MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. WH 7803 chromosome

Total Repeats: 50037

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_009481	CGC	2	6	849747	849752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148239232
18002	NC_009481	CGA	2	6	849849	849854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148239232
18003	NC_009481	GCTG	2	8	849908	849915	0 %	25 %	50 %	25 %	148239232
18004	NC_009481	TGG	2	6	849922	849927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148239232
18005	NC_009481	CAG	2	6	850050	850055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148239232
18006	NC_009481	G	7	7	850100	850106	0 %	0 %	100 %	0 %	148239232
18007	NC_009481	AGA	2	6	850117	850122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148239232
18008	NC_009481	CGG	2	6	850238	850243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148239232
18009	NC_009481	CGAC	2	8	850283	850290	25 %	0 %	25 %	50 %	148239232
18010	NC_009481	GGC	2	6	850319	850324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148239232
18011	NC_009481	GCC	2	6	850327	850332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148239232
18012	NC_009481	AGC	2	6	850333	850338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148239232
18013	NC_009481	GCCAC	2	10	850474	850483	20 %	0 %	20 %	60 %	148239232
18014	NC_009481	GGC	2	6	850503	850508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148239232
18015	NC_009481	TGTT	2	8	850528	850535	0 %	75 %	25 %	0 %	148239232
18016	NC_009481	CTAA	2	8	850625	850632	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18017	NC_009481	TAA	2	6	850707	850712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18018	NC_009481	TGT	2	6	850840	850845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148239233
18019	NC_009481	GAA	2	6	850952	850957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148239233
18020	NC_009481	CGG	2	6	850961	850966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148239233
18021	NC_009481	TCAATA	2	12	850999	851010	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148239233
18022	NC_009481	TG	3	6	851013	851018	0 %	50 %	50 %	0 %	148239233
18023	NC_009481	CGA	2	6	851073	851078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148239233
18024	NC_009481	GCA	2	6	851155	851160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148239233
18025	NC_009481	TGAT	2	8	851183	851190	25 %	50 %	25 %	0 %	148239233
18026	NC_009481	ATCA	2	8	851250	851257	50 %	25 %	0 %	25 %	148239234
18027	NC_009481	CATA	2	8	851277	851284	50 %	25 %	0 %	25 %	148239234
18028	NC_009481	CCA	2	6	851361	851366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148239234
18029	NC_009481	CTGA	2	8	851405	851412	25 %	25 %	25 %	25 %	148239234
18030	NC_009481	TGA	2	6	851453	851458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148239234
18031	NC_009481	CAG	2	6	851508	851513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148239234
18032	NC_009481	GTG	2	6	851551	851556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148239234
18033	NC_009481	TG	3	6	851555	851560	0 %	50 %	50 %	0 %	148239234
18034	NC_009481	CCT	2	6	851570	851575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18035	NC_009481	TCCA	2	8	851605	851612	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18036	NC_009481	CT	3	6	851734	851739	0 %	50 %	0 %	50 %	148239235
18037	NC_009481	CGG	2	6	851752	851757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148239235
18038	NC_009481	CCT	2	6	851774	851779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148239235
18039	NC_009481	CTTC	2	8	851788	851795	0 %	50 %	0 %	50 %	148239235
18040	NC_009481	GTC	2	6	851808	851813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148239235
18041	NC_009481	CAG	2	6	851868	851873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148239235
18042	NC_009481	TTG	2	6	851973	851978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148239235
18043	NC_009481	TCC	2	6	851980	851985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148239235
18044	NC_009481	GA	3	6	851989	851994	50 %	0 %	50 %	0 %	148239235
18045	NC_009481	TGT	2	6	852002	852007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148239235
18046	NC_009481	TCA	2	6	852082	852087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148239235
18047	NC_009481	ACT	2	6	852118	852123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148239235
18048	NC_009481	CGG	3	9	852142	852150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148239235
18049	NC_009481	GA	3	6	852190	852195	50 %	0 %	50 %	0 %	148239235
18050	NC_009481	CAA	2	6	852230	852235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148239235
18051	NC_009481	TTTG	2	8	852251	852258	0 %	75 %	25 %	0 %	148239235
18052	NC_009481	CAT	2	6	852293	852298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148239235
18053	NC_009481	CAT	2	6	852464	852469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18054	NC_009481	TAA	2	6	852483	852488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18055	NC_009481	T	6	6	852491	852496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18056	NC_009481	GTT	2	6	852675	852680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18057	NC_009481	CTC	2	6	852694	852699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18058	NC_009481	CAG	2	6	852706	852711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18059	NC_009481	ATTTG	2	10	852756	852765	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
