MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 51524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_009482	ATTGG	2	10	556134	556143	20 %	40 %	40 %	0 %	148241718
13002	NC_009482	GCA	2	6	556318	556323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241718
13003	NC_009482	CAG	2	6	556361	556366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241718
13004	NC_009482	ACC	2	6	556404	556409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241718
13005	NC_009482	CAG	2	6	556433	556438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241718
13006	NC_009482	CAATGG	2	12	556505	556516	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148241718
13007	NC_009482	TGT	2	6	556538	556543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241718
13008	NC_009482	CTG	2	6	556577	556582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241718
13009	NC_009482	CGA	2	6	556589	556594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241718
13010	NC_009482	CTC	2	6	556607	556612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148241718
13011	NC_009482	GCTGCA	2	12	556615	556626	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148241718
13012	NC_009482	CCAT	2	8	556753	556760	25 %	25 %	0 %	50 %	148241718
13013	NC_009482	TGAA	2	8	556763	556770	50 %	25 %	25 %	0 %	148241718
13014	NC_009482	TAA	2	6	556928	556933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148241718
13015	NC_009482	GAG	2	6	556937	556942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241718
13016	NC_009482	GCACCT	2	12	556972	556983	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148241718
13017	NC_009482	G	6	6	557117	557122	0 %	0 %	100 %	0 %	148241718
13018	NC_009482	CACG	2	8	557123	557130	25 %	0 %	25 %	50 %	148241718
13019	NC_009482	CTA	2	6	557227	557232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13020	NC_009482	TTG	2	6	557241	557246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13021	NC_009482	CTCGA	2	10	557280	557289	20 %	20 %	20 %	40 %	148241719
13022	NC_009482	TTG	2	6	557342	557347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241719
13023	NC_009482	TCT	2	6	557356	557361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241719
13024	NC_009482	GTT	2	6	557386	557391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241719
13025	NC_009482	T	6	6	557528	557533	0 %	100 %	0 %	0 %	148241719
13026	NC_009482	TAG	2	6	557600	557605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13027	NC_009482	GCTT	2	8	557628	557635	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13028	NC_009482	ATT	2	6	557652	557657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13029	NC_009482	GGA	2	6	557665	557670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13030	NC_009482	TTG	2	6	557710	557715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13031	NC_009482	ACA	2	6	557812	557817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13032	NC_009482	AGT	2	6	557828	557833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_009482	TTG	2	6	557874	557879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13034	NC_009482	GCC	2	6	557886	557891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13035	NC_009482	TTG	2	6	557906	557911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13036	NC_009482	CAA	2	6	557962	557967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13037	NC_009482	A	6	6	557966	557971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13038	NC_009482	GAA	2	6	557995	558000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13039	NC_009482	AGT	2	6	558031	558036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241720
13040	NC_009482	CCA	3	9	558040	558048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241720
13041	NC_009482	CAC	2	6	558095	558100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241720
13042	NC_009482	G	6	6	558138	558143	0 %	0 %	100 %	0 %	148241720
13043	NC_009482	GGTT	2	8	558169	558176	0 %	50 %	50 %	0 %	148241720
13044	NC_009482	CTT	2	6	558185	558190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241720
13045	NC_009482	CTT	2	6	558197	558202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241720
13046	NC_009482	ATCAC	2	10	558216	558225	40 %	20 %	0 %	40 %	148241720
13047	NC_009482	CGA	2	6	558253	558258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241720
13048	NC_009482	TGG	2	6	558313	558318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241720
13049	NC_009482	CAG	2	6	558362	558367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241720
13050	NC_009482	GGTT	2	8	558376	558383	0 %	50 %	50 %	0 %	148241720
13051	NC_009482	GCC	2	6	558392	558397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241720
13052	NC_009482	CTT	2	6	558410	558415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241720
13053	NC_009482	G	6	6	558530	558535	0 %	0 %	100 %	0 %	148241720
13054	NC_009482	GGC	2	6	558548	558553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241720
13055	NC_009482	GGAT	2	8	558643	558650	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13056	NC_009482	CAA	2	6	558701	558706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148241721
13057	NC_009482	CTG	2	6	558756	558761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241721
13058	NC_009482	TGC	2	6	558763	558768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241721
13059	NC_009482	CCG	2	6	558779	558784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241721
13060	NC_009482	GCA	2	6	558832	558837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241721
13061	NC_009482	GTT	2	6	558902	558907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241721
13062	NC_009482	GGC	2	6	558930	558935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241721
13063	NC_009482	GATGGC	2	12	558955	558966	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148241721
