MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. WH 7803 chromosome

Total Repeats: 50037

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_009481	GGC	2	6	176925	176930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238493
4002	NC_009481	AGC	2	6	176997	177002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238493
4003	NC_009481	TGC	2	6	177088	177093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238493
4004	NC_009481	GCTGG	2	10	177231	177240	0 %	20 %	60 %	20 %	148238493
4005	NC_009481	TGCG	2	8	177257	177264	0 %	25 %	50 %	25 %	148238493
4006	NC_009481	AGC	2	6	177277	177282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238493
4007	NC_009481	GGCTTG	2	12	177295	177306	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148238493
4008	NC_009481	GAG	2	6	177366	177371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_009481	CAG	2	6	177432	177437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_009481	TCG	2	6	177459	177464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_009481	CAG	3	9	177481	177489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238494
4012	NC_009481	TTG	2	6	177546	177551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238494
4013	NC_009481	TCG	2	6	177559	177564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238494
4014	NC_009481	GGTTG	2	10	177763	177772	0 %	40 %	60 %	0 %	148238494
4015	NC_009481	GATGC	2	10	177804	177813	20 %	20 %	40 %	20 %	148238495
4016	NC_009481	GAG	2	6	177879	177884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238495
4017	NC_009481	CAG	2	6	177942	177947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238495
4018	NC_009481	CCGTG	2	10	177959	177968	0 %	20 %	40 %	40 %	148238495
4019	NC_009481	CCG	2	6	177995	178000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238495
4020	NC_009481	CTG	2	6	178031	178036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238495
4021	NC_009481	AGA	2	6	178046	178051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148238496
4022	NC_009481	TTGC	2	8	178070	178077	0 %	50 %	25 %	25 %	148238496
4023	NC_009481	CAG	2	6	178087	178092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238496
4024	NC_009481	TGC	2	6	178095	178100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238496
4025	NC_009481	AAGGG	2	10	178105	178114	40 %	0 %	60 %	0 %	148238496
4026	NC_009481	CCA	2	6	178151	178156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238496
4027	NC_009481	TCC	2	6	178182	178187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238496
4028	NC_009481	AGC	2	6	178324	178329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238496
4029	NC_009481	GCG	2	6	178334	178339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238496
4030	NC_009481	CCA	2	6	178379	178384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238496
4031	NC_009481	GAT	2	6	178413	178418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238496
4032	NC_009481	CCA	2	6	178430	178435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238496
4033	NC_009481	AG	3	6	178443	178448	50 %	0 %	50 %	0 %	148238496
4034	NC_009481	CGT	2	6	178449	178454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238496
4035	NC_009481	TCGT	2	8	178490	178497	0 %	50 %	25 %	25 %	148238496
4036	NC_009481	GCT	2	6	178524	178529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238496
4037	NC_009481	ACA	2	6	178550	178555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148238496
4038	NC_009481	GTA	2	6	178557	178562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238496
4039	NC_009481	CAC	2	6	178563	178568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238496
4040	NC_009481	CG	3	6	178660	178665	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4041	NC_009481	TGC	2	6	178719	178724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_009481	CAGC	2	8	178818	178825	25 %	0 %	25 %	50 %	148238497
4043	NC_009481	GCT	2	6	178865	178870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238497
4044	NC_009481	TGC	2	6	178930	178935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238497
4045	NC_009481	GCA	3	9	178975	178983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238497
4046	NC_009481	C	6	6	179005	179010	0 %	0 %	0 %	100 %	148238497
4047	NC_009481	AGG	2	6	179028	179033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238497
4048	NC_009481	CAG	2	6	179039	179044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238497
4049	NC_009481	CTCC	2	8	179049	179056	0 %	25 %	0 %	75 %	148238497
4050	NC_009481	CCG	2	6	179084	179089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238497
4051	NC_009481	A	6	6	179207	179212	100 %	0 %	0 %	0 %	148238497
4052	NC_009481	GTT	2	6	179292	179297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238497
4053	NC_009481	TGG	2	6	179309	179314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238497
4054	NC_009481	CGT	2	6	179326	179331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_009481	TGG	2	6	179441	179446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238498
4056	NC_009481	CG	3	6	179545	179550	0 %	0 %	50 %	50 %	148238498
4057	NC_009481	CGT	2	6	179580	179585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238498
4058	NC_009481	GCT	3	9	179599	179607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238498
4059	NC_009481	TGC	2	6	179631	179636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238498
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4061	NC_009481	GTT	2	6	179666	179671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238498
