MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. WH 7803 chromosome

Total Repeats: 50037

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_009481	CCA	2	6	701463	701468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148239042
15002	NC_009481	AAG	2	6	701582	701587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15003	NC_009481	GC	3	6	701600	701605	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15004	NC_009481	CGT	2	6	701645	701650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148239043
15005	NC_009481	TGT	2	6	701692	701697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148239043
15006	NC_009481	TGG	2	6	701726	701731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148239043
15007	NC_009481	CAG	2	6	701816	701821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148239043
15008	NC_009481	GATGG	2	10	701856	701865	20 %	20 %	60 %	0 %	148239043
15009	NC_009481	GTT	2	6	701905	701910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148239043
15010	NC_009481	TGC	2	6	701937	701942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148239043
15011	NC_009481	G	6	6	701977	701982	0 %	0 %	100 %	0 %	148239043
15012	NC_009481	GTT	2	6	702169	702174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15013	NC_009481	ACG	2	6	702187	702192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15014	NC_009481	TCCGT	2	10	702202	702211	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
15015	NC_009481	GTTG	2	8	702275	702282	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15016	NC_009481	GAC	2	6	702367	702372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148239044
15017	NC_009481	TGC	2	6	702389	702394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148239044
15018	NC_009481	GCC	2	6	702427	702432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148239044
15019	NC_009481	GTG	2	6	702482	702487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148239044
15020	NC_009481	TGA	2	6	702494	702499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148239044
15021	NC_009481	CT	3	6	702551	702556	0 %	50 %	0 %	50 %	148239045
15022	NC_009481	GCA	2	6	702602	702607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148239045
15023	NC_009481	CGGC	2	8	702612	702619	0 %	0 %	50 %	50 %	148239045
15024	NC_009481	GTGATC	2	12	702630	702641	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148239045
15025	NC_009481	TGG	2	6	702656	702661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148239045
15026	NC_009481	CGAT	2	8	702690	702697	25 %	25 %	25 %	25 %	148239045
15027	NC_009481	GCTC	2	8	702710	702717	0 %	25 %	25 %	50 %	148239045
15028	NC_009481	CTC	2	6	702763	702768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148239045
15029	NC_009481	GTG	2	6	702783	702788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148239045
15030	NC_009481	TTC	2	6	702804	702809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148239045
15031	NC_009481	CT	3	6	702818	702823	0 %	50 %	0 %	50 %	148239045
15032	NC_009481	GCG	3	9	702846	702854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148239045
15033	NC_009481	CT	3	6	702868	702873	0 %	50 %	0 %	50 %	148239046
15034	NC_009481	TGG	2	6	702875	702880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148239046
15035	NC_009481	TGC	2	6	702912	702917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148239046
15036	NC_009481	GCC	3	9	703074	703082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148239046
15037	NC_009481	AAG	2	6	703190	703195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148239046
15038	NC_009481	GTT	2	6	703221	703226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148239046
15039	NC_009481	ACC	2	6	703227	703232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148239046
15040	NC_009481	CAG	2	6	703268	703273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148239046
15041	NC_009481	CAC	2	6	703362	703367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148239046
15042	NC_009481	CCG	2	6	703449	703454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148239046
15043	NC_009481	GATG	2	8	703531	703538	25 %	25 %	50 %	0 %	148239047
15044	NC_009481	CGT	2	6	703564	703569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148239047
15045	NC_009481	CAC	2	6	703580	703585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148239047
15046	NC_009481	CGG	2	6	703592	703597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148239047
15047	NC_009481	ATT	2	6	703621	703626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148239047
15048	NC_009481	CTCTG	2	10	703662	703671	0 %	40 %	20 %	40 %	148239047
15049	NC_009481	TGC	2	6	703673	703678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148239047
15050	NC_009481	T	6	6	703722	703727	0 %	100 %	0 %	0 %	148239047
15051	NC_009481	TGA	2	6	703825	703830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148239047
15052	NC_009481	GTG	2	6	703933	703938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148239047
15053	NC_009481	GAC	2	6	703950	703955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148239047
15054	NC_009481	CTG	2	6	703992	703997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148239047
15055	NC_009481	TGG	2	6	704056	704061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148239048
15056	NC_009481	GCCATC	2	12	704141	704152	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148239048
15057	NC_009481	TCG	2	6	704172	704177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148239048
15058	NC_009481	CAC	2	6	704207	704212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148239048
15059	NC_009481	GT	3	6	704237	704242	0 %	50 %	50 %	0 %	148239048
15060	NC_009481	CAC	2	6	704255	704260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148239048
15061	NC_009481	TTG	2	6	704337	704342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148239048
15062	NC_009481	TGT	2	6	704386	704391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148239048
15063	NC_009481	CCA	2	6	704420	704425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148239048
