MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 51524

< Previous12...6364656667686970717273...103104Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33501	NC_009482	GGT	2	6	1451186	1451191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242756
33502	NC_009482	TCC	2	6	1451208	1451213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148242756
33503	NC_009482	ACA	2	6	1451316	1451321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148242756
33504	NC_009482	GGC	2	6	1451349	1451354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242756
33505	NC_009482	GC	3	6	1451438	1451443	0 %	0 %	50 %	50 %	148242757
33506	NC_009482	CTG	2	6	1451458	1451463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242757
33507	NC_009482	TGG	2	6	1451474	1451479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242757
33508	NC_009482	GCC	2	6	1451545	1451550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242757
33509	NC_009482	CTG	2	6	1451650	1451655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242757
33510	NC_009482	GGC	2	6	1451691	1451696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242757
33511	NC_009482	CTG	2	6	1451713	1451718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242757
33512	NC_009482	GCT	2	6	1451721	1451726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242757
33513	NC_009482	GCC	2	6	1451754	1451759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242757
33514	NC_009482	CTG	2	6	1451772	1451777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242757
33515	NC_009482	TCAA	2	8	1451854	1451861	50 %	25 %	0 %	25 %	148242758
33516	NC_009482	A	6	6	1451860	1451865	100 %	0 %	0 %	0 %	148242758
33517	NC_009482	GAC	2	6	1451875	1451880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242758
33518	NC_009482	ATC	2	6	1452013	1452018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242758
33519	NC_009482	GCA	2	6	1452042	1452047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242758
33520	NC_009482	CTG	2	6	1452079	1452084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242758
33521	NC_009482	CAC	2	6	1452138	1452143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242758
33522	NC_009482	GC	3	6	1452168	1452173	0 %	0 %	50 %	50 %	148242758
33523	NC_009482	CCT	2	6	1452195	1452200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148242758
33524	NC_009482	GAGC	2	8	1452209	1452216	25 %	0 %	50 %	25 %	148242758
33525	NC_009482	CCA	2	6	1452225	1452230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242758
33526	NC_009482	ATGG	2	8	1452232	1452239	25 %	25 %	50 %	0 %	148242758
33527	NC_009482	AGG	2	6	1452299	1452304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148242758
33528	NC_009482	CCA	2	6	1452465	1452470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242759
33529	NC_009482	GCT	2	6	1452720	1452725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242759
33530	NC_009482	CCA	2	6	1452780	1452785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242759
33531	NC_009482	GCA	2	6	1452805	1452810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242759
33532	NC_009482	GC	3	6	1452821	1452826	0 %	0 %	50 %	50 %	148242759
33533	NC_009482	GCA	2	6	1452861	1452866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242759
33534	NC_009482	GC	3	6	1452932	1452937	0 %	0 %	50 %	50 %	148242759
33535	NC_009482	TGATC	2	10	1452945	1452954	20 %	40 %	20 %	20 %	148242759
33536	NC_009482	GTT	2	6	1452964	1452969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148242759
33537	NC_009482	CAC	2	6	1452973	1452978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242759
33538	NC_009482	GCA	2	6	1453014	1453019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242759
33539	NC_009482	TCC	2	6	1453040	1453045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148242759
33540	NC_009482	CAA	2	6	1453057	1453062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148242759
33541	NC_009482	CAG	2	6	1453111	1453116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242759
33542	NC_009482	AGCC	2	8	1453131	1453138	25 %	0 %	25 %	50 %	148242759
33543	NC_009482	CAG	2	6	1453144	1453149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242759
33544	NC_009482	CCA	2	6	1453209	1453214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242759
33545	NC_009482	TGG	2	6	1453239	1453244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242759
33546	NC_009482	GCA	2	6	1453272	1453277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242759
33547	NC_009482	CGT	3	9	1453320	1453328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242759
33548	NC_009482	TGC	2	6	1453352	1453357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242759
33549	NC_009482	TGG	2	6	1453365	1453370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242759
33550	NC_009482	GCT	2	6	1453413	1453418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242759
33551	NC_009482	CCA	2	6	1453470	1453475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242759
33552	NC_009482	GTT	2	6	1453560	1453565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148242760
33553	NC_009482	CTG	2	6	1453618	1453623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242760
33554	NC_009482	CTG	2	6	1453780	1453785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242760
33555	NC_009482	CCG	2	6	1453835	1453840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242760
33556	NC_009482	CAG	2	6	1453860	1453865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242760
33557	NC_009482	GGC	2	6	1454112	1454117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242760