4062	NC_009481	GTG	2	6	179684	179689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238498
4063	NC_009481	GTG	3	9	179693	179701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238498
4064	NC_009481	CCG	2	6	179819	179824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238498
4065	NC_009481	CGC	3	9	179934	179942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238498
4066	NC_009481	CGC	2	6	179955	179960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238498
4067	NC_009481	CA	3	6	179965	179970	50 %	0 %	0 %	50 %	148238498
4068	NC_009481	CAGC	2	8	179975	179982	25 %	0 %	25 %	50 %	148238498
4069	NC_009481	CAC	2	6	180097	180102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238498
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4071	NC_009481	GTG	3	9	180191	180199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238498
4072	NC_009481	C	6	6	180210	180215	0 %	0 %	0 %	100 %	148238498
4073	NC_009481	GT	3	6	180222	180227	0 %	50 %	50 %	0 %	148238498
4074	NC_009481	CGC	2	6	180256	180261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238498
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4077	NC_009481	TGG	2	6	180285	180290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238498
4078	NC_009481	GCTGGC	2	12	180292	180303	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148238498
4079	NC_009481	GC	3	6	180302	180307	0 %	0 %	50 %	50 %	148238498
4080	NC_009481	TGG	2	6	180333	180338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238498
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4084	NC_009481	GAT	2	6	180401	180406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238498
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4086	NC_009481	GTG	2	6	180467	180472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238498
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4089	NC_009481	GCTCT	2	10	180514	180523	0 %	40 %	20 %	40 %	148238499
4090	NC_009481	TGG	2	6	180526	180531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238499
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4095	NC_009481	TGC	2	6	180647	180652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238499
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4098	NC_009481	GGA	2	6	180735	180740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238499
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4100	NC_009481	GCA	2	6	180902	180907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238499
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4102	NC_009481	GCG	2	6	180969	180974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238499
4103	NC_009481	GCTC	2	8	180978	180985	0 %	25 %	25 %	50 %	148238499
4104	NC_009481	CGC	2	6	181004	181009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238499
4105	NC_009481	CG	5	10	181072	181081	0 %	0 %	50 %	50 %	148238499
4106	NC_009481	GCT	2	6	181171	181176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238499
4107	NC_009481	GGTGTG	2	12	181246	181257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238499
4108	NC_009481	GGCG	2	8	181269	181276	0 %	0 %	75 %	25 %	148238499
4109	NC_009481	TGAT	2	8	181283	181290	25 %	50 %	25 %	0 %	148238499
4110	NC_009481	G	7	7	181335	181341	0 %	0 %	100 %	0 %	148238499
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4114	NC_009481	CAG	2	6	181525	181530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238499
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4117	NC_009481	CAT	2	6	181590	181595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238499
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4119	NC_009481	GTT	2	6	181793	181798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238500
4120	NC_009481	TCTGT	2	10	181919	181928	0 %	60 %	20 %	20 %	148238500
4121	NC_009481	AG	3	6	181945	181950	50 %	0 %	50 %	0 %	148238500
4122	NC_009481	CCG	2	6	181971	181976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238500
4123	NC_009481	GTG	2	6	182056	182061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238500
4124	NC_009481	GGGC	2	8	182070	182077	0 %	0 %	75 %	25 %	148238500
4125	NC_009481	TGAT	2	8	182160	182167	25 %	50 %	25 %	0 %	148238500
4126	NC_009481	TAA	2	6	182225	182230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148238500
4127	NC_009481	GAA	2	6	182240	182245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148238500
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4129	NC_009481	GA	3	6	182300	182305	50 %	0 %	50 %	0 %	148238500
4130	NC_009481	GCCCA	2	10	182325	182334	20 %	0 %	20 %	60 %	148238500
4131	NC_009481	GAT	2	6	182420	182425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238500
4132	NC_009481	GTC	2	6	182459	182464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238500
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4135	NC_009481	CTG	3	9	182623	182631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238500
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4143	NC_009481	GCAT	2	8	182937	182944	25 %	25 %	25 %	25 %	148238500
4144	NC_009481	ATG	2	6	182955	182960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238500
4145	NC_009481	CAG	2	6	183041	183046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238500
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4148	NC_009481	CAA	2	6	183118	183123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148238500
4149	NC_009481	GTA	2	6	183167	183172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238500
