MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 51524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_009482	AAG	2	6	490353	490358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148241651
11502	NC_009482	TGA	2	6	490409	490414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241651
11503	NC_009482	GCC	2	6	490443	490448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241651
11504	NC_009482	GGA	2	6	490511	490516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241651
11505	NC_009482	CAAGCT	2	12	490613	490624	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148241651
11506	NC_009482	CAG	2	6	490658	490663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241651
11507	NC_009482	CTT	2	6	490691	490696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241651
11508	NC_009482	GCT	2	6	490700	490705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241651
11509	NC_009482	TGG	2	6	490816	490821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241651
11510	NC_009482	ATCG	2	8	490859	490866	25 %	25 %	25 %	25 %	148241651
11511	NC_009482	CAC	2	6	490973	490978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241651
11512	NC_009482	GGT	2	6	491018	491023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241651
11513	NC_009482	CTT	2	6	491030	491035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241651
11514	NC_009482	CAC	2	6	491156	491161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241651
11515	NC_009482	TGG	2	6	491203	491208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241651
11516	NC_009482	GCA	2	6	491234	491239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241651
11517	NC_009482	CAT	2	6	491276	491281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241651
11518	NC_009482	GCGA	2	8	491283	491290	25 %	0 %	50 %	25 %	148241651
11519	NC_009482	CGG	2	6	491333	491338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241651
11520	NC_009482	GAA	2	6	491351	491356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148241651
11521	NC_009482	GCT	2	6	491360	491365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241651
11522	NC_009482	GAA	2	6	491366	491371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148241651
11523	NC_009482	AGG	2	6	491425	491430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241651
11524	NC_009482	GCTCAA	2	12	491444	491455	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148241651
11525	NC_009482	CAG	2	6	491483	491488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11526	NC_009482	GCA	2	6	491519	491524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241652
11527	NC_009482	TGC	2	6	491533	491538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241652
11528	NC_009482	ATC	2	6	491565	491570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241652
11529	NC_009482	CAG	2	6	491731	491736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241653
11530	NC_009482	CAG	2	6	491777	491782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241653
11531	NC_009482	CGG	2	6	491793	491798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241653
11532	NC_009482	CAG	2	6	491801	491806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241653
11533	NC_009482	TGGC	2	8	491810	491817	0 %	25 %	50 %	25 %	148241653
11534	NC_009482	TTG	2	6	491843	491848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241653
11535	NC_009482	GCT	2	6	491863	491868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241653
11536	NC_009482	GCA	2	6	491880	491885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241653
11537	NC_009482	AAC	2	6	491892	491897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148241653
11538	NC_009482	TGC	2	6	491910	491915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241653
11539	NC_009482	CAACG	2	10	491970	491979	40 %	0 %	20 %	40 %	148241653
11540	NC_009482	GCT	2	6	492095	492100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241654
11541	NC_009482	CTG	2	6	492103	492108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241654
11542	NC_009482	CAG	2	6	492171	492176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241654
11543	NC_009482	G	6	6	492416	492421	0 %	0 %	100 %	0 %	148241654
11544	NC_009482	TG	3	6	492465	492470	0 %	50 %	50 %	0 %	148241654
11545	NC_009482	TG	3	6	492525	492530	0 %	50 %	50 %	0 %	148241654
11546	NC_009482	CAG	2	6	492541	492546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241654
11547	NC_009482	AAG	2	6	492567	492572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148241655
11548	NC_009482	GAT	2	6	492627	492632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241655
11549	NC_009482	GCA	2	6	492654	492659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241655
11550	NC_009482	GCC	2	6	492702	492707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241655
11551	NC_009482	AAG	3	9	492781	492789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148241655
11552	NC_009482	A	6	6	492796	492801	100 %	0 %	0 %	0 %	148241655
11553	NC_009482	CTT	2	6	492825	492830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241656
11554	NC_009482	CTG	2	6	492836	492841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241656
11555	NC_009482	CCA	3	9	492860	492868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241656
11556	NC_009482	TCCA	2	8	492887	492894	25 %	25 %	0 %	50 %	148241656
11557	NC_009482	TGC	2	6	492939	492944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241656
