MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. WH 7803 chromosome

Total Repeats: 50037

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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48502	NC_009481	AAC	2	6	2294063	2294068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148240800
48503	NC_009481	GAG	2	6	2294075	2294080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148240800
48504	NC_009481	GGA	2	6	2294095	2294100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148240800
48505	NC_009481	TC	3	6	2294144	2294149	0 %	50 %	0 %	50 %	148240800
48506	NC_009481	AAG	2	6	2294193	2294198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148240800
48507	NC_009481	CTG	2	6	2294222	2294227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240800
48508	NC_009481	A	6	6	2294328	2294333	100 %	0 %	0 %	0 %	148240800
48509	NC_009481	GCA	2	6	2294334	2294339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240800
48510	NC_009481	GGTCG	2	10	2294342	2294351	0 %	20 %	60 %	20 %	148240800
48511	NC_009481	GTG	2	6	2294417	2294422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240800
48512	NC_009481	GTG	2	6	2294446	2294451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240800
48513	NC_009481	GGT	2	6	2294452	2294457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240800
48514	NC_009481	GGA	2	6	2294467	2294472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148240800
48515	NC_009481	CGA	2	6	2294491	2294496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240800
48516	NC_009481	GGC	2	6	2294515	2294520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240800
48517	NC_009481	GCT	2	6	2294524	2294529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240800
48518	NC_009481	AGTC	2	8	2294556	2294563	25 %	25 %	25 %	25 %	148240800
48519	NC_009481	GC	3	6	2294650	2294655	0 %	0 %	50 %	50 %	148240801
48520	NC_009481	GCT	2	6	2294764	2294769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240801
48521	NC_009481	GCT	2	6	2294839	2294844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240801
48522	NC_009481	CCGCG	2	10	2294869	2294878	0 %	0 %	40 %	60 %	148240801
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48528	NC_009481	CTG	2	6	2295059	2295064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240802
48529	NC_009481	GC	3	6	2295120	2295125	0 %	0 %	50 %	50 %	148240802
48530	NC_009481	CAG	2	6	2295145	2295150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240802
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48535	NC_009481	TCAA	2	8	2295402	2295409	50 %	25 %	0 %	25 %	148240802
48536	NC_009481	GGCG	2	8	2295439	2295446	0 %	0 %	75 %	25 %	148240802
48537	NC_009481	GTG	2	6	2295452	2295457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240802
48538	NC_009481	GAG	2	6	2295458	2295463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148240802
48539	NC_009481	TGA	2	6	2295495	2295500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240802
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48541	NC_009481	TGC	2	6	2295534	2295539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240802
48542	NC_009481	GGGCTG	2	12	2295599	2295610	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	148240802
48543	NC_009481	CCAG	2	8	2295738	2295745	25 %	0 %	25 %	50 %	148240802
48544	NC_009481	TGC	3	9	2295804	2295812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240802
48545	NC_009481	GCACCA	2	12	2295819	2295830	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	148240802
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48550	NC_009481	TGG	2	6	2296026	2296031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240802
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48554	NC_009481	GGTG	2	8	2296174	2296181	0 %	25 %	75 %	0 %	148240802
48555	NC_009481	CAC	2	6	2296243	2296248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240802
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48561	NC_009481	CAT	2	6	2296675	2296680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240802
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48572	NC_009481	CCTC	2	8	2297253	2297260	0 %	25 %	0 %	75 %	148240802
48573	NC_009481	CTG	2	6	2297300	2297305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240802
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48603	NC_009481	TGGA	2	8	2298370	2298377	25 %	25 %	50 %	0 %	148240803
48604	NC_009481	CAA	2	6	2298398	2298403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148240803
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48607	NC_009481	CTGG	2	8	2298573	2298580	0 %	25 %	50 %	25 %	148240803
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48610	NC_009481	AACTCA	2	12	2298679	2298690	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	148240803
48611	NC_009481	ACG	2	6	2298691	2298696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240803
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48613	NC_009481	TTCA	2	8	2298826	2298833	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48614	NC_009481	CTG	2	6	2298871	2298876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240804
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48616	NC_009481	T	6	6	2299027	2299032	0 %	100 %	0 %	0 %	148240804
48617	NC_009481	CTTCA	2	10	2299057	2299066	20 %	40 %	0 %	40 %	148240804
48618	NC_009481	GCA	2	6	2299092	2299097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240804
48619	NC_009481	CCT	2	6	2299152	2299157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240804
48620	NC_009481	GCA	2	6	2299224	2299229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240804
48621	NC_009481	CGGTGC	2	12	2299264	2299275	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148240804
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48624	NC_009481	TCG	2	6	2299395	2299400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48625	NC_009481	CCG	2	6	2299551	2299556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240805
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48732	NC_009481	GCTG	2	8	2303865	2303872	0 %	25 %	50 %	25 %	148240808
48733	NC_009481	GGCT	2	8	2303873	2303880	0 %	25 %	50 %	25 %	148240808
48734	NC_009481	CGC	2	6	2303942	2303947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240808
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48736	NC_009481	CATGGG	2	12	2304035	2304046	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148240809
48737	NC_009481	GGCC	2	8	2304080	2304087	0 %	0 %	50 %	50 %	148240809
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48750	NC_009481	ATGG	2	8	2304564	2304571	25 %	25 %	50 %	0 %	148240809
