MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 51524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_009482	TGG	2	6	681702	681707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241852
16003	NC_009482	GCC	2	6	681790	681795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241852
16004	NC_009482	GTGA	2	8	681797	681804	25 %	25 %	50 %	0 %	148241852
16005	NC_009482	AGC	2	6	681809	681814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241852
16006	NC_009482	CAC	2	6	681845	681850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241852
16007	NC_009482	GGT	2	6	681859	681864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241852
16008	NC_009482	G	6	6	681872	681877	0 %	0 %	100 %	0 %	148241852
16009	NC_009482	TGC	2	6	681882	681887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241852
16010	NC_009482	CAG	2	6	681922	681927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241852
16011	NC_009482	CCG	2	6	681932	681937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241852
16012	NC_009482	CTG	2	6	681938	681943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241852
16013	NC_009482	GAC	2	6	681956	681961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241852
16014	NC_009482	GGT	2	6	681976	681981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241852
16015	NC_009482	GGA	2	6	681988	681993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241852
16016	NC_009482	AAG	2	6	682011	682016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148241852
16017	NC_009482	GCG	2	6	682108	682113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241852
16018	NC_009482	CGG	2	6	682179	682184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241852
16019	NC_009482	GCAG	2	8	682394	682401	25 %	0 %	50 %	25 %	148241852
16020	NC_009482	GGC	2	6	682407	682412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241852
16021	NC_009482	CAGC	2	8	682468	682475	25 %	0 %	25 %	50 %	148241852
16022	NC_009482	TGC	2	6	682503	682508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241852
16023	NC_009482	GCA	2	6	682566	682571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241852
16024	NC_009482	GCA	2	6	682612	682617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241852
16025	NC_009482	GGA	2	6	682618	682623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241852
16026	NC_009482	TGGT	2	8	682676	682683	0 %	50 %	50 %	0 %	148241852
16027	NC_009482	GCA	2	6	682720	682725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241852
16028	NC_009482	GCT	2	6	682821	682826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241853
16029	NC_009482	CAG	2	6	682857	682862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241853
16030	NC_009482	CTG	2	6	682872	682877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241853
16031	NC_009482	CAG	3	9	682908	682916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241853
16032	NC_009482	TGC	2	6	682919	682924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241853
16033	NC_009482	CAG	2	6	682959	682964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241853
16034	NC_009482	TGA	2	6	682972	682977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241853
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16036	NC_009482	GCGGT	2	10	683045	683054	0 %	20 %	60 %	20 %	148241853
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16039	NC_009482	CAG	2	6	683169	683174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241853
16040	NC_009482	CGG	2	6	683180	683185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241853
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16042	NC_009482	CAG	2	6	683319	683324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241853
16043	NC_009482	TGC	2	6	683330	683335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241853
16044	NC_009482	CAG	5	15	683337	683351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241853
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16048	NC_009482	CAG	2	6	683606	683611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241854
16049	NC_009482	GATC	2	8	683614	683621	25 %	25 %	25 %	25 %	148241854
16050	NC_009482	CA	3	6	683682	683687	50 %	0 %	0 %	50 %	148241854
16051	NC_009482	TGG	2	6	683719	683724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241854
16052	NC_009482	GCA	2	6	683905	683910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241854
16053	NC_009482	CTA	2	6	683922	683927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241854
16054	NC_009482	GGC	2	6	683935	683940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241854
16055	NC_009482	AGC	2	6	683973	683978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241854
16056	NC_009482	GGC	2	6	684003	684008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16057	NC_009482	CTG	2	6	684025	684030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16058	NC_009482	GGT	2	6	684112	684117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241855
16059	NC_009482	GCGAC	2	10	684119	684128	20 %	0 %	40 %	40 %	148241855
16060	NC_009482	G	6	6	684158	684163	0 %	0 %	100 %	0 %	148241855
16061	NC_009482	CAC	2	6	684173	684178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241855
16062	NC_009482	TCG	2	6	684203	684208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241855
16063	NC_009482	CAGC	2	8	684254	684261	25 %	0 %	25 %	50 %	148241855
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16072	NC_009482	GCGGT	2	10	684643	684652	0 %	20 %	60 %	20 %	148241856
16073	NC_009482	GGCC	2	8	684695	684702	0 %	0 %	50 %	50 %	148241856
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16089	NC_009482	GGCT	2	8	685391	685398	0 %	25 %	50 %	25 %	148241856
16090	NC_009482	CCA	3	9	685400	685408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241856
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16102	NC_009482	TGG	2	6	685874	685879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241857
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16239	NC_009482	GGT	2	6	692223	692228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241862
16240	NC_009482	TGA	2	6	692265	692270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241862
16241	NC_009482	CGG	2	6	692271	692276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241862
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16244	NC_009482	GCT	2	6	692440	692445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241862
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16274	NC_009482	GCA	2	6	693595	693600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241863
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16282	NC_009482	CACC	2	8	693894	693901	25 %	0 %	0 %	75 %	148241863
16283	NC_009482	TGG	2	6	693987	693992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241863
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16478	NC_009482	TGA	2	6	702871	702876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241871
16479	NC_009482	GCC	2	6	702890	702895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241871
16480	NC_009482	CTG	2	6	702905	702910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241871
16481	NC_009482	TCCC	2	8	702934	702941	0 %	25 %	0 %	75 %	148241871
16482	NC_009482	CAG	2	6	702977	702982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241872
16483	NC_009482	GGTGG	2	10	703002	703011	0 %	20 %	80 %	0 %	148241872
16484	NC_009482	GC	3	6	703041	703046	0 %	0 %	50 %	50 %	148241872
16485	NC_009482	GCC	2	6	703066	703071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241872
16486	NC_009482	CGC	2	6	703072	703077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241872
16487	NC_009482	CG	3	6	703145	703150	0 %	0 %	50 %	50 %	148241872
16488	NC_009482	TTG	2	6	703158	703163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241872
16489	NC_009482	GCT	2	6	703175	703180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241872
16490	NC_009482	CACGGC	2	12	703199	703210	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148241872
16491	NC_009482	GTCGCT	2	12	703214	703225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241872
16492	NC_009482	G	7	7	703226	703232	0 %	0 %	100 %	0 %	148241872
16493	NC_009482	GCT	2	6	703259	703264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241872
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16495	NC_009482	GCT	2	6	703339	703344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241872
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