11558	NC_009482	TCG	2	6	492986	492991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241656
11559	NC_009482	TC	3	6	492995	493000	0 %	50 %	0 %	50 %	148241656
11560	NC_009482	CCA	2	6	493007	493012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241656
11561	NC_009482	AGAA	2	8	493039	493046	75 %	0 %	25 %	0 %	148241656
11562	NC_009482	ACC	2	6	493108	493113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241656
11563	NC_009482	ATC	2	6	493132	493137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241656
11564	NC_009482	TA	3	6	493143	493148	50 %	50 %	0 %	0 %	148241656
11565	NC_009482	ATC	2	6	493210	493215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241656
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11567	NC_009482	ATC	2	6	493273	493278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241656
11568	NC_009482	ATAGCC	2	12	493360	493371	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148241656
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11570	NC_009482	CGA	3	9	493446	493454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241656
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11572	NC_009482	TCA	2	6	493517	493522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241656
11573	NC_009482	TGC	2	6	493558	493563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241656
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11575	NC_009482	T	6	6	493605	493610	0 %	100 %	0 %	0 %	148241656
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11578	NC_009482	CTGAA	2	10	493748	493757	40 %	20 %	20 %	20 %	148241656
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11582	NC_009482	CTT	2	6	494132	494137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241656
11583	NC_009482	ATTC	2	8	494158	494165	25 %	50 %	0 %	25 %	148241656
11584	NC_009482	TC	3	6	494205	494210	0 %	50 %	0 %	50 %	148241656
11585	NC_009482	TGT	2	6	494224	494229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241656
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11587	NC_009482	GT	3	6	494335	494340	0 %	50 %	50 %	0 %	148241656
11588	NC_009482	GCTT	2	8	494394	494401	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11589	NC_009482	AAG	2	6	494404	494409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11590	NC_009482	TGT	2	6	494417	494422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11591	NC_009482	GAT	2	6	494488	494493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11592	NC_009482	TTC	2	6	494525	494530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241657
11593	NC_009482	A	6	6	494699	494704	100 %	0 %	0 %	0 %	148241657
11594	NC_009482	CTG	2	6	494754	494759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241657
11595	NC_009482	AC	3	6	494784	494789	50 %	0 %	0 %	50 %	148241657
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11598	NC_009482	TTGC	2	8	494938	494945	0 %	50 %	25 %	25 %	148241657
11599	NC_009482	CTTTG	2	10	494994	495003	0 %	60 %	20 %	20 %	148241657
11600	NC_009482	CAC	2	6	495059	495064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241657
11601	NC_009482	TAA	2	6	495065	495070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148241657
11602	NC_009482	TGT	2	6	495115	495120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241657
11603	NC_009482	TGA	2	6	495130	495135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11604	NC_009482	AATT	2	8	495230	495237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11605	NC_009482	T	6	6	495273	495278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11606	NC_009482	TGG	2	6	495298	495303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241658
11607	NC_009482	TTG	2	6	495347	495352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241658
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11609	NC_009482	GCA	2	6	495422	495427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241658
11610	NC_009482	TTG	2	6	495436	495441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241658
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11614	NC_009482	ATTT	2	8	495650	495657	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11615	NC_009482	T	6	6	495675	495680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11616	NC_009482	TCTG	2	8	495717	495724	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11617	NC_009482	ACTCC	2	10	495826	495835	20 %	20 %	0 %	60 %	148241659
11618	NC_009482	CTG	2	6	495846	495851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241659
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11620	NC_009482	TCT	2	6	495875	495880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241659
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11978	NC_009482	GCT	2	6	511649	511654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241675
11979	NC_009482	TGA	2	6	511656	511661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241675
11980	NC_009482	GCA	2	6	511683	511688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241675
11981	NC_009482	GCT	2	6	511698	511703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241675
11982	NC_009482	CGG	2	6	511750	511755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241675
11983	NC_009482	GCT	2	6	511772	511777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241675
11984	NC_009482	TCA	2	6	511793	511798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241675
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