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48792	NC_009481	GTT	2	6	2306568	2306573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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48813	NC_009481	AAAAGC	2	12	2307905	2307916	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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48815	NC_009481	CAA	2	6	2308013	2308018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148240812
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48819	NC_009481	GC	3	6	2308172	2308177	0 %	0 %	50 %	50 %	148240812
48820	NC_009481	AAC	2	6	2308208	2308213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148240812
48821	NC_009481	TGT	2	6	2308267	2308272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148240813
48822	NC_009481	G	6	6	2308373	2308378	0 %	0 %	100 %	0 %	148240813
48823	NC_009481	ACG	2	6	2308413	2308418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240813
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48826	NC_009481	ACA	2	6	2308693	2308698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48827	NC_009481	CTC	2	6	2308806	2308811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240814
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48829	NC_009481	CAGG	2	8	2308914	2308921	25 %	0 %	50 %	25 %	148240814
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48831	NC_009481	CCG	2	6	2309105	2309110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240814
48832	NC_009481	AT	3	6	2309158	2309163	50 %	50 %	0 %	0 %	148240814
48833	NC_009481	CG	3	6	2309192	2309197	0 %	0 %	50 %	50 %	148240814
48834	NC_009481	GCA	2	6	2309213	2309218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240814
48835	NC_009481	TCG	2	6	2309238	2309243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240814
48836	NC_009481	TTGAGC	2	12	2309254	2309265	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148240814
48837	NC_009481	GCGCG	2	10	2309290	2309299	0 %	0 %	60 %	40 %	148240814
48838	NC_009481	CGG	2	6	2309429	2309434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240814
48839	NC_009481	CAG	2	6	2309463	2309468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240814
48840	NC_009481	GTC	2	6	2309479	2309484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240814
48841	NC_009481	CCT	2	6	2309492	2309497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240814
48842	NC_009481	CGAG	2	8	2309503	2309510	25 %	0 %	50 %	25 %	148240814
48843	NC_009481	GCA	2	6	2309518	2309523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240814
48844	NC_009481	GCC	2	6	2309536	2309541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240814
48845	NC_009481	AGC	2	6	2309551	2309556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240814
48846	NC_009481	CAA	2	6	2309559	2309564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148240814
48847	NC_009481	CTG	2	6	2309646	2309651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240814
48848	NC_009481	CTC	2	6	2309676	2309681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240814
48849	NC_009481	GCA	2	6	2309691	2309696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240814
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48954	NC_009481	AAC	2	6	2315167	2315172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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48964	NC_009481	GTT	2	6	2315597	2315602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148240820
48965	NC_009481	AGC	2	6	2315640	2315645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240820
48966	NC_009481	CT	3	6	2315719	2315724	0 %	50 %	0 %	50 %	148240820
48967	NC_009481	TCCGCT	2	12	2315729	2315740	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	148240820
48968	NC_009481	GCA	2	6	2315806	2315811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240820
48969	NC_009481	GCT	2	6	2315927	2315932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240820
48970	NC_009481	CGA	2	6	2316000	2316005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240821
48971	NC_009481	CG	3	6	2316148	2316153	0 %	0 %	50 %	50 %	148240821
48972	NC_009481	TTG	2	6	2316218	2316223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148240821
48973	NC_009481	CTG	2	6	2316236	2316241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240821
48974	NC_009481	CAA	2	6	2316250	2316255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148240821
48975	NC_009481	ATTG	2	8	2316336	2316343	25 %	50 %	25 %	0 %	148240821
48976	NC_009481	TCC	2	6	2316382	2316387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240821
48977	NC_009481	CGA	2	6	2316408	2316413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240821
48978	NC_009481	CTC	2	6	2316436	2316441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240821
48979	NC_009481	GAA	2	6	2316571	2316576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148240821
48980	NC_009481	GCA	2	6	2316578	2316583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240821
48981	NC_009481	T	6	6	2316873	2316878	0 %	100 %	0 %	0 %	148240821
48982	NC_009481	GCA	2	6	2316901	2316906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240821
48983	NC_009481	GCT	2	6	2316924	2316929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240821
48984	NC_009481	GAC	2	6	2317025	2317030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240821
48985	NC_009481	CG	3	6	2317080	2317085	0 %	0 %	50 %	50 %	148240821
48986	NC_009481	CGA	2	6	2317207	2317212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240821
48987	NC_009481	CAC	2	6	2317276	2317281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240822
48988	NC_009481	CAA	2	6	2317316	2317321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148240822
48989	NC_009481	AGC	3	9	2317336	2317344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240822
48990	NC_009481	CCA	2	6	2317378	2317383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240822
48991	NC_009481	GTT	3	9	2317459	2317467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148240822
48992	NC_009481	CA	3	6	2317492	2317497	50 %	0 %	0 %	50 %	148240822
48993	NC_009481	CCAT	2	8	2317539	2317546	25 %	25 %	0 %	50 %	148240822
48994	NC_009481	GCA	2	6	2317587	2317592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240822
48995	NC_009481	GAAT	2	8	2317650	2317657	50 %	25 %	25 %	0 %	148240822
48996	NC_009481	AGG	2	6	2317710	2317715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148240823
48997	NC_009481	CAT	2	6	2317736	2317741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240823
48998	NC_009481	GAT	2	6	2317748	2317753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240823
48999	NC_009481	GCG	2	6	2317835	2317840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240823
49000	NC_009481	CGA	2	6	2318147	2318152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240824

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