MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. WH 7803 chromosome

Total Repeats: 50037

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
42501	NC_009481	CCG	2	6	2018642	2018647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42502	NC_009481	CAT	2	6	2018819	2018824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42503	NC_009481	ATC	2	6	2018846	2018851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42504	NC_009481	CAT	2	6	2018853	2018858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42505	NC_009481	CAA	2	6	2018982	2018987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42506	NC_009481	ACC	2	6	2019245	2019250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42507	NC_009481	CCA	2	6	2019321	2019326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42508	NC_009481	GTT	2	6	2019434	2019439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42509	NC_009481	AGG	2	6	2019452	2019457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42510	NC_009481	TCA	2	6	2019509	2019514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42511	NC_009481	TCC	3	9	2019530	2019538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42512	NC_009481	GT	3	6	2019593	2019598	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42513	NC_009481	TCC	2	6	2019653	2019658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42514	NC_009481	TGC	2	6	2019732	2019737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42515	NC_009481	GTA	2	6	2019755	2019760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42516	NC_009481	GT	3	6	2019762	2019767	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42517	NC_009481	ATG	2	6	2019787	2019792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42518	NC_009481	TCC	2	6	2019813	2019818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42519	NC_009481	CGG	2	6	2019829	2019834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42520	NC_009481	TC	3	6	2019835	2019840	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42521	NC_009481	CACGA	2	10	2019912	2019921	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
42522	NC_009481	GAC	2	6	2019925	2019930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42523	NC_009481	CAC	2	6	2019938	2019943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42524	NC_009481	TTC	2	6	2020013	2020018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42525	NC_009481	TGCG	2	8	2020091	2020098	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42526	NC_009481	CAG	2	6	2020251	2020256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42527	NC_009481	TTC	2	6	2020276	2020281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42528	NC_009481	ATG	2	6	2020361	2020366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42529	NC_009481	CAG	2	6	2020388	2020393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42530	NC_009481	GCC	2	6	2020403	2020408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42531	NC_009481	AAT	2	6	2020427	2020432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42532	NC_009481	GCT	2	6	2020467	2020472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42533	NC_009481	TCT	2	6	2020515	2020520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42534	NC_009481	CTG	2	6	2020612	2020617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42535	NC_009481	ATC	2	6	2020662	2020667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42536	NC_009481	CCT	2	6	2020809	2020814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42537	NC_009481	GTTC	2	8	2020863	2020870	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42538	NC_009481	CGC	2	6	2020890	2020895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42539	NC_009481	CCT	2	6	2021016	2021021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42540	NC_009481	GTT	2	6	2021099	2021104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42541	NC_009481	AAT	2	6	2021182	2021187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42542	NC_009481	TCAT	2	8	2021220	2021227	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42543	NC_009481	AAC	2	6	2021232	2021237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42544	NC_009481	CAA	2	6	2021262	2021267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42545	NC_009481	ACA	2	6	2021375	2021380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42546	NC_009481	GCTCTC	2	12	2021429	2021440	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
42547	NC_009481	C	6	6	2021471	2021476	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
42548	NC_009481	CCATAA	2	12	2021484	2021495	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42549	NC_009481	CAC	2	6	2021496	2021501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42550	NC_009481	CAA	2	6	2021537	2021542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148240534
42551	NC_009481	GCT	2	6	2021575	2021580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240534
42552	NC_009481	AG	3	6	2021618	2021623	50 %	0 %	50 %	0 %	148240534
42553	NC_009481	ACCA	2	8	2021694	2021701	50 %	0 %	0 %	50 %	148240534
42554	NC_009481	GCA	2	6	2021703	2021708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240534
42555	NC_009481	GCC	2	6	2021742	2021747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240534
42556	NC_009481	TGA	2	6	2021826	2021831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240534
42557	NC_009481	GCC	2	6	2021886	2021891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240534
42558	NC_009481	CAC	2	6	2021932	2021937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240534
42559	NC_009481	GC	3	6	2022014	2022019	0 %	0 %	50 %	50 %	148240534
42560	NC_009481	CGG	2	6	2022046	2022051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240534
42561	NC_009481	CCA	2	6	2022079	2022084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240534
42562	NC_009481	CTC	2	6	2022122	2022127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240534
42563	NC_009481	CT	3	6	2022138	2022143	0 %	50 %	0 %	50 %	148240534
42564	NC_009481	TCA	2	6	2022180	2022185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240534
42565	NC_009481	TC	3	6	2022263	2022268	0 %	50 %	0 %	50 %	148240534
42566	NC_009481	AAG	2	6	2022281	2022286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148240534
42567	NC_009481	AGCA	2	8	2022296	2022303	50 %	0 %	25 %	25 %	148240534
42568	NC_009481	GA	4	8	2022313	2022320	50 %	0 %	50 %	0 %	148240534
42569	NC_009481	CTT	2	6	2022433	2022438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148240535
42570	NC_009481	GCG	2	6	2022453	2022458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240535
42571	NC_009481	ACC	2	6	2022578	2022583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240535
42572	NC_009481	TGC	2	6	2022680	2022685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240535
42573	NC_009481	TC	3	6	2022689	2022694	0 %	50 %	0 %	50 %	148240535
42574	NC_009481	TTC	2	6	2022709	2022714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148240535
42575	NC_009481	CTC	2	6	2022763	2022768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240535
42576	NC_009481	GCTT	2	8	2022773	2022780	0 %	50 %	25 %	25 %	148240535
42577	NC_009481	GCG	2	6	2022784	2022789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240535
