MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. WH 7803 chromosome

Total Repeats: 50037

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33002	NC_009481	T	6	6	1579093	1579098	0 %	100 %	0 %	0 %	148240065
33003	NC_009481	CAG	2	6	1579106	1579111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240065
33004	NC_009481	CGT	2	6	1579123	1579128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240065
33005	NC_009481	CTG	2	6	1579157	1579162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240065
33006	NC_009481	CGGGT	2	10	1579207	1579216	0 %	20 %	60 %	20 %	148240065
33007	NC_009481	CTG	2	6	1579294	1579299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240065
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33009	NC_009481	CGTG	2	8	1579361	1579368	0 %	25 %	50 %	25 %	148240065
33010	NC_009481	C	6	6	1579381	1579386	0 %	0 %	0 %	100 %	148240065
33011	NC_009481	CGT	2	6	1579420	1579425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240065
33012	NC_009481	CCT	2	6	1579495	1579500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240065
33013	NC_009481	GCA	2	6	1579513	1579518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240065
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33016	NC_009481	TGC	2	6	1579720	1579725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240065
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33019	NC_009481	CAG	3	9	1579779	1579787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240066
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33022	NC_009481	CGA	2	6	1579884	1579889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240066
33023	NC_009481	CGTC	2	8	1580054	1580061	0 %	25 %	25 %	50 %	148240066
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33025	NC_009481	CTT	2	6	1580110	1580115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148240066
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33028	NC_009481	TCT	3	9	1580241	1580249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148240067
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33033	NC_009481	CAG	2	6	1580533	1580538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240067
33034	NC_009481	CTG	2	6	1580557	1580562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240067
33035	NC_009481	ATC	2	6	1580576	1580581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240067
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33042	NC_009481	TGC	2	6	1580702	1580707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240067
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33052	NC_009481	ATC	2	6	1581104	1581109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240067
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33098	NC_009481	GCCC	2	8	1583042	1583049	0 %	0 %	25 %	75 %	148240068
33099	NC_009481	GCT	2	6	1583059	1583064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240068
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33115	NC_009481	GCA	2	6	1583814	1583819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240069
33116	NC_009481	GCT	2	6	1583844	1583849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240069
33117	NC_009481	CCG	2	6	1583850	1583855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240069
33118	NC_009481	CCA	2	6	1583865	1583870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240069
33119	NC_009481	CGG	2	6	1583880	1583885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240069
33120	NC_009481	GCA	2	6	1583930	1583935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240069
33121	NC_009481	GCG	2	6	1583943	1583948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240069
33122	NC_009481	CAC	2	6	1583979	1583984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240069
33123	NC_009481	CGG	2	6	1584000	1584005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240069
33124	NC_009481	GCCG	2	8	1584043	1584050	0 %	0 %	50 %	50 %	148240069
33125	NC_009481	CCA	2	6	1584060	1584065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240069
33126	NC_009481	AC	3	6	1584075	1584080	50 %	0 %	0 %	50 %	148240069
33127	NC_009481	CAG	2	6	1584091	1584096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240069
33128	NC_009481	AG	3	6	1584127	1584132	50 %	0 %	50 %	0 %	148240069
33129	NC_009481	CTCGTC	2	12	1584199	1584210	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	148240069
33130	NC_009481	GCT	2	6	1584223	1584228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240069
33131	NC_009481	GTC	2	6	1584229	1584234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240069
33132	NC_009481	ACC	2	6	1584236	1584241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240069
33133	NC_009481	GCTGGC	2	12	1584242	1584253	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148240069
33134	NC_009481	TGCC	2	8	1584328	1584335	0 %	25 %	25 %	50 %	148240069
33135	NC_009481	GCATCC	2	12	1584410	1584421	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148240069
33136	NC_009481	GCA	2	6	1584438	1584443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240069
33137	NC_009481	GAT	2	6	1584501	1584506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240069
33138	NC_009481	TCCA	2	8	1584509	1584516	25 %	25 %	0 %	50 %	148240069
33139	NC_009481	CAG	2	6	1584598	1584603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240069