13064	NC_009482	GCT	3	9	559008	559016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241722
13065	NC_009482	TG	3	6	559017	559022	0 %	50 %	50 %	0 %	148241722
13066	NC_009482	GTGGAT	2	12	559076	559087	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	148241722
13067	NC_009482	GGTTT	2	10	559110	559119	0 %	60 %	40 %	0 %	148241722
13068	NC_009482	TGA	2	6	559134	559139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241722
13069	NC_009482	GCC	2	6	559168	559173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241722
13070	NC_009482	GTG	2	6	559182	559187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241722
13071	NC_009482	CAG	2	6	559222	559227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241722
13072	NC_009482	CCA	2	6	559251	559256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13073	NC_009482	CCT	2	6	559257	559262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13074	NC_009482	CAG	2	6	559330	559335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241723
13075	NC_009482	GTG	2	6	559348	559353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241723
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13078	NC_009482	GCA	2	6	559455	559460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241723
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13084	NC_009482	CAC	2	6	559752	559757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241723
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13087	NC_009482	GGC	2	6	559818	559823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241723
13088	NC_009482	CGGTG	2	10	559881	559890	0 %	20 %	60 %	20 %	148241723
13089	NC_009482	ACC	2	6	559910	559915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241723
13090	NC_009482	ACT	2	6	559940	559945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241723
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13095	NC_009482	TGA	2	6	560195	560200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241723
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13100	NC_009482	TGG	2	6	560336	560341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241723
13101	NC_009482	GGC	2	6	560382	560387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241723
13102	NC_009482	GC	3	6	560386	560391	0 %	0 %	50 %	50 %	148241723
13103	NC_009482	GCG	2	6	560429	560434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241723
13104	NC_009482	GCA	2	6	560447	560452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241723
13105	NC_009482	TGG	2	6	560498	560503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241723
13106	NC_009482	GCA	2	6	560535	560540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241723
13107	NC_009482	TGA	2	6	560547	560552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241723
13108	NC_009482	GTGC	2	8	560579	560586	0 %	25 %	50 %	25 %	148241723
13109	NC_009482	GTT	2	6	560587	560592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241723
13110	NC_009482	TGC	2	6	560604	560609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241723
13111	NC_009482	GCCAA	2	10	560630	560639	40 %	0 %	20 %	40 %	148241723
13112	NC_009482	CAC	2	6	560697	560702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241723
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13116	NC_009482	GCT	2	6	560900	560905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241724
13117	NC_009482	GCTG	2	8	560944	560951	0 %	25 %	50 %	25 %	148241724
13118	NC_009482	CAC	2	6	560965	560970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241724
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13120	NC_009482	GC	3	6	561010	561015	0 %	0 %	50 %	50 %	148241724
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13233	NC_009482	GTG	2	6	565654	565659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13234	NC_009482	CAT	2	6	565720	565725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241727
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13241	NC_009482	TGA	2	6	566001	566006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241727
13242	NC_009482	GCA	2	6	566016	566021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241727
13243	NC_009482	GTG	2	6	566083	566088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13244	NC_009482	GCC	2	6	566098	566103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241728
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13284	NC_009482	CTCCC	2	10	568257	568266	0 %	20 %	0 %	80 %	148241728
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13287	NC_009482	T	7	7	568544	568550	0 %	100 %	0 %	0 %	148241728
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13299	NC_009482	GCGCG	2	10	569355	569364	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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13323	NC_009482	CATC	2	8	570452	570459	25 %	25 %	0 %	50 %	148241730
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13358	NC_009482	CAA	2	6	572580	572585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148241730
13359	NC_009482	TGC	2	6	572705	572710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241730
13360	NC_009482	CTG	2	6	572737	572742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241730
13361	NC_009482	GCAT	2	8	572759	572766	25 %	25 %	25 %	25 %	148241730
13362	NC_009482	TGC	2	6	572789	572794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241730
13363	NC_009482	CACG	2	8	572846	572853	25 %	0 %	25 %	50 %	148241730
13364	NC_009482	ACT	2	6	572858	572863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241730
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13367	NC_009482	GCT	2	6	572982	572987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241730
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13369	NC_009482	TGG	2	6	573119	573124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241730
