MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. WH 7803 chromosome

Total Repeats: 50037

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43501	NC_009481	GCT	2	6	2064624	2064629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240575
43502	NC_009481	CCA	2	6	2064713	2064718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240575
43503	NC_009481	GCC	2	6	2064795	2064800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240575
43504	NC_009481	CGAA	2	8	2064814	2064821	50 %	0 %	25 %	25 %	148240575
43505	NC_009481	AGA	2	6	2064847	2064852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148240575
43506	NC_009481	CAG	2	6	2064890	2064895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240575
43507	NC_009481	AGG	2	6	2064950	2064955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148240575
43508	NC_009481	GGT	2	6	2064963	2064968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240575
43509	NC_009481	AGCC	2	8	2064976	2064983	25 %	0 %	25 %	50 %	148240575
43510	NC_009481	AGA	2	6	2065012	2065017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148240575
43511	NC_009481	GC	3	6	2065094	2065099	0 %	0 %	50 %	50 %	148240575
43512	NC_009481	GCC	2	6	2065160	2065165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43513	NC_009481	AC	3	6	2065191	2065196	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43514	NC_009481	GGTT	2	8	2065252	2065259	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43515	NC_009481	CAA	2	6	2065361	2065366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148240576
43516	NC_009481	GCCA	2	8	2065389	2065396	25 %	0 %	25 %	50 %	148240576
43517	NC_009481	CTG	2	6	2065411	2065416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240576
43518	NC_009481	GCG	2	6	2065497	2065502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240576
43519	NC_009481	CAG	2	6	2065574	2065579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240577
43520	NC_009481	CTTTG	2	10	2065582	2065591	0 %	60 %	20 %	20 %	148240577
43521	NC_009481	CTG	2	6	2065605	2065610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240577
43522	NC_009481	GCA	2	6	2065640	2065645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240577
43523	NC_009481	GCA	2	6	2065682	2065687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240577
43524	NC_009481	TGCAC	2	10	2065754	2065763	20 %	20 %	20 %	40 %	148240577
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43527	NC_009481	GCC	2	6	2065845	2065850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240577
43528	NC_009481	GCTG	2	8	2065908	2065915	0 %	25 %	50 %	25 %	148240577
43529	NC_009481	GGCC	3	12	2065920	2065931	0 %	0 %	50 %	50 %	148240577
43530	NC_009481	GCG	2	6	2065946	2065951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240577
43531	NC_009481	AGC	2	6	2065958	2065963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240577
43532	NC_009481	CTC	3	9	2066005	2066013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240577
43533	NC_009481	GCCA	2	8	2066041	2066048	25 %	0 %	25 %	50 %	148240577
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43535	NC_009481	GC	3	6	2066158	2066163	0 %	0 %	50 %	50 %	148240577
43536	NC_009481	GAA	2	6	2066210	2066215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148240577
43537	NC_009481	CCCG	2	8	2066330	2066337	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
43538	NC_009481	T	6	6	2066343	2066348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43539	NC_009481	CAC	2	6	2066349	2066354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43540	NC_009481	AC	3	6	2066353	2066358	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43541	NC_009481	T	6	6	2066380	2066385	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43542	NC_009481	TTTG	2	8	2066414	2066421	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
43543	NC_009481	ACCGAA	2	12	2066450	2066461	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43544	NC_009481	GA	3	6	2066581	2066586	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43545	NC_009481	GA	3	6	2066592	2066597	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43546	NC_009481	ACG	2	6	2066610	2066615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43547	NC_009481	CAC	2	6	2066622	2066627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43548	NC_009481	ACC	2	6	2066638	2066643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43549	NC_009481	CTG	2	6	2066672	2066677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240578
43550	NC_009481	GAC	2	6	2066684	2066689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240578
43551	NC_009481	GAC	2	6	2066753	2066758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240578
43552	NC_009481	AGGCC	2	10	2066767	2066776	20 %	0 %	40 %	40 %	148240578
43553	NC_009481	CCTGA	2	10	2066795	2066804	20 %	20 %	20 %	40 %	148240578
43554	NC_009481	TGA	2	6	2066866	2066871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240578
43555	NC_009481	GAT	2	6	2066954	2066959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240578
43556	NC_009481	CCT	2	6	2067010	2067015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240578
43557	NC_009481	CG	3	6	2067029	2067034	0 %	0 %	50 %	50 %	148240578
43558	NC_009481	CAC	2	6	2067056	2067061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240578
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43563	NC_009481	GCT	2	6	2067575	2067580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240579
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43567	NC_009481	GCTCAG	2	12	2067788	2067799	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148240579
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43586	NC_009481	CGC	2	6	2068790	2068795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240580
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43588	NC_009481	CAG	2	6	2068854	2068859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240580
43589	NC_009481	TCA	2	6	2068885	2068890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240580
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43592	NC_009481	CCCG	2	8	2068935	2068942	0 %	0 %	25 %	75 %	148240580
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43613	NC_009481	CAC	3	9	2070058	2070066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240581
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43617	NC_009481	TGA	2	6	2070222	2070227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240581
43618	NC_009481	CCATGG	2	12	2070237	2070248	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148240581
43619	NC_009481	CAC	2	6	2070257	2070262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240581
43620	NC_009481	GCT	2	6	2070290	2070295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240581
43621	NC_009481	CCA	2	6	2070305	2070310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240581
43622	NC_009481	CGC	2	6	2070396	2070401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240581
43623	NC_009481	CCA	2	6	2070415	2070420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240581
43624	NC_009481	ATG	2	6	2070426	2070431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240581
43625	NC_009481	ACCC	2	8	2070452	2070459	25 %	0 %	0 %	75 %	148240581
