MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. WH 7803 chromosome

Total Repeats: 50037

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34501	NC_009481	TGG	2	6	1647673	1647678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240134
34502	NC_009481	CG	3	6	1647762	1647767	0 %	0 %	50 %	50 %	148240134
34503	NC_009481	ATG	2	6	1647790	1647795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240134
34504	NC_009481	TC	3	6	1647837	1647842	0 %	50 %	0 %	50 %	148240134
34505	NC_009481	AG	3	6	1647948	1647953	50 %	0 %	50 %	0 %	148240134
34506	NC_009481	AC	3	6	1647982	1647987	50 %	0 %	0 %	50 %	148240134
34507	NC_009481	TTG	2	6	1648191	1648196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148240135
34508	NC_009481	CAC	2	6	1648201	1648206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240135
34509	NC_009481	ACAA	2	8	1648312	1648319	75 %	0 %	0 %	25 %	148240135
34510	NC_009481	TCC	2	6	1648322	1648327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240135
34511	NC_009481	CCA	2	6	1648343	1648348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240135
34512	NC_009481	CCA	2	6	1648370	1648375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240135
34513	NC_009481	A	6	6	1648377	1648382	100 %	0 %	0 %	0 %	148240135
34514	NC_009481	TCA	2	6	1648397	1648402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240135
34515	NC_009481	TCGAAC	2	12	1648463	1648474	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148240135
34516	NC_009481	ACG	2	6	1648584	1648589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240135
34517	NC_009481	AGCA	2	8	1648590	1648597	50 %	0 %	25 %	25 %	148240135
34518	NC_009481	ACC	2	6	1648643	1648648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240135
34519	NC_009481	TTG	2	6	1648664	1648669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148240135
34520	NC_009481	C	6	6	1648707	1648712	0 %	0 %	0 %	100 %	148240135
34521	NC_009481	AAC	2	6	1648819	1648824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34522	NC_009481	AAG	2	6	1648941	1648946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34523	NC_009481	CAA	2	6	1649004	1649009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148240136
34524	NC_009481	TGA	2	6	1649044	1649049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240136
34525	NC_009481	GCG	2	6	1649058	1649063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240136
34526	NC_009481	CGA	2	6	1649128	1649133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240136
34527	NC_009481	ACG	2	6	1649139	1649144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240136
34528	NC_009481	GC	3	6	1649180	1649185	0 %	0 %	50 %	50 %	148240136
34529	NC_009481	ATC	2	6	1649254	1649259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240136
34530	NC_009481	GCAG	2	8	1649294	1649301	25 %	0 %	50 %	25 %	148240136
34531	NC_009481	TGA	3	9	1649365	1649373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240136
34532	NC_009481	CA	4	8	1649510	1649517	50 %	0 %	0 %	50 %	148240136
34533	NC_009481	TGA	2	6	1649534	1649539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240136
34534	NC_009481	AAT	2	6	1649550	1649555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148240136
34535	NC_009481	AC	3	6	1649578	1649583	50 %	0 %	0 %	50 %	148240136
34536	NC_009481	CAA	2	6	1649636	1649641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148240136
34537	NC_009481	TGA	2	6	1649666	1649671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240136
34538	NC_009481	CGC	2	6	1649713	1649718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240136
34539	NC_009481	CTC	2	6	1649746	1649751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240136
34540	NC_009481	GAA	2	6	1649856	1649861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148240136
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34542	NC_009481	TTCT	2	8	1649897	1649904	0 %	75 %	0 %	25 %	148240136
34543	NC_009481	GTA	2	6	1649937	1649942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240136
34544	NC_009481	TGGATC	2	12	1649945	1649956	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148240136
34545	NC_009481	CGC	2	6	1649997	1650002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240136
34546	NC_009481	CCAGG	2	10	1650015	1650024	20 %	0 %	40 %	40 %	148240136
34547	NC_009481	CAA	2	6	1650034	1650039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148240136
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34549	NC_009481	TGA	2	6	1650185	1650190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240136
34550	NC_009481	GAT	2	6	1650327	1650332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240136
34551	NC_009481	ATT	2	6	1650430	1650435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148240136
34552	NC_009481	GAA	2	6	1650454	1650459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148240136
34553	NC_009481	CA	3	6	1650460	1650465	50 %	0 %	0 %	50 %	148240136
34554	NC_009481	ACA	2	6	1650495	1650500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148240136
34555	NC_009481	A	6	6	1650541	1650546	100 %	0 %	0 %	0 %	148240136
34556	NC_009481	CAG	2	6	1650709	1650714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240137
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34559	NC_009481	TGG	2	6	1650783	1650788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240137
34560	NC_009481	ATG	2	6	1650794	1650799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240137
34561	NC_009481	CTG	2	6	1650835	1650840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240137
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34564	NC_009481	GC	3	6	1650929	1650934	0 %	0 %	50 %	50 %	148240137
34565	NC_009481	GTTC	2	8	1650966	1650973	0 %	50 %	25 %	25 %	148240137
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34588	NC_009481	CCA	3	9	1652100	1652108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240137
34589	NC_009481	CTC	2	6	1652197	1652202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240137
