MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 51524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_009482	TGA	2	6	579213	579218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241737
13502	NC_009482	CG	3	6	579228	579233	0 %	0 %	50 %	50 %	148241737
13503	NC_009482	ACA	2	6	579281	579286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148241737
13504	NC_009482	TTC	2	6	579330	579335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241738
13505	NC_009482	GTC	2	6	579345	579350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241738
13506	NC_009482	CAG	3	9	579381	579389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241738
13507	NC_009482	GGC	2	6	579397	579402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241738
13508	NC_009482	GCA	2	6	579440	579445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241738
13509	NC_009482	CGCT	2	8	579471	579478	0 %	25 %	25 %	50 %	148241738
13510	NC_009482	TGC	2	6	579488	579493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241738
13511	NC_009482	CAC	2	6	579498	579503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241738
13512	NC_009482	GCA	2	6	579545	579550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241738
13513	NC_009482	TGG	2	6	579554	579559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241738
13514	NC_009482	GCA	2	6	579581	579586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241738
13515	NC_009482	TTG	2	6	579591	579596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241738
13516	NC_009482	GCG	2	6	579722	579727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241739
13517	NC_009482	CGG	2	6	579741	579746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241739
13518	NC_009482	TGCGCA	2	12	579757	579768	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148241739
13519	NC_009482	GCC	2	6	579977	579982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241740
13520	NC_009482	GGA	2	6	580029	580034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241740
13521	NC_009482	CGT	2	6	580069	580074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241740
13522	NC_009482	CGC	2	6	580088	580093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241740
13523	NC_009482	TTC	2	6	580103	580108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241740
13524	NC_009482	AG	3	6	580151	580156	50 %	0 %	50 %	0 %	148241740
13525	NC_009482	TCGAA	2	10	580180	580189	40 %	20 %	20 %	20 %	148241740
13526	NC_009482	AAG	2	6	580254	580259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148241740
13527	NC_009482	GCG	2	6	580268	580273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241740
13528	NC_009482	GCT	2	6	580336	580341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241740
13529	NC_009482	CGA	2	6	580405	580410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241740
13530	NC_009482	TGC	2	6	580412	580417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241740
13531	NC_009482	TTG	2	6	580459	580464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13532	NC_009482	TTG	2	6	580689	580694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241741
13533	NC_009482	GGA	2	6	580695	580700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241741
13534	NC_009482	CGT	2	6	580735	580740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241741
13535	NC_009482	TGG	2	6	580840	580845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241741
13536	NC_009482	AGG	2	6	580855	580860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241741
13537	NC_009482	TGA	2	6	580879	580884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241741
13538	NC_009482	GTT	2	6	580988	580993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241741
13539	NC_009482	C	6	6	581088	581093	0 %	0 %	0 %	100 %	148241741
13540	NC_009482	CGG	2	6	581190	581195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13541	NC_009482	CTG	2	6	581339	581344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241742
13542	NC_009482	CAG	2	6	581351	581356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241742
13543	NC_009482	CCATC	2	10	581364	581373	20 %	20 %	0 %	60 %	148241742
13544	NC_009482	CGC	2	6	581382	581387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241742
13545	NC_009482	GTT	2	6	581468	581473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241742
13546	NC_009482	GCG	2	6	581520	581525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241742
13547	NC_009482	GGT	2	6	581540	581545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241742
13548	NC_009482	GCC	2	6	581611	581616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241743
13549	NC_009482	GGCT	2	8	581690	581697	0 %	25 %	50 %	25 %	148241743
13550	NC_009482	CGCGC	2	10	581733	581742	0 %	0 %	40 %	60 %	148241743
13551	NC_009482	CCA	2	6	581766	581771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241743
