MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 51524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_009482	GAC	2	6	278411	278416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241376
6502	NC_009482	AGG	2	6	278428	278433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148241376
6503	NC_009482	CTC	2	6	278461	278466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148241376
6504	NC_009482	GGTGG	2	10	278471	278480	0 %	20 %	80 %	0 %	148241376
6505	NC_009482	GCCT	2	8	278550	278557	0 %	25 %	25 %	50 %	148241376
6506	NC_009482	GGCC	2	8	278627	278634	0 %	0 %	50 %	50 %	148241376
6507	NC_009482	GGC	2	6	278674	278679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241377
6508	NC_009482	CAG	2	6	278728	278733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241377
6509	NC_009482	CTG	2	6	278783	278788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241377
6510	NC_009482	GCT	2	6	278857	278862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241377
6511	NC_009482	AGC	2	6	278896	278901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241377
6512	NC_009482	GCC	2	6	278945	278950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241377
6513	NC_009482	CG	3	6	278963	278968	0 %	0 %	50 %	50 %	148241377
6514	NC_009482	CAGC	2	8	278988	278995	25 %	0 %	25 %	50 %	148241377
6515	NC_009482	GCGT	2	8	278997	279004	0 %	25 %	50 %	25 %	148241377
6516	NC_009482	CCG	2	6	279005	279010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241377
6517	NC_009482	CAG	2	6	279067	279072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241377
6518	NC_009482	CGG	2	6	279105	279110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241377
6519	NC_009482	TCC	2	6	279122	279127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148241377
6520	NC_009482	GCC	2	6	279177	279182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241377
6521	NC_009482	ACC	2	6	279248	279253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241377
6522	NC_009482	TCC	2	6	279266	279271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148241377
6523	NC_009482	CAT	2	6	279285	279290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241377
6524	NC_009482	CGGG	2	8	279309	279316	0 %	0 %	75 %	25 %	148241377
6525	NC_009482	CG	3	6	279397	279402	0 %	0 %	50 %	50 %	148241377
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6528	NC_009482	CAT	2	6	279484	279489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241378
6529	NC_009482	TGC	2	6	279501	279506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241378
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6533	NC_009482	GCC	2	6	279557	279562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241378
6534	NC_009482	GGC	2	6	279572	279577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241378
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6536	NC_009482	CCAGC	2	10	279692	279701	20 %	0 %	20 %	60 %	148241378
6537	NC_009482	GCA	3	9	279769	279777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241378
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6540	NC_009482	GTA	2	6	279845	279850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241378
6541	NC_009482	TGC	2	6	279874	279879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241378
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6543	NC_009482	CAG	2	6	279959	279964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241378
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6545	NC_009482	GCC	2	6	280004	280009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241378
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6553	NC_009482	TCA	2	6	280365	280370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148241378
6554	NC_009482	AGC	3	9	280371	280379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241378
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6582	NC_009482	AGATC	2	10	281358	281367	40 %	20 %	20 %	20 %	148241379
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6594	NC_009482	TGA	2	6	281796	281801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148241379
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6599	NC_009482	GCAGC	2	10	282058	282067	20 %	0 %	40 %	40 %	148241379
6600	NC_009482	CAGC	2	8	282117	282124	25 %	0 %	25 %	50 %	148241379
6601	NC_009482	TCG	2	6	282137	282142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241379
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6607	NC_009482	GCG	2	6	282366	282371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241380
6608	NC_009482	GCTCA	2	10	282387	282396	20 %	20 %	20 %	40 %	148241380
6609	NC_009482	GCC	2	6	282412	282417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241380
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6612	NC_009482	TGC	2	6	282487	282492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241380
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6614	NC_009482	ACC	2	6	282505	282510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241380
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6620	NC_009482	GC	3	6	282704	282709	0 %	0 %	50 %	50 %	148241381
6621	NC_009482	CGG	2	6	282722	282727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241381
6622	NC_009482	GC	3	6	282744	282749	0 %	0 %	50 %	50 %	148241381
6623	NC_009482	CGCC	2	8	282886	282893	0 %	0 %	25 %	75 %	148241381
6624	NC_009482	GGC	2	6	282954	282959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241382
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6633	NC_009482	GTGCC	2	10	283304	283313	0 %	20 %	40 %	40 %	148241382
6634	NC_009482	GGT	2	6	283327	283332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241382
6635	NC_009482	TGC	2	6	283343	283348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241382
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6641	NC_009482	GC	3	6	283652	283657	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6642	NC_009482	GCA	2	6	283751	283756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241383
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6649	NC_009482	GCG	2	6	284020	284025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241383
6650	NC_009482	TGC	2	6	284047	284052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241383
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6658	NC_009482	GCCC	2	8	284350	284357	0 %	0 %	25 %	75 %	148241383
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6666	NC_009482	GGC	2	6	284531	284536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148241383
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6673	NC_009482	GCC	2	6	284819	284824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241384
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6682	NC_009482	GCC	2	6	285095	285100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148241384
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6684	NC_009482	GGT	2	6	285127	285132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241384
6685	NC_009482	A	6	6	285140	285145	100 %	0 %	0 %	0 %	148241384
6686	NC_009482	GGT	2	6	285178	285183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241384
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6688	NC_009482	AGC	2	6	285219	285224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241384
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6694	NC_009482	GGT	2	6	285353	285358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148241384
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6699	NC_009482	CTG	2	6	285518	285523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241384
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6721	NC_009482	AGGCG	2	10	286251	286260	20 %	0 %	60 %	20 %	148241386
6722	NC_009482	GGGCAT	2	12	286328	286339	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148241386
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6724	NC_009482	GC	3	6	286376	286381	0 %	0 %	50 %	50 %	148241386
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6729	NC_009482	CAG	2	6	286573	286578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241386
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6731	NC_009482	CGCTGC	2	12	286640	286651	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148241386
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6733	NC_009482	CACAGG	2	12	286674	286685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148241386
6734	NC_009482	GGCC	2	8	286703	286710	0 %	0 %	50 %	50 %	148241386
6735	NC_009482	TTC	2	6	286722	286727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148241386
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6739	NC_009482	ATTC	2	8	286887	286894	25 %	50 %	0 %	25 %	148241386
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6981	NC_009482	CAA	2	6	296684	296689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148241399
6982	NC_009482	CTC	2	6	296814	296819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148241399
6983	NC_009482	TGC	2	6	296827	296832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241399
6984	NC_009482	CCA	2	6	296879	296884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148241399
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6991	NC_009482	CTG	2	6	297129	297134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148241399
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