MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. RCC307 chromosome

Total Repeats: 51524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
49501	NC_009482	GAAA	2	8	2138164	2138171	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49502	NC_009482	ATC	2	6	2138191	2138196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49503	NC_009482	GCT	2	6	2138277	2138282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243546
49504	NC_009482	GAC	2	6	2138297	2138302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243546
49505	NC_009482	CTC	2	6	2138391	2138396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243546
49506	NC_009482	TGG	2	6	2138445	2138450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243546
49507	NC_009482	TCG	2	6	2138472	2138477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243546
49508	NC_009482	TAAC	2	8	2138506	2138513	50 %	25 %	0 %	25 %	148243546
49509	NC_009482	GAA	2	6	2138579	2138584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49510	NC_009482	TAA	2	6	2138647	2138652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49511	NC_009482	CAA	2	6	2138663	2138668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49512	NC_009482	AGT	2	6	2138693	2138698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49513	NC_009482	TA	3	6	2138795	2138800	50 %	50 %	0 %	0 %	148243547
49514	NC_009482	ACA	2	6	2138893	2138898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243547
49515	NC_009482	GCC	2	6	2139125	2139130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243547
49516	NC_009482	TGG	2	6	2139172	2139177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243547
49517	NC_009482	CAG	2	6	2139211	2139216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243547
49518	NC_009482	AAG	2	6	2139245	2139250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243547
49519	NC_009482	CTT	2	6	2139256	2139261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243547
49520	NC_009482	ACC	2	6	2139269	2139274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243547
49521	NC_009482	AGC	2	6	2139296	2139301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243547
49522	NC_009482	CAAC	2	8	2139507	2139514	50 %	0 %	0 %	50 %	148243547
49523	NC_009482	CAA	2	6	2139625	2139630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243547
49524	NC_009482	ACA	2	6	2139753	2139758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243547
49525	NC_009482	CCT	2	6	2139952	2139957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243547
49526	NC_009482	TGC	2	6	2139996	2140001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243547
49527	NC_009482	ATCA	2	8	2140039	2140046	50 %	25 %	0 %	25 %	148243547
49528	NC_009482	CAC	2	6	2140081	2140086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49529	NC_009482	TC	3	6	2140092	2140097	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49530	NC_009482	CTT	2	6	2140185	2140190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243548
49531	NC_009482	TGCC	2	8	2140220	2140227	0 %	25 %	25 %	50 %	148243548
49532	NC_009482	TTC	2	6	2140285	2140290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243548
49533	NC_009482	GAA	2	6	2140405	2140410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243548
49534	NC_009482	AGAT	2	8	2140448	2140455	50 %	25 %	25 %	0 %	148243548
49535	NC_009482	AGA	2	6	2140499	2140504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243548
49536	NC_009482	TAC	2	6	2140551	2140556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243548
49537	NC_009482	GCA	2	6	2140763	2140768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243548
49538	NC_009482	TCT	2	6	2140871	2140876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243548
49539	NC_009482	AAG	2	6	2140880	2140885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243548
49540	NC_009482	ATT	2	6	2141026	2141031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49541	NC_009482	CTG	2	6	2141095	2141100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49542	NC_009482	CCA	2	6	2141183	2141188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243549
49543	NC_009482	CTGA	2	8	2141193	2141200	25 %	25 %	25 %	25 %	148243549
49544	NC_009482	GGT	2	6	2141205	2141210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243549
49545	NC_009482	CGC	2	6	2141231	2141236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243549
49546	NC_009482	GTA	2	6	2141247	2141252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243549
49547	NC_009482	TGC	2	6	2141281	2141286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243549
49548	NC_009482	CCA	2	6	2141288	2141293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243549
49549	NC_009482	GCA	2	6	2141294	2141299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243549
49550	NC_009482	ATG	2	6	2141320	2141325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243549
49551	NC_009482	CGC	2	6	2141326	2141331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243549
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49553	NC_009482	TGC	2	6	2141437	2141442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243549
49554	NC_009482	CCT	2	6	2141464	2141469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243549
49555	NC_009482	AAG	2	6	2141479	2141484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243549
49556	NC_009482	C	7	7	2141544	2141550	0 %	0 %	0 %	100 %	148243549
49557	NC_009482	CAG	2	6	2141571	2141576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243549
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49559	NC_009482	GGC	2	6	2141656	2141661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243549
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49563	NC_009482	GTA	2	6	2141832	2141837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243549
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49567	NC_009482	GCA	2	6	2141965	2141970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243550
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49571	NC_009482	GCA	2	6	2142115	2142120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243550
