MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. WH 7803 chromosome

Total Repeats: 50037

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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48002	NC_009481	CAG	2	6	2270246	2270251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240774
48003	NC_009481	C	6	6	2270256	2270261	0 %	0 %	0 %	100 %	148240774
48004	NC_009481	ACG	2	6	2270263	2270268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240774
48005	NC_009481	CTGCA	2	10	2270288	2270297	20 %	20 %	20 %	40 %	148240774
48006	NC_009481	GCC	2	6	2270358	2270363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240774
48007	NC_009481	TCC	2	6	2270427	2270432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240774
48008	NC_009481	ACC	2	6	2270445	2270450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240774
48009	NC_009481	ACC	2	6	2270454	2270459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240774
48010	NC_009481	CG	3	6	2270532	2270537	0 %	0 %	50 %	50 %	148240774
48011	NC_009481	ATG	2	6	2270562	2270567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240774
48012	NC_009481	CAG	2	6	2270642	2270647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240774
48013	NC_009481	GAT	2	6	2270654	2270659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240774
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48019	NC_009481	CAG	2	6	2270815	2270820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240775
48020	NC_009481	GCC	2	6	2270850	2270855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240775
48021	NC_009481	GCT	2	6	2270925	2270930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240775
48022	NC_009481	TGG	2	6	2270972	2270977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240775
48023	NC_009481	CAG	2	6	2270980	2270985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240775
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48026	NC_009481	CCTGG	2	10	2271085	2271094	0 %	20 %	40 %	40 %	148240775
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48034	NC_009481	TGC	2	6	2271344	2271349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240775
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48041	NC_009481	GGCCTG	2	12	2271701	2271712	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148240776
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48045	NC_009481	CGA	2	6	2271865	2271870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240776
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48047	NC_009481	TCCGCC	2	12	2271942	2271953	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	148240776
48048	NC_009481	CCGC	2	8	2271976	2271983	0 %	0 %	25 %	75 %	148240776
48049	NC_009481	GCC	2	6	2272023	2272028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240776
48050	NC_009481	CGC	2	6	2272033	2272038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240776
48051	NC_009481	GCACCG	2	12	2272054	2272065	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148240776
48052	NC_009481	CCGC	2	8	2272090	2272097	0 %	0 %	25 %	75 %	148240776
48053	NC_009481	CAC	2	6	2272106	2272111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240776
48054	NC_009481	TCAGC	2	10	2272126	2272135	20 %	20 %	20 %	40 %	148240776
48055	NC_009481	GAAG	2	8	2272136	2272143	50 %	0 %	50 %	0 %	148240776
48056	NC_009481	TCA	2	6	2272152	2272157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240776
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48099	NC_009481	GAC	2	6	2274607	2274612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240777
48100	NC_009481	CAG	2	6	2274618	2274623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240777
48101	NC_009481	CT	3	6	2274710	2274715	0 %	50 %	0 %	50 %	148240777
48102	NC_009481	CGC	2	6	2274756	2274761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240777
48103	NC_009481	CAG	2	6	2274796	2274801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240777
48104	NC_009481	GAAC	2	8	2274993	2275000	50 %	0 %	25 %	25 %	148240777
48105	NC_009481	TGC	2	6	2275014	2275019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240777
48106	NC_009481	CGG	2	6	2275127	2275132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240777
48107	NC_009481	TGGAT	2	10	2275250	2275259	20 %	40 %	40 %	0 %	148240777
48108	NC_009481	CGA	2	6	2275305	2275310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240777
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48110	NC_009481	CAG	3	9	2275398	2275406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240777
48111	NC_009481	TCGT	2	8	2275486	2275493	0 %	50 %	25 %	25 %	148240777
48112	NC_009481	TGA	2	6	2275511	2275516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240777
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48115	NC_009481	CCAAC	2	10	2275668	2275677	40 %	0 %	0 %	60 %	148240777
48116	NC_009481	GC	3	6	2275766	2275771	0 %	0 %	50 %	50 %	148240778
48117	NC_009481	GCT	3	9	2275787	2275795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240778
48118	NC_009481	GCTG	2	8	2275822	2275829	0 %	25 %	50 %	25 %	148240778
48119	NC_009481	CCT	2	6	2275871	2275876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240778
