MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. WH 7803 chromosome

Total Repeats: 50037

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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38002	NC_009481	GCC	2	6	1806424	1806429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240309
38003	NC_009481	CCA	2	6	1806479	1806484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240309
38004	NC_009481	C	6	6	1806538	1806543	0 %	0 %	0 %	100 %	148240309
38005	NC_009481	CAGA	2	8	1806551	1806558	50 %	0 %	25 %	25 %	148240309
38006	NC_009481	CAG	2	6	1806573	1806578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240309
38007	NC_009481	TCA	2	6	1806611	1806616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240309
38008	NC_009481	GCA	2	6	1806620	1806625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240309
38009	NC_009481	GCAGC	2	10	1806638	1806647	20 %	0 %	40 %	40 %	148240309
38010	NC_009481	AGGT	2	8	1806661	1806668	25 %	25 %	50 %	0 %	148240309
38011	NC_009481	GCC	2	6	1806688	1806693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240309
38012	NC_009481	CCA	2	6	1806695	1806700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240309
38013	NC_009481	GGT	2	6	1806702	1806707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240309
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38015	NC_009481	GCG	2	6	1806775	1806780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240309
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38032	NC_009481	CCG	2	6	1807545	1807550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240310
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38051	NC_009481	GCCG	2	8	1808492	1808499	0 %	0 %	50 %	50 %	148240311
38052	NC_009481	CG	4	8	1808498	1808505	0 %	0 %	50 %	50 %	148240311
38053	NC_009481	GA	3	6	1808535	1808540	50 %	0 %	50 %	0 %	148240311
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38100	NC_009481	T	6	6	1811246	1811251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38101	NC_009481	ACC	2	6	1811324	1811329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240314
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38106	NC_009481	TGC	2	6	1811489	1811494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240314
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38112	NC_009481	AC	4	8	1811682	1811689	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38113	NC_009481	CAA	2	6	1811698	1811703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38114	NC_009481	TTG	2	6	1811753	1811758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38115	NC_009481	GTC	3	9	1811858	1811866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240315
38116	NC_009481	TCG	2	6	1811997	1812002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240315
38117	NC_009481	TTG	2	6	1812018	1812023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148240315
38118	NC_009481	AAG	2	6	1812058	1812063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148240315
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38120	NC_009481	C	6	6	1812141	1812146	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
38121	NC_009481	GGCCAA	2	12	1812169	1812180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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38202	NC_009481	CT	3	6	1816625	1816630	0 %	50 %	0 %	50 %	148240320
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38217	NC_009481	CGG	2	6	1817666	1817671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240320
38218	NC_009481	TGA	2	6	1817736	1817741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38219	NC_009481	CAC	2	6	1817788	1817793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240321
38220	NC_009481	T	8	8	1817863	1817870	0 %	100 %	0 %	0 %	148240321
38221	NC_009481	CAT	2	6	1817896	1817901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240321
38222	NC_009481	TTG	2	6	1817931	1817936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148240321
38223	NC_009481	CCCA	2	8	1817939	1817946	25 %	0 %	0 %	75 %	148240321
38224	NC_009481	TCCT	2	8	1817953	1817960	0 %	50 %	0 %	50 %	148240321
38225	NC_009481	AAC	2	6	1818084	1818089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148240321
38226	NC_009481	GTG	2	6	1818095	1818100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240321
38227	NC_009481	TC	3	6	1818115	1818120	0 %	50 %	0 %	50 %	148240321
38228	NC_009481	TCC	2	6	1818123	1818128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240321
38229	NC_009481	CAG	2	6	1818189	1818194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240322
38230	NC_009481	ACC	2	6	1818222	1818227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240322
38231	NC_009481	CTCG	2	8	1818324	1818331	0 %	25 %	25 %	50 %	148240322
38232	NC_009481	CTG	3	9	1818381	1818389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240322
38233	NC_009481	GCT	2	6	1818425	1818430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240322
38234	NC_009481	GCTG	2	8	1818508	1818515	0 %	25 %	50 %	25 %	148240322
38235	NC_009481	GTG	2	6	1818552	1818557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240322
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38240	NC_009481	CTG	2	6	1818843	1818848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240322
38241	NC_009481	CATTC	2	10	1818851	1818860	20 %	40 %	0 %	40 %	148240322
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38249	NC_009481	GCA	2	6	1819227	1819232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38250	NC_009481	CAA	2	6	1819248	1819253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38251	NC_009481	AGC	2	6	1819330	1819335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38252	NC_009481	GGCC	2	8	1819542	1819549	0 %	0 %	50 %	50 %	148240324
38253	NC_009481	CTCG	2	8	1819565	1819572	0 %	25 %	25 %	50 %	148240324
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38270	NC_009481	CTC	2	6	1820299	1820304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240326
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38272	NC_009481	TCC	2	6	1820421	1820426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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38307	NC_009481	GT	3	6	1822127	1822132	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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38316	NC_009481	GAAA	2	8	1822613	1822620	75 %	0 %	25 %	0 %	148240328
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38337	NC_009481	TCG	2	6	1823725	1823730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240330
