MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 51524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_009482	GGA	2	6	424834	424839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241551
10002	NC_009482	AGC	2	6	424841	424846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241551
10003	NC_009482	CAA	2	6	424849	424854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148241551
10004	NC_009482	GC	3	6	424864	424869	0 %	0 %	50 %	50 %	148241551
10005	NC_009482	GCA	2	6	424903	424908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241551
10006	NC_009482	GAT	2	6	424909	424914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241551
10007	NC_009482	GGC	2	6	424921	424926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241551
10008	NC_009482	CAG	2	6	424937	424942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241551
10009	NC_009482	GCC	2	6	424962	424967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241551
10010	NC_009482	GCC	2	6	424985	424990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241551
10011	NC_009482	GCA	2	6	425029	425034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241551
10012	NC_009482	AGG	2	6	425103	425108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241551
10013	NC_009482	AGG	2	6	425127	425132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241551
10014	NC_009482	CACAGC	2	12	425161	425172	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	148241551
10015	NC_009482	GGC	2	6	425188	425193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241551
10016	NC_009482	TGG	2	6	425286	425291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241551
10017	NC_009482	TGG	2	6	425298	425303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241551
10018	NC_009482	GCA	2	6	425311	425316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241551
10019	NC_009482	GCC	2	6	425355	425360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241551
10020	NC_009482	CTGG	2	8	425383	425390	0 %	25 %	50 %	25 %	148241551
10021	NC_009482	GCA	3	9	425397	425405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241551
10022	NC_009482	GCA	2	6	425451	425456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241551
10023	NC_009482	GGC	2	6	425486	425491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241551
10024	NC_009482	TGG	2	6	425511	425516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241551
10025	NC_009482	GCA	2	6	425551	425556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241551
10026	NC_009482	GCC	2	6	425558	425563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241551
10027	NC_009482	G	6	6	425580	425585	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_009482	CCGT	2	8	425595	425602	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10029	NC_009482	CTG	2	6	425626	425631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241552
10030	NC_009482	GCA	3	9	425640	425648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241552
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10032	NC_009482	GGTGG	2	10	425782	425791	0 %	20 %	80 %	0 %	148241552
10033	NC_009482	GCC	2	6	425846	425851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241552
10034	NC_009482	CGC	2	6	425859	425864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241552
10035	NC_009482	GCA	3	9	425910	425918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241552
10036	NC_009482	TGT	2	6	425942	425947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241552
10037	NC_009482	GCC	2	6	425981	425986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241552
10038	NC_009482	GGA	2	6	425994	425999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241552
10039	NC_009482	CAT	2	6	426174	426179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241552
10040	NC_009482	GCG	2	6	426195	426200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241552
10041	NC_009482	GGA	2	6	426264	426269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241552
10042	NC_009482	GGC	2	6	426357	426362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241552
10043	NC_009482	GCA	2	6	426438	426443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241552
10044	NC_009482	TGG	2	6	426470	426475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241552
10045	NC_009482	TGC	2	6	426524	426529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241552
10046	NC_009482	GCCG	2	8	426580	426587	0 %	0 %	50 %	50 %	148241552
10047	NC_009482	TGC	3	9	426608	426616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241552
10048	NC_009482	CAGCT	2	10	426680	426689	20 %	20 %	20 %	40 %	148241552
10049	NC_009482	GCG	2	6	426690	426695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241552
10050	NC_009482	GCC	2	6	426725	426730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241552
10051	NC_009482	GTT	2	6	426776	426781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241552
10052	NC_009482	GAG	2	6	426793	426798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241552
10053	NC_009482	CTG	2	6	426838	426843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241552
10054	NC_009482	CG	3	6	426844	426849	0 %	0 %	50 %	50 %	148241552
10055	NC_009482	GGC	2	6	426888	426893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241552
10056	NC_009482	CCCA	2	8	426911	426918	25 %	0 %	0 %	75 %	148241552
10057	NC_009482	GCG	2	6	426942	426947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241552
10058	NC_009482	GAAG	2	8	426969	426976	50 %	0 %	50 %	0 %	148241552
10059	NC_009482	CAG	2	6	427002	427007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241552
10060	NC_009482	TGGT	2	8	427017	427024	0 %	50 %	50 %	0 %	148241552
10061	NC_009482	CGCTG	2	10	427040	427049	0 %	20 %	40 %	40 %	148241552
10062	NC_009482	GGC	2	6	427083	427088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241552
