MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 51524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_009482	GTG	2	6	533032	533037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241697
12502	NC_009482	TGG	2	6	533063	533068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241697
12503	NC_009482	GGC	2	6	533115	533120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241697
12504	NC_009482	GCT	2	6	533209	533214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241698
12505	NC_009482	CAG	2	6	533228	533233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241698
12506	NC_009482	GCCGAT	2	12	533276	533287	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148241698
12507	NC_009482	CGGC	2	8	533329	533336	0 %	0 %	50 %	50 %	148241698
12508	NC_009482	TGC	2	6	533370	533375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241698
12509	NC_009482	GCG	2	6	533458	533463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241698
12510	NC_009482	CCG	2	6	533677	533682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241698
12511	NC_009482	TGC	2	6	533688	533693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241698
12512	NC_009482	GGT	2	6	533720	533725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241698
12513	NC_009482	CCA	2	6	533740	533745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241698
12514	NC_009482	CCA	2	6	533761	533766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241698
12515	NC_009482	GCC	2	6	533842	533847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241698
12516	NC_009482	TTGC	2	8	533849	533856	0 %	50 %	25 %	25 %	148241698
12517	NC_009482	GCT	2	6	533866	533871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241698
12518	NC_009482	GCA	2	6	533986	533991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12519	NC_009482	AGGC	2	8	534009	534016	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12520	NC_009482	GCC	2	6	534192	534197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241699
12521	NC_009482	CCA	2	6	534251	534256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241699
12522	NC_009482	GAT	2	6	534267	534272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241699
12523	NC_009482	CCA	2	6	534287	534292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241699
12524	NC_009482	CGT	2	6	534293	534298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241699
12525	NC_009482	GGT	2	6	534315	534320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241699
12526	NC_009482	GCC	2	6	534345	534350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241699
12527	NC_009482	CA	3	6	534363	534368	50 %	0 %	0 %	50 %	148241699
12528	NC_009482	CAG	2	6	534399	534404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241699
12529	NC_009482	GCT	2	6	534408	534413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241699
12530	NC_009482	GCC	2	6	534418	534423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241699
12531	NC_009482	GGC	2	6	534426	534431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241699
12532	NC_009482	CAG	2	6	534471	534476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241699
12533	NC_009482	CGG	2	6	534485	534490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241699
12534	NC_009482	TGA	2	6	534545	534550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241699
12535	NC_009482	GCA	2	6	534578	534583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241699
12536	NC_009482	CGG	2	6	534590	534595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241699
12537	NC_009482	CTT	2	6	534605	534610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241699
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12539	NC_009482	CGG	2	6	534836	534841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241699
12540	NC_009482	TGA	2	6	534842	534847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241699
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12544	NC_009482	GCTG	2	8	534974	534981	0 %	25 %	50 %	25 %	148241699
12545	NC_009482	ATC	2	6	535054	535059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241699
12546	NC_009482	TGC	2	6	535073	535078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241699
12547	NC_009482	CTG	2	6	535133	535138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241699
12548	NC_009482	CATT	2	8	535211	535218	25 %	50 %	0 %	25 %	148241699
12549	NC_009482	GCA	2	6	535223	535228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241699
12550	NC_009482	GAC	2	6	535319	535324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241700
12551	NC_009482	CGG	2	6	535327	535332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241700
12552	NC_009482	GCA	2	6	535541	535546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241700
12553	NC_009482	GCA	3	9	535560	535568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241700
12554	NC_009482	CCAGC	2	10	535597	535606	20 %	0 %	20 %	60 %	148241700
12555	NC_009482	CTTGTT	2	12	535638	535649	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	148241700
12556	NC_009482	GATC	2	8	535749	535756	25 %	25 %	25 %	25 %	148241700
12557	NC_009482	GGC	2	6	535766	535771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241700
12558	NC_009482	TCC	2	6	535796	535801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148241700
12559	NC_009482	GCT	2	6	535824	535829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241700
12560	NC_009482	GCG	2	6	535880	535885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241700
12561	NC_009482	GCA	2	6	535947	535952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241700
12562	NC_009482	GCCA	2	8	535953	535960	25 %	0 %	25 %	50 %	148241700
12563	NC_009482	GCA	3	9	535965	535973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241700
12564	NC_009482	CAG	3	9	536005	536013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241700
12565	NC_009482	GCG	2	6	536027	536032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241700
12566	NC_009482	CGG	2	6	536063	536068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241700
12567	NC_009482	GGCC	2	8	536086	536093	0 %	0 %	50 %	50 %	148241700
12568	NC_009482	GC	3	6	536101	536106	0 %	0 %	50 %	50 %	148241700
12569	NC_009482	TCA	2	6	536144	536149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241701
12570	NC_009482	GCT	2	6	536150	536155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241701
12571	NC_009482	CAATC	2	10	536156	536165	40 %	20 %	0 %	40 %	148241701
12572	NC_009482	ATCGGC	2	12	536175	536186	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148241701
12573	NC_009482	CGC	2	6	536207	536212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241701
12574	NC_009482	CAGGCG	2	12	536220	536231	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148241701
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12585	NC_009482	CAG	2	6	536648	536653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241702
12586	NC_009482	GCT	2	6	536747	536752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241702
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12589	NC_009482	GAG	2	6	536799	536804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241702
12590	NC_009482	CTCAC	2	10	536841	536850	20 %	20 %	0 %	60 %	148241702
12591	NC_009482	TGGC	2	8	536943	536950	0 %	25 %	50 %	25 %	148241702
12592	NC_009482	TGG	2	6	536986	536991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241702
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12597	NC_009482	GCT	2	6	537362	537367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241702
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12599	NC_009482	CGAT	2	8	537411	537418	25 %	25 %	25 %	25 %	148241702
