MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 51524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33001	NC_009482	ACA	2	6	1430280	1430285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148242732
33002	NC_009482	ACA	2	6	1430394	1430399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148242732
33003	NC_009482	TTGGTC	2	12	1430414	1430425	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	148242732
33004	NC_009482	CGC	2	6	1430428	1430433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242732
33005	NC_009482	TGCC	2	8	1430502	1430509	0 %	25 %	25 %	50 %	148242732
33006	NC_009482	TCG	2	6	1430583	1430588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242732
33007	NC_009482	CTGC	2	8	1430647	1430654	0 %	25 %	25 %	50 %	148242732
33008	NC_009482	ATC	2	6	1430699	1430704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242732
33009	NC_009482	GTG	2	6	1430709	1430714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242732
33010	NC_009482	CAA	2	6	1430749	1430754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148242732
33011	NC_009482	TTC	2	6	1430768	1430773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148242732
33012	NC_009482	GCG	2	6	1430817	1430822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242732
33013	NC_009482	CTA	2	6	1430839	1430844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242732
33014	NC_009482	GGCC	2	8	1430860	1430867	0 %	0 %	50 %	50 %	148242732
33015	NC_009482	ACA	2	6	1430880	1430885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148242732
33016	NC_009482	GTG	2	6	1430909	1430914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242732
33017	NC_009482	CCCA	2	8	1430924	1430931	25 %	0 %	0 %	75 %	148242732
33018	NC_009482	CAA	2	6	1431073	1431078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148242732
33019	NC_009482	CAA	2	6	1431158	1431163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148242732
33020	NC_009482	TGA	2	6	1431165	1431170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242732
33021	NC_009482	CCGA	2	8	1431227	1431234	25 %	0 %	25 %	50 %	148242733
33022	NC_009482	GCC	2	6	1431276	1431281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242733
33023	NC_009482	GT	3	6	1431283	1431288	0 %	50 %	50 %	0 %	148242733
33024	NC_009482	GCT	2	6	1431360	1431365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242733
33025	NC_009482	TGA	2	6	1431368	1431373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242733
33026	NC_009482	CAG	2	6	1431374	1431379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242733
33027	NC_009482	GCC	2	6	1431383	1431388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242733
33028	NC_009482	AACC	2	8	1431395	1431402	50 %	0 %	0 %	50 %	148242733
33029	NC_009482	ACA	2	6	1431434	1431439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148242733
33030	NC_009482	AGC	2	6	1431446	1431451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242733
33031	NC_009482	CTG	2	6	1431493	1431498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242733
33032	NC_009482	TGC	3	9	1431515	1431523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242733
33033	NC_009482	GCA	2	6	1431542	1431547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242733
33034	NC_009482	CAG	2	6	1431624	1431629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242733
33035	NC_009482	GTC	2	6	1431733	1431738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242733
33036	NC_009482	ACG	2	6	1431761	1431766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242733
33037	NC_009482	CTGC	2	8	1431798	1431805	0 %	25 %	25 %	50 %	148242733
33038	NC_009482	TGG	2	6	1431836	1431841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242733
33039	NC_009482	ATC	2	6	1431850	1431855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242733
33040	NC_009482	TTC	2	6	1431919	1431924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148242733
33041	NC_009482	CGC	2	6	1431935	1431940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242733
33042	NC_009482	CAA	2	6	1432032	1432037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148242733
33043	NC_009482	CAG	2	6	1432109	1432114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242733
33044	NC_009482	CAG	3	9	1432166	1432174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242733
33045	NC_009482	AACA	2	8	1432297	1432304	75 %	0 %	0 %	25 %	148242733
33046	NC_009482	TGC	2	6	1432384	1432389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242734
33047	NC_009482	TGC	2	6	1432510	1432515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242734
33048	NC_009482	TGGC	2	8	1432562	1432569	0 %	25 %	50 %	25 %	148242734
33049	NC_009482	TCA	2	6	1432660	1432665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242734
33050	NC_009482	TTC	2	6	1432753	1432758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148242734
33051	NC_009482	CGGC	2	8	1432784	1432791	0 %	0 %	50 %	50 %	148242734
33052	NC_009482	GGA	2	6	1432831	1432836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148242734
33053	NC_009482	CTG	2	6	1432879	1432884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242734
33054	NC_009482	GGT	2	6	1432907	1432912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242734
33055	NC_009482	GAT	2	6	1432989	1432994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242734
33056	NC_009482	TGG	2	6	1433047	1433052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242734
33057	NC_009482	CTG	2	6	1433053	1433058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242734
33058	NC_009482	ACG	2	6	1433069	1433074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242734
33059	NC_009482	GCC	2	6	1433080	1433085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242734
33060	NC_009482	GGC	2	6	1433125	1433130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242734
33061	NC_009482	CCG	2	6	1433175	1433180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242734
33062	NC_009482	CAG	2	6	1433267	1433272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242734
33063	NC_009482	CAGC	2	8	1433386	1433393	25 %	0 %	25 %	50 %	148242734
33064	NC_009482	C	6	6	1433449	1433454	0 %	0 %	0 %	100 %	148242734
33065	NC_009482	AGG	2	6	1433519	1433524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148242734
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33068	NC_009482	AGC	2	6	1433771	1433776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242734
33069	NC_009482	TGC	2	6	1433800	1433805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242734
33070	NC_009482	GCT	3	9	1433822	1433830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242734
33071	NC_009482	AGG	2	6	1433902	1433907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148242735
33072	NC_009482	TTG	2	6	1434067	1434072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148242735
33073	NC_009482	TCA	2	6	1434077	1434082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242735
33074	NC_009482	AAG	2	6	1434091	1434096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148242735
33075	NC_009482	GTG	2	6	1434097	1434102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242735
33076	NC_009482	TGC	2	6	1434104	1434109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242735
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33082	NC_009482	CCAA	2	8	1434636	1434643	50 %	0 %	0 %	50 %	148242735