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49574	NC_009482	GCCG	2	8	2142265	2142272	0 %	0 %	50 %	50 %	148243550
49575	NC_009482	GCT	2	6	2142289	2142294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243550
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49580	NC_009482	AG	3	6	2142604	2142609	50 %	0 %	50 %	0 %	148243550
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49586	NC_009482	AGGCC	2	10	2142799	2142808	20 %	0 %	40 %	40 %	148243551
49587	NC_009482	GCC	2	6	2142877	2142882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243551
49588	NC_009482	GC	3	6	2142966	2142971	0 %	0 %	50 %	50 %	148243551
49589	NC_009482	ACC	2	6	2142988	2142993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243551
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49592	NC_009482	AGCCA	2	10	2143121	2143130	40 %	0 %	20 %	40 %	148243551
49593	NC_009482	AGA	2	6	2143155	2143160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243551
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49603	NC_009482	A	6	6	2143537	2143542	100 %	0 %	0 %	0 %	148243551
49604	NC_009482	GCA	2	6	2143653	2143658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243551
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49607	NC_009482	TGT	2	6	2143721	2143726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148243551
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49725	NC_009482	CAAC	2	8	2148305	2148312	50 %	0 %	0 %	50 %	148243556
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49732	NC_009482	GTG	3	9	2148577	2148585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243557
49733	NC_009482	CCTC	2	8	2148608	2148615	0 %	25 %	0 %	75 %	148243557
49734	NC_009482	GCA	2	6	2148663	2148668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243557
49735	NC_009482	CGC	2	6	2148751	2148756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243557
49736	NC_009482	GCA	2	6	2148759	2148764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243557
49737	NC_009482	ACC	3	9	2148788	2148796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243557
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49739	NC_009482	CG	3	6	2148879	2148884	0 %	0 %	50 %	50 %	148243557
49740	NC_009482	TCC	2	6	2148911	2148916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243557
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49744	NC_009482	GCG	2	6	2149065	2149070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243558
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49751	NC_009482	TG	3	6	2149258	2149263	0 %	50 %	50 %	0 %	148243558
49752	NC_009482	GCT	2	6	2149269	2149274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243558
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49759	NC_009482	CGC	2	6	2149639	2149644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243558
49760	NC_009482	TGG	2	6	2149661	2149666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243558
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49762	NC_009482	GCG	2	6	2149715	2149720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243558
49763	NC_009482	GCCTG	2	10	2149851	2149860	0 %	20 %	40 %	40 %	148243558
49764	NC_009482	CG	3	6	2149863	2149868	0 %	0 %	50 %	50 %	148243558
49765	NC_009482	TTC	2	6	2149906	2149911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243558
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49796	NC_009482	CCAA	2	8	2150834	2150841	50 %	0 %	0 %	50 %	148243559
49797	NC_009482	CAGG	2	8	2150858	2150865	25 %	0 %	50 %	25 %	148243559
49798	NC_009482	GCA	2	6	2150887	2150892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243559
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49804	NC_009482	GCA	2	6	2151152	2151157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243560
49805	NC_009482	TCA	2	6	2151171	2151176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243560
49806	NC_009482	GCA	2	6	2151283	2151288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243561
49807	NC_009482	GCCG	2	8	2151337	2151344	0 %	0 %	50 %	50 %	148243561
49808	NC_009482	ACC	2	6	2151352	2151357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243561
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49830	NC_009482	CAC	2	6	2152268	2152273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243562
49831	NC_009482	CAG	2	6	2152276	2152281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243562
49832	NC_009482	CGAT	2	8	2152282	2152289	25 %	25 %	25 %	25 %	148243562
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49834	NC_009482	GGC	3	9	2152428	2152436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243562
49835	NC_009482	CAT	2	6	2152448	2152453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243562
49836	NC_009482	TGC	2	6	2152477	2152482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243562
49837	NC_009482	CAG	2	6	2152484	2152489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243562
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49840	NC_009482	CCA	2	6	2152556	2152561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243562
49841	NC_009482	CGC	2	6	2152611	2152616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243562
49842	NC_009482	GCC	2	6	2152626	2152631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243562
49843	NC_009482	CAT	2	6	2152664	2152669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243562
49844	NC_009482	GGTGA	2	10	2152701	2152710	20 %	20 %	60 %	0 %	148243562
49845	NC_009482	G	6	6	2152753	2152758	0 %	0 %	100 %	0 %	148243562
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49847	NC_009482	ACA	2	6	2152786	2152791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243562
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49952	NC_009482	GTGG	2	8	2157820	2157827	0 %	25 %	75 %	0 %	148243568
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49959	NC_009482	CGA	2	6	2158114	2158119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243568
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