473704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242785
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34016	NC_009482	GTTG	2	8	1473920	1473927	0 %	50 %	50 %	0 %	148242785
34017	NC_009482	CGG	2	6	1473964	1473969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242785
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34019	NC_009482	GCCAG	2	10	1474065	1474074	20 %	0 %	40 %	40 %	148242785
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34039	NC_009482	GC	3	6	1475210	1475215	0 %	0 %	50 %	50 %	148242787
34040	NC_009482	GGC	2	6	1475265	1475270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242787
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34045	NC_009482	CAA	2	6	1475464	1475469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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34051	NC_009482	GCA	2	6	1475694	1475699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242789
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34116	NC_009482	AGC	2	6	1477943	1477948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242791
34117	NC_009482	TGC	2	6	1477949	1477954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242791
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34149	NC_009482	CGG	2	6	1479359	1479364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242793
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34151	NC_009482	GGGC	2	8	1479513	1479520	0 %	0 %	75 %	25 %	148242794
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34211	NC_009482	GCA	2	6	1481993	1481998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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34214	NC_009482	CAA	2	6	1482096	1482101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148242796
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34218	NC_009482	CTGC	2	8	1482241	1482248	0 %	25 %	25 %	50 %	148242796
34219	NC_009482	GCT	3	9	1482289	1482297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242796
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34225	NC_009482	GCCCT	2	10	1482711	1482720	0 %	20 %	20 %	60 %	148242797
34226	NC_009482	CGC	2	6	1482746	1482751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242797
34227	NC_009482	GCA	2	6	1482758	1482763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242797
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34230	NC_009482	TGC	2	6	1482804	1482809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242797
34231	NC_009482	TGC	2	6	1482868	1482873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242797
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34337	NC_009482	CAGCG	2	10	1486689	1486698	20 %	0 %	40 %	40 %	148242802
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34343	NC_009482	GCC	2	6	1486967	1486972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242802
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34459	NC_009482	CAG	2	6	1491686	1491691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242806
34460	NC_009482	GATC	2	8	1491721	1491728	25 %	25 %	25 %	25 %	148242806
34461	NC_009482	CCG	2	6	1491762	1491767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242806
34462	NC_009482	GCCT	2	8	1491887	1491894	0 %	25 %	25 %	50 %	148242806
34463	NC_009482	AGC	2	6	1491922	1491927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242806
34464	NC_009482	AGC	2	6	1492124	1492129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242806
34465	NC_009482	GC	3	6	1492144	1492149	0 %	0 %	50 %	50 %	148242806
34466	NC_009482	GC	3	6	1492164	1492169	0 %	0 %	50 %	50 %	148242806
34467	NC_009482	TGC	2	6	1492188	1492193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242806
34468	NC_009482	AGC	3	9	1492238	1492246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242806
34469	NC_009482	GAA	2	6	1492247	1492252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148242806
34470	NC_009482	GCA	2	6	1492312	1492317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242806
34471	NC_009482	CCA	2	6	1492350	1492355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242806
34472	NC_009482	CCG	3	9	1492386	1492394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242806
34473	NC_009482	CTG	2	6	1492401	1492406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242806
34474	NC_009482	ATTG	2	8	1492408	1492415	25 %	50 %	25 %	0 %	148242806
34475	NC_009482	CAGC	2	8	1492429	1492436	25 %	0 %	25 %	50 %	148242806
34476	NC_009482	CTG	3	9	1492463	1492471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242806
34477	NC_009482	C	6	6	1492479	1492484	0 %	0 %	0 %	100 %	148242806
34478	NC_009482	GGA	2	6	1492531	1492536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148242806
34479	NC_009482	CTG	2	6	1492547	1492552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242806
34480	NC_009482	GCT	2	6	1492579	1492584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242806
34481	NC_009482	GGCC	2	8	1492651	1492658	0 %	0 %	50 %	50 %	148242806
34482	NC_009482	GGAGCT	2	12	1492711	1492722	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148242806
34483	NC_009482	CAG	2	6	1492723	1492728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242806
34484	NC_009482	GAG	2	6	1492772	1492777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148242806
34485	NC_009482	CGA	2	6	1492789	1492794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242806
34486	NC_009482	GCT	2	6	1492801	1492806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242806
34487	NC_009482	A	6	6	1492853	1492858	100 %	0 %	0 %	0 %	148242806
34488	NC_009482	GCTGA	2	10	1492902	1492911	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
34489	NC_009482	GGC	2	6	1492944	1492949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242807
34490	NC_009482	CGC	2	6	1493056	1493061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242807
34491	NC_009482	CTG	2	6	1493065	1493070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242807
34492	NC_009482	GGT	2	6	1493091	1493096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242807
34493	NC_009482	GTG	2	6	1493143	1493148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242807
34494	NC_009482	CAG	2	6	1493167	1493172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242807
34495	NC_009482	TCA	2	6	1493174	1493179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242807
34496	NC_009482	GAG	2	6	1493191	1493196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148242807
34497	NC_009482	TTG	2	6	1493198	1493203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148242807
34498	NC_009482	GTG	2	6	1493257	1493262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242807
34499	NC_009482	GGCC	2	8	1493268	1493275	0 %	0 %	50 %	50 %	148242807
34500	NC_009482	ACC	2	6	1493293	1493298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242807

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