18060	NC_009481	TG	3	6	852771	852776	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18061	NC_009481	ACA	3	9	852802	852810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18062	NC_009481	GCA	2	6	852992	852997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148239236
18063	NC_009481	CAA	2	6	853053	853058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148239236
18064	NC_009481	CAA	2	6	853074	853079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148239236
18065	NC_009481	GCAA	2	8	853120	853127	50 %	0 %	25 %	25 %	148239236
18066	NC_009481	TGC	2	6	853174	853179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148239236
18067	NC_009481	TCG	2	6	853211	853216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148239236
18068	NC_009481	T	6	6	853225	853230	0 %	100 %	0 %	0 %	148239236
18069	NC_009481	TCGAC	2	10	853233	853242	20 %	20 %	20 %	40 %	148239236
18070	NC_009481	CCT	2	6	853312	853317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18071	NC_009481	CAG	2	6	853440	853445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18072	NC_009481	CCT	2	6	853453	853458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18073	NC_009481	ACTG	2	8	853497	853504	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18074	NC_009481	TGGC	2	8	853518	853525	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18075	NC_009481	CAA	2	6	853563	853568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148239237
18076	NC_009481	GCT	2	6	853580	853585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148239237
18077	NC_009481	CTG	2	6	853590	853595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148239237
18078	NC_009481	TGG	2	6	853606	853611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148239237
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18081	NC_009481	CT	3	6	853730	853735	0 %	50 %	0 %	50 %	148239237
18082	NC_009481	GAT	2	6	853969	853974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148239237
18083	NC_009481	GCG	2	6	853985	853990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148239237
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18085	NC_009481	CTG	2	6	854040	854045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148239237
18086	NC_009481	CGT	2	6	854117	854122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148239237
18087	NC_009481	GAT	2	6	854136	854141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148239237
18088	NC_009481	ACT	2	6	854145	854150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18089	NC_009481	CCG	2	6	854201	854206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18090	NC_009481	TAC	2	6	854239	854244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18091	NC_009481	AGA	2	6	854249	854254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18092	NC_009481	ATT	2	6	854361	854366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18093	NC_009481	GCCT	2	8	854481	854488	0 %	25 %	25 %	50 %	148239238
18094	NC_009481	ACT	2	6	854531	854536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148239238
18095	NC_009481	CCA	2	6	854543	854548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148239238
18096	NC_009481	TGA	2	6	854583	854588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148239238
18097	NC_009481	CTGA	2	8	854605	854612	25 %	25 %	25 %	25 %	148239238
18098	NC_009481	GAAA	2	8	854725	854732	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18099	NC_009481	AGC	2	6	854801	854806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18100	NC_009481	CAG	2	6	854808	854813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18101	NC_009481	CAAA	2	8	854874	854881	75 %	0 %	0 %	25 %	148239239
18102	NC_009481	CAAG	2	8	854919	854926	50 %	0 %	25 %	25 %	148239239
18103	NC_009481	TGT	2	6	855033	855038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148239239
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18105	NC_009481	TGC	2	6	855123	855128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148239239
18106	NC_009481	GCT	2	6	855152	855157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148239239
18107	NC_009481	CAA	2	6	855237	855242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148239239
18108	NC_009481	TCCA	2	8	855257	855264	25 %	25 %	0 %	50 %	148239239
18109	NC_009481	CAA	2	6	855360	855365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148239239
18110	NC_009481	CTT	2	6	855390	855395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148239239
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18112	NC_009481	ATT	2	6	855436	855441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148239239
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18117	NC_009481	T	7	7	855570	855576	0 %	100 %	0 %	0 %	148239239
18118	NC_009481	GCC	2	6	855585	855590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148239239
