MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 51524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
50001	NC_009482	AGGCTG	2	12	2159870	2159881	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148243571
50002	NC_009482	CTG	3	9	2159879	2159887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243571
50003	NC_009482	CTG	3	9	2159890	2159898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243571
50004	NC_009482	GCCC	2	8	2159916	2159923	0 %	0 %	25 %	75 %	148243571
50005	NC_009482	AGCTGC	2	12	2159939	2159950	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148243571
50006	NC_009482	CTG	2	6	2160004	2160009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243571
50007	NC_009482	GCA	2	6	2160050	2160055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243571
50008	NC_009482	GGC	2	6	2160073	2160078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243571
50009	NC_009482	CGC	2	6	2160177	2160182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243571
50010	NC_009482	CAC	2	6	2160211	2160216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243571
50011	NC_009482	AGC	3	9	2160236	2160244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243571
50012	NC_009482	CAA	2	6	2160253	2160258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243571
50013	NC_009482	CCA	2	6	2160313	2160318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243571
50014	NC_009482	AGCC	2	8	2160371	2160378	25 %	0 %	25 %	50 %	148243571
50015	NC_009482	GAA	2	6	2160381	2160386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243571
50016	NC_009482	GCG	2	6	2160447	2160452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243572
50017	NC_009482	CCT	2	6	2160581	2160586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243572
50018	NC_009482	CAA	2	6	2160603	2160608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243572
50019	NC_009482	GCA	2	6	2160638	2160643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243572
50020	NC_009482	GAG	2	6	2160699	2160704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243572
50021	NC_009482	GCT	2	6	2160749	2160754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243572
50022	NC_009482	CCCG	2	8	2160759	2160766	0 %	0 %	25 %	75 %	148243572
50023	NC_009482	CAC	2	6	2160807	2160812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243572
50024	NC_009482	GGACCC	2	12	2160946	2160957	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148243572
50025	NC_009482	GCT	2	6	2160998	2161003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243572
50026	NC_009482	AG	3	6	2161062	2161067	50 %	0 %	50 %	0 %	148243572
50027	NC_009482	CAA	2	6	2161200	2161205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243573
50028	NC_009482	ATCG	2	8	2161221	2161228	25 %	25 %	25 %	25 %	148243573
50029	NC_009482	GAA	2	6	2161281	2161286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243573
50030	NC_009482	CAG	2	6	2161325	2161330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243573
50031	NC_009482	CCA	2	6	2161331	2161336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243573
50032	NC_009482	CAA	2	6	2161346	2161351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243573
50033	NC_009482	GAT	2	6	2161392	2161397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243573
50034	NC_009482	GC	3	6	2161413	2161418	0 %	0 %	50 %	50 %	148243573
50035	NC_009482	CAC	2	6	2161419	2161424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243573
50036	NC_009482	AGGGTG	2	12	2161456	2161467	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	148243573
50037	NC_009482	TCAA	2	8	2161471	2161478	50 %	25 %	0 %	25 %	148243573
50038	NC_009482	GAAC	2	8	2161487	2161494	50 %	0 %	25 %	25 %	148243573
50039	NC_009482	CATC	2	8	2161502	2161509	25 %	25 %	0 %	50 %	148243573
50040	NC_009482	GAT	2	6	2161584	2161589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243573
50041	NC_009482	CGC	2	6	2161605	2161610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243573
50042	NC_009482	GCA	2	6	2161625	2161630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243573
50043	NC_009482	CA	3	6	2161646	2161651	50 %	0 %	0 %	50 %	148243573
50044	NC_009482	AC	3	6	2161670	2161675	50 %	0 %	0 %	50 %	148243573
50045	NC_009482	AAG	2	6	2161714	2161719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243573
50046	NC_009482	CCGG	2	8	2161734	2161741	0 %	0 %	50 %	50 %	148243573
50047	NC_009482	CCG	2	6	2161805	2161810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243573
50048	NC_009482	CCA	2	6	2161835	2161840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243573
50049	NC_009482	CAG	2	6	2161881	2161886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243573
50050	NC_009482	CCA	2	6	2161985	2161990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243573
50051	NC_009482	TGA	2	6	2162011	2162016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243574
50052	NC_009482	AGG	2	6	2162017	2162022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243574
50053	NC_009482	TCT	2	6	2162089	2162094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243574
50054	NC_009482	GGC	2	6	2162096	2162101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243574
50055	NC_009482	GCCATC	2	12	2162120	2162131	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148243574
50056	NC_009482	GAA	2	6	2162162	2162167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243574
50057	NC_009482	GGT	2	6	2162168	2162173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243574
50058	NC_009482	CCA	2	6	2162276	2162281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243574
