MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 51524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_009482	GCCC	2	8	468111	468118	0 %	0 %	25 %	75 %	148241622
11002	NC_009482	GCT	2	6	468121	468126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241622
11003	NC_009482	CAA	2	6	468234	468239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148241622
11004	NC_009482	GTT	2	6	468280	468285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11005	NC_009482	AGAT	2	8	468340	468347	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11006	NC_009482	CAG	2	6	468404	468409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11007	NC_009482	ACCC	2	8	468443	468450	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
11008	NC_009482	GAC	2	6	468507	468512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11009	NC_009482	TCCT	2	8	468518	468525	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11010	NC_009482	CTTG	2	8	468540	468547	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11011	NC_009482	AAGC	2	8	468552	468559	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11012	NC_009482	ACG	2	6	468561	468566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11013	NC_009482	GTT	2	6	468632	468637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11014	NC_009482	CAG	2	6	468737	468742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11015	NC_009482	TGGC	2	8	468749	468756	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11016	NC_009482	TCT	2	6	468766	468771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11017	NC_009482	CCA	2	6	468839	468844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241623
11018	NC_009482	CACC	2	8	468895	468902	25 %	0 %	0 %	75 %	148241623
11019	NC_009482	CT	3	6	468932	468937	0 %	50 %	0 %	50 %	148241623
11020	NC_009482	TTG	2	6	468943	468948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241623
11021	NC_009482	GCT	2	6	468970	468975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241623
11022	NC_009482	TGA	2	6	468983	468988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241623
11023	NC_009482	CAC	2	6	469020	469025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241623
11024	NC_009482	GCCTG	2	10	469043	469052	0 %	20 %	40 %	40 %	148241623
11025	NC_009482	C	6	6	469078	469083	0 %	0 %	0 %	100 %	148241623
11026	NC_009482	ACT	2	6	469115	469120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241623
11027	NC_009482	TGG	3	9	469130	469138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241623
11028	NC_009482	CCG	2	6	469155	469160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241623
11029	NC_009482	GAG	2	6	469225	469230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241623
11030	NC_009482	TGG	2	6	469232	469237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241623
11031	NC_009482	GCCA	2	8	469270	469277	25 %	0 %	25 %	50 %	148241623
11032	NC_009482	GGGC	2	8	469301	469308	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11033	NC_009482	AGT	2	6	469356	469361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11034	NC_009482	AGA	2	6	469381	469386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11035	NC_009482	TTAT	2	8	469428	469435	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11036	NC_009482	CAA	2	6	469441	469446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11037	NC_009482	CATT	2	8	469465	469472	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11038	NC_009482	AAC	2	6	469535	469540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11039	NC_009482	CTC	2	6	469578	469583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148241624
11040	NC_009482	GAG	2	6	469603	469608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241624
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11042	NC_009482	GGC	3	9	469734	469742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241624
11043	NC_009482	GGC	2	6	469752	469757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241624
11044	NC_009482	TGT	2	6	469778	469783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241624
11045	NC_009482	CTG	2	6	469800	469805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241624
11046	NC_009482	GAGGAA	2	12	469905	469916	50 %	0 %	50 %	0 %	148241624
11047	NC_009482	TTG	2	6	469959	469964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11048	NC_009482	GGT	2	6	470118	470123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11049	NC_009482	T	7	7	470135	470141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11050	NC_009482	GAT	2	6	470203	470208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241625
11051	NC_009482	GCC	3	9	470276	470284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241625
11052	NC_009482	CAG	3	9	470300	470308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241625
11053	NC_009482	T	6	6	470352	470357	0 %	100 %	0 %	0 %	148241625
11054	NC_009482	CAAGC	2	10	470431	470440	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
11055	NC_009482	TTC	2	6	470487	470492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241626
11056	NC_009482	CGC	2	6	470537	470542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241626
11057	NC_009482	CG	3	6	470583	470588	0 %	0 %	50 %	50 %	148241626
11058	NC_009482	AAAG	2	8	470625	470632	75 %	0 %	25 %	0 %	148241626
11059	NC_009482	CAAT	2	8	470693	470700	50 %	25 %	0 %	25 %	148241627
11060	NC_009482	GGTT	2	8	470708	470715	0 %	50 %	50 %	0 %	148241627
11061	NC_009482	GAA	2	6	470789	470794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148241627
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11063	NC_009482	CAG	2	6	470818	470823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241627
11064	NC_009482	GCT	2	6	470847	470852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241627
11065	NC_009482	GAG	2	6	470853	470858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241627