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13372	NC_009482	TGC	2	6	573221	573226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241730
13373	NC_009482	GGC	2	6	573301	573306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241730
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13377	NC_009482	AGTC	2	8	573539	573546	25 %	25 %	25 %	25 %	148241730
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13379	NC_009482	TGA	2	6	573683	573688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241731
13380	NC_009482	CT	3	6	573741	573746	0 %	50 %	0 %	50 %	148241731
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13382	NC_009482	GCA	2	6	573802	573807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241731
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13384	NC_009482	ATCG	2	8	573966	573973	25 %	25 %	25 %	25 %	148241731
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13390	NC_009482	CAA	2	6	574370	574375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148241731
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13395	NC_009482	GCA	2	6	574552	574557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241732
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13397	NC_009482	TGG	2	6	574695	574700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241732
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13404	NC_009482	GCA	2	6	575016	575021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241732
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13411	NC_009482	CTG	2	6	575428	575433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13412	NC_009482	GCA	2	6	575467	575472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241733
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13419	NC_009482	AG	3	6	575644	575649	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13420	NC_009482	CGG	2	6	575674	575679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13421	NC_009482	CGGGC	2	10	575725	575734	0 %	0 %	60 %	40 %	148241734
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13450	NC_009482	CCAG	2	8	576949	576956	25 %	0 %	25 %	50 %	148241734
13451	NC_009482	GGCG	2	8	576989	576996	0 %	0 %	75 %	25 %	148241734
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13462	NC_009482	TCA	2	6	577554	577559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241735
13463	NC_009482	AGCC	2	8	577578	577585	25 %	0 %	25 %	50 %	148241735
13464	NC_009482	GCTC	2	8	577609	577616	0 %	25 %	25 %	50 %	148241735
13465	NC_009482	GCT	2	6	577654	577659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241735
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13469	NC_009482	CGG	2	6	577875	577880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241736
13470	NC_009482	GAA	2	6	577888	577893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148241736
13471	NC_009482	ATC	2	6	577910	577915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241736
13472	NC_009482	CTG	2	6	577942	577947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241736
13473	NC_009482	AAGCCA	2	12	578000	578011	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	148241736
13474	NC_009482	CCA	2	6	578013	578018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241736
13475	NC_009482	TGA	2	6	578079	578084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241736
13476	NC_009482	TCA	2	6	578189	578194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241736
13477	NC_009482	TTG	2	6	578318	578323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241736
13478	NC_009482	CCG	2	6	578324	578329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241736
13479	NC_009482	TGGC	2	8	578381	578388	0 %	25 %	50 %	25 %	148241736
13480	NC_009482	GCA	2	6	578433	578438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241736
13481	NC_009482	TGT	2	6	578451	578456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241736
13482	NC_009482	CAG	2	6	578524	578529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241736
13483	NC_009482	AAC	2	6	578535	578540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148241736
13484	NC_009482	TCA	2	6	578565	578570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241736
13485	NC_009482	TCC	2	6	578582	578587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148241736
13486	NC_009482	TGC	2	6	578588	578593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241736
13487	NC_009482	GTT	2	6	578602	578607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241736
13488	NC_009482	TGC	2	6	578616	578621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241736
13489	NC_009482	TGC	2	6	578639	578644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241736
13490	NC_009482	GCG	2	6	578668	578673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241736
13491	NC_009482	CAC	2	6	578722	578727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241736
13492	NC_009482	AGA	2	6	578772	578777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148241736
13493	NC_009482	GCA	2	6	578790	578795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241736
13494	NC_009482	TGA	2	6	578854	578859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13495	NC_009482	GCT	2	6	578872	578877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241737
13496	NC_009482	CGGC	2	8	578901	578908	0 %	0 %	50 %	50 %	148241737
13497	NC_009482	CTC	2	6	578929	578934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148241737
13498	NC_009482	GC	3	6	578969	578974	0 %	0 %	50 %	50 %	148241737
13499	NC_009482	CAGC	2	8	579094	579101	25 %	0 %	25 %	50 %	148241737
13500	NC_009482	GAC	2	6	579157	579162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241737

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