15064	NC_009481	GGT	2	6	704496	704501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148239048
15065	NC_009481	AGT	3	9	704584	704592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148239048
15066	NC_009481	TCA	2	6	704671	704676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148239048
15067	NC_009481	CTG	2	6	704730	704735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148239048
15068	NC_009481	GCA	2	6	704740	704745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148239048
15069	NC_009481	GCT	2	6	704751	704756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148239048
15070	NC_009481	CGC	2	6	704771	704776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148239048
15071	NC_009481	CAA	2	6	704782	704787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148239048
15072	NC_009481	AAC	2	6	704799	704804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148239048
15073	NC_009481	ATCG	2	8	704886	704893	25 %	25 %	25 %	25 %	148239048
15074	NC_009481	TCG	2	6	705213	705218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148239048
15075	NC_009481	C	6	6	705250	705255	0 %	0 %	0 %	100 %	148239048
15076	NC_009481	GGT	2	6	705284	705289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148239048
15077	NC_009481	CGTT	2	8	705327	705334	0 %	50 %	25 %	25 %	148239048
15078	NC_009481	CCG	2	6	705405	705410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148239048
15079	NC_009481	CGATGA	2	12	705484	705495	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148239048
15080	NC_009481	TCG	2	6	705510	705515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148239048
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15082	NC_009481	TCC	2	6	705770	705775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148239049
15083	NC_009481	TGA	2	6	705958	705963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148239049
15084	NC_009481	GGA	2	6	705996	706001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148239049
15085	NC_009481	A	6	6	706043	706048	100 %	0 %	0 %	0 %	148239049
15086	NC_009481	GAT	2	6	706058	706063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148239049
15087	NC_009481	CCT	2	6	706177	706182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148239050
15088	NC_009481	CTC	2	6	706202	706207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148239050
15089	NC_009481	GTT	2	6	706247	706252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148239050
15090	NC_009481	CGG	2	6	706289	706294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148239050
15091	NC_009481	AGA	2	6	706410	706415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148239050
15092	NC_009481	AGT	2	6	706491	706496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148239050
15093	NC_009481	GTA	2	6	706574	706579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148239050
15094	NC_009481	CGG	2	6	706615	706620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148239050
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15097	NC_009481	ATCG	2	8	706700	706707	25 %	25 %	25 %	25 %	148239050
15098	NC_009481	TCCC	2	8	706801	706808	0 %	25 %	0 %	75 %	148239050
15099	NC_009481	TGG	2	6	706864	706869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148239050
15100	NC_009481	GC	3	6	707000	707005	0 %	0 %	50 %	50 %	148239050
15101	NC_009481	GCA	2	6	707044	707049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148239050
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15104	NC_009481	ATG	2	6	707166	707171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148239050
15105	NC_009481	A	6	6	707252	707257	100 %	0 %	0 %	0 %	148239050
15106	NC_009481	TGA	2	6	707281	707286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148239050
15107	NC_009481	GAC	2	6	707319	707324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148239050
15108	NC_009481	AG	3	6	707330	707335	50 %	0 %	50 %	0 %	148239050
15109	NC_009481	AGC	2	6	707346	707351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148239050
15110	NC_009481	CGG	2	6	707402	707407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148239050
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15119	NC_009481	CCCA	2	8	707702	707709	25 %	0 %	0 %	75 %	148239050
15120	NC_009481	TGG	2	6	707848	707853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148239050
15121	NC_009481	CGT	2	6	707871	707876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148239051
15122	NC_009481	GGT	3	9	707912	707920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148239051
15123	NC_009481	GTT	2	6	708009	708014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148239051
15124	NC_009481	GCC	2	6	708023	708028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148239051
15125	NC_009481	TCT	2	6	708047	708052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148239051
15126	NC_009481	GA	3	6	708081	708086	50 %	0 %	50 %	0 %	148239051
15127	NC_009481	ATG	2	6	708173	708178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148239051
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15129	NC_009481	TTA	2	6	708512	708517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148239051
15130	NC_009481	TCG	2	6	708542	708547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148239051
15131	NC_009481	CGG	2	6	708588	708593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148239051
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15133	NC_009481	GCG	2	6	708659	708664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148239051
15134	NC_009481	CCT	2	6	708809	708814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148239052
15135	NC_009481	GCG	2	6	708829	708834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148239052
15136	NC_009481	GGC	2	6	708956	708961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148239052
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15140	NC_009481	TGG	2	6	709418	709423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148239052