43626	NC_009481	GA	3	6	2070561	2070566	50 %	0 %	50 %	0 %	148240581
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43630	NC_009481	GCA	2	6	2070649	2070654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240581
43631	NC_009481	TGC	2	6	2070719	2070724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240581
43632	NC_009481	GAG	2	6	2070782	2070787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148240581
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43634	NC_009481	CCA	2	6	2070856	2070861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240581
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43636	NC_009481	AG	3	6	2071064	2071069	50 %	0 %	50 %	0 %	148240581
43637	NC_009481	CCA	2	6	2071087	2071092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240581
43638	NC_009481	CCA	2	6	2071112	2071117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240581
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43640	NC_009481	GGCTG	2	10	2071170	2071179	0 %	20 %	60 %	20 %	148240581
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43642	NC_009481	CTG	2	6	2071223	2071228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240581
43643	NC_009481	GC	3	6	2071332	2071337	0 %	0 %	50 %	50 %	148240581
43644	NC_009481	AC	3	6	2071338	2071343	50 %	0 %	0 %	50 %	148240581
43645	NC_009481	CCG	2	6	2071344	2071349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240581
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43649	NC_009481	G	7	7	2071397	2071403	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
43650	NC_009481	TGA	2	6	2071412	2071417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43651	NC_009481	GGAT	2	8	2071477	2071484	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43652	NC_009481	GCA	2	6	2071510	2071515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240582
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43655	NC_009481	GAG	2	6	2071695	2071700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148240582
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43669	NC_009481	CCA	2	6	2072297	2072302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240583
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43722	NC_009481	GCC	2	6	2074654	2074659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240585
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43730	NC_009481	CCT	2	6	2074997	2075002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240585
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43733	NC_009481	CT	3	6	2075194	2075199	0 %	50 %	0 %	50 %	148240585
43734	NC_009481	GTG	3	9	2075212	2075220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240585
43735	NC_009481	TGC	2	6	2075243	2075248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240585
43736	NC_009481	CTT	2	6	2075278	2075283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148240585
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43738	NC_009481	GCA	2	6	2075345	2075350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240585
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43740	NC_009481	CGG	2	6	2075391	2075396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240585
43741	NC_009481	GCT	2	6	2075400	2075405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240585
43742	NC_009481	TG	3	6	2075425	2075430	0 %	50 %	50 %	0 %	148240585
43743	NC_009481	GCA	3	9	2075441	2075449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240585
43744	NC_009481	GGA	2	6	2075511	2075516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148240585
43745	NC_009481	CGCTG	2	10	2075520	2075529	0 %	20 %	40 %	40 %	148240585
43746	NC_009481	CCT	2	6	2075561	2075566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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43748	NC_009481	TCT	2	6	2075602	2075607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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43764	NC_009481	G	6	6	2076254	2076259	0 %	0 %	100 %	0 %	148240586
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43832	NC_009481	ACTG	2	8	2079739	2079746	25 %	25 %	25 %	25 %	148240592
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43835	NC_009481	GGTGC	2	10	2079893	2079902	0 %	20 %	60 %	20 %	148240592
43836	NC_009481	GCGT	2	8	2079941	2079948	0 %	25 %	50 %	25 %	148240592
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43843	NC_009481	GCG	2	6	2080349	2080354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240592
43844	NC_009481	GCA	2	6	2080408	2080413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240592
43845	NC_009481	GC	3	6	2080441	2080446	0 %	0 %	50 %	50 %	148240592
43846	NC_009481	CCT	2	6	2080449	2080454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240592
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43966	NC_009481	CGCA	2	8	2085886	2085893	25 %	0 %	25 %	50 %	148240598
43967	NC_009481	ACC	2	6	2085942	2085947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240598
43968	NC_009481	GAT	2	6	2085988	2085993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240598
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43970	NC_009481	GTG	2	6	2086216	2086221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240599
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43972	NC_009481	CTG	2	6	2086246	2086251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240599
43973	NC_009481	GTG	2	6	2086258	2086263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240599
43974	NC_009481	CTG	3	9	2086471	2086479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240599
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43979	NC_009481	TGCT	2	8	2086687	2086694	0 %	50 %	25 %	25 %	148240599
43980	NC_009481	TGT	2	6	2086698	2086703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148240599
43981	NC_009481	GAC	2	6	2086728	2086733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240599
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43983	NC_009481	ACC	2	6	2086796	2086801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240599
43984	NC_009481	A	6	6	2086806	2086811	100 %	0 %	0 %	0 %	148240599
43985	NC_009481	TCA	2	6	2086814	2086819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240599
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43988	NC_009481	CCT	2	6	2086977	2086982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240599
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43992	NC_009481	CT	3	6	2087214	2087219	0 %	50 %	0 %	50 %	148240599
43993	NC_009481	CAG	2	6	2087255	2087260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240599
43994	NC_009481	CTT	2	6	2087478	2087483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148240600
43995	NC_009481	TCG	2	6	2087491	2087496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240600
43996	NC_009481	AGGC	2	8	2087497	2087504	25 %	0 %	50 %	25 %	148240600
43997	NC_009481	GAA	2	6	2087618	2087623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148240600
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43999	NC_009481	CTG	2	6	2087637	2087642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240600
44000	NC_009481	TCAC	2	8	2087710	2087717	25 %	25 %	0 %	50 %	148240600

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