MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. WH 7803 chromosome

Total Repeats: 50037

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
45501	NC_009481	CGA	2	6	2159260	2159265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45502	NC_009481	CAG	2	6	2159379	2159384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240675
45503	NC_009481	CGA	2	6	2159399	2159404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240675
45504	NC_009481	CCT	2	6	2159405	2159410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240675
45505	NC_009481	CGAAA	2	10	2159411	2159420	60 %	0 %	20 %	20 %	148240675
45506	NC_009481	GGC	2	6	2159444	2159449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240675
45507	NC_009481	GTG	4	12	2159475	2159486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240675
45508	NC_009481	CAC	2	6	2159518	2159523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240675
45509	NC_009481	G	6	6	2159620	2159625	0 %	0 %	100 %	0 %	148240675
45510	NC_009481	TGGC	2	8	2159675	2159682	0 %	25 %	50 %	25 %	148240675
45511	NC_009481	GTG	2	6	2159715	2159720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240675
45512	NC_009481	ACC	2	6	2159734	2159739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240675
45513	NC_009481	CGGA	3	12	2159809	2159820	25 %	0 %	50 %	25 %	148240675
45514	NC_009481	CTC	2	6	2159887	2159892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240676
45515	NC_009481	GATC	2	8	2159931	2159938	25 %	25 %	25 %	25 %	148240676
45516	NC_009481	GCC	2	6	2159966	2159971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240676
45517	NC_009481	CGG	2	6	2159997	2160002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240676
45518	NC_009481	CTG	2	6	2160004	2160009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240676
45519	NC_009481	AGC	2	6	2160041	2160046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240676
45520	NC_009481	GCA	2	6	2160140	2160145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240676
45521	NC_009481	CG	4	8	2160160	2160167	0 %	0 %	50 %	50 %	148240676
45522	NC_009481	TTG	2	6	2160191	2160196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148240676
45523	NC_009481	CAG	2	6	2160202	2160207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240676
45524	NC_009481	GCG	2	6	2160218	2160223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240676
45525	NC_009481	TCG	2	6	2160354	2160359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240676
45526	NC_009481	GGT	2	6	2160433	2160438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240676
45527	NC_009481	GGTC	2	8	2160447	2160454	0 %	25 %	50 %	25 %	148240676
45528	NC_009481	CCA	2	6	2160519	2160524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240676
45529	NC_009481	GTCC	2	8	2160564	2160571	0 %	25 %	25 %	50 %	148240676
45530	NC_009481	GCT	2	6	2160579	2160584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240676
45531	NC_009481	CAC	2	6	2160591	2160596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240676
45532	NC_009481	CTC	2	6	2160610	2160615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240676
45533	NC_009481	GCT	2	6	2160623	2160628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240676
45534	NC_009481	TCC	2	6	2160647	2160652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240676
45535	NC_009481	GCA	2	6	2160761	2160766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240676
45536	NC_009481	GC	3	6	2160775	2160780	0 %	0 %	50 %	50 %	148240676
45537	NC_009481	CCA	2	6	2160783	2160788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240676
45538	NC_009481	GAC	2	6	2160822	2160827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240676
45539	NC_009481	AGCAC	2	10	2160833	2160842	40 %	0 %	20 %	40 %	148240676
45540	NC_009481	GCTG	2	8	2160843	2160850	0 %	25 %	50 %	25 %	148240676
45541	NC_009481	CCA	2	6	2160945	2160950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240676
45542	NC_009481	GCG	2	6	2160972	2160977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240676
45543	NC_009481	CAGCAC	2	12	2160988	2160999	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	148240676
45544	NC_009481	CGC	2	6	2161014	2161019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240676
45545	NC_009481	CTG	2	6	2161069	2161074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240676
45546	NC_009481	GA	3	6	2161124	2161129	50 %	0 %	50 %	0 %	148240676
45547	NC_009481	AGC	2	6	2161218	2161223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45548	NC_009481	TCCT	2	8	2161240	2161247	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45549	NC_009481	AGG	2	6	2161357	2161362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148240677
45550	NC_009481	GC	3	6	2161376	2161381	0 %	0 %	50 %	50 %	148240677
45551	NC_009481	TCT	2	6	2161402	2161407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148240677
45552	NC_009481	GCT	2	6	2161411	2161416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240677
45553	NC_009481	GTG	2	6	2161464	2161469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240677
45554	NC_009481	AAG	2	6	2161612	2161617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148240677
45555	NC_009481	GCT	3	9	2161652	2161660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240677
45556	NC_009481	GTG	2	6	2161700	2161705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240677
45557	NC_009481	GCTG	2	8	2161717	2161724	0 %	25 %	50 %	25 %	148240677
45558	NC_009481	GC	3	6	2161727	2161732	0 %	0 %	50 %	50 %	148240677
45559	NC_009481	TGC	2	6	2161755	2161760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45560	NC_009481	CCG	2	6	2161812	2161817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45561	NC_009481	GCA	2	6	2161924	2161929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240678
45562	NC_009481	GATC	2	8	2162012	2162019	25 %	25 %	25 %	25 %	148240678
45563	NC_009481	CGAT	2	8	2162061	2162068	25 %	25 %	25 %	25 %	148240678
45564	NC_009481	GCA	2	6	2162252	2162257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240678
45565	NC_009481	CCA	2	6	2162347	2162352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240678
45566	NC_009481	CCG	2	6	2162389	2162394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240678
45567	NC_009481	TTC	2	6	2162414	2162419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148240678
45568	NC_009481	ATC	2	6	2162480	2162485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240678
45569	NC_009481	TCGCT	2	10	2162524	2162533	0 %	40 %	20 %	40 %	148240678
45570	NC_009481	TGA	2	6	2162716	2162721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240678
45571	NC_009481	GCG	2	6	2162737	2162742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240678
45572	NC_009481	ACA	2	6	2162853	2162858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148240678
45573	NC_009481	GAACAC	2	12	2162873	2162884	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	148240678