33558	NC_009482	TGCTG	2	10	1454118	1454127	0 %	40 %	40 %	20 %	148242760
33559	NC_009482	GCT	2	6	1454137	1454142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242760
33560	NC_009482	ATC	2	6	1454155	1454160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242760
33561	NC_009482	CTG	2	6	1454202	1454207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242760
33562	NC_009482	CTA	2	6	1454220	1454225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242760
33563	NC_009482	CA	3	6	1454235	1454240	50 %	0 %	0 %	50 %	148242760
33564	NC_009482	CAC	2	6	1454327	1454332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162138547
33565	NC_009482	CTC	2	6	1454462	1454467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162138547
33566	NC_009482	TCC	2	6	1454502	1454507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162138547
33567	NC_009482	CAG	2	6	1454561	1454566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162138547
33568	NC_009482	CGGC	2	8	1454571	1454578	0 %	0 %	50 %	50 %	162138547
33569	NC_009482	GA	3	6	1454625	1454630	50 %	0 %	50 %	0 %	162138547
33570	NC_009482	CAC	2	6	1454768	1454773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162138547
33571	NC_009482	GGT	2	6	1454885	1454890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162138547
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33573	NC_009482	CGG	2	6	1454997	1455002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162138547
33574	NC_009482	TTG	2	6	1455003	1455008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162138547
33575	NC_009482	CAG	2	6	1455044	1455049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162138547
33576	NC_009482	TGC	2	6	1455149	1455154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242762
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33578	NC_009482	GGCT	2	8	1455176	1455183	0 %	25 %	50 %	25 %	148242762
33579	NC_009482	GTC	2	6	1455187	1455192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242762
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33581	NC_009482	GCT	2	6	1455201	1455206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242762
33582	NC_009482	GGGCT	2	10	1455223	1455232	0 %	20 %	60 %	20 %	148242762
33583	NC_009482	CTG	2	6	1455382	1455387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242762
33584	NC_009482	AGTTG	2	10	1455455	1455464	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
33585	NC_009482	GAG	2	6	1455507	1455512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148242763
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33587	NC_009482	GAA	2	6	1455615	1455620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148242763
33588	NC_009482	CAA	2	6	1455695	1455700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148242763
33589	NC_009482	GTG	2	6	1455726	1455731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242763
33590	NC_009482	CGG	2	6	1455746	1455751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242763
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33592	NC_009482	CAG	2	6	1455944	1455949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33593	NC_009482	CCT	2	6	1456003	1456008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33594	NC_009482	TCC	2	6	1456068	1456073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33595	NC_009482	TGT	2	6	1456158	1456163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148242764
33596	NC_009482	TCA	2	6	1456356	1456361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33597	NC_009482	T	7	7	1456399	1456405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33598	NC_009482	A	6	6	1456412	1456417	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33599	NC_009482	CAA	2	6	1456433	1456438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33600	NC_009482	TCC	2	6	1456479	1456484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33601	NC_009482	CAG	2	6	1456551	1456556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33602	NC_009482	CGG	2	6	1456611	1456616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33603	NC_009482	CGCA	2	8	1456720	1456727	25 %	0 %	25 %	50 %	148242765
33604	NC_009482	CGG	2	6	1456728	1456733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242765
33605	NC_009482	CG	3	6	1456750	1456755	0 %	0 %	50 %	50 %	148242765
33606	NC_009482	GGC	2	6	1456763	1456768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242765
33607	NC_009482	TGC	2	6	1456776	1456781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242765
33608	NC_009482	GCA	2	6	1456806	1456811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242765
33609	NC_009482	AGCG	2	8	1456889	1456896	25 %	0 %	50 %	25 %	148242765
33610	NC_009482	AGC	2	6	1456902	1456907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242765
33611	NC_009482	CAA	2	6	1456922	1456927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148242765
33612	NC_009482	CTG	2	6	1456928	1456933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242765
33613	NC_009482	CAA	2	6	1457005	1457010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148242765
33614	NC_009482	GCGCG	2	10	1457146	1457155	0 %	0 %	60 %	40 %	148242765
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33616	NC_009482	GCG	2	6	1457181	1457186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242765
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33730	NC_009482	GCG	2	6	1461829	1461834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242768
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33843	NC_009482	CCA	2	6	1465864	1465869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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