13552	NC_009482	GCC	2	6	581864	581869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241743
13553	NC_009482	GCT	2	6	581884	581889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241743
13554	NC_009482	CAG	2	6	582004	582009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241743
13555	NC_009482	GTT	2	6	582019	582024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241743
13556	NC_009482	CGG	2	6	582084	582089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241743
13557	NC_009482	CCA	2	6	582138	582143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241743
13558	NC_009482	CGCAGC	2	12	582161	582172	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148241743
13559	NC_009482	GCC	2	6	582208	582213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241743
13560	NC_009482	GCA	2	6	582228	582233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241743
13561	NC_009482	ACA	2	6	582234	582239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148241743
13562	NC_009482	TCC	2	6	582254	582259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148241743
13563	NC_009482	ACC	2	6	582278	582283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241743
13564	NC_009482	GCGG	2	8	582289	582296	0 %	0 %	75 %	25 %	148241743
13565	NC_009482	GGC	2	6	582348	582353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241743
13566	NC_009482	GTG	2	6	582375	582380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241744
13567	NC_009482	CTGG	2	8	582459	582466	0 %	25 %	50 %	25 %	148241744
13568	NC_009482	TGC	3	9	582470	582478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241744
13569	NC_009482	GCT	2	6	582519	582524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241744
13570	NC_009482	CCTGG	2	10	582546	582555	0 %	20 %	40 %	40 %	148241744
13571	NC_009482	CGG	2	6	582569	582574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241744
13572	NC_009482	GTT	2	6	582582	582587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241744
13573	NC_009482	CTG	2	6	582601	582606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241744
13574	NC_009482	CGC	2	6	582628	582633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241744
13575	NC_009482	TGGCTG	2	12	582637	582648	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148241744
13576	NC_009482	CTG	3	9	582646	582654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241744
13577	NC_009482	CTG	2	6	582688	582693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241744
13578	NC_009482	TTGA	2	8	582736	582743	25 %	50 %	25 %	0 %	148241744
13579	NC_009482	GCT	2	6	582753	582758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241744
13580	NC_009482	GCT	2	6	582765	582770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241744
13581	NC_009482	CGCT	2	8	582775	582782	0 %	25 %	25 %	50 %	148241744
13582	NC_009482	TTGG	2	8	582806	582813	0 %	50 %	50 %	0 %	148241744
13583	NC_009482	CTG	3	9	582820	582828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241744
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13586	NC_009482	TGGC	2	8	582962	582969	0 %	25 %	50 %	25 %	148241744
13587	NC_009482	TGT	2	6	583034	583039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241744
13588	NC_009482	G	6	6	583041	583046	0 %	0 %	100 %	0 %	148241744
13589	NC_009482	TGC	2	6	583058	583063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241744
13590	NC_009482	AGCGC	2	10	583114	583123	20 %	0 %	40 %	40 %	148241744
13591	NC_009482	CCTC	2	8	583220	583227	0 %	25 %	0 %	75 %	148241744
13592	NC_009482	GTT	2	6	583269	583274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241744
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13598	NC_009482	CGC	2	6	583467	583472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241745
13599	NC_009482	TGG	2	6	583489	583494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241745
13600	NC_009482	CTG	2	6	583495	583500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241745
13601	NC_009482	CAGC	2	8	583505	583512	25 %	0 %	25 %	50 %	148241745
13602	NC_009482	CTG	2	6	583535	583540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241745
13603	NC_009482	GCA	2	6	583571	583576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241745
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13605	NC_009482	GC	3	6	583588	583593	0 %	0 %	50 %	50 %	148241745
13606	NC_009482	TGC	2	6	583618	583623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241745
13607	NC_009482	AGC	3	9	583651	583659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241745
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13609	NC_009482	GCCA	2	8	583830	583837	25 %	0 %	25 %	50 %	148241745
13610	NC_009482	GGC	2	6	583838	583843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241745
13611	NC_009482	C	6	6	583862	583867	0 %	0 %	0 %	100 %	148241745
13612	NC_009482	TGGGT	2	10	583933	583942	0 %	40 %	60 %	0 %	148241745
