MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 51524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_009482	GCC	2	6	445696	445701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241578
10502	NC_009482	G	7	7	445770	445776	0 %	0 %	100 %	0 %	148241578
10503	NC_009482	GTG	2	6	445785	445790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241578
10504	NC_009482	CAG	2	6	445862	445867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241578
10505	NC_009482	TCGAT	2	10	445872	445881	20 %	40 %	20 %	20 %	148241578
10506	NC_009482	ATGG	2	8	445899	445906	25 %	25 %	50 %	0 %	148241578
10507	NC_009482	GGC	2	6	445909	445914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241578
10508	NC_009482	TGG	2	6	445964	445969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241578
10509	NC_009482	TAG	2	6	445970	445975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241578
10510	NC_009482	CAGG	2	8	446002	446009	25 %	0 %	50 %	25 %	148241578
10511	NC_009482	GGT	2	6	446029	446034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241578
10512	NC_009482	GGC	2	6	446083	446088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241578
10513	NC_009482	GCT	2	6	446103	446108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241578
10514	NC_009482	GCCG	2	8	446109	446116	0 %	0 %	50 %	50 %	148241578
10515	NC_009482	GTG	2	6	446146	446151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241578
10516	NC_009482	GGC	2	6	446193	446198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241578
10517	NC_009482	AAG	2	6	446297	446302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148241578
10518	NC_009482	GCT	2	6	446329	446334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241578
10519	NC_009482	GCC	2	6	446350	446355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241578
10520	NC_009482	CGCGGG	2	12	446396	446407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241578
10521	NC_009482	ACC	2	6	446441	446446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241578
10522	NC_009482	TGT	2	6	446466	446471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241578
10523	NC_009482	CAG	2	6	446539	446544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241578
10524	NC_009482	TGG	2	6	446550	446555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241578
10525	NC_009482	AGC	3	9	446607	446615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241578
10526	NC_009482	AGT	2	6	446646	446651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241578
10527	NC_009482	TGATT	2	10	446682	446691	20 %	60 %	20 %	0 %	148241578
10528	NC_009482	CAG	3	9	446719	446727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241578
10529	NC_009482	TGG	2	6	446736	446741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241578
10530	NC_009482	GGCTG	2	10	446827	446836	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
10531	NC_009482	ATGG	2	8	446873	446880	25 %	25 %	50 %	0 %	148241579
10532	NC_009482	C	6	6	446921	446926	0 %	0 %	0 %	100 %	148241579
10533	NC_009482	CGG	2	6	446941	446946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241579
10534	NC_009482	GCG	2	6	446973	446978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241579
10535	NC_009482	GCT	2	6	447001	447006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241579
10536	NC_009482	TGA	2	6	447010	447015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241579
10537	NC_009482	GCTG	2	8	447024	447031	0 %	25 %	50 %	25 %	148241579
10538	NC_009482	AGG	2	6	447135	447140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241579
10539	NC_009482	GCA	2	6	447160	447165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241579
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10541	NC_009482	GCT	2	6	447211	447216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241579
10542	NC_009482	CTG	2	6	447244	447249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241579
10543	NC_009482	TGT	2	6	447279	447284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241579
10544	NC_009482	CAG	2	6	447365	447370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241579
10545	NC_009482	GGC	2	6	447381	447386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241579
10546	NC_009482	CTGG	2	8	447394	447401	0 %	25 %	50 %	25 %	148241579
10547	NC_009482	TTG	2	6	447465	447470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241579
10548	NC_009482	TCGC	2	8	447501	447508	0 %	25 %	25 %	50 %	148241579
10549	NC_009482	GGTT	2	8	447548	447555	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10550	NC_009482	CTC	2	6	447600	447605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10551	NC_009482	GGT	2	6	447694	447699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241580
10552	NC_009482	CAT	2	6	447718	447723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241580
10553	NC_009482	CGT	2	6	447730	447735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241580