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34597	NC_009481	CTGC	2	8	1652506	1652513	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34598	NC_009481	CAG	2	6	1652552	1652557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34599	NC_009481	GCA	2	6	1652641	1652646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240138
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34601	NC_009481	GAG	2	6	1652734	1652739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148240138
34602	NC_009481	CAGCA	2	10	1652761	1652770	40 %	0 %	20 %	40 %	148240138
34603	NC_009481	GAT	2	6	1652950	1652955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240138
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34605	NC_009481	CGA	2	6	1653025	1653030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240138
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34612	NC_009481	GAG	2	6	1653300	1653305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148240138
34613	NC_009481	ACT	2	6	1653333	1653338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240138
34614	NC_009481	TGAT	2	8	1653378	1653385	25 %	50 %	25 %	0 %	148240138
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34616	NC_009481	GGC	2	6	1653488	1653493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240138
34617	NC_009481	GC	3	6	1653492	1653497	0 %	0 %	50 %	50 %	148240138
34618	NC_009481	CGC	2	6	1653508	1653513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240138
34619	NC_009481	GTC	2	6	1653534	1653539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240138
34620	NC_009481	CGG	2	6	1653544	1653549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240138
34621	NC_009481	GAC	2	6	1653566	1653571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240138
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34625	NC_009481	GC	3	6	1653820	1653825	0 %	0 %	50 %	50 %	148240138
34626	NC_009481	CCCG	2	8	1653833	1653840	0 %	0 %	25 %	75 %	148240138
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34630	NC_009481	TGC	2	6	1653985	1653990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240138
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34644	NC_009481	CT	3	6	1654608	1654613	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34645	NC_009481	CAG	2	6	1654626	1654631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240139
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34731	NC_009481	CAAC	2	8	1657828	1657835	50 %	0 %	0 %	50 %	148240142
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34733	NC_009481	CAAC	2	8	1657913	1657920	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34734	NC_009481	TGG	2	6	1657933	1657938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240143
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34968	NC_009481	GCA	2	6	1667926	1667931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240151
34969	NC_009481	GCG	2	6	1667942	1667947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240151
34970	NC_009481	CTC	2	6	1667951	1667956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240151
34971	NC_009481	CCAA	2	8	1668039	1668046	50 %	0 %	0 %	50 %	148240151
34972	NC_009481	CTC	2	6	1668068	1668073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240151
34973	NC_009481	C	6	6	1668131	1668136	0 %	0 %	0 %	100 %	148240151
34974	NC_009481	CCA	2	6	1668151	1668156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240151
34975	NC_009481	CCG	2	6	1668213	1668218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240151
34976	NC_009481	CAGC	2	8	1668282	1668289	25 %	0 %	25 %	50 %	148240151
34977	NC_009481	CGA	2	6	1668323	1668328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240151
34978	NC_009481	GCT	2	6	1668337	1668342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240152
34979	NC_009481	CGC	2	6	1668381	1668386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240152
34980	NC_009481	GCC	2	6	1668394	1668399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240152
34981	NC_009481	AGC	2	6	1668443	1668448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240152
34982	NC_009481	CAC	3	9	1668574	1668582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240152
34983	NC_009481	AGT	2	6	1668630	1668635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240152
34984	NC_009481	CGG	2	6	1668660	1668665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240152
34985	NC_009481	CTGC	2	8	1668671	1668678	0 %	25 %	25 %	50 %	148240152
34986	NC_009481	AGATGC	2	12	1668731	1668742	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148240152
34987	NC_009481	ACC	2	6	1668767	1668772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240152
34988	NC_009481	GGCT	2	8	1668782	1668789	0 %	25 %	50 %	25 %	148240152
34989	NC_009481	CAC	2	6	1668832	1668837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240152
34990	NC_009481	TCG	2	6	1668890	1668895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240152
34991	NC_009481	CAC	2	6	1668919	1668924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240152
34992	NC_009481	GAC	2	6	1669009	1669014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34993	NC_009481	CTG	2	6	1669107	1669112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240153
34994	NC_009481	CAC	2	6	1669158	1669163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240153
34995	NC_009481	CGC	2	6	1669171	1669176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240153
34996	NC_009481	AGC	2	6	1669215	1669220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240153
34997	NC_009481	AACTC	2	10	1669295	1669304	40 %	20 %	0 %	40 %	148240153
34998	NC_009481	GC	3	6	1669349	1669354	0 %	0 %	50 %	50 %	148240153
34999	NC_009481	GCG	2	6	1669425	1669430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240153
35000	NC_009481	AGC	2	6	1669471	1669476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240153

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