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33142	NC_009481	TGC	2	6	1584743	1584748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240069
33143	NC_009481	GCG	2	6	1584790	1584795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240069
33144	NC_009481	CTG	2	6	1584799	1584804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240069
33145	NC_009481	A	6	6	1584805	1584810	100 %	0 %	0 %	0 %	148240069
33146	NC_009481	CGG	2	6	1584849	1584854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240069
33147	NC_009481	AGC	2	6	1584862	1584867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240069
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33149	NC_009481	AGC	2	6	1585052	1585057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240069
33150	NC_009481	GCA	2	6	1585071	1585076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240069
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33153	NC_009481	G	6	6	1585236	1585241	0 %	0 %	100 %	0 %	148240069
33154	NC_009481	AGCC	2	8	1585299	1585306	25 %	0 %	25 %	50 %	148240069
33155	NC_009481	CGG	2	6	1585361	1585366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240069
33156	NC_009481	CAT	2	6	1585425	1585430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240069
33157	NC_009481	CGG	2	6	1585497	1585502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240069
33158	NC_009481	CAG	2	6	1585516	1585521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240069
33159	NC_009481	CCA	2	6	1585545	1585550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240069
33160	NC_009481	GGT	2	6	1585628	1585633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33161	NC_009481	CACG	2	8	1585680	1585687	25 %	0 %	25 %	50 %	148240070
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33163	NC_009481	AG	3	6	1585749	1585754	50 %	0 %	50 %	0 %	148240070
33164	NC_009481	CG	3	6	1585766	1585771	0 %	0 %	50 %	50 %	148240070
33165	NC_009481	GAC	2	6	1585806	1585811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240070
33166	NC_009481	TAC	2	6	1585838	1585843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240070
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33168	NC_009481	GCA	2	6	1585941	1585946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240070
33169	NC_009481	TGAG	2	8	1586001	1586008	25 %	25 %	50 %	0 %	148240070
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33171	NC_009481	GCA	2	6	1586031	1586036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240070
33172	NC_009481	CAG	2	6	1586176	1586181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240070
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33181	NC_009481	GAA	2	6	1586540	1586545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148240070
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33184	NC_009481	CCG	2	6	1586771	1586776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240071
33185	NC_009481	CGT	2	6	1586822	1586827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240071
33186	NC_009481	GCC	3	9	1586829	1586837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240071
33187	NC_009481	CGG	2	6	1586863	1586868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240071
33188	NC_009481	AGGC	2	8	1586869	1586876	25 %	0 %	50 %	25 %	148240071
33189	NC_009481	GAT	2	6	1586888	1586893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148240071
33190	NC_009481	GCCGA	2	10	1586931	1586940	20 %	0 %	40 %	40 %	148240071
33191	NC_009481	TCC	2	6	1587046	1587051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240071
33192	NC_009481	CGGGA	2	10	1587094	1587103	20 %	0 %	60 %	20 %	148240071
33193	NC_009481	CG	3	6	1587137	1587142	0 %	0 %	50 %	50 %	148240071
33194	NC_009481	CGC	2	6	1587146	1587151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240071
33195	NC_009481	CG	4	8	1587236	1587243	0 %	0 %	50 %	50 %	148240071
33196	NC_009481	TGG	2	6	1587298	1587303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240071
33197	NC_009481	CCAC	2	8	1587367	1587374	25 %	0 %	0 %	75 %	148240071
33198	NC_009481	CGT	2	6	1587402	1587407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240071
33199	NC_009481	GGCA	2	8	1587408	1587415	25 %	0 %	50 %	25 %	148240071
33200	NC_009481	GCG	2	6	1587423	1587428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240071
33201	NC_009481	CG	3	6	1587452	1587457	0 %	0 %	50 %	50 %	148240071
33202	NC_009481	CTC	2	6	1587475	1587480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240071
33203	NC_009481	GCT	2	6	1587606	1587611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240071
33204	NC_009481	GACG	2	8	1587762	1587769	25 %	0 %	50 %	25 %	148240072
33205	NC_009481	GAG	2	6	1587787	1587792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148240072
33206	NC_009481	CGTT	2	8	1587818	1587825	0 %	50 %	25 %	25 %	148240072
33207	NC_009481	TGC	2	6	1587857	1587862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240072
33208	NC_009481	GCT	2	6	1587897	1587902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240072
33209	NC_009481	GCT	2	6	1587915	1587920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240072
33210	NC_009481	CTC	2	6	1587937	1587942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240072
33211	NC_009481	GAGG	2	8	1587943	1587950	25 %	0 %	75 %	0 %	148240072