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4151	NC_009481	CGTTG	2	10	183225	183234	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4152	NC_009481	TCCGT	2	10	183241	183250	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4153	NC_009481	GTG	2	6	183341	183346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4154	NC_009481	GCA	2	6	183372	183377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4155	NC_009481	TGG	2	6	183427	183432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238501
4156	NC_009481	CGG	2	6	183466	183471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238501
4157	NC_009481	CGA	2	6	183485	183490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238501
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4160	NC_009481	CGA	2	6	183644	183649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238501
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4179	NC_009481	GAGC	2	8	184537	184544	25 %	0 %	50 %	25 %	148238502
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4230	NC_009481	GGC	2	6	186723	186728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238503
4231	NC_009481	C	6	6	186733	186738	0 %	0 %	0 %	100 %	148238503
4232	NC_009481	GAGGCA	2	12	186831	186842	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	148238503
4233	NC_009481	CGGG	2	8	186848	186855	0 %	0 %	75 %	25 %	148238503
4234	NC_009481	CTG	2	6	186893	186898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238504
4235	NC_009481	CCA	3	9	187013	187021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238504
4236	NC_009481	TCC	2	6	187045	187050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238504
4237	NC_009481	GTC	2	6	187068	187073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238504
4238	NC_009481	CAGC	2	8	187082	187089	25 %	0 %	25 %	50 %	148238504
4239	NC_009481	TGC	2	6	187141	187146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238504
4240	NC_009481	TTC	2	6	187176	187181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148238504
4241	NC_009481	CAG	3	9	187248	187256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238504
4242	NC_009481	AGGTCC	2	12	187322	187333	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148238504
4243	NC_009481	TGG	2	6	187423	187428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238505
4244	NC_009481	ATCA	2	8	187485	187492	50 %	25 %	0 %	25 %	148238505
4245	NC_009481	CCGAGA	2	12	187525	187536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238505
4246	NC_009481	GCCTG	2	10	187538	187547	0 %	20 %	40 %	40 %	148238505
4247	NC_009481	TGG	2	6	187651	187656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238505
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4269	NC_009481	TGC	2	6	188707	188712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238505
4270	NC_009481	TGG	2	6	188731	188736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238505
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4280	NC_009481	GAG	2	6	189177	189182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238506
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4302	NC_009481	ATG	2	6	190004	190009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4303	NC_009481	GCT	2	6	190042	190047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4305	NC_009481	TGC	2	6	190223	190228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238508
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4351	NC_009481	TGG	2	6	192480	192485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238511
4352	NC_009481	CGGC	3	12	192526	192537	0 %	0 %	50 %	50 %	148238511
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4354	NC_009481	GCT	2	6	192688	192693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238511
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4356	NC_009481	GCC	2	6	192749	192754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238511
4357	NC_009481	AGGG	2	8	192768	192775	25 %	0 %	75 %	0 %	148238511
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4484	NC_009481	GCA	2	6	197771	197776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238517
4485	NC_009481	CGGG	2	8	197790	197797	0 %	0 %	75 %	25 %	148238517
4486	NC_009481	A	6	6	197823	197828	100 %	0 %	0 %	0 %	148238517
4487	NC_009481	GCG	2	6	197835	197840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238517
4488	NC_009481	GCA	2	6	197849	197854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238517
4489	NC_009481	GCA	2	6	197892	197897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238517
4490	NC_009481	GCG	2	6	198076	198081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238517
4491	NC_009481	CAG	2	6	198102	198107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238517
4492	NC_009481	GCT	2	6	198140	198145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238517
4493	NC_009481	CGT	2	6	198179	198184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238517
4494	NC_009481	CTG	2	6	198216	198221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238517
4495	NC_009481	GCA	2	6	198242	198247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238517
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4497	NC_009481	GGCC	2	8	198322	198329	0 %	0 %	50 %	50 %	148238518
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4499	NC_009481	CTG	2	6	198402	198407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238518
4500	NC_009481	GCA	2	6	198412	198417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238518

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