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13615	NC_009482	GCCG	2	8	584069	584076	0 %	0 %	50 %	50 %	148241745
13616	NC_009482	AC	3	6	584152	584157	50 %	0 %	0 %	50 %	148241745
13617	NC_009482	GTG	3	9	584184	584192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241745
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13738	NC_009482	TGC	2	6	588542	588547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241748
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13745	NC_009482	GCGCCA	2	12	588824	588835	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148241748
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13814	NC_009482	CTGGGG	2	12	591533	591544	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	148241750
13815	NC_009482	GCTC	2	8	591594	591601	0 %	25 %	25 %	50 %	148241750
13816	NC_009482	TCGC	2	8	591632	591639	0 %	25 %	25 %	50 %	148241750
13817	NC_009482	CGT	2	6	591648	591653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241750
13818	NC_009482	GCT	2	6	591654	591659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241750
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13822	NC_009482	GCT	2	6	591981	591986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13825	NC_009482	GCGG	2	8	592218	592225	0 %	0 %	75 %	25 %	148241751
13826	NC_009482	A	6	6	592237	592242	100 %	0 %	0 %	0 %	148241751
13827	NC_009482	GAG	2	6	592246	592251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241751
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13830	NC_009482	A	6	6	592402	592407	100 %	0 %	0 %	0 %	148241751
13831	NC_009482	GCC	2	6	592432	592437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241751
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13833	NC_009482	GTGG	2	8	592465	592472	0 %	25 %	75 %	0 %	148241751
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13837	NC_009482	GAG	2	6	592726	592731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241751
13838	NC_009482	TCGA	2	8	592750	592757	25 %	25 %	25 %	25 %	148241751
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13841	NC_009482	TG	3	6	592889	592894	0 %	50 %	50 %	0 %	148241752
13842	NC_009482	GCC	2	6	592915	592920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241752
13843	NC_009482	GCC	2	6	592944	592949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241752
13844	NC_009482	CCA	2	6	593002	593007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241752
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13847	NC_009482	GCA	2	6	593205	593210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241753
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13849	NC_009482	C	6	6	593308	593313	0 %	0 %	0 %	100 %	148241753
13850	NC_009482	AGC	2	6	593314	593319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241753
13851	NC_009482	TTGC	2	8	593325	593332	0 %	50 %	25 %	25 %	148241753
13852	NC_009482	GGCCGC	2	12	593358	593369	0 %	0 %	50 %	50 %	148241753
13853	NC_009482	CTG	2	6	593419	593424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241753
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13855	NC_009482	AGG	2	6	593438	593443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241753
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13866	NC_009482	CTGG	2	8	593854	593861	0 %	25 %	50 %	25 %	148241753
13867	NC_009482	GTG	2	6	593926	593931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241753
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13874	NC_009482	TGG	2	6	594356	594361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13875	NC_009482	CTG	2	6	594409	594414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241754
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13879	NC_009482	TGC	2	6	594589	594594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241754
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13974	NC_009482	TAA	2	6	598004	598009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148241758
13975	NC_009482	GCTC	2	8	598037	598044	0 %	25 %	25 %	50 %	148241758
13976	NC_009482	CAG	2	6	598056	598061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241758
13977	NC_009482	GC	3	6	598107	598112	0 %	0 %	50 %	50 %	148241758
13978	NC_009482	TC	3	6	598119	598124	0 %	50 %	0 %	50 %	148241758
13979	NC_009482	AGGC	2	8	598144	598151	25 %	0 %	50 %	25 %	148241758
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13981	NC_009482	GC	3	6	598226	598231	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13982	NC_009482	TTCGGA	2	12	598292	598303	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13983	NC_009482	GCT	2	6	598318	598323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13985	NC_009482	TCG	2	6	598350	598355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241759
13986	NC_009482	CTT	2	6	598387	598392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241759
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