MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 51524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8002	NC_009482	GCA	2	6	337756	337761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241448
8003	NC_009482	GCA	2	6	337794	337799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8004	NC_009482	CTG	2	6	337844	337849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241449
8005	NC_009482	CTGTTG	2	12	337866	337877	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	148241449
8006	NC_009482	TGG	2	6	337914	337919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241449
8007	NC_009482	GCC	2	6	337990	337995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241449
8008	NC_009482	GTG	2	6	338006	338011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241449
8009	NC_009482	TC	3	6	338144	338149	0 %	50 %	0 %	50 %	148241449
8010	NC_009482	TGT	2	6	338185	338190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241449
8011	NC_009482	GCAGC	2	10	338195	338204	20 %	0 %	40 %	40 %	148241449
8012	NC_009482	GCC	2	6	338210	338215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241449
8013	NC_009482	CCAG	2	8	338282	338289	25 %	0 %	25 %	50 %	148241449
8014	NC_009482	TGG	2	6	338304	338309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241449
8015	NC_009482	CCT	2	6	338328	338333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148241449
8016	NC_009482	TCC	2	6	338336	338341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148241449
8017	NC_009482	GCC	2	6	338365	338370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241449
8018	NC_009482	GCA	2	6	338389	338394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241449
8019	NC_009482	CGC	2	6	338417	338422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241449
8020	NC_009482	GCT	2	6	338423	338428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241449
8021	NC_009482	GGC	3	9	338434	338442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241449
8022	NC_009482	TGG	2	6	338463	338468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241449
8023	NC_009482	ACC	2	6	338470	338475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241449
8024	NC_009482	CTTG	2	8	338506	338513	0 %	50 %	25 %	25 %	148241449
8025	NC_009482	CCT	2	6	338515	338520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148241449
8026	NC_009482	TGG	2	6	338571	338576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241449
8027	NC_009482	GCT	2	6	338599	338604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241449
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8029	NC_009482	C	7	7	338611	338617	0 %	0 %	0 %	100 %	148241449
8030	NC_009482	CG	3	6	338621	338626	0 %	0 %	50 %	50 %	148241449
8031	NC_009482	CAC	2	6	338630	338635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241449
8032	NC_009482	AGC	2	6	338636	338641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241449
8033	NC_009482	TGG	2	6	338655	338660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241449
8034	NC_009482	CTG	2	6	338711	338716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241449
8035	NC_009482	TCCC	2	8	338824	338831	0 %	25 %	0 %	75 %	148241449
8036	NC_009482	TGG	2	6	338841	338846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241449
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8040	NC_009482	TGC	2	6	338900	338905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241449
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8042	NC_009482	GCA	2	6	338920	338925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241449
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8045	NC_009482	TGG	2	6	339036	339041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241449
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8048	NC_009482	TGG	2	6	339164	339169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241449
8049	NC_009482	GGCT	2	8	339180	339187	0 %	25 %	50 %	25 %	148241449
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8054	NC_009482	GCA	2	6	339274	339279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241449
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8057	NC_009482	TGG	2	6	339331	339336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241449
8058	NC_009482	GGC	2	6	339357	339362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241449
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8063	NC_009482	CGGA	2	8	339659	339666	25 %	0 %	50 %	25 %	148241450
8064	NC_009482	CCT	2	6	339690	339695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148241450
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8066	NC_009482	GTT	2	6	339766	339771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8070	NC_009482	GCG	2	6	339911	339916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241451
8071	NC_009482	TTCGCT	2	12	339975	339986	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8072	NC_009482	GGC	2	6	340096	340101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241452
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8077	NC_009482	TCA	2	6	340201	340206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241452
8078	NC_009482	AATC	2	8	340258	340265	50 %	25 %	0 %	25 %	148241452
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8081	NC_009482	TCTT	2	8	340395	340402	0 %	75 %	0 %	25 %	148241452
8082	NC_009482	GCC	2	6	340427	340432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241452
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8089	NC_009482	AAG	2	6	340678	340683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148241453
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8091	NC_009482	CG	3	6	340722	340727	0 %	0 %	50 %	50 %	148241453
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8094	NC_009482	GGCC	2	8	340821	340828	0 %	0 %	50 %	50 %	148241453
8095	NC_009482	CAT	2	6	340867	340872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241454
