MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. WH 7803 chromosome

Total Repeats: 50037

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
42001	NC_009481	CCG	2	6	1995471	1995476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240510
42002	NC_009481	ATG	2	6	1995510	1995515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240510
42003	NC_009481	GCCT	2	8	1995559	1995566	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42004	NC_009481	C	6	6	1995590	1995595	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
42005	NC_009481	TGGT	2	8	1995636	1995643	0 %	50 %	50 %	0 %	148240511
42006	NC_009481	CAG	2	6	1995679	1995684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240511
42007	NC_009481	C	7	7	1995698	1995704	0 %	0 %	0 %	100 %	148240511
42008	NC_009481	TTGT	2	8	1995734	1995741	0 %	75 %	25 %	0 %	148240511
42009	NC_009481	GCT	2	6	1995757	1995762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240511
42010	NC_009481	G	6	6	1995822	1995827	0 %	0 %	100 %	0 %	148240511
42011	NC_009481	GGA	2	6	1995865	1995870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148240511
42012	NC_009481	CGT	2	6	1995874	1995879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240511
42013	NC_009481	AACG	2	8	1995883	1995890	50 %	0 %	25 %	25 %	148240511
42014	NC_009481	GGA	2	6	1995997	1996002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148240511
42015	NC_009481	TTG	2	6	1996071	1996076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148240511
42016	NC_009481	TCG	2	6	1996113	1996118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240511
42017	NC_009481	CTG	2	6	1996121	1996126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240511
42018	NC_009481	AGC	2	6	1996132	1996137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240511
42019	NC_009481	TCG	2	6	1996149	1996154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240511
42020	NC_009481	AGCA	2	8	1996200	1996207	50 %	0 %	25 %	25 %	148240511
42021	NC_009481	GC	3	6	1996210	1996215	0 %	0 %	50 %	50 %	148240511
42022	NC_009481	AAC	2	6	1996221	1996226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148240511
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42024	NC_009481	AGTGG	2	10	1996284	1996293	20 %	20 %	60 %	0 %	148240511
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42032	NC_009481	GAC	2	6	1997002	1997007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240512
42033	NC_009481	CGG	2	6	1997016	1997021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240512
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42037	NC_009481	CGC	2	6	1997202	1997207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240512
42038	NC_009481	GCGAT	2	10	1997223	1997232	20 %	20 %	40 %	20 %	148240512
42039	NC_009481	TG	3	6	1997255	1997260	0 %	50 %	50 %	0 %	148240512
42040	NC_009481	ACA	2	6	1997269	1997274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148240512
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42045	NC_009481	GT	3	6	1997443	1997448	0 %	50 %	50 %	0 %	148240512
42046	NC_009481	GCC	2	6	1997525	1997530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240512
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42051	NC_009481	TGC	2	6	1997664	1997669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240512
42052	NC_009481	AGG	2	6	1997751	1997756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148240512
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42055	NC_009481	CG	4	8	1997866	1997873	0 %	0 %	50 %	50 %	148240512
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42063	NC_009481	TGG	3	9	1998176	1998184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240512
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42088	NC_009481	CCTG	2	8	1999090	1999097	0 %	25 %	25 %	50 %	148240513
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42115	NC_009481	GACTG	2	10	2000463	2000472	20 %	20 %	40 %	20 %	148240514
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42117	NC_009481	CAC	2	6	2000565	2000570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240514
42118	NC_009481	GTG	2	6	2000587	2000592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240514
42119	NC_009481	TCG	2	6	2000607	2000612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240514
42120	NC_009481	TCGA	2	8	2000618	2000625	25 %	25 %	25 %	25 %	148240514
42121	NC_009481	CGG	2	6	2000652	2000657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240514
42122	NC_009481	GCA	2	6	2000663	2000668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240514
42123	NC_009481	G	6	6	2000757	2000762	0 %	0 %	100 %	0 %	148240514
42124	NC_009481	GGGCCT	2	12	2000768	2000779	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148240514
42125	NC_009481	CT	4	8	2000778	2000785	0 %	50 %	0 %	50 %	148240514
42126	NC_009481	ACA	2	6	2000804	2000809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148240514
42127	NC_009481	CTGA	2	8	2001037	2001044	25 %	25 %	25 %	25 %	148240514
42128	NC_009481	CAC	2	6	2001069	2001074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240514
42129	NC_009481	GA	3	6	2001088	2001093	50 %	0 %	50 %	0 %	148240514
42130	NC_009481	TGA	2	6	2001095	2001100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240514
42131	NC_009481	GCAC	2	8	2001124	2001131	25 %	0 %	25 %	50 %	148240514
42132	NC_009481	CAC	2	6	2001141	2001146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240514
42133	NC_009481	CTC	3	9	2001187	2001195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240514
42134	NC_009481	TGG	2	6	2001234	2001239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240514
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42136	NC_009481	CCA	2	6	2001275	2001280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240514