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10064	NC_009482	CCA	2	6	427229	427234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241553
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10068	NC_009482	GTC	2	6	427354	427359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241553
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10072	NC_009482	TTG	2	6	427486	427491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241553
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10078	NC_009482	AGC	2	6	427687	427692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10084	NC_009482	GCT	2	6	427970	427975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241554
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10086	NC_009482	TGC	2	6	427988	427993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241554
10087	NC_009482	TAGG	2	8	428001	428008	25 %	25 %	50 %	0 %	148241554
10088	NC_009482	GCT	2	6	428047	428052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241554
10089	NC_009482	TCC	2	6	428098	428103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148241554
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10092	NC_009482	GCCG	2	8	428243	428250	0 %	0 %	50 %	50 %	148241554
10093	NC_009482	CAG	2	6	428492	428497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241554
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10101	NC_009482	CGG	2	6	428702	428707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241554
10102	NC_009482	TGC	2	6	428815	428820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241554
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10104	NC_009482	GCA	2	6	428981	428986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241554
10105	NC_009482	GTT	2	6	428997	429002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241554
10106	NC_009482	GCCAG	2	10	429017	429026	20 %	0 %	40 %	40 %	148241554
10107	NC_009482	GAG	2	6	429120	429125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10108	NC_009482	GTG	2	6	429145	429150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10109	NC_009482	GGA	2	6	429157	429162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10110	NC_009482	GAA	2	6	429341	429346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10111	NC_009482	CGG	2	6	429371	429376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10112	NC_009482	TGC	2	6	429433	429438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241555
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10115	NC_009482	CAG	2	6	429600	429605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241555
10116	NC_009482	GCT	2	6	429680	429685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241555
10117	NC_009482	GAG	2	6	429738	429743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241555
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10119	NC_009482	TGG	2	6	429832	429837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241555
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10124	NC_009482	TGG	2	6	430218	430223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241556
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10126	NC_009482	CTG	2	6	430262	430267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241556
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10128	NC_009482	GCT	2	6	430351	430356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241556
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10229	NC_009482	A	7	7	434242	434248	100 %	0 %	0 %	0 %	148241562
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10240	NC_009482	GC	3	6	435002	435007	0 %	0 %	50 %	50 %	148241563
10241	NC_009482	CGC	2	6	435104	435109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10242	NC_009482	CATG	2	8	435252	435259	25 %	25 %	25 %	25 %	148241564
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10247	NC_009482	GA	3	6	435531	435536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10248	NC_009482	ATT	3	9	435613	435621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10249	NC_009482	GGCC	2	8	435662	435669	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10250	NC_009482	AAC	2	6	435681	435686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10251	NC_009482	GGT	2	6	435721	435726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241565
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10360	NC_009482	AGC	4	12	439943	439954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241570
10361	NC_009482	GGTG	2	8	439977	439984	0 %	25 %	75 %	0 %	148241570
10362	NC_009482	CTGC	2	8	440011	440018	0 %	25 %	25 %	50 %	148241570
10363	NC_009482	TCA	2	6	440035	440040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241570
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10365	NC_009482	GCC	2	6	440092	440097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241570
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10464	NC_009482	CGC	2	6	444301	444306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241577
10465	NC_009482	CACC	2	8	444314	444321	25 %	0 %	0 %	75 %	148241577
10466	NC_009482	CAG	2	6	444352	444357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241577
10467	NC_009482	AGCC	2	8	444411	444418	25 %	0 %	25 %	50 %	148241577
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10469	NC_009482	GCC	2	6	444540	444545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241577
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10472	NC_009482	AGCC	2	8	444598	444605	25 %	0 %	25 %	50 %	148241577
10473	NC_009482	G	6	6	444607	444612	0 %	0 %	100 %	0 %	148241577
10474	NC_009482	CAG	2	6	444613	444618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241577
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