33083	NC_009482	CGC	2	6	1434644	1434649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242735
33084	NC_009482	CAAT	2	8	1434711	1434718	50 %	25 %	0 %	25 %	148242735
33085	NC_009482	GCA	2	6	1434720	1434725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242735
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33087	NC_009482	AGG	2	6	1434755	1434760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148242735
33088	NC_009482	AAG	2	6	1434763	1434768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148242735
33089	NC_009482	AAG	2	6	1434899	1434904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148242735
33090	NC_009482	AGC	2	6	1434937	1434942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242736
33091	NC_009482	CGCTT	2	10	1434987	1434996	0 %	40 %	20 %	40 %	148242736
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33094	NC_009482	GTG	2	6	1435035	1435040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242736
33095	NC_009482	TGATCG	2	12	1435042	1435053	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148242736
33096	NC_009482	CCT	2	6	1435081	1435086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148242736
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33098	NC_009482	GCT	2	6	1435184	1435189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242736
33099	NC_009482	GGT	2	6	1435211	1435216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242736
33100	NC_009482	GCCAAG	2	12	1435318	1435329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242736
33101	NC_009482	AGG	2	6	1435330	1435335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33102	NC_009482	TAG	2	6	1435350	1435355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33103	NC_009482	GAG	2	6	1435388	1435393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33104	NC_009482	ACC	2	6	1435398	1435403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33105	NC_009482	GCC	2	6	1435424	1435429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33106	NC_009482	A	6	6	1435471	1435476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33107	NC_009482	GAA	2	6	1435533	1435538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148242737
33108	NC_009482	CAA	2	6	1435591	1435596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148242737
33109	NC_009482	AGCA	2	8	1435600	1435607	50 %	0 %	25 %	25 %	148242737
33110	NC_009482	ACT	2	6	1435673	1435678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242737
33111	NC_009482	GAT	2	6	1435684	1435689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242737
33112	NC_009482	ACT	2	6	1435719	1435724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242737
33113	NC_009482	CAA	2	6	1435764	1435769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148242737
33114	NC_009482	CAA	2	6	1435834	1435839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33115	NC_009482	CA	3	6	1435876	1435881	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33116	NC_009482	CAA	2	6	1435883	1435888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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33232	NC_009482	TGA	2	6	1440152	1440157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242743
33233	NC_009482	ACT	2	6	1440170	1440175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242743
33234	NC_009482	GCT	2	6	1440218	1440223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242743
33235	NC_009482	GCT	2	6	1440266	1440271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242743
33236	NC_009482	ACG	4	12	1440295	1440306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242743
33237	NC_009482	GCA	2	6	1440419	1440424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242743
33238	NC_009482	GCC	2	6	1440444	1440449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242743
33239	NC_009482	GCA	2	6	1440497	1440502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242743
33240	NC_009482	GCG	2	6	1440549	1440554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242743
33241	NC_009482	CCACC	2	10	1440557	1440566	20 %	0 %	0 %	80 %	148242743
33242	NC_009482	CTG	2	6	1440579	1440584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242743
33243	NC_009482	GTT	2	6	1440593	1440598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148242743
33244	NC_009482	GCA	2	6	1440641	1440646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242743
33245	NC_009482	AACTC	2	10	1440657	1440666	40 %	20 %	0 %	40 %	148242743
33246	NC_009482	GCT	2	6	1440696	1440701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242743
33247	NC_009482	ATCG	2	8	1440870	1440877	25 %	25 %	25 %	25 %	148242744
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33249	NC_009482	GCA	2	6	1440920	1440925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242744
33250	NC_009482	GGTT	2	8	1441004	1441011	0 %	50 %	50 %	0 %	148242744
33251	NC_009482	CGC	2	6	1441029	1441034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242744
33252	NC_009482	CAG	3	9	1441041	1441049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242744
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33254	NC_009482	CTG	2	6	1441176	1441181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242745
33255	NC_009482	GCTG	2	8	1441183	1441190	0 %	25 %	50 %	25 %	148242745
33256	NC_009482	GAA	2	6	1441266	1441271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148242745
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33259	NC_009482	CTG	2	6	1441371	1441376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242745
33260	NC_009482	GCC	2	6	1441389	1441394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242745
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33262	NC_009482	CTGGC	2	10	1441509	1441518	0 %	20 %	40 %	40 %	148242745
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33266	NC_009482	GCA	2	6	1441823	1441828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242745
33267	NC_009482	TGA	2	6	1441913	1441918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242745
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33304	NC_009482	GGCC	2	8	1443391	1443398	0 %	0 %	50 %	50 %	148242746
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33307	NC_009482	GCG	2	6	1443470	1443475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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33312	NC_009482	GGC	2	6	1443627	1443632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242747
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33337	NC_009482	CGC	2	6	1444901	1444906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242748
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33340	NC_009482	GGC	2	6	1444991	1444996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242748
33341	NC_009482	TGA	2	6	1445025	1445030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242748
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33347	NC_009482	G	6	6	1445233	1445238	0 %	0 %	100 %	0 %	148242748
33348	NC_009482	CTG	2	6	1445292	1445297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242748
33349	NC_009482	G	6	6	1445317	1445322	0 %	0 %	100 %	0 %	148242748
33350	NC_009482	CCTC	2	8	1445352	1445359	0 %	25 %	0 %	75 %	148242748
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33497	NC_009482	TCA	2	6	1451100	1451105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148242756
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