42137	NC_009481	ACG	2	6	2001302	2001307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240514
42138	NC_009481	GGT	2	6	2001342	2001347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240514
42139	NC_009481	CTG	2	6	2001379	2001384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240514
42140	NC_009481	TGA	2	6	2001392	2001397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240514
42141	NC_009481	TTG	2	6	2001403	2001408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148240514
42142	NC_009481	CCG	2	6	2001431	2001436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240514
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42144	NC_009481	TGG	2	6	2001712	2001717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240515
42145	NC_009481	GTC	2	6	2001794	2001799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240515
42146	NC_009481	TCC	2	6	2001841	2001846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240515
42147	NC_009481	GTG	2	6	2001895	2001900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240515
42148	NC_009481	GAG	2	6	2001913	2001918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148240515
42149	NC_009481	AGGC	2	8	2001929	2001936	25 %	0 %	50 %	25 %	148240515
42150	NC_009481	CGT	2	6	2001954	2001959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240515
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42152	NC_009481	GTG	2	6	2002105	2002110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240515
42153	NC_009481	GCTCGA	2	12	2002176	2002187	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148240515
42154	NC_009481	GAG	2	6	2002204	2002209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148240515
42155	NC_009481	CTG	2	6	2002298	2002303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240515
42156	NC_009481	CTG	2	6	2002309	2002314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240515
42157	NC_009481	TTC	2	6	2002337	2002342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148240515
42158	NC_009481	GTC	2	6	2002360	2002365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240515
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42161	NC_009481	CTG	2	6	2002517	2002522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240516
42162	NC_009481	ACCC	2	8	2002588	2002595	25 %	0 %	0 %	75 %	148240516
42163	NC_009481	GGC	2	6	2002642	2002647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240516
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42166	NC_009481	CCGC	2	8	2002717	2002724	0 %	0 %	25 %	75 %	148240516
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42170	NC_009481	GGA	2	6	2002859	2002864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148240516
42171	NC_009481	GCG	2	6	2002895	2002900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240516
42172	NC_009481	TGGC	2	8	2002918	2002925	0 %	25 %	50 %	25 %	148240516
42173	NC_009481	TCC	2	6	2002969	2002974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240516
42174	NC_009481	TGGGA	2	10	2003007	2003016	20 %	20 %	60 %	0 %	148240516
42175	NC_009481	GGCC	2	8	2003022	2003029	0 %	0 %	50 %	50 %	148240516
42176	NC_009481	GCG	2	6	2003064	2003069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240516
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42178	NC_009481	GAG	2	6	2003123	2003128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148240516
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42180	NC_009481	CGA	2	6	2003219	2003224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240516
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42182	NC_009481	GCC	2	6	2003285	2003290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240516
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42184	NC_009481	GCT	2	6	2003347	2003352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240516
42185	NC_009481	G	6	6	2003363	2003368	0 %	0 %	100 %	0 %	148240516
42186	NC_009481	GGC	2	6	2003400	2003405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240516
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42189	NC_009481	TGG	2	6	2003492	2003497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240516
42190	NC_009481	GCA	2	6	2003540	2003545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240516
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42192	NC_009481	CCG	2	6	2003642	2003647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240517
42193	NC_009481	GCT	2	6	2003650	2003655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240517
42194	NC_009481	TCGG	2	8	2003682	2003689	0 %	25 %	50 %	25 %	148240517
42195	NC_009481	G	7	7	2003695	2003701	0 %	0 %	100 %	0 %	148240517
42196	NC_009481	CTG	2	6	2003756	2003761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240517
42197	NC_009481	GCAG	2	8	2003824	2003831	25 %	0 %	50 %	25 %	148240517
42198	NC_009481	CAC	2	6	2003846	2003851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240517
42199	NC_009481	GCAGAG	2	12	2003910	2003921	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
42200	NC_009481	CGCC	2	8	2003995	2004002	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
42201	NC_009481	CAACG	2	10	2004017	2004026	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
42202	NC_009481	TCC	2	6	2004081	2004086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240518
42203	NC_009481	CCA	2	6	2004094	2004099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240518
42204	NC_009481	CGG	2	6	2004134	2004139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240518
42205	NC_009481	CGT	2	6	2004153	2004158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240518
42206	NC_009481	ACCT	2	8	2004201	2004208	25 %	25 %	0 %	50 %	148240518
42207	NC_009481	TTC	2	6	2004229	2004234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148240518
