MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 51524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_009482	CGAGG	2	10	317095	317104	20 %	0 %	60 %	20 %	148241420
7502	NC_009482	CGG	2	6	317128	317133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241420
7503	NC_009482	TGG	2	6	317146	317151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241420
7504	NC_009482	CGG	3	9	317230	317238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241420
7505	NC_009482	CAG	2	6	317362	317367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241420
7506	NC_009482	TCA	2	6	317463	317468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7507	NC_009482	AGG	2	6	317486	317491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7508	NC_009482	GCTC	2	8	317551	317558	0 %	25 %	25 %	50 %	148241421
7509	NC_009482	GCC	2	6	317669	317674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241421
7510	NC_009482	GCG	2	6	317700	317705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241421
7511	NC_009482	GCT	2	6	317811	317816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241421
7512	NC_009482	GTT	2	6	317817	317822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241421
7513	NC_009482	TGG	2	6	317861	317866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241421
7514	NC_009482	CAG	2	6	317921	317926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241421
7515	NC_009482	CTG	2	6	318008	318013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7516	NC_009482	CTT	2	6	318027	318032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7517	NC_009482	CT	3	6	318092	318097	0 %	50 %	0 %	50 %	148241422
7518	NC_009482	TCC	2	6	318116	318121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148241422
7519	NC_009482	CAG	2	6	318154	318159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241422
7520	NC_009482	T	6	6	318184	318189	0 %	100 %	0 %	0 %	148241422
7521	NC_009482	TGC	2	6	318213	318218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241422
7522	NC_009482	CT	3	6	318287	318292	0 %	50 %	0 %	50 %	148241422
7523	NC_009482	AGC	2	6	318322	318327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241422
7524	NC_009482	CGC	2	6	318335	318340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241422
7525	NC_009482	GCG	2	6	318422	318427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241422
7526	NC_009482	AGT	2	6	318432	318437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241422
7527	NC_009482	CAG	2	6	318450	318455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241422
7528	NC_009482	CAG	2	6	318494	318499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7529	NC_009482	A	9	9	318507	318515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7530	NC_009482	GAAT	2	8	318577	318584	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7531	NC_009482	GCTG	2	8	318586	318593	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7532	NC_009482	TCC	2	6	318658	318663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7533	NC_009482	TC	3	6	318741	318746	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7534	NC_009482	CCA	2	6	318833	318838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241423
7535	NC_009482	CAG	2	6	318841	318846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241423
7536	NC_009482	GC	3	6	318870	318875	0 %	0 %	50 %	50 %	148241423
7537	NC_009482	TGG	2	6	318977	318982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241423
7538	NC_009482	GGC	2	6	319042	319047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7539	NC_009482	GATC	2	8	319056	319063	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7540	NC_009482	CGC	2	6	319094	319099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241424
7541	NC_009482	GCC	2	6	319113	319118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241424
7542	NC_009482	CGC	2	6	319151	319156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241424
7543	NC_009482	CGA	2	6	319211	319216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241424
7544	NC_009482	CT	3	6	319498	319503	0 %	50 %	0 %	50 %	148241424
7545	NC_009482	CTG	2	6	319530	319535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241424
7546	NC_009482	CAG	2	6	319538	319543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241424
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7548	NC_009482	AG	4	8	319570	319577	50 %	0 %	50 %	0 %	148241424
7549	NC_009482	CAG	2	6	319581	319586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241424
7550	NC_009482	CAG	2	6	319593	319598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241424
7551	NC_009482	A	6	6	319635	319640	100 %	0 %	0 %	0 %	148241425
7552	NC_009482	CTGG	2	8	319651	319658	0 %	25 %	50 %	25 %	148241425
7553	NC_009482	GCTT	2	8	319669	319676	0 %	50 %	25 %	25 %	148241425
7554	NC_009482	GCA	2	6	319680	319685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241425
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7556	NC_009482	ACG	2	6	319842	319847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241425
7557	NC_009482	AGC	2	6	319872	319877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241425
7558	NC_009482	AGC	2	6	319881	319886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241425
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7561	NC_009482	GCT	2	6	319952	319957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241425
7562	NC_009482	CG	3	6	319961	319966	0 %	0 %	50 %	50 %	148241425
7563	NC_009482	GA	3	6	320020	320025	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7564	NC_009482	CTG	2	6	320033	320038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7565	NC_009482	A	7	7	320044	320050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7566	NC_009482	GTG	2	6	320078	320083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7572	NC_009482	TGA	2	6	320170	320175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241426
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7579	NC_009482	TGA	2	6	320299	320304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7580	NC_009482	GGC	2	6	320446	320451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7581	NC_009482	TGC	2	6	320485	320490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7582	NC_009482	TTG	2	6	320585	320590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241427
7583	NC_009482	AGC	2	6	320659	320664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241427
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7589	NC_009482	AGC	2	6	320853	320858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241428
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7593	NC_009482	GCT	2	6	321098	321103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241429
7594	NC_009482	CGAT	2	8	321106	321113	25 %	25 %	25 %	25 %	148241429
7595	NC_009482	TCG	2	6	321154	321159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241429
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7599	NC_009482	GCT	2	6	321248	321253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7607	NC_009482	CTC	2	6	321702	321707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7608	NC_009482	CAC	2	6	321745	321750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241432
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7612	NC_009482	AGT	2	6	321989	321994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241432
7613	NC_009482	GCAA	2	8	322011	322018	50 %	0 %	25 %	25 %	148241432
7614	NC_009482	CCA	2	6	322060	322065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241432
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7619	NC_009482	ACGA	2	8	322308	322315	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7620	NC_009482	TGT	2	6	322316	322321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7621	NC_009482	CCT	2	6	322364	322369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7622	NC_009482	GCA	2	6	322493	322498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7623	NC_009482	GTGCG	2	10	322620	322629	0 %	20 %	60 %	20 %	148241433
7624	NC_009482	GCC	2	6	322632	322637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241433
7625	NC_009482	GCA	2	6	322750	322755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241433
7626	NC_009482	GCG	2	6	322757	322762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241433
7627	NC_009482	GCC	2	6	322780	322785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241433
7628	NC_009482	CAGCT	2	10	322787	322796	20 %	20 %	20 %	40 %	148241433
7629	NC_009482	TGG	2	6	322872	322877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241433
7630	NC_009482	CGT	2	6	322980	322985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241433
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7985	NC_009482	CACATG	2	12	337124	337135	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148241448
7986	NC_009482	GGCC	2	8	337198	337205	0 %	0 %	50 %	50 %	148241448
7987	NC_009482	GGC	2	6	337220	337225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241448
7988	NC_009482	GGGCT	2	10	337262	337271	0 %	20 %	60 %	20 %	148241448
7989	NC_009482	CAG	2	6	337307	337312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241448
7990	NC_009482	ATGCA	2	10	337345	337354	40 %	20 %	20 %	20 %	148241448
7991	NC_009482	CAG	2	6	337378	337383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241448
7992	NC_009482	CGC	2	6	337390	337395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241448
7993	NC_009482	GTT	2	6	337421	337426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148241448
7994	NC_009482	ATGT	2	8	337489	337496	25 %	50 %	25 %	0 %	148241448
7995	NC_009482	TGC	2	6	337527	337532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241448
7996	NC_009482	GCG	2	6	337561	337566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241448
7997	NC_009482	CTG	2	6	337622	337627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241448
7998	NC_009482	CTGAT	2	10	337647	337656	20 %	40 %	20 %	20 %	148241448
7999	NC_009482	AGC	2	6	337668	337673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241448
8000	NC_009482	GCC	2	6	337686	337691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241448

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