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10555	NC_009482	CCG	2	6	447864	447869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241580
10556	NC_009482	AGG	2	6	447950	447955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10557	NC_009482	CAG	2	6	447970	447975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10558	NC_009482	CGC	2	6	447976	447981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10559	NC_009482	GC	3	6	447993	447998	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10560	NC_009482	GAT	2	6	448108	448113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241581
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10562	NC_009482	GCTT	2	8	448178	448185	0 %	50 %	25 %	25 %	148241581
10563	NC_009482	AGCG	2	8	448210	448217	25 %	0 %	50 %	25 %	148241581
10564	NC_009482	GCT	2	6	448262	448267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241581
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10568	NC_009482	GTG	2	6	448580	448585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241581
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10570	NC_009482	GC	3	6	448640	448645	0 %	0 %	50 %	50 %	148241581
10571	NC_009482	TGC	2	6	448670	448675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241581
10572	NC_009482	GGCC	2	8	448683	448690	0 %	0 %	50 %	50 %	148241581
10573	NC_009482	CG	3	6	448750	448755	0 %	0 %	50 %	50 %	148241581
10574	NC_009482	GCTGG	2	10	448785	448794	0 %	20 %	60 %	20 %	148241581
10575	NC_009482	GCTG	2	8	448830	448837	0 %	25 %	50 %	25 %	148241581
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10580	NC_009482	CCTG	2	8	449086	449093	0 %	25 %	25 %	50 %	148241582
10581	NC_009482	GCC	2	6	449178	449183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241582
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10591	NC_009482	CGGC	2	8	449586	449593	0 %	0 %	50 %	50 %	148241584
10592	NC_009482	GGT	2	6	449597	449602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241584
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10607	NC_009482	TGG	2	6	450392	450397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241585
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10609	NC_009482	CCACG	2	10	450669	450678	20 %	0 %	20 %	60 %	148241585
10610	NC_009482	CGG	2	6	450830	450835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241586
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10614	NC_009482	CGC	2	6	451106	451111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241586
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10616	NC_009482	GATCA	2	10	451140	451149	40 %	20 %	20 %	20 %	148241586
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10618	NC_009482	CCA	2	6	451208	451213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241586
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10620	NC_009482	T	7	7	451336	451342	0 %	100 %	0 %	0 %	148241586
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10861	NC_009482	CTT	2	6	461245	461250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241604
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10979	NC_009482	CAA	2	6	467088	467093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10980	NC_009482	CTGG	2	8	467147	467154	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10981	NC_009482	ATC	2	6	467179	467184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10982	NC_009482	CTG	2	6	467205	467210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10983	NC_009482	GTG	2	6	467234	467239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241621
10984	NC_009482	GGCA	2	8	467242	467249	25 %	0 %	50 %	25 %	148241621
10985	NC_009482	CGA	2	6	467255	467260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241621
10986	NC_009482	GTTG	2	8	467283	467290	0 %	50 %	50 %	0 %	148241621
10987	NC_009482	GT	3	6	467307	467312	0 %	50 %	50 %	0 %	148241621
10988	NC_009482	GCTGAA	2	12	467318	467329	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148241621
10989	NC_009482	CACC	2	8	467363	467370	25 %	0 %	0 %	75 %	148241621
10990	NC_009482	CAG	2	6	467375	467380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241621
10991	NC_009482	TGC	2	6	467399	467404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241622
10992	NC_009482	GA	3	6	467497	467502	50 %	0 %	50 %	0 %	148241622
10993	NC_009482	GCC	2	6	467572	467577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241622
10994	NC_009482	GGC	2	6	467587	467592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241622
10995	NC_009482	C	6	6	467607	467612	0 %	0 %	0 %	100 %	148241622
10996	NC_009482	GTG	2	6	467681	467686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241622
10997	NC_009482	CT	3	6	467832	467837	0 %	50 %	0 %	50 %	148241622
10998	NC_009482	CCA	2	6	467882	467887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241622
10999	NC_009482	GGC	2	6	467994	467999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241622
11000	NC_009482	ATCG	2	8	468055	468062	25 %	25 %	25 %	25 %	148241622

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