18119	NC_009481	CTT	2	6	855669	855674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148239239
18120	NC_009481	CTA	2	6	855735	855740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148239239
18121	NC_009481	TCA	2	6	855749	855754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148239239
18122	NC_009481	AG	3	6	855789	855794	50 %	0 %	50 %	0 %	148239239
18123	NC_009481	TC	3	6	855845	855850	0 %	50 %	0 %	50 %	148239239
18124	NC_009481	TCA	2	6	855873	855878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148239240
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18128	NC_009481	TCA	2	6	856091	856096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148239240
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18130	NC_009481	TTC	2	6	856193	856198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148239240
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18136	NC_009481	TC	3	6	856471	856476	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18137	NC_009481	CGA	2	6	856519	856524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18138	NC_009481	TCC	2	6	856562	856567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18139	NC_009481	AAG	2	6	856642	856647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18140	NC_009481	TCTA	2	8	856676	856683	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18141	NC_009481	ACC	2	6	856699	856704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18142	NC_009481	GCAG	2	8	856802	856809	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18143	NC_009481	TGG	2	6	856825	856830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18144	NC_009481	AGG	2	6	856844	856849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18145	NC_009481	CTG	2	6	856921	856926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18147	NC_009481	ACTTG	2	10	857173	857182	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18148	NC_009481	GGC	2	6	857209	857214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18149	NC_009481	ATC	2	6	857308	857313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18152	NC_009481	CAGGT	2	10	857413	857422	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18153	NC_009481	GCT	2	6	857437	857442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18154	NC_009481	GTT	2	6	857483	857488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18155	NC_009481	TTC	2	6	857500	857505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18157	NC_009481	CCG	2	6	857518	857523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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18162	NC_009481	TGG	2	6	857813	857818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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18230	NC_009481	TGG	2	6	861325	861330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148239247
18231	NC_009481	T	7	7	861333	861339	0 %	100 %	0 %	0 %	148239247
18232	NC_009481	TCC	2	6	861346	861351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148239247
18233	NC_009481	TGC	2	6	861359	861364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148239247
18234	NC_009481	T	6	6	861535	861540	0 %	100 %	0 %	0 %	148239247
18235	NC_009481	CCTG	2	8	861560	861567	0 %	25 %	25 %	50 %	148239247
18236	NC_009481	TC	3	6	861593	861598	0 %	50 %	0 %	50 %	148239247
18237	NC_009481	CATT	2	8	861644	861651	25 %	50 %	0 %	25 %	148239247
18238	NC_009481	TCA	2	6	861764	861769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148239247
18239	NC_009481	GAT	2	6	861772	861777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148239247
18240	NC_009481	AAGC	2	8	861804	861811	50 %	0 %	25 %	25 %	148239247
18241	NC_009481	TGGG	2	8	861847	861854	0 %	25 %	75 %	0 %	148239247
18242	NC_009481	CAT	3	9	861889	861897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148239247
18243	NC_009481	CTT	2	6	862022	862027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148239248
18244	NC_009481	CA	3	6	862055	862060	50 %	0 %	0 %	50 %	148239248
18245	NC_009481	GCA	2	6	862072	862077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148239248
18246	NC_009481	GCA	2	6	862163	862168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148239248
18247	NC_009481	CTG	2	6	862213	862218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148239248
18248	NC_009481	TCC	2	6	862249	862254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148239248
18249	NC_009481	GGAG	2	8	862265	862272	25 %	0 %	75 %	0 %	148239248
18250	NC_009481	CCG	2	6	862310	862315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148239249
18251	NC_009481	TCCA	2	8	862334	862341	25 %	25 %	0 %	50 %	148239249
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18255	NC_009481	GCG	2	6	862404	862409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148239249
18256	NC_009481	ATCGCC	2	12	862437	862448	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148239249
