MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 51524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_009482	TGCT	2	8	381906	381913	0 %	50 %	25 %	25 %	148241499
9002	NC_009482	TGT	2	6	381918	381923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241499
9003	NC_009482	TGCTG	2	10	381934	381943	0 %	40 %	40 %	20 %	148241499
9004	NC_009482	TGG	2	6	382017	382022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241499
9005	NC_009482	GCA	2	6	382126	382131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241500
9006	NC_009482	GCT	3	9	382287	382295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241500
9007	NC_009482	CAC	2	6	382322	382327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241500
9008	NC_009482	GGT	2	6	382343	382348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241500
9009	NC_009482	CAC	2	6	382355	382360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241500
9010	NC_009482	CCA	2	6	382417	382422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241500
9011	NC_009482	CAC	2	6	382457	382462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241500
9012	NC_009482	ATCG	2	8	382516	382523	25 %	25 %	25 %	25 %	148241500
9013	NC_009482	TCA	2	6	382527	382532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241500
9014	NC_009482	GCA	2	6	382540	382545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241500
9015	NC_009482	CAC	2	6	382589	382594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241500
9016	NC_009482	GCT	2	6	382598	382603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241500
9017	NC_009482	GCA	2	6	382699	382704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241500
9018	NC_009482	GCAG	2	8	382726	382733	25 %	0 %	50 %	25 %	148241500
9019	NC_009482	CAC	2	6	382814	382819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241500
9020	NC_009482	GAT	2	6	382841	382846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241500
9021	NC_009482	GCC	2	6	382862	382867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241500
9022	NC_009482	GGT	2	6	382984	382989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241501
9023	NC_009482	CGG	2	6	383013	383018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241501
9024	NC_009482	GCC	2	6	383065	383070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241501
9025	NC_009482	GAT	2	6	383140	383145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241501
9026	NC_009482	TCC	2	6	383156	383161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148241501
9027	NC_009482	GTC	2	6	383224	383229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241501
9028	NC_009482	AGT	2	6	383349	383354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241501
9029	NC_009482	TGC	3	9	383378	383386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241501
9030	NC_009482	ACA	2	6	383436	383441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148241501
9031	NC_009482	CT	3	6	383492	383497	0 %	50 %	0 %	50 %	148241501
9032	NC_009482	GCT	2	6	383583	383588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241501
9033	NC_009482	CCA	2	6	383592	383597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241501
9034	NC_009482	TGG	2	6	383613	383618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241501
9035	NC_009482	CGAG	2	8	383623	383630	25 %	0 %	50 %	25 %	148241501
9036	NC_009482	AGC	2	6	383715	383720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241501
9037	NC_009482	TCGCCA	2	12	383744	383755	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148241501
9038	NC_009482	TCA	2	6	383780	383785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241501
9039	NC_009482	CAG	3	9	383791	383799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241501
9040	NC_009482	GCC	2	6	383842	383847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241501
9041	NC_009482	GCT	2	6	383904	383909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241501
9042	NC_009482	GCAT	2	8	383942	383949	25 %	25 %	25 %	25 %	148241501
9043	NC_009482	TGC	2	6	384014	384019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241501
9044	NC_009482	GTC	2	6	384034	384039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241501
9045	NC_009482	GCT	2	6	384138	384143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241501
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9047	NC_009482	TGGC	2	8	384245	384252	0 %	25 %	50 %	25 %	148241501
9048	NC_009482	GAT	2	6	384259	384264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241501
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9052	NC_009482	GCC	2	6	384362	384367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241501
9053	NC_009482	TGA	2	6	384375	384380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241501
9054	NC_009482	GCG	2	6	384391	384396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241501
9055	NC_009482	CAC	2	6	384421	384426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241501
9056	NC_009482	AGGG	2	8	384448	384455	25 %	0 %	75 %	0 %	148241501
9057	NC_009482	TTG	2	6	384505	384510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241501
9058	NC_009482	CTG	2	6	384574	384579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241501
9059	NC_009482	AT	3	6	384666	384671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9060	NC_009482	GCA	2	6	384682	384687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9061	NC_009482	GGT	2	6	384719	384724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241502
9062	NC_009482	TTGC	2	8	384730	384737	0 %	50 %	25 %	25 %	148241502
9063	NC_009482	GCA	2	6	384783	384788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241502
9064	NC_009482	CCTG	2	8	384836	384843	0 %	25 %	25 %	50 %	148241502
9065	NC_009482	GAT	2	6	384852	384857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241502
9066	NC_009482	TGA	2	6	384888	384893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241502
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9069	NC_009482	TCT	2	6	385100	385105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241503
9070	NC_009482	CG	3	6	385131	385136	0 %	0 %	50 %	50 %	148241503
9071	NC_009482	TTG	2	6	385192	385197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241503
9072	NC_009482	TCA	2	6	385256	385261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241503
9073	NC_009482	GGCG	2	8	385269	385276	0 %	0 %	75 %	25 %	148241503
9074	NC_009482	CGA	2	6	385314	385319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241503
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9076	NC_009482	CAGAC	2	10	385453	385462	40 %	0 %	20 %	40 %	148241503
9077	NC_009482	GCAT	2	8	385474	385481	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9078	NC_009482	TGC	2	6	385545	385550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241504
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9081	NC_009482	TGC	2	6	385585	385590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241504
9082	NC_009482	CTG	3	9	385601	385609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241504
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9084	NC_009482	GTTG	2	8	385749	385756	0 %	50 %	50 %	0 %	148241504
9085	NC_009482	CTG	2	6	385757	385762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241504
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9088	NC_009482	TGGTG	2	10	385878	385887	0 %	40 %	60 %	0 %	148241504
9089	NC_009482	GGC	2	6	385891	385896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241504
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9091	NC_009482	TTGGCG	2	12	386000	386011	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148241504
9092	NC_009482	TTG	4	12	386210	386221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241504
9093	NC_009482	GATC	2	8	386299	386306	25 %	25 %	25 %	25 %	148241504
9094	NC_009482	GGC	2	6	386382	386387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241504
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9102	NC_009482	TGC	2	6	386694	386699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241504
9103	NC_009482	TCGC	2	8	386764	386771	0 %	25 %	25 %	50 %	148241504
9104	NC_009482	CCG	2	6	386912	386917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241505
9105	NC_009482	CCA	3	9	386931	386939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241505
9106	NC_009482	CGT	2	6	386941	386946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241505
9107	NC_009482	GCT	2	6	387130	387135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241505
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9110	NC_009482	TGC	2	6	387410	387415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241505
9111	NC_009482	TGG	2	6	387436	387441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241505
9112	NC_009482	TGC	2	6	387443	387448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241505
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9116	NC_009482	GGT	2	6	387601	387606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241505
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9349	NC_009482	GCTG	2	8	396940	396947	0 %	25 %	50 %	25 %	148241513
9350	NC_009482	CAG	2	6	396965	396970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241513
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9353	NC_009482	GGT	2	6	397097	397102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9354	NC_009482	TCCATG	2	12	397124	397135	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148241514
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9481	NC_009482	GCT	2	6	402994	402999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241522
9482	NC_009482	GCA	2	6	403018	403023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241522
9483	NC_009482	GCC	2	6	403051	403056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241522
9484	NC_009482	TGC	2	6	403065	403070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241522
9485	NC_009482	GCC	2	6	403114	403119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241522
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9487	NC_009482	TGC	2	6	403161	403166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241522
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9491	NC_009482	GCT	2	6	403253	403258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241522
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