11066	NC_009482	CCAT	2	8	470865	470872	25 %	25 %	0 %	50 %	148241627
11067	NC_009482	CCA	2	6	471033	471038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241628
11068	NC_009482	ACC	2	6	471074	471079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241628
11069	NC_009482	GAG	3	9	471125	471133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241628
11070	NC_009482	GGA	2	6	471161	471166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241628
11071	NC_009482	GAT	2	6	471340	471345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241628
11072	NC_009482	CAA	2	6	471395	471400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148241628
11073	NC_009482	CTG	3	9	471411	471419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11074	NC_009482	CAC	2	6	471475	471480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241629
11075	NC_009482	GCA	2	6	471491	471496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241629
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11079	NC_009482	A	6	6	471772	471777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11080	NC_009482	GCT	2	6	471822	471827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11081	NC_009482	GGC	2	6	471873	471878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11082	NC_009482	AGC	2	6	471911	471916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11083	NC_009482	AGC	2	6	471992	471997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241630
11084	NC_009482	GTT	2	6	472075	472080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241630
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11089	NC_009482	CTTT	2	8	472272	472279	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11090	NC_009482	GGC	2	6	472319	472324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241631
11091	NC_009482	GTTG	2	8	472435	472442	0 %	50 %	50 %	0 %	148241631
11092	NC_009482	TGG	2	6	472483	472488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241631
11093	NC_009482	GCA	2	6	472514	472519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241631
11094	NC_009482	AAG	2	6	472521	472526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148241631
11095	NC_009482	CAG	2	6	472561	472566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241631
11096	NC_009482	TGGG	2	8	472588	472595	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
11097	NC_009482	GCC	2	6	472607	472612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11098	NC_009482	GGT	2	6	472619	472624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11099	NC_009482	GCG	2	6	472662	472667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11100	NC_009482	GCT	2	6	472755	472760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11101	NC_009482	GATGCG	2	12	472857	472868	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11102	NC_009482	GCG	2	6	472894	472899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11103	NC_009482	CGA	2	6	472920	472925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11104	NC_009482	ACCA	2	8	472961	472968	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11105	NC_009482	T	6	6	472994	472999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11106	NC_009482	CACCAG	2	12	473114	473125	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11107	NC_009482	TGGTG	2	10	473211	473220	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
11108	NC_009482	TTGAT	2	10	473264	473273	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11109	NC_009482	GCC	2	6	473280	473285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241632
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11111	NC_009482	TGG	2	6	473452	473457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241632
11112	NC_009482	TGA	2	6	473470	473475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241632
11113	NC_009482	GAG	2	6	473508	473513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241632
11114	NC_009482	GTG	2	6	473556	473561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241632
11115	NC_009482	AAGC	2	8	473605	473612	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11116	NC_009482	ACT	2	6	473629	473634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11117	NC_009482	TGATG	2	10	473649	473658	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11118	NC_009482	CGA	2	6	473686	473691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11119	NC_009482	A	6	6	473779	473784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11120	NC_009482	GCT	2	6	473802	473807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11121	NC_009482	GTG	2	6	473890	473895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11122	NC_009482	AG	3	6	473989	473994	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11123	NC_009482	GAA	3	9	474027	474035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148241633
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11125	NC_009482	TGA	2	6	474175	474180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241633
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11128	NC_009482	CCA	2	6	474244	474249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241634
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11153	NC_009482	GACT	2	8	475225	475232	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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11247	NC_009482	CGG	2	6	479634	479639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241642
11248	NC_009482	GAT	2	6	479651	479656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241642
11249	NC_009482	CAG	3	9	479671	479679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241642
11250	NC_009482	CGT	2	6	479683	479688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241642
11251	NC_009482	TTGGTG	2	12	479730	479741	0 %	50 %	50 %	0 %	148241642
11252	NC_009482	GCC	2	6	479768	479773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241642