50059	NC_009482	TCT	2	6	2162293	2162298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243574
50060	NC_009482	GATCA	2	10	2162321	2162330	40 %	20 %	20 %	20 %	148243574
50061	NC_009482	AGG	2	6	2162426	2162431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243574
50062	NC_009482	GCA	2	6	2162460	2162465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243574
50063	NC_009482	TCGG	2	8	2162484	2162491	0 %	25 %	50 %	25 %	148243574
50064	NC_009482	TGA	2	6	2162500	2162505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243574
50065	NC_009482	TCA	2	6	2162511	2162516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243574
50066	NC_009482	CAG	2	6	2162549	2162554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243574
50067	NC_009482	ATC	2	6	2162558	2162563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243574
50068	NC_009482	AAC	3	9	2162672	2162680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243574
50069	NC_009482	CGC	2	6	2162683	2162688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243574
50070	NC_009482	TC	3	6	2162692	2162697	0 %	50 %	0 %	50 %	148243574
50071	NC_009482	AAG	2	6	2162703	2162708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243574
50072	NC_009482	CGG	2	6	2162752	2162757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243574
50073	NC_009482	CCA	2	6	2162858	2162863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243574
50074	NC_009482	ACC	2	6	2162943	2162948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243574
50075	NC_009482	GTT	2	6	2162977	2162982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148243574
50076	NC_009482	ACA	2	6	2163005	2163010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50077	NC_009482	GCT	2	6	2163020	2163025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243575
50078	NC_009482	GCG	2	6	2163160	2163165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243575
50079	NC_009482	GCA	2	6	2163195	2163200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243575
50080	NC_009482	TGA	2	6	2163213	2163218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243575
50081	NC_009482	CAG	2	6	2163324	2163329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243575
50082	NC_009482	CAG	2	6	2163361	2163366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243575
50083	NC_009482	CAA	2	6	2163397	2163402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243575
50084	NC_009482	GCC	2	6	2163409	2163414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243575
50085	NC_009482	GGC	2	6	2163424	2163429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243575
50086	NC_009482	GGT	2	6	2163451	2163456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243575
50087	NC_009482	CAC	2	6	2163463	2163468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243575
50088	NC_009482	GGT	2	6	2163508	2163513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243575
50089	NC_009482	GCCC	2	8	2163589	2163596	0 %	0 %	25 %	75 %	148243575
50090	NC_009482	TCA	2	6	2163606	2163611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243575
50091	NC_009482	GCC	2	6	2163677	2163682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243575
50092	NC_009482	TCT	2	6	2163704	2163709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243575
50093	NC_009482	AG	3	6	2163728	2163733	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50094	NC_009482	TGC	2	6	2163819	2163824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243576
50095	NC_009482	GCA	2	6	2163871	2163876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243576
50096	NC_009482	GC	3	6	2163969	2163974	0 %	0 %	50 %	50 %	148243576
50097	NC_009482	GCC	2	6	2163998	2164003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243576
50098	NC_009482	GCT	2	6	2164020	2164025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243576
50099	NC_009482	ATGG	2	8	2164060	2164067	25 %	25 %	50 %	0 %	148243576
50100	NC_009482	CCA	2	6	2164071	2164076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243576
50101	NC_009482	CTC	2	6	2164096	2164101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243576
50102	NC_009482	CATG	2	8	2164149	2164156	25 %	25 %	25 %	25 %	148243576
50103	NC_009482	CAC	2	6	2164241	2164246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243577
50104	NC_009482	CG	3	6	2164275	2164280	0 %	0 %	50 %	50 %	148243577
50105	NC_009482	ATGTC	2	10	2164291	2164300	20 %	40 %	20 %	20 %	148243577
50106	NC_009482	AGGG	2	8	2164312	2164319	25 %	0 %	75 %	0 %	148243577
50107	NC_009482	CCA	2	6	2164327	2164332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243577
50108	NC_009482	CAA	2	6	2164397	2164402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243577
50109	NC_009482	C	6	6	2164403	2164408	0 %	0 %	0 %	100 %	148243577
50110	NC_009482	GCGG	2	8	2164514	2164521	0 %	0 %	75 %	25 %	148243577
50111	NC_009482	GCCA	2	8	2164612	2164619	25 %	0 %	25 %	50 %	148243577
50112	NC_009482	GATC	2	8	2164708	2164715	25 %	25 %	25 %	25 %	148243577
50113	NC_009482	GAT	2	6	2164745	2164750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243577
50114	NC_009482	CTT	2	6	2164757	2164762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243577
50115	NC_009482	CAC	2	6	2164816	2164821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243577
50116	NC_009482	GTT	2	6	2164895	2164900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148243577
50117	NC_009482	GGT	2	6	2165042	2165047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243577
50118	NC_009482	CAC	2	6	2165069	2165074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243577
50119	NC_009482	TGC	2	6	2165244	2165249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243577