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8097	NC_009482	AGCTC	2	10	340909	340918	20 %	20 %	20 %	40 %	148241454
8098	NC_009482	CGGC	2	8	341012	341019	0 %	0 %	50 %	50 %	148241454
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8106	NC_009482	GC	3	6	341426	341431	0 %	0 %	50 %	50 %	148241454
8107	NC_009482	AG	3	6	341468	341473	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_009482	GCA	2	6	341486	341491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8109	NC_009482	GTTC	2	8	341512	341519	0 %	50 %	25 %	25 %	148241455
8110	NC_009482	CTG	3	9	341584	341592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241455
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8114	NC_009482	CCGCA	2	10	341672	341681	20 %	0 %	20 %	60 %	148241455
8115	NC_009482	TGG	2	6	341730	341735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241455
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8121	NC_009482	TGC	2	6	341978	341983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241455
8122	NC_009482	GCC	2	6	342010	342015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241455
8123	NC_009482	CT	3	6	342016	342021	0 %	50 %	0 %	50 %	148241455
8124	NC_009482	TTGGC	2	10	342037	342046	0 %	40 %	40 %	20 %	148241455
8125	NC_009482	CTGC	2	8	342058	342065	0 %	25 %	25 %	50 %	148241455
8126	NC_009482	GCC	2	6	342109	342114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241455
8127	NC_009482	GCT	2	6	342201	342206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241455
8128	NC_009482	TGG	2	6	342229	342234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241455
8129	NC_009482	GCCGCT	2	12	342276	342287	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148241455
8130	NC_009482	GCC	2	6	342343	342348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241455
8131	NC_009482	CTG	2	6	342361	342366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241455
8132	NC_009482	GCA	2	6	342414	342419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241455
8133	NC_009482	GGC	2	6	342428	342433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241455
8134	NC_009482	CCT	2	6	342473	342478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148241455
8135	NC_009482	GCGG	2	8	342483	342490	0 %	0 %	75 %	25 %	148241455
8136	NC_009482	GTTGGA	2	12	342528	342539	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	148241455
8137	NC_009482	GCA	2	6	342544	342549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241455
8138	NC_009482	GCCA	2	8	342550	342557	25 %	0 %	25 %	50 %	148241455
8139	NC_009482	CAGC	2	8	342568	342575	25 %	0 %	25 %	50 %	148241455
8140	NC_009482	CGG	2	6	342633	342638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241455
8141	NC_009482	AGC	2	6	342649	342654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241455
8142	NC_009482	C	7	7	342669	342675	0 %	0 %	0 %	100 %	148241455
8143	NC_009482	AGGC	2	8	342686	342693	25 %	0 %	50 %	25 %	148241455
8144	NC_009482	CGG	2	6	342810	342815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241455
8145	NC_009482	TGG	2	6	342908	342913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241455
8146	NC_009482	GGAG	2	8	342948	342955	25 %	0 %	75 %	0 %	148241455
8147	NC_009482	GCGG	2	8	342961	342968	0 %	0 %	75 %	25 %	148241455
8148	NC_009482	GGC	2	6	342981	342986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241455
8149	NC_009482	GT	3	6	343033	343038	0 %	50 %	50 %	0 %	148241455
8150	NC_009482	CAG	2	6	343114	343119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241455
8151	NC_009482	ACG	2	6	343130	343135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241455
8152	NC_009482	GTG	2	6	343207	343212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241455
8153	NC_009482	C	6	6	343213	343218	0 %	0 %	0 %	100 %	148241455
8154	NC_009482	TGC	2	6	343277	343282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241455
8155	NC_009482	GCG	2	6	343356	343361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241455
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8160	NC_009482	CTGG	2	8	343713	343720	0 %	25 %	50 %	25 %	148241456
8161	NC_009482	CAG	2	6	343728	343733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241456
8162	NC_009482	CAG	2	6	343737	343742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241456
8163	NC_009482	TCGTGT	2	12	343867	343878	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	148241456
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8165	NC_009482	CGG	2	6	343939	343944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241456
8166	NC_009482	ACC	2	6	343951	343956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241456
8167	NC_009482	GGC	2	6	343971	343976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241456
8168	NC_009482	ATCA	2	8	343992	343999	50 %	25 %	0 %	25 %	148241456
8169	NC_009482	CGAT	2	8	344131	344138	25 %	25 %	25 %	25 %	148241456
8170	NC_009482	GCA	2	6	344148	344153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241456
8171	NC_009482	TGC	2	6	344233	344238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241456
8172	NC_009482	AGC	2	6	344239	344244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241456
8173	NC_009482	GCATT	2	10	344251	344260	20 %	40 %	20 %	20 %	148241456
8174	NC_009482	ACA	2	6	344281	344286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148241456
8175	NC_009482	CCA	2	6	344297	344302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241456
8176	NC_009482	GGC	2	6	344304	344309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8177	NC_009482	GCT	2	6	344313	344318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241457
8178	NC_009482	CTT	2	6	344381	344386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241457
8179	NC_009482	CAC	2	6	344471	344476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241457
8180	NC_009482	CGT	2	6	344483	344488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241457
8181	NC_009482	TCC	2	6	344493	344498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148241457
