MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. WH 7803 chromosome

Total Repeats: 50037

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
47501	NC_009481	CTG	2	6	2248206	2248211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240751
47502	NC_009481	GTGG	2	8	2248212	2248219	0 %	25 %	75 %	0 %	148240751
47503	NC_009481	CAA	2	6	2248248	2248253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148240751
47504	NC_009481	CCA	2	6	2248254	2248259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240751
47505	NC_009481	CTG	2	6	2248330	2248335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240751
47506	NC_009481	CGCA	2	8	2248392	2248399	25 %	0 %	25 %	50 %	148240752
47507	NC_009481	GCA	2	6	2248630	2248635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240752
47508	NC_009481	ACCA	2	8	2248985	2248992	50 %	0 %	0 %	50 %	148240752
47509	NC_009481	ATGA	2	8	2249010	2249017	50 %	25 %	25 %	0 %	148240752
47510	NC_009481	CAT	2	6	2249081	2249086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240752
47511	NC_009481	C	6	6	2249185	2249190	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
47512	NC_009481	TGC	2	6	2249342	2249347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240753
47513	NC_009481	CTG	2	6	2249380	2249385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240753
47514	NC_009481	GCCT	2	8	2249404	2249411	0 %	25 %	25 %	50 %	148240753
47515	NC_009481	CTG	2	6	2249437	2249442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240753
47516	NC_009481	CTGG	2	8	2249469	2249476	0 %	25 %	50 %	25 %	148240753
47517	NC_009481	CTT	2	6	2249481	2249486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148240753
47518	NC_009481	GCG	2	6	2249495	2249500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240753
47519	NC_009481	GATT	2	8	2249523	2249530	25 %	50 %	25 %	0 %	148240753
47520	NC_009481	CAC	2	6	2249551	2249556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240753
47521	NC_009481	CAC	2	6	2249581	2249586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240753
47522	NC_009481	TGG	2	6	2249605	2249610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240753
47523	NC_009481	TAC	2	6	2249692	2249697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240753
47524	NC_009481	GCTG	2	8	2249699	2249706	0 %	25 %	50 %	25 %	148240753
47525	NC_009481	AAC	2	6	2249707	2249712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148240753
47526	NC_009481	CTG	3	9	2249719	2249727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240753
47527	NC_009481	CTG	2	6	2249746	2249751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240753
47528	NC_009481	GGA	2	6	2249779	2249784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148240753
47529	NC_009481	CTCGTG	2	12	2249818	2249829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240753
47530	NC_009481	CTGG	2	8	2249841	2249848	0 %	25 %	50 %	25 %	148240753
47531	NC_009481	CCAC	2	8	2249858	2249865	25 %	0 %	0 %	75 %	148240753
47532	NC_009481	GCG	2	6	2249891	2249896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240753
47533	NC_009481	CAA	3	9	2249907	2249915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148240753
47534	NC_009481	GTGG	2	8	2249916	2249923	0 %	25 %	75 %	0 %	148240753
47535	NC_009481	CAA	2	6	2249952	2249957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148240753
47536	NC_009481	CCA	2	6	2249958	2249963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240753
47537	NC_009481	CCGC	2	8	2249978	2249985	0 %	0 %	25 %	75 %	148240753
47538	NC_009481	GC	3	6	2250039	2250044	0 %	0 %	50 %	50 %	148240753
47539	NC_009481	CGT	2	6	2250080	2250085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240753
47540	NC_009481	ATCG	2	8	2250092	2250099	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47541	NC_009481	TCG	3	9	2250105	2250113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47542	NC_009481	ATC	2	6	2250120	2250125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47543	NC_009481	TGG	2	6	2250193	2250198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240754
47544	NC_009481	TGA	2	6	2250268	2250273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240754
47545	NC_009481	CCG	2	6	2250287	2250292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240754
47546	NC_009481	AGG	2	6	2250298	2250303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148240754
47547	NC_009481	GAA	2	6	2250380	2250385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148240754
47548	NC_009481	GAC	2	6	2250399	2250404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240754
47549	NC_009481	GAG	2	6	2250450	2250455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148240754
47550	NC_009481	CCA	2	6	2250457	2250462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240754
47551	NC_009481	CCG	2	6	2250476	2250481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240754
47552	NC_009481	CACCG	2	10	2250504	2250513	20 %	0 %	20 %	60 %	148240754
47553	NC_009481	CTG	2	6	2250553	2250558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240754
47554	NC_009481	CGC	2	6	2250736	2250741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240755
47555	NC_009481	GCC	2	6	2250801	2250806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240755
47556	NC_009481	GGC	2	6	2250838	2250843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240755
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47558	NC_009481	CGG	2	6	2250935	2250940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240755