50120	NC_009482	GCC	2	6	2165286	2165291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243577
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50123	NC_009482	CTCA	2	8	2165431	2165438	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
50124	NC_009482	GTT	2	6	2165530	2165535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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50219	NC_009482	GCTG	2	8	2170055	2170062	0 %	25 %	50 %	25 %	148243582
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50221	NC_009482	CTG	2	6	2170105	2170110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243583
50222	NC_009482	GGAACT	2	12	2170130	2170141	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148243583
50223	NC_009482	GAA	2	6	2170185	2170190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243583
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50225	NC_009482	CTG	2	6	2170200	2170205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243583
50226	NC_009482	CAA	2	6	2170299	2170304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243583
50227	NC_009482	AGC	2	6	2170366	2170371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243583
50228	NC_009482	TGC	2	6	2170372	2170377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243583
50229	NC_009482	TGC	2	6	2170414	2170419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243583
50230	NC_009482	ATCA	2	8	2170454	2170461	50 %	25 %	0 %	25 %	148243583
50231	NC_009482	GCCAG	2	10	2170481	2170490	20 %	0 %	40 %	40 %	148243583
50232	NC_009482	CTG	2	6	2170554	2170559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243583
50233	NC_009482	CTG	2	6	2170575	2170580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243583
50234	NC_009482	GCT	2	6	2170619	2170624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243583
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50346	NC_009482	GGCC	2	8	2175623	2175630	0 %	0 %	50 %	50 %	148243588
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50463	NC_009482	CG	3	6	2180284	2180289	0 %	0 %	50 %	50 %	148243593
50464	NC_009482	TGC	2	6	2180299	2180304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243593
50465	NC_009482	GCC	2	6	2180345	2180350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243593
50466	NC_009482	GGC	2	6	2180365	2180370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243593
50467	NC_009482	AGGCCA	2	12	2180469	2180480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243593
50468	NC_009482	CAGCC	2	10	2180499	2180508	20 %	0 %	20 %	60 %	148243593
50469	NC_009482	CGG	2	6	2180549	2180554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243593
50470	NC_009482	GCT	2	6	2180604	2180609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243593
50471	NC_009482	AGC	2	6	2180678	2180683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243593
50472	NC_009482	GCC	2	6	2180684	2180689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243593
50473	NC_009482	CA	3	6	2180692	2180697	50 %	0 %	0 %	50 %	148243593
50474	NC_009482	GCT	2	6	2180712	2180717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243593
50475	NC_009482	CGG	2	6	2180728	2180733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243593
50476	NC_009482	GCG	2	6	2180768	2180773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243593
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50478	NC_009482	GCA	2	6	2180853	2180858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243593
50479	NC_009482	CAA	2	6	2180875	2180880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243593
50480	NC_009482	CTG	2	6	2180890	2180895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243593
50481	NC_009482	GGC	2	6	2180909	2180914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243593
50482	NC_009482	CTC	2	6	2180932	2180937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243593
50483	NC_009482	CCAATG	2	12	2180967	2180978	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148243593
50484	NC_009482	CTG	2	6	2180990	2180995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243593
50485	NC_009482	CGGC	2	8	2181019	2181026	0 %	0 %	50 %	50 %	148243593
50486	NC_009482	CAG	2	6	2181039	2181044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243593
50487	NC_009482	GCC	2	6	2181051	2181056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243593
50488	NC_009482	CG	3	6	2181082	2181087	0 %	0 %	50 %	50 %	148243593
50489	NC_009482	CAA	2	6	2181130	2181135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243593
50490	NC_009482	ATCA	2	8	2181187	2181194	50 %	25 %	0 %	25 %	148243593
50491	NC_009482	GCT	2	6	2181220	2181225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243593
50492	NC_009482	CAC	2	6	2181247	2181252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243593
50493	NC_009482	GCG	2	6	2181256	2181261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243593
50494	NC_009482	CGG	2	6	2181273	2181278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243593
50495	NC_009482	CCG	2	6	2181282	2181287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243593
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50497	NC_009482	GAC	2	6	2181372	2181377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243593
50498	NC_009482	CTG	2	6	2181418	2181423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243593
50499	NC_009482	TCGC	2	8	2181468	2181475	0 %	25 %	25 %	50 %	148243593
50500	NC_009482	CTG	2	6	2181542	2181547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243593

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