42208	NC_009481	GCC	2	6	2004279	2004284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240518
42209	NC_009481	AGG	2	6	2004358	2004363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148240518
42210	NC_009481	GCC	2	6	2004378	2004383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240518
42211	NC_009481	ACA	2	6	2004387	2004392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42212	NC_009481	CGC	2	6	2004393	2004398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42213	NC_009481	CGC	2	6	2004409	2004414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42214	NC_009481	CGCT	2	8	2004539	2004546	0 %	25 %	25 %	50 %	148240519
42215	NC_009481	CTG	2	6	2004570	2004575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240519
42216	NC_009481	CGA	2	6	2004631	2004636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240519
42217	NC_009481	GAC	2	6	2004662	2004667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240519
42218	NC_009481	AGCA	2	8	2004674	2004681	50 %	0 %	25 %	25 %	148240519
42219	NC_009481	G	6	6	2004701	2004706	0 %	0 %	100 %	0 %	148240519
42220	NC_009481	ACG	2	6	2004750	2004755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240520
42221	NC_009481	TCCGCC	2	12	2004765	2004776	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	148240520
42222	NC_009481	GAA	2	6	2004786	2004791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148240520
42223	NC_009481	CCG	2	6	2004863	2004868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240520
42224	NC_009481	CAC	2	6	2004893	2004898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42225	NC_009481	GAT	2	6	2004906	2004911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240521
42226	NC_009481	TGC	2	6	2004935	2004940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240521
42227	NC_009481	GAA	2	6	2005084	2005089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148240521
42228	NC_009481	CAG	2	6	2005092	2005097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240521
42229	NC_009481	CAG	2	6	2005141	2005146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240521
42230	NC_009481	GA	3	6	2005165	2005170	50 %	0 %	50 %	0 %	148240521
42231	NC_009481	AGC	2	6	2005206	2005211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240521
42232	NC_009481	TGAG	2	8	2005220	2005227	25 %	25 %	50 %	0 %	148240521
42233	NC_009481	GCAG	2	8	2005260	2005267	25 %	0 %	50 %	25 %	148240521
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42349	NC_009481	CAA	2	6	2010730	2010735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148240526
42350	NC_009481	TGG	2	6	2010827	2010832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240526
42351	NC_009481	TGGC	2	8	2010850	2010857	0 %	25 %	50 %	25 %	148240526
42352	NC_009481	CTG	2	6	2010889	2010894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240526
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42354	NC_009481	TGCCCA	2	12	2011007	2011018	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148240526
42355	NC_009481	GAC	2	6	2011078	2011083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240526
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42357	NC_009481	GATG	2	8	2011344	2011351	25 %	25 %	50 %	0 %	148240526
42358	NC_009481	G	6	6	2011373	2011378	0 %	0 %	100 %	0 %	148240526
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42362	NC_009481	CT	3	6	2011609	2011614	0 %	50 %	0 %	50 %	148240526
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42370	NC_009481	T	6	6	2012106	2012111	0 %	100 %	0 %	0 %	148240528
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42401	NC_009481	CATC	3	12	2013415	2013426	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
42402	NC_009481	CAA	2	6	2013433	2013438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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42455	NC_009481	GC	3	6	2015490	2015495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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42458	NC_009481	CTTT	2	8	2015536	2015543	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42459	NC_009481	C	6	6	2015603	2015608	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
42460	NC_009481	TCG	2	6	2015614	2015619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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42463	NC_009481	CAA	2	6	2015740	2015745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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42467	NC_009481	TTC	2	6	2015881	2015886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42468	NC_009481	TCC	2	6	2016028	2016033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42469	NC_009481	ACG	2	6	2016106	2016111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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42471	NC_009481	TCG	2	6	2016380	2016385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42472	NC_009481	GC	3	6	2016417	2016422	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42473	NC_009481	AGG	2	6	2016437	2016442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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42489	NC_009481	C	6	6	2017790	2017795	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
42490	NC_009481	AGCT	2	8	2017842	2017849	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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42497	NC_009481	TCGC	2	8	2018427	2018434	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42498	NC_009481	CTTTC	2	10	2018458	2018467	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
42499	NC_009481	CTA	2	6	2018474	2018479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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