33212	NC_009481	GCT	2	6	1588012	1588017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240072
33213	NC_009481	GGT	2	6	1588018	1588023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240072
33214	NC_009481	CTC	2	6	1588051	1588056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148240072
33215	NC_009481	GGC	2	6	1588089	1588094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240072
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33217	NC_009481	CCA	2	6	1588228	1588233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240072
33218	NC_009481	GA	3	6	1588300	1588305	50 %	0 %	50 %	0 %	148240072
33219	NC_009481	CTT	2	6	1588308	1588313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148240072
33220	NC_009481	TTC	2	6	1588352	1588357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148240072
33221	NC_009481	TCA	2	6	1588389	1588394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148240072
33222	NC_009481	GTT	2	6	1588398	1588403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148240072
33223	NC_009481	ACCC	2	8	1588414	1588421	25 %	0 %	0 %	75 %	148240072
33224	NC_009481	GCT	2	6	1588434	1588439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240072
33225	NC_009481	GCT	2	6	1588497	1588502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240072
33226	NC_009481	TTC	2	6	1588551	1588556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148240072
33227	NC_009481	TCG	2	6	1588594	1588599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240072
33228	NC_009481	CGGCTG	2	12	1588620	1588631	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148240072
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33230	NC_009481	GCAT	2	8	1588884	1588891	25 %	25 %	25 %	25 %	148240073
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33444	NC_009481	CAG	2	6	1598231	1598236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33445	NC_009481	GCTCTA	2	12	1598243	1598254	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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33448	NC_009481	GCCG	2	8	1598429	1598436	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33449	NC_009481	GAC	2	6	1598497	1598502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240082
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33454	NC_009481	T	6	6	1598813	1598818	0 %	100 %	0 %	0 %	148240082
33455	NC_009481	GGC	2	6	1598870	1598875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148240082
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33459	NC_009481	GC	3	6	1599149	1599154	0 %	0 %	50 %	50 %	148240082
33460	NC_009481	GGT	2	6	1599167	1599172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240082
33461	NC_009481	TGCTG	2	10	1599322	1599331	0 %	40 %	40 %	20 %	148240082
33462	NC_009481	CAC	2	6	1599418	1599423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148240082
33463	NC_009481	GCT	2	6	1599472	1599477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240082
33464	NC_009481	TTG	2	6	1599594	1599599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148240082
33465	NC_009481	TGC	2	6	1599619	1599624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240082
33466	NC_009481	GCA	2	6	1599690	1599695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240082
33467	NC_009481	TGCGG	2	10	1599761	1599770	0 %	20 %	60 %	20 %	148240082
33468	NC_009481	GGT	2	6	1599807	1599812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33469	NC_009481	GACTC	2	10	1599857	1599866	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
33470	NC_009481	GA	3	6	1599944	1599949	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33471	NC_009481	TGG	2	6	1599996	1600001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240083
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33473	NC_009481	GCA	2	6	1600204	1600209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240083
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33476	NC_009481	TTC	2	6	1600289	1600294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148240083
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33483	NC_009481	ACG	2	6	1600503	1600508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240083
33484	NC_009481	AGC	2	6	1600521	1600526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148240083
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33487	NC_009481	AGCG	2	8	1600649	1600656	25 %	0 %	50 %	25 %	148240083
33488	NC_009481	CTG	2	6	1600664	1600669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240083
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33490	NC_009481	CTG	2	6	1600796	1600801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240083
33491	NC_009481	GTGA	2	8	1600802	1600809	25 %	25 %	50 %	0 %	148240083
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33494	NC_009481	CTG	2	6	1601018	1601023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240083
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33497	NC_009481	GCC	2	6	1601078	1601083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148240083
33498	NC_009481	CTG	3	9	1601096	1601104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148240083
33499	NC_009481	TGCC	2	8	1601106	1601113	0 %	25 %	25 %	50 %	148240083
33500	NC_009481	GGT	2	6	1601122	1601127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148240083

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