42578	NC_009481	CG	3	6	2022796	2022801	0 %	0 %	50 %	50 %	148240535
42579	NC_009481	TCCA	2	8	2022861	2022868	25 %	25 %	0 %	50 %	148240535
42580	NC_009481	C	6	6	2022902	2022907	0 %	0 %	0 %	100 %	148240535
42581	NC_009481	TTG	2	6	2022929	2022934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148240535
42582	NC_009481	TGC	2	6	2022967	2022972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240535
42583	NC_009481	TGT	2	6	2022984	2022989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148240535
42584	NC_009481	TCGA	2	8	2023012	2023019	25 %	25 %	25 %	25 %	148240535
42585	NC_009481	ATG	2	6	2023046	2023051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240535
42586	NC_009481	AGC	2	6	2023187	2023192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240535
42587	NC_009481	TTG	2	6	2023306	2023311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148240535
42588	NC_009481	CTGG	2	8	2023451	2023458	0 %	25 %	50 %	25 %	148240535
42589	NC_009481	TCAA	2	8	2023460	2023467	50 %	25 %	0 %	25 %	148240535
42590	NC_009481	TGC	2	6	2023589	2023594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240535
42591	NC_009481	ATTGAG	2	12	2023627	2023638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240535
42592	NC_009481	ATT	2	6	2023720	2023725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148240535
42593	NC_009481	CGG	2	6	2023816	2023821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240535
42594	NC_009481	GTG	2	6	2023853	2023858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240535
42595	NC_009481	G	6	6	2023864	2023869	0 %	0 %	100 %	0 %	148240535
42596	NC_009481	GATC	2	8	2023935	2023942	25 %	25 %	25 %	25 %	148240535
42597	NC_009481	GCA	2	6	2023964	2023969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240535
42598	NC_009481	AGA	2	6	2024039	2024044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42599	NC_009481	GCA	2	6	2024048	2024053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42600	NC_009481	CTG	2	6	2024104	2024109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240536
42601	NC_009481	CAG	2	6	2024118	2024123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240536
42602	NC_009481	GCT	2	6	2024135	2024140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240536
42603	NC_009481	GTCAT	2	10	2024192	2024201	20 %	40 %	20 %	20 %	148240536
42604	NC_009481	ACGG	2	8	2024234	2024241	25 %	0 %	50 %	25 %	148240536
42605	NC_009481	AAG	2	6	2024242	2024247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148240536
42606	NC_009481	TCT	2	6	2024291	2024296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148240536
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42608	NC_009481	CCA	2	6	2024418	2024423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240536
42609	NC_009481	CAC	2	6	2024431	2024436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240536
42610	NC_009481	GCT	2	6	2024440	2024445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240536
42611	NC_009481	GCT	2	6	2024475	2024480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240536
42612	NC_009481	TTG	2	6	2024536	2024541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148240536
42613	NC_009481	TCA	2	6	2024600	2024605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240536
42614	NC_009481	GCGT	2	8	2024680	2024687	0 %	25 %	50 %	25 %	148240536
42615	NC_009481	CCG	2	6	2024688	2024693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240536
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42618	NC_009481	AGC	2	6	2024755	2024760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240536
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42620	NC_009481	CAT	2	6	2024832	2024837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240536
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42956	NC_009481	GCA	2	6	2040089	2040094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240552
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42967	NC_009481	ACAG	2	8	2040553	2040560	50 %	0 %	25 %	25 %	148240552
42968	NC_009481	TGG	2	6	2040658	2040663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240552
42969	NC_009481	CGCCAT	2	12	2040724	2040735	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148240553
42970	NC_009481	TTC	2	6	2040743	2040748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148240553
42971	NC_009481	CGC	2	6	2040830	2040835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240553
42972	NC_009481	CCG	2	6	2040849	2040854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240553
42973	NC_009481	TCA	2	6	2040885	2040890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240553
42974	NC_009481	GAC	2	6	2040952	2040957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240554
42975	NC_009481	GCG	2	6	2041072	2041077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240554
42976	NC_009481	GCA	2	6	2041082	2041087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240554
42977	NC_009481	AGC	2	6	2041154	2041159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240554
42978	NC_009481	CAG	2	6	2041160	2041165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240554
42979	NC_009481	GTC	2	6	2041186	2041191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240554
42980	NC_009481	GCG	2	6	2041202	2041207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240554
42981	NC_009481	GTG	2	6	2041218	2041223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240554
42982	NC_009481	G	6	6	2041303	2041308	0 %	0 %	100 %	0 %	148240554
42983	NC_009481	C	6	6	2041313	2041318	0 %	0 %	0 %	100 %	148240554
42984	NC_009481	ACG	2	6	2041345	2041350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240554
42985	NC_009481	AGTTG	2	10	2041359	2041368	20 %	40 %	40 %	0 %	148240554
42986	NC_009481	CGG	2	6	2041369	2041374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42987	NC_009481	GCT	2	6	2041386	2041391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240555
42988	NC_009481	GGT	2	6	2041392	2041397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240555
42989	NC_009481	CGG	2	6	2041491	2041496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240555
42990	NC_009481	CTG	2	6	2041504	2041509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240555
42991	NC_009481	GCA	2	6	2041530	2041535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240555
42992	NC_009481	GC	3	6	2041551	2041556	0 %	0 %	50 %	50 %	148240555
42993	NC_009481	TGA	2	6	2041566	2041571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240555
42994	NC_009481	GAA	2	6	2041597	2041602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148240555
42995	NC_009481	GGTC	2	8	2041605	2041612	0 %	25 %	50 %	25 %	148240555
42996	NC_009481	CGG	3	9	2041679	2041687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240555
42997	NC_009481	GCC	2	6	2041837	2041842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240555
42998	NC_009481	CGG	2	6	2042008	2042013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240555
42999	NC_009481	GACC	2	8	2042109	2042116	25 %	0 %	25 %	50 %	148240555
43000	NC_009481	TGG	2	6	2042189	2042194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240555

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