47559	NC_009481	TGC	2	6	2250944	2250949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240755
47560	NC_009481	CTGG	2	8	2250990	2250997	0 %	25 %	50 %	25 %	148240755
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47563	NC_009481	TCGA	2	8	2251075	2251082	25 %	25 %	25 %	25 %	148240755
47564	NC_009481	TCAG	2	8	2251223	2251230	25 %	25 %	25 %	25 %	148240755
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47567	NC_009481	TGATC	2	10	2251380	2251389	20 %	40 %	20 %	20 %	148240755
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47570	NC_009481	CAGG	2	8	2251565	2251572	25 %	0 %	50 %	25 %	148240755
47571	NC_009481	AGG	2	6	2251580	2251585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148240755
47572	NC_009481	GCT	2	6	2251593	2251598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240755
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47577	NC_009481	TGA	2	6	2251952	2251957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240755
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47585	NC_009481	GCC	2	6	2252198	2252203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240756
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47588	NC_009481	GCC	2	6	2252349	2252354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240756
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47606	NC_009481	CGG	2	6	2252980	2252985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240756
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47614	NC_009481	CTGC	2	8	2253227	2253234	0 %	25 %	25 %	50 %	148240756
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47729	NC_009481	GC	3	6	2258261	2258266	0 %	0 %	50 %	50 %	148240764
47730	NC_009481	CTC	2	6	2258283	2258288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240764
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47850	NC_009481	GGT	2	6	2263371	2263376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240768
47851	NC_009481	GCT	2	6	2263443	2263448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240768
47852	NC_009481	CGGG	2	8	2263455	2263462	0 %	0 %	75 %	25 %	148240768
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47895	NC_009481	GCTTC	2	10	2265284	2265293	0 %	40 %	20 %	40 %	148240769
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47904	NC_009481	CCCT	2	8	2265569	2265576	0 %	25 %	0 %	75 %	148240770
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47908	NC_009481	ACA	2	6	2265989	2265994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148240770
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47912	NC_009481	CAG	2	6	2266194	2266199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240770
47913	NC_009481	CAG	2	6	2266203	2266208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240770
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47917	NC_009481	CCT	2	6	2266350	2266355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240770
47918	NC_009481	ATC	2	6	2266382	2266387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240770
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47922	NC_009481	CAAGC	2	10	2266545	2266554	40 %	0 %	20 %	40 %	148240770
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47925	NC_009481	C	6	6	2266622	2266627	0 %	0 %	0 %	100 %	148240771
47926	NC_009481	GCTG	2	8	2266652	2266659	0 %	25 %	50 %	25 %	148240771
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47928	NC_009481	CTCCAA	2	12	2266738	2266749	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	148240771
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47934	NC_009481	GGT	2	6	2267311	2267316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240771
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47943	NC_009481	GCT	3	9	2267625	2267633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240771
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47945	NC_009481	TCG	2	6	2267707	2267712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240771
47946	NC_009481	AAG	2	6	2267807	2267812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148240771
47947	NC_009481	CCAGG	2	10	2267914	2267923	20 %	0 %	40 %	40 %	148240771
47948	NC_009481	CCG	2	6	2268008	2268013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47949	NC_009481	CTG	2	6	2268088	2268093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240772
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47951	NC_009481	GCT	2	6	2268264	2268269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240772
47952	NC_009481	ATC	2	6	2268271	2268276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240772
47953	NC_009481	GCG	2	6	2268333	2268338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240772
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47955	NC_009481	TCA	2	6	2268377	2268382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240772
47956	NC_009481	CTG	2	6	2268385	2268390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240772
47957	NC_009481	CAC	2	6	2268423	2268428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240772
47958	NC_009481	AGC	2	6	2268429	2268434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240772
47959	NC_009481	GAT	2	6	2268435	2268440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240772
47960	NC_009481	GCC	2	6	2268463	2268468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240772
47961	NC_009481	GCA	2	6	2268516	2268521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240772
47962	NC_009481	TC	3	6	2268537	2268542	0 %	50 %	0 %	50 %	148240772
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