8182	NC_009482	GGA	2	6	344531	344536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241457
8183	NC_009482	CAC	2	6	344558	344563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241457
8184	NC_009482	CAC	2	6	344585	344590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241457
8185	NC_009482	CAG	2	6	344663	344668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241457
8186	NC_009482	CTGGGC	2	12	344771	344782	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148241457
8187	NC_009482	TTC	2	6	344846	344851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241457
8188	NC_009482	AGG	2	6	344860	344865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241457
8189	NC_009482	AGCGCT	2	12	344894	344905	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148241457
8190	NC_009482	CAC	2	6	344917	344922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241457
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8192	NC_009482	CAC	2	6	345032	345037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241457
8193	NC_009482	CGG	2	6	345043	345048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241457
8194	NC_009482	GCA	2	6	345054	345059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241457
8195	NC_009482	CAG	2	6	345077	345082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241457
8196	NC_009482	CAC	2	6	345089	345094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241457
8197	NC_009482	CAG	2	6	345137	345142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241457
8198	NC_009482	CAG	2	6	345158	345163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241457
8199	NC_009482	CCA	2	6	345208	345213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241457
8200	NC_009482	GCC	2	6	345222	345227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241457
8201	NC_009482	TGA	2	6	345238	345243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241457
8202	NC_009482	GT	3	6	345274	345279	0 %	50 %	50 %	0 %	148241457
8203	NC_009482	CCA	2	6	345307	345312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241457
8204	NC_009482	CCAG	2	8	345402	345409	25 %	0 %	25 %	50 %	148241457
8205	NC_009482	CCA	2	6	345433	345438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241457
8206	NC_009482	GCC	2	6	345452	345457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241457
8207	NC_009482	CCAC	2	8	345534	345541	25 %	0 %	0 %	75 %	148241457
8208	NC_009482	GCC	2	6	345548	345553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241457
8209	NC_009482	GAT	2	6	345554	345559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241457
8210	NC_009482	GGC	2	6	345656	345661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241457
8211	NC_009482	GAG	2	6	345704	345709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241457
8212	NC_009482	TCA	2	6	345757	345762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241457
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8214	NC_009482	GCC	2	6	345886	345891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241458
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8216	NC_009482	TGA	2	6	345912	345917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241458
8217	NC_009482	GCC	2	6	345929	345934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241458
8218	NC_009482	TCA	2	6	345969	345974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241458
8219	NC_009482	CAG	2	6	346021	346026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241458
8220	NC_009482	GAG	2	6	346033	346038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241458
8221	NC_009482	CGT	2	6	346053	346058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241458
8222	NC_009482	CGT	2	6	346071	346076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241458
8223	NC_009482	GC	3	6	346102	346107	0 %	0 %	50 %	50 %	148241459
8224	NC_009482	CTT	2	6	346199	346204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241459
8225	NC_009482	GATC	2	8	346205	346212	25 %	25 %	25 %	25 %	148241459
8226	NC_009482	CAG	2	6	346221	346226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241459
8227	NC_009482	GTG	2	6	346260	346265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241459
8228	NC_009482	GTG	2	6	346311	346316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241459
8229	NC_009482	C	6	6	346354	346359	0 %	0 %	0 %	100 %	148241459
8230	NC_009482	CAC	2	6	346467	346472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241459
8231	NC_009482	CCCG	2	8	346501	346508	0 %	0 %	25 %	75 %	148241459
8232	NC_009482	GCTT	2	8	346534	346541	0 %	50 %	25 %	25 %	148241459
8233	NC_009482	GCC	2	6	346548	346553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241459
8234	NC_009482	GC	3	6	346630	346635	0 %	0 %	50 %	50 %	148241459
8235	NC_009482	CTGACG	2	12	346642	346653	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148241459
8236	NC_009482	ACC	3	9	346714	346722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241459
8237	NC_009482	TGGC	2	8	346724	346731	0 %	25 %	50 %	25 %	148241459
8238	NC_009482	GCC	2	6	346744	346749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241459
8239	NC_009482	TCA	2	6	346751	346756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241459
8240	NC_009482	CCG	2	6	346781	346786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241459
8241	NC_009482	GAG	2	6	346828	346833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241459
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8497	NC_009482	CTT	2	6	359275	359280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241472
8498	NC_009482	TCGCGG	2	12	359370	359381	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148241472
8499	NC_009482	CCA	2	6	359386	359391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241472
8500	NC_009482	CCA	2	6	359413	359418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241472

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