MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 51524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22002	NC_009482	CAG	2	6	938677	938682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22003	NC_009482	TGA	2	6	938730	938735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22004	NC_009482	CTC	2	6	938776	938781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22005	NC_009482	GC	3	6	938843	938848	0 %	0 %	50 %	50 %	148242126
22006	NC_009482	CAC	3	9	938900	938908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242126
22007	NC_009482	CGTG	2	8	938944	938951	0 %	25 %	50 %	25 %	148242126
22008	NC_009482	CAC	2	6	938983	938988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148242126
22009	NC_009482	CGAT	2	8	939050	939057	25 %	25 %	25 %	25 %	148242126
22010	NC_009482	GC	3	6	939104	939109	0 %	0 %	50 %	50 %	148242126
22011	NC_009482	CAG	2	6	939133	939138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242126
22012	NC_009482	GAC	2	6	939154	939159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242126
22013	NC_009482	ACG	2	6	939182	939187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242127
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22017	NC_009482	GCT	2	6	939411	939416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242127
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22031	NC_009482	TGA	2	6	939885	939890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148242128
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22053	NC_009482	GAAT	2	8	940880	940887	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22054	NC_009482	CAGC	2	8	940927	940934	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22055	NC_009482	TGA	3	9	940961	940969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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22057	NC_009482	TCG	2	6	941083	941088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242130
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22090	NC_009482	TGAT	2	8	942670	942677	25 %	50 %	25 %	0 %	148242133
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22099	NC_009482	TGG	2	6	943055	943060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242135
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22116	NC_009482	C	6	6	943884	943889	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
22117	NC_009482	GGGC	2	8	943904	943911	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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22122	NC_009482	CAG	2	6	944181	944186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22123	NC_009482	GCTC	2	8	944191	944198	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22124	NC_009482	CAG	3	9	944221	944229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22125	NC_009482	GCA	2	6	944231	944236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22126	NC_009482	AAC	2	6	944300	944305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22127	NC_009482	GCG	2	6	944308	944313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22128	NC_009482	CTG	2	6	944319	944324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22129	NC_009482	A	7	7	944390	944396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22130	NC_009482	CAG	2	6	944497	944502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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22132	NC_009482	TGC	2	6	944605	944610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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22136	NC_009482	CAG	2	6	944958	944963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242139
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22144	NC_009482	GAC	2	6	945296	945301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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22147	NC_009482	AGCG	2	8	945356	945363	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22148	NC_009482	GCTC	2	8	945386	945393	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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22162	NC_009482	GCTG	2	8	946107	946114	0 %	25 %	50 %	25 %	148242142
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22233	NC_009482	CCG	2	6	948635	948640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148242145
22234	NC_009482	AACGC	2	10	948641	948650	40 %	0 %	20 %	40 %	148242145
22235	NC_009482	TGT	2	6	948651	948656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148242145
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22241	NC_009482	GGAA	2	8	948873	948880	50 %	0 %	50 %	0 %	148242145
22242	NC_009482	CACC	2	8	948888	948895	25 %	0 %	0 %	75 %	148242145
22243	NC_009482	TG	3	6	948995	949000	0 %	50 %	50 %	0 %	148242145
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22245	NC_009482	CTG	2	6	949096	949101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242145
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22364	NC_009482	TGG	2	6	954604	954609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242153
22365	NC_009482	AGC	2	6	954617	954622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242153
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22394	NC_009482	AGCTC	2	10	955751	955760	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
22395	NC_009482	TGC	2	6	955818	955823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242155
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22399	NC_009482	T	6	6	956111	956116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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22424	NC_009482	G	6	6	957480	957485	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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22469	NC_009482	GTT	2	6	959348	959353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148242164
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22473	NC_009482	GCG	2	6	959506	959511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22474	NC_009482	CTTTTT	2	12	959582	959593	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	148242165
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22482	NC_009482	GGA	2	6	959978	959983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148242166
22483	NC_009482	TGC	2	6	960010	960015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242166
22484	NC_009482	CAG	2	6	960021	960026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148242166
22485	NC_009482	TTGG	2	8	960063	960070	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22486	NC_009482	TCT	2	6	960073	960078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22487	NC_009482	CGT	2	6	960092	960097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22488	NC_009482	T	6	6	960102	960107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22489	NC_009482	GCTTG	2	10	960134	960143	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22490	NC_009482	C	6	6	960157	960162	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
22491	NC_009482	G	6	6	960168	960173	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
22492	NC_009482	GTGA	2	8	960176	960183	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22493	NC_009482	GTG	2	6	960220	960225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242167
22494	NC_009482	GTTG	2	8	960299	960306	0 %	50 %	50 %	0 %	148242167
22495	NC_009482	CGG	2	6	960325	960330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148242167
22496	NC_009482	CAA	2	6	960331	960336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148242167
22497	NC_009482	GGT	2	6	960356	960361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148242167
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22499	NC_009482	ATGG	2	8	960377	960384	25 %	25 %	50 %	0 %	148242167
22500	NC_009482	CTG	2	6	960401	960406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148242167

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