48120	NC_009481	ACCT	2	8	2275947	2275954	25 %	25 %	0 %	50 %	148240778
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48128	NC_009481	CTCG	2	8	2276183	2276190	0 %	25 %	25 %	50 %	148240778
48129	NC_009481	TGC	2	6	2276203	2276208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240778
48130	NC_009481	C	6	6	2276222	2276227	0 %	0 %	0 %	100 %	148240778
48131	NC_009481	TGC	2	6	2276248	2276253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240778
48132	NC_009481	ATC	2	6	2276301	2276306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240778
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48205	NC_009481	CCG	2	6	2279977	2279982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240784
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48215	NC_009481	CTG	3	9	2280632	2280640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240785
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48220	NC_009481	GGGAG	2	10	2280829	2280838	20 %	0 %	80 %	0 %	148240785
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48226	NC_009481	GAG	2	6	2281103	2281108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148240785
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48229	NC_009481	C	6	6	2281306	2281311	0 %	0 %	0 %	100 %	148240786
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48343	NC_009481	GGCT	2	8	2286964	2286971	0 %	25 %	50 %	25 %	148240793
48344	NC_009481	GC	3	6	2287020	2287025	0 %	0 %	50 %	50 %	148240793
48345	NC_009481	GGTC	2	8	2287053	2287060	0 %	25 %	50 %	25 %	148240793
48346	NC_009481	GCC	2	6	2287249	2287254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240793
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48464	NC_009481	CAA	2	6	2292543	2292548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148240797
48465	NC_009481	CCG	2	6	2292599	2292604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240798
48466	NC_009481	CT	3	6	2292613	2292618	0 %	50 %	0 %	50 %	148240798
48467	NC_009481	GTG	2	6	2292623	2292628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240798
48468	NC_009481	CTT	2	6	2292679	2292684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148240798
48469	NC_009481	GC	3	6	2292761	2292766	0 %	0 %	50 %	50 %	148240798
48470	NC_009481	GCA	4	12	2292791	2292802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240798
48471	NC_009481	CGG	2	6	2292835	2292840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240798
48472	NC_009481	CAC	2	6	2292851	2292856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240798
48473	NC_009481	GCAC	2	8	2292976	2292983	25 %	0 %	25 %	50 %	148240798
48474	NC_009481	GCT	2	6	2292997	2293002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240798
48475	NC_009481	GTG	3	9	2293025	2293033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240798
48476	NC_009481	CTG	2	6	2293049	2293054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240798
48477	NC_009481	GCC	2	6	2293088	2293093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240798
48478	NC_009481	GCT	2	6	2293096	2293101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240798
48479	NC_009481	ACA	2	6	2293129	2293134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148240798
48480	NC_009481	GCA	2	6	2293148	2293153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240798
48481	NC_009481	CGC	2	6	2293154	2293159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240798
48482	NC_009481	GGC	2	6	2293170	2293175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240798
48483	NC_009481	TCA	2	6	2293232	2293237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48484	NC_009481	GCAC	2	8	2293309	2293316	25 %	0 %	25 %	50 %	148240799
48485	NC_009481	CG	3	6	2293381	2293386	0 %	0 %	50 %	50 %	148240799
48486	NC_009481	CCT	2	6	2293400	2293405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240799
48487	NC_009481	CCGG	2	8	2293420	2293427	0 %	0 %	50 %	50 %	148240799
48488	NC_009481	GC	3	6	2293462	2293467	0 %	0 %	50 %	50 %	148240799
48489	NC_009481	TGGC	2	8	2293486	2293493	0 %	25 %	50 %	25 %	148240799
48490	NC_009481	AGC	2	6	2293503	2293508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240799
48491	NC_009481	CCGG	2	8	2293581	2293588	0 %	0 %	50 %	50 %	148240799
48492	NC_009481	CAGC	2	8	2293749	2293756	25 %	0 %	25 %	50 %	148240799
48493	NC_009481	GAT	2	6	2293853	2293858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240800
48494	NC_009481	CCAG	2	8	2293861	2293868	25 %	0 %	25 %	50 %	148240800
48495	NC_009481	CCTC	2	8	2293878	2293885	0 %	25 %	0 %	75 %	148240800
48496	NC_009481	GCC	2	6	2293886	2293891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240800
48497	NC_009481	CGC	2	6	2293919	2293924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240800
48498	NC_009481	CCT	2	6	2293930	2293935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240800
48499	NC_009481	CGC	2	6	2293949	2293954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240800
48500	NC_009481	GAA	2	6	2294005	2294010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148240800

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