MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. WH 7803 chromosome

Total Repeats: 50037

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
38501	NC_009481	GATT	2	8	1830471	1830478	25 %	50 %	25 %	0 %	148240337
38502	NC_009481	A	8	8	1830552	1830559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38503	NC_009481	GC	3	6	1830608	1830613	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38504	NC_009481	CTTGCC	2	12	1830674	1830685	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	148240338
38505	NC_009481	TTG	2	6	1830720	1830725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148240338
38506	NC_009481	ACTC	2	8	1830772	1830779	25 %	25 %	0 %	50 %	148240338
38507	NC_009481	AGA	2	6	1830811	1830816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148240338
38508	NC_009481	ACC	2	6	1830839	1830844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240338
38509	NC_009481	CGA	2	6	1830847	1830852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240338
38510	NC_009481	GT	3	6	1830928	1830933	0 %	50 %	50 %	0 %	148240338
38511	NC_009481	GGAA	2	8	1830938	1830945	50 %	0 %	50 %	0 %	148240338
38512	NC_009481	TGG	2	6	1830961	1830966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240338
38513	NC_009481	CCG	2	6	1830987	1830992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240338
38514	NC_009481	CCTT	2	8	1831008	1831015	0 %	50 %	0 %	50 %	148240338
38515	NC_009481	CTG	3	9	1831022	1831030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240338
38516	NC_009481	GCT	3	9	1831062	1831070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240338
38517	NC_009481	CCT	2	6	1831084	1831089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240338
38518	NC_009481	ACAA	2	8	1831145	1831152	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
38519	NC_009481	CTAAC	2	10	1831153	1831162	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
38520	NC_009481	GCC	2	6	1831164	1831169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38521	NC_009481	TCA	2	6	1831178	1831183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38522	NC_009481	CCA	2	6	1831205	1831210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240339
38523	NC_009481	TGT	2	6	1831216	1831221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148240339
38524	NC_009481	CCG	2	6	1831262	1831267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240339
38525	NC_009481	GAT	2	6	1831326	1831331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240339
38526	NC_009481	AAC	2	6	1831353	1831358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148240339
38527	NC_009481	AGA	2	6	1831463	1831468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148240339
38528	NC_009481	ACTGG	2	10	1831480	1831489	20 %	20 %	40 %	20 %	148240339
38529	NC_009481	GCG	2	6	1831573	1831578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240339
38530	NC_009481	C	6	6	1831584	1831589	0 %	0 %	0 %	100 %	148240339
38531	NC_009481	CCGC	2	8	1831591	1831598	0 %	0 %	25 %	75 %	148240339
38532	NC_009481	AGC	2	6	1831609	1831614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240339
38533	NC_009481	CGCCC	2	10	1831628	1831637	0 %	0 %	20 %	80 %	148240339
38534	NC_009481	CTC	2	6	1831704	1831709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240339
38535	NC_009481	CAG	2	6	1831712	1831717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240339
38536	NC_009481	ACC	2	6	1831725	1831730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240339
38537	NC_009481	GAAC	2	8	1831797	1831804	50 %	0 %	25 %	25 %	148240339
38538	NC_009481	CGT	2	6	1831857	1831862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240339
38539	NC_009481	AGC	2	6	1831908	1831913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240339
38540	NC_009481	CCCTCG	2	12	1832059	1832070	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	148240340
38541	NC_009481	GGC	2	6	1832073	1832078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240340
38542	NC_009481	GCT	2	6	1832117	1832122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240340
38543	NC_009481	CTC	2	6	1832181	1832186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240340
38544	NC_009481	GCT	2	6	1832213	1832218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240340
38545	NC_009481	TGATCG	2	12	1832269	1832280	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148240340
38546	NC_009481	GCA	2	6	1832296	1832301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240340
38547	NC_009481	TGA	2	6	1832359	1832364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240340
38548	NC_009481	CAGA	2	8	1832417	1832424	50 %	0 %	25 %	25 %	148240340
38549	NC_009481	TGAG	2	8	1832446	1832453	25 %	25 %	50 %	0 %	148240340
38550	NC_009481	TCA	2	6	1832503	1832508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240340
38551	NC_009481	TCA	2	6	1832530	1832535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240340
38552	NC_009481	TTC	2	6	1832661	1832666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148240340
38553	NC_009481	TC	3	6	1832688	1832693	0 %	50 %	0 %	50 %	148240340
38554	NC_009481	GGCG	3	12	1832740	1832751	0 %	0 %	75 %	25 %	148240340
38555	NC_009481	CTG	2	6	1832754	1832759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240340
38556	NC_009481	GTG	3	9	1832775	1832783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240340
38557	NC_009481	GAAC	2	8	1832825	1832832	50 %	0 %	25 %	25 %	148240340
38558	NC_009481	CTGG	2	8	1832850	1832857	0 %	25 %	50 %	25 %	148240340
38559	NC_009481	CGC	2	6	1832916	1832921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240340
38560	NC_009481	TCA	2	6	1832998	1833003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240340
38561	NC_009481	ATC	2	6	1833012	1833017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240340
38562	NC_009481	GGT	2	6	1833026	1833031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240340
38563	NC_009481	TGC	2	6	1833058	1833063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240340
38564	NC_009481	TGG	2	6	1833130	1833135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240340
38565	NC_009481	TCG	2	6	1833240	1833245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240341