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18263	NC_009481	A	6	6	862664	862669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18264	NC_009481	GCA	2	6	862778	862783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18265	NC_009481	GCT	2	6	862790	862795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18266	NC_009481	ACGA	2	8	862807	862814	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18267	NC_009481	TGT	2	6	862815	862820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18268	NC_009481	CTC	2	6	862864	862869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18269	NC_009481	GCTC	2	8	862932	862939	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18270	NC_009481	GT	3	6	863000	863005	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18271	NC_009481	CAG	2	6	863047	863052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18275	NC_009481	GCT	2	6	863205	863210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148239250
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18299	NC_009481	TGCG	2	8	864665	864672	0 %	25 %	50 %	25 %	148239252
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18304	NC_009481	ACGA	2	8	864938	864945	50 %	0 %	25 %	25 %	148239252
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18319	NC_009481	ATCACC	2	12	865493	865504	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	148239252
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18332	NC_009481	CGG	2	6	865897	865902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148239252
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18339	NC_009481	CCT	2	6	866369	866374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148239254
18340	NC_009481	CAT	2	6	866378	866383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148239254
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18342	NC_009481	GGGCTG	2	12	866481	866492	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	148239254
18343	NC_009481	GCT	2	6	866495	866500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148239254
18344	NC_009481	CAT	2	6	866504	866509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148239254
18345	NC_009481	GCA	2	6	866576	866581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18346	NC_009481	AGC	2	6	866685	866690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18347	NC_009481	GGC	2	6	866713	866718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148239255
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18349	NC_009481	GCAG	2	8	866754	866761	25 %	0 %	50 %	25 %	148239255
18350	NC_009481	CCT	2	6	866796	866801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148239255
18351	NC_009481	G	6	6	866848	866853	0 %	0 %	100 %	0 %	148239255
18352	NC_009481	TGAT	2	8	866859	866866	25 %	50 %	25 %	0 %	148239255
18353	NC_009481	CGA	2	6	866896	866901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148239255
18354	NC_009481	GCC	2	6	866907	866912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148239255
18355	NC_009481	GCCCTG	2	12	866954	866965	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148239255
18356	NC_009481	GCG	2	6	866966	866971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148239255
18357	NC_009481	TGC	2	6	866982	866987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148239255
18358	NC_009481	GCC	2	6	866989	866994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148239255
18359	NC_009481	GCT	2	6	867037	867042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148239255
18360	NC_009481	GTGG	2	8	867086	867093	0 %	25 %	75 %	0 %	148239255
18361	NC_009481	TGC	2	6	867120	867125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148239255
18362	NC_009481	TGC	2	6	867240	867245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148239255
18363	NC_009481	CTC	2	6	867251	867256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148239255
18364	NC_009481	GGT	2	6	867257	867262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148239255
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18487	NC_009481	GTC	2	6	872610	872615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148239265
18488	NC_009481	CTG	2	6	872667	872672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148239265
18489	NC_009481	CTT	2	6	872685	872690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148239265
18490	NC_009481	GTTGGC	2	12	872709	872720	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148239265
18491	NC_009481	GCC	2	6	872854	872859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148239265
18492	NC_009481	TCG	2	6	872884	872889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148239265
18493	NC_009481	GCGG	2	8	872937	872944	0 %	0 %	75 %	25 %	148239265
18494	NC_009481	AGC	2	6	873025	873030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148239265
18495	NC_009481	CGG	2	6	873062	873067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148239265
18496	NC_009481	A	6	6	873172	873177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18497	NC_009481	GTG	2	6	873186	873191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18498	NC_009481	CAG	2	6	873247	873252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148239266
18499	NC_009481	CGCA	2	8	873274	873281	25 %	0 %	25 %	50 %	148239266
18500	NC_009481	CAGCTG	2	12	873364	873375	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148239266

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