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11265	NC_009482	GCA	2	6	480501	480506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241642
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11270	NC_009482	CAG	2	6	480679	480684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241642
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11287	NC_009482	GTC	2	6	481190	481195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241642
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11291	NC_009482	GGC	2	6	481270	481275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241642
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11318	NC_009482	CG	3	6	482426	482431	0 %	0 %	50 %	50 %	148241644
11319	NC_009482	ATC	2	6	482432	482437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241644
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11321	NC_009482	CAG	3	9	482572	482580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241645
11322	NC_009482	CGGC	2	8	482626	482633	0 %	0 %	50 %	50 %	148241645
11323	NC_009482	CAG	3	9	482650	482658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241645
11324	NC_009482	GCC	2	6	482668	482673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241645
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11328	NC_009482	GGCGG	2	10	482920	482929	0 %	0 %	80 %	20 %	148241645
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11331	NC_009482	CCA	2	6	483078	483083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241645
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11333	NC_009482	TGC	2	6	483099	483104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241645
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11339	NC_009482	CCA	2	6	483255	483260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241645
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11341	NC_009482	CG	3	6	483354	483359	0 %	0 %	50 %	50 %	148241645
11342	NC_009482	TCT	2	6	483383	483388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241645
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11345	NC_009482	GCA	2	6	483456	483461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241645
11346	NC_009482	CAC	3	9	483541	483549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241645
11347	NC_009482	CAG	2	6	483550	483555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241645
11348	NC_009482	AAG	2	6	483600	483605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11349	NC_009482	TGC	2	6	483669	483674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241646
11350	NC_009482	GCT	2	6	483681	483686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241646
11351	NC_009482	CAG	2	6	483697	483702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241646
11352	NC_009482	GCC	2	6	483704	483709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241646
11353	NC_009482	GCA	2	6	483750	483755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241646
11354	NC_009482	TGC	2	6	483819	483824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241646
11355	NC_009482	GCC	2	6	483887	483892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241646
11356	NC_009482	GCT	2	6	483978	483983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241646
11357	NC_009482	TTG	2	6	484034	484039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241646
11358	NC_009482	CGG	2	6	484094	484099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241646
11359	NC_009482	GGC	2	6	484114	484119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241646
11360	NC_009482	GCT	2	6	484134	484139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241646
11361	NC_009482	CGG	2	6	484185	484190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241646
11362	NC_009482	GTC	3	9	484207	484215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241646
11363	NC_009482	TTC	2	6	484231	484236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241646
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11365	NC_009482	GC	3	6	484352	484357	0 %	0 %	50 %	50 %	148241646
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11482	NC_009482	GCG	2	6	489589	489594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11483	NC_009482	AGC	2	6	489615	489620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11484	NC_009482	CTG	2	6	489648	489653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11485	NC_009482	CAT	2	6	489692	489697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241651
11486	NC_009482	TGC	2	6	489739	489744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241651
11487	NC_009482	ACA	2	6	489793	489798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148241651
11488	NC_009482	GGAGCG	2	12	489806	489817	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	148241651
11489	NC_009482	CG	3	6	489842	489847	0 %	0 %	50 %	50 %	148241651
11490	NC_009482	AGC	2	6	489860	489865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241651
11491	NC_009482	GC	3	6	489958	489963	0 %	0 %	50 %	50 %	148241651
11492	NC_009482	TGG	3	9	489967	489975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241651
11493	NC_009482	GCCA	2	8	489978	489985	25 %	0 %	25 %	50 %	148241651
11494	NC_009482	CAA	2	6	490058	490063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148241651
11495	NC_009482	GATC	2	8	490064	490071	25 %	25 %	25 %	25 %	148241651
11496	NC_009482	CGC	2	6	490213	490218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241651
11497	NC_009482	AGA	2	6	490229	490234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148241651
11498	NC_009482	GTG	2	6	490302	490307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241651
11499	NC_009482	CGGC	2	8	490310	490317	0 %	0 %	50 %	50 %	148241651
11500	NC_009482	AAGA	2	8	490323	490330	75 %	0 %	25 %	0 %	148241651

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