12600	NC_009482	TTG	2	6	537447	537452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241702
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12602	NC_009482	CGT	2	6	537502	537507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241702
12603	NC_009482	GCC	2	6	537521	537526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241702
12604	NC_009482	GCTG	2	8	537553	537560	0 %	25 %	50 %	25 %	148241702
12605	NC_009482	GCTG	2	8	537597	537604	0 %	25 %	50 %	25 %	148241703
12606	NC_009482	CG	3	6	537632	537637	0 %	0 %	50 %	50 %	148241703
12607	NC_009482	GCACCG	2	12	537652	537663	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148241703
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12611	NC_009482	GGCTTT	2	12	537803	537814	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	148241703
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12615	NC_009482	GGC	2	6	537917	537922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241703
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12618	NC_009482	GGC	2	6	538025	538030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241703
12619	NC_009482	CGA	2	6	538057	538062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241703
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12733	NC_009482	AG	3	6	542307	542312	50 %	0 %	50 %	0 %	148241707
12734	NC_009482	GCG	2	6	542353	542358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241707
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12737	NC_009482	GCCC	2	8	542409	542416	0 %	0 %	25 %	75 %	148241707
12738	NC_009482	GCA	2	6	542420	542425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241707
12739	NC_009482	GTG	2	6	542438	542443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241707
12740	NC_009482	CTG	4	12	542449	542460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241707
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12742	NC_009482	CTG	2	6	542520	542525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241707
12743	NC_009482	C	7	7	542542	542548	0 %	0 %	0 %	100 %	148241707
12744	NC_009482	TGC	3	9	542555	542563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241707
12745	NC_009482	CTG	2	6	542571	542576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241707
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12748	NC_009482	TGGG	2	8	542740	542747	0 %	25 %	75 %	0 %	148241707
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12820	NC_009482	CGT	2	6	545909	545914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241711
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12840	NC_009482	TCG	2	6	547054	547059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241711
12841	NC_009482	CTG	2	6	547060	547065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241711
12842	NC_009482	GCAG	2	8	547067	547074	25 %	0 %	50 %	25 %	148241711
12843	NC_009482	TC	3	6	547121	547126	0 %	50 %	0 %	50 %	148241711
12844	NC_009482	CGGC	2	8	547259	547266	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12845	NC_009482	CGG	2	6	547347	547352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12846	NC_009482	GTG	2	6	547472	547477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12847	NC_009482	GTT	2	6	547522	547527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12848	NC_009482	AAC	2	6	547534	547539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12849	NC_009482	CTT	2	6	547558	547563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12850	NC_009482	T	7	7	547562	547568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12851	NC_009482	GAA	2	6	547590	547595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12852	NC_009482	CTT	2	6	547669	547674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241712
12853	NC_009482	GGA	2	6	547714	547719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241712
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12855	NC_009482	TGA	2	6	547818	547823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241712
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12861	NC_009482	GCA	2	6	547925	547930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241713
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12882	NC_009482	CGG	2	6	548662	548667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241713
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12889	NC_009482	CCTCT	2	10	548893	548902	0 %	40 %	0 %	60 %	148241714
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12895	NC_009482	TGGC	2	8	549221	549228	0 %	25 %	50 %	25 %	148241714
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12932	NC_009482	GCG	2	6	550865	550870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241715
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12935	NC_009482	TGA	2	6	550905	550910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241715
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12949	NC_009482	CCG	2	6	551626	551631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241716
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12966	NC_009482	GACT	2	8	553061	553068	25 %	25 %	25 %	25 %	148241717
12967	NC_009482	TGG	2	6	553098	553103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241717
12968	NC_009482	TGC	2	6	553134	553139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241717
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12971	NC_009482	TGA	2	6	553435	553440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241717
12972	NC_009482	TGA	2	6	553612	553617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241717
12973	NC_009482	CGG	2	6	553791	553796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241717
12974	NC_009482	AGC	2	6	553828	553833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241717
12975	NC_009482	TGGCTT	2	12	553857	553868	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	148241717
12976	NC_009482	GC	3	6	553869	553874	0 %	0 %	50 %	50 %	148241717
12977	NC_009482	CGAG	2	8	553885	553892	25 %	0 %	50 %	25 %	148241717
12978	NC_009482	CAC	2	6	553953	553958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241717
12979	NC_009482	GCT	2	6	553990	553995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241717
12980	NC_009482	TGA	2	6	554053	554058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241717
12981	NC_009482	CGT	3	9	554223	554231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241717
12982	NC_009482	TGC	2	6	554289	554294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241718
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12984	NC_009482	TGGC	2	8	554650	554657	0 %	25 %	50 %	25 %	148241718
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12986	NC_009482	TGA	2	6	554847	554852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241718
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12988	NC_009482	GAA	2	6	554950	554955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148241718
12989	NC_009482	GTTG	2	8	555231	555238	0 %	50 %	50 %	0 %	148241718
12990	NC_009482	CAATGG	2	12	555554	555565	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148241718
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12994	NC_009482	TTGA	2	8	555819	555826	25 %	50 %	25 %	0 %	148241718
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12997	NC_009482	ATG	2	6	555994	555999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241718
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12999	NC_009482	CTG	2	6	556049	556054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241718
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