38566	NC_009481	CGT	2	6	1833262	1833267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240341
38567	NC_009481	GATGCC	2	12	1833278	1833289	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148240341
38568	NC_009481	TCG	2	6	1833300	1833305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240341
38569	NC_009481	CAT	2	6	1833424	1833429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240341
38570	NC_009481	CGGTG	2	10	1833454	1833463	0 %	20 %	60 %	20 %	148240341
38571	NC_009481	CCA	2	6	1833544	1833549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240341
38572	NC_009481	CAGC	2	8	1833625	1833632	25 %	0 %	25 %	50 %	148240341
38573	NC_009481	GCT	2	6	1833652	1833657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240341
38574	NC_009481	CGC	2	6	1833658	1833663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240341
38575	NC_009481	GTA	2	6	1833707	1833712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240341
38576	NC_009481	AGC	2	6	1833724	1833729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240341
38577	NC_009481	CAG	2	6	1833740	1833745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240341
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38580	NC_009481	C	8	8	1833805	1833812	0 %	0 %	0 %	100 %	148240341
38581	NC_009481	CAC	2	6	1833835	1833840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240341
38582	NC_009481	GAC	2	6	1833908	1833913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240341
38583	NC_009481	GCG	2	6	1833933	1833938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240341
38584	NC_009481	CCG	2	6	1833976	1833981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240341
38585	NC_009481	GCA	2	6	1834006	1834011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240341
38586	NC_009481	CAAGGC	2	12	1834028	1834039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240341
38587	NC_009481	GGC	2	6	1834082	1834087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240341
38588	NC_009481	ACC	2	6	1834089	1834094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240341
38589	NC_009481	CGAC	2	8	1834116	1834123	25 %	0 %	25 %	50 %	148240341
38590	NC_009481	GCT	2	6	1834168	1834173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240341
38591	NC_009481	GCA	3	9	1834318	1834326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240341
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38593	NC_009481	ATG	2	6	1834406	1834411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240341
38594	NC_009481	C	6	6	1834449	1834454	0 %	0 %	0 %	100 %	148240341
38595	NC_009481	ACG	2	6	1834475	1834480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38596	NC_009481	G	6	6	1834507	1834512	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
38597	NC_009481	GGCA	2	8	1834559	1834566	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38598	NC_009481	CTG	2	6	1834591	1834596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240342
38599	NC_009481	CTG	2	6	1834600	1834605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240342
38600	NC_009481	TGG	4	12	1834610	1834621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240342
38601	NC_009481	CT	3	6	1834637	1834642	0 %	50 %	0 %	50 %	148240342
38602	NC_009481	CGC	2	6	1834698	1834703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240342
38603	NC_009481	CCGC	3	12	1834700	1834711	0 %	0 %	25 %	75 %	148240342
38604	NC_009481	CAA	2	6	1834788	1834793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148240342
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38607	NC_009481	TGC	2	6	1834988	1834993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240342
38608	NC_009481	CTGG	2	8	1834995	1835002	0 %	25 %	50 %	25 %	148240342
38609	NC_009481	TGA	2	6	1835006	1835011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240342
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38611	NC_009481	CTG	2	6	1835041	1835046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240342
38612	NC_009481	GAG	2	6	1835059	1835064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148240342
38613	NC_009481	GCC	2	6	1835146	1835151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240342
38614	NC_009481	CCGC	2	8	1835186	1835193	0 %	0 %	25 %	75 %	148240342
38615	NC_009481	TGA	2	6	1835198	1835203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240342
38616	NC_009481	GTG	2	6	1835286	1835291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240342
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38716	NC_009481	CTGGGG	2	12	1838903	1838914	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	148240345
38717	NC_009481	G	6	6	1838911	1838916	0 %	0 %	100 %	0 %	148240345
38718	NC_009481	GGCCA	2	10	1838933	1838942	20 %	0 %	40 %	40 %	148240345
38719	NC_009481	CCAGA	2	10	1838975	1838984	40 %	0 %	20 %	40 %	148240345
38720	NC_009481	CCTG	2	8	1838998	1839005	0 %	25 %	25 %	50 %	148240345
38721	NC_009481	GTG	2	6	1839057	1839062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240345
38722	NC_009481	AGC	2	6	1839063	1839068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240345
38723	NC_009481	CGA	2	6	1839091	1839096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240345
38724	NC_009481	GTT	2	6	1839115	1839120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148240345
38725	NC_009481	GCG	2	6	1839139	1839144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240345
38726	NC_009481	TGGC	2	8	1839190	1839197	0 %	25 %	50 %	25 %	148240345
38727	NC_009481	GAC	2	6	1839234	1839239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38728	NC_009481	TGA	2	6	1839312	1839317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240346
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38730	NC_009481	TGG	2	6	1839482	1839487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240346
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38815	NC_009481	GATG	2	8	1843263	1843270	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
38816	NC_009481	GT	3	6	1843272	1843277	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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38848	NC_009481	CCTG	2	8	1844789	1844796	0 %	25 %	25 %	50 %	148240353
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