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38341	NC_009481	GCG	2	6	1823845	1823850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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38343	NC_009481	GTC	2	6	1823966	1823971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240331
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38347	NC_009481	GC	3	6	1824224	1824229	0 %	0 %	50 %	50 %	148240331
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38349	NC_009481	GCA	2	6	1824240	1824245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240331
38350	NC_009481	GCTG	2	8	1824263	1824270	0 %	25 %	50 %	25 %	148240331
38351	NC_009481	GGC	2	6	1824324	1824329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240331
38352	NC_009481	GCT	2	6	1824372	1824377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240331
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38356	NC_009481	GCT	2	6	1824575	1824580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240331
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38363	NC_009481	TGT	2	6	1824818	1824823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148240331
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38365	NC_009481	CCT	2	6	1824890	1824895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240331
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38376	NC_009481	CA	3	6	1825327	1825332	50 %	0 %	0 %	50 %	148240331
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38378	NC_009481	TGG	2	6	1825381	1825386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240331
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38380	NC_009481	CGA	2	6	1825412	1825417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240331
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38383	NC_009481	GCT	2	6	1825454	1825459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240331
38384	NC_009481	TTGA	2	8	1825497	1825504	25 %	50 %	25 %	0 %	148240331
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38407	NC_009481	AGT	2	6	1826306	1826311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240334
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38448	NC_009481	AGA	2	6	1827963	1827968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38449	NC_009481	GCTGT	2	10	1827981	1827990	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
38450	NC_009481	GAC	2	6	1827998	1828003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240335
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38453	NC_009481	GAA	2	6	1828198	1828203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148240335
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38458	NC_009481	CA	3	6	1828503	1828508	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38459	NC_009481	CCT	2	6	1828509	1828514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38460	NC_009481	GCT	3	9	1828526	1828534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240336
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38464	NC_009481	GCA	2	6	1828690	1828695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240336
38465	NC_009481	GCT	2	6	1828696	1828701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240336
38466	NC_009481	CCGTG	2	10	1828717	1828726	0 %	20 %	40 %	40 %	148240336
38467	NC_009481	TCA	2	6	1829049	1829054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240336
38468	NC_009481	ACA	2	6	1829055	1829060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148240336
38469	NC_009481	GAG	2	6	1829135	1829140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148240336
38470	NC_009481	ATGA	2	8	1829210	1829217	50 %	25 %	25 %	0 %	148240336
38471	NC_009481	C	6	6	1829219	1829224	0 %	0 %	0 %	100 %	148240336
38472	NC_009481	TC	3	6	1829245	1829250	0 %	50 %	0 %	50 %	148240336
38473	NC_009481	TCG	2	6	1829307	1829312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240336
38474	NC_009481	ACA	2	6	1829313	1829318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148240336
38475	NC_009481	GAC	2	6	1829489	1829494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240336
38476	NC_009481	ACC	2	6	1829516	1829521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240336
38477	NC_009481	CCA	2	6	1829538	1829543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240336
38478	NC_009481	GGCCT	2	10	1829558	1829567	0 %	20 %	40 %	40 %	148240336
38479	NC_009481	CCA	2	6	1829604	1829609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240336
38480	NC_009481	CCG	2	6	1829625	1829630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240336
38481	NC_009481	GAG	2	6	1829639	1829644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148240336
38482	NC_009481	CGTGC	2	10	1829660	1829669	0 %	20 %	40 %	40 %	148240336
38483	NC_009481	CAT	2	6	1829704	1829709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240336
38484	NC_009481	TGA	2	6	1829725	1829730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240336
38485	NC_009481	CTT	2	6	1829797	1829802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148240336
38486	NC_009481	GT	3	6	1829832	1829837	0 %	50 %	50 %	0 %	148240336
38487	NC_009481	GAA	2	6	1829849	1829854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148240336
38488	NC_009481	ACC	2	6	1829895	1829900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240336
38489	NC_009481	TCG	2	6	1829922	1829927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240336
38490	NC_009481	CAAGGC	2	12	1829944	1829955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240336
38491	NC_009481	CCG	2	6	1829996	1830001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38492	NC_009481	CCA	2	6	1830016	1830021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38493	NC_009481	TCC	2	6	1830054	1830059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38494	NC_009481	GT	3	6	1830103	1830108	0 %	50 %	50 %	0 %	148240337
38495	NC_009481	TTC	2	6	1830133	1830138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148240337
38496	NC_009481	CAC	2	6	1830143	1830148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240337
38497	NC_009481	GGC	2	6	1830228	1830233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240337
38498	NC_009481	CTG	2	6	1830304	1830309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240337
38499	NC_009481	CAA	2	6	1830420	1830425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148240337
38500	NC_009481	GGC	2	6	1830455	1830460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240337

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