45574	NC_009481	CTC	2	6	2162885	2162890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240678
45575	NC_009481	ATC	2	6	2162933	2162938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240678
45576	NC_009481	GCC	2	6	2162942	2162947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240678
45577	NC_009481	CTG	2	6	2162951	2162956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240678
45578	NC_009481	C	6	6	2163000	2163005	0 %	0 %	0 %	100 %	148240678
45579	NC_009481	GCG	2	6	2163006	2163011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240678
45580	NC_009481	CCT	2	6	2163018	2163023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240678
45581	NC_009481	CCG	2	6	2163121	2163126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240678
45582	NC_009481	TTGGGC	2	12	2163147	2163158	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148240678
45583	NC_009481	CAC	2	6	2163209	2163214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240678
45584	NC_009481	GCC	2	6	2163264	2163269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240678
45585	NC_009481	CGT	2	6	2163271	2163276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240678
45586	NC_009481	CTG	2	6	2163296	2163301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240678
45587	NC_009481	GCC	3	9	2163372	2163380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240678
45588	NC_009481	CAG	2	6	2163392	2163397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240678
45589	NC_009481	CTC	2	6	2163419	2163424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240678
45590	NC_009481	CGCT	2	8	2163426	2163433	0 %	25 %	25 %	50 %	148240678
45591	NC_009481	TGG	2	6	2163439	2163444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240678
45592	NC_009481	CCT	2	6	2163448	2163453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240678
45593	NC_009481	AGC	2	6	2163483	2163488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240678
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45595	NC_009481	TGT	2	6	2163622	2163627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148240678
45596	NC_009481	TGGCCA	2	12	2163670	2163681	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148240678
45597	NC_009481	CCA	2	6	2163760	2163765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240678
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45599	NC_009481	CGT	2	6	2163832	2163837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240678
45600	NC_009481	GGA	2	6	2163838	2163843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148240678
45601	NC_009481	CTGGCG	2	12	2163861	2163872	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148240678
45602	NC_009481	GCA	2	6	2163883	2163888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240678
45603	NC_009481	CAGC	2	8	2163979	2163986	25 %	0 %	25 %	50 %	148240678
45604	NC_009481	TGAT	2	8	2164035	2164042	25 %	50 %	25 %	0 %	148240678
45605	NC_009481	TCG	2	6	2164080	2164085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240678
45606	NC_009481	CCA	2	6	2164114	2164119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240678
45607	NC_009481	CCT	2	6	2164236	2164241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240678
45608	NC_009481	TGG	2	6	2164369	2164374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240679
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45610	NC_009481	TC	3	6	2164454	2164459	0 %	50 %	0 %	50 %	148240679
45611	NC_009481	TGA	2	6	2164567	2164572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240679
45612	NC_009481	G	7	7	2164577	2164583	0 %	0 %	100 %	0 %	148240679
45613	NC_009481	CTG	2	6	2164587	2164592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240679
45614	NC_009481	GCG	2	6	2164634	2164639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240679
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45616	NC_009481	GCG	2	6	2164714	2164719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240679
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45724	NC_009481	ACG	2	6	2169563	2169568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240684
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45731	NC_009481	GCA	2	6	2169809	2169814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240684
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45733	NC_009481	T	6	6	2169894	2169899	0 %	100 %	0 %	0 %	148240684
45734	NC_009481	CGG	2	6	2169905	2169910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240684
45735	NC_009481	CCGG	2	8	2169949	2169956	0 %	0 %	50 %	50 %	148240684
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45738	NC_009481	GTG	2	6	2170063	2170068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240684
45739	NC_009481	GCCTG	2	10	2170092	2170101	0 %	20 %	40 %	40 %	148240684
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45742	NC_009481	TTG	2	6	2170207	2170212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148240684
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45964	NC_009481	CAG	2	6	2180153	2180158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240696
45965	NC_009481	AGC	2	6	2180159	2180164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240696
45966	NC_009481	CCACCG	2	12	2180214	2180225	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	148240696
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45968	NC_009481	TGC	2	6	2180268	2180273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240696
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45970	NC_009481	CGT	2	6	2180341	2180346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240696
45971	NC_009481	CTG	2	6	2180516	2180521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240696
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45975	NC_009481	GTC	2	6	2180690	2180695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240696
45976	NC_009481	CTG	2	6	2180708	2180713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240696
45977	NC_009481	GCT	2	6	2180720	2180725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240696
45978	NC_009481	TTAAG	2	10	2180843	2180852	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45979	NC_009481	CGC	2	6	2180894	2180899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240697
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45981	NC_009481	CCGG	2	8	2180952	2180959	0 %	0 %	50 %	50 %	148240697
45982	NC_009481	GC	3	6	2180965	2180970	0 %	0 %	50 %	50 %	148240697
45983	NC_009481	CTGG	2	8	2180972	2180979	0 %	25 %	50 %	25 %	148240697
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45995	NC_009481	GGCCC	2	10	2181406	2181415	0 %	0 %	40 %	60 %	148240697
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45999	NC_009481	TGC	2	6	2181487	2181492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240697
46000	NC_009481	GTG	2	6	2181510	2181515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240697

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