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15144	NC_009481	CCAG	2	8	709632	709639	25 %	0 %	25 %	50 %	148239053
15145	NC_009481	GAT	2	6	709724	709729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148239053
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15148	NC_009481	ACA	2	6	709824	709829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148239053
15149	NC_009481	AAC	2	6	709859	709864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148239053
15150	NC_009481	ATGA	2	8	709871	709878	50 %	25 %	25 %	0 %	148239053
15151	NC_009481	GTG	2	6	709909	709914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148239053
15152	NC_009481	GTT	2	6	710060	710065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148239054
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15154	NC_009481	CCTG	2	8	710103	710110	0 %	25 %	25 %	50 %	148239054
15155	NC_009481	GCAG	2	8	710133	710140	25 %	0 %	50 %	25 %	148239054
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15170	NC_009481	GCT	2	6	710891	710896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148239054
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15172	NC_009481	AGCTCA	2	12	710977	710988	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148239054
15173	NC_009481	AACA	2	8	711086	711093	75 %	0 %	0 %	25 %	148239054
15174	NC_009481	CCA	2	6	711102	711107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148239054
15175	NC_009481	CCA	2	6	711124	711129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148239054
15176	NC_009481	CTC	2	6	711210	711215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15177	NC_009481	ACG	2	6	711276	711281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148239055
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15179	NC_009481	G	7	7	711329	711335	0 %	0 %	100 %	0 %	148239055
15180	NC_009481	GCT	2	6	711341	711346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148239055
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15183	NC_009481	ATC	2	6	711425	711430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148239055
15184	NC_009481	GGA	2	6	711452	711457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148239055
15185	NC_009481	GGT	2	6	711496	711501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148239055
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15193	NC_009481	TGG	2	6	712014	712019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148239055
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15198	NC_009481	TGG	2	6	712162	712167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148239055
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15201	NC_009481	GC	4	8	712246	712253	0 %	0 %	50 %	50 %	148239055
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15204	NC_009481	CAT	2	6	712348	712353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148239055
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15209	NC_009481	GAGCAG	2	12	712568	712579	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	148239055
15210	NC_009481	CTG	2	6	712607	712612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148239055
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15217	NC_009481	GAC	2	6	712985	712990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148239056
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15219	NC_009481	CAC	2	6	713095	713100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148239056
15220	NC_009481	GC	4	8	713111	713118	0 %	0 %	50 %	50 %	148239056
15221	NC_009481	CGG	2	6	713148	713153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148239056
15222	NC_009481	TGA	2	6	713172	713177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148239056
15223	NC_009481	CCA	3	9	713271	713279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148239056
15224	NC_009481	GATGTG	2	12	713384	713395	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	148239056
15225	NC_009481	ATCC	2	8	713451	713458	25 %	25 %	0 %	50 %	148239056
15226	NC_009481	CAC	2	6	713482	713487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148239056
15227	NC_009481	CTGG	2	8	713522	713529	0 %	25 %	50 %	25 %	148239056
15228	NC_009481	CGC	2	6	713556	713561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148239056
15229	NC_009481	GGT	2	6	713597	713602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148239056
15230	NC_009481	TGCC	2	8	713621	713628	0 %	25 %	25 %	50 %	148239056
15231	NC_009481	GGC	2	6	713668	713673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148239056
15232	NC_009481	CCTGT	2	10	713683	713692	0 %	40 %	20 %	40 %	148239056
15233	NC_009481	TTCT	2	8	713693	713700	0 %	75 %	0 %	25 %	148239056
15234	NC_009481	TGCA	2	8	713775	713782	25 %	25 %	25 %	25 %	148239056
15235	NC_009481	AGG	2	6	713811	713816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148239056
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15237	NC_009481	CGC	2	6	714095	714100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148239057
15238	NC_009481	CAC	2	6	714202	714207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148239057
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15361	NC_009481	CTG	2	6	720323	720328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148239065
15362	NC_009481	CGT	2	6	720357	720362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148239065
15363	NC_009481	CGT	2	6	720364	720369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148239065
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15479	NC_009481	GATC	2	8	727020	727027	25 %	25 %	25 %	25 %	148239075
15480	NC_009481	AAC	2	6	727056	727061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148239075
15481	NC_009481	CT	3	6	727066	727071	0 %	50 %	0 %	50 %	148239075
15482	NC_009481	AGG	3	9	727269	727277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148239076
15483	NC_009481	GCTG	2	8	727307	727314	0 %	25 %	50 %	25 %	148239076
15484	NC_009481	CCA	2	6	727404	727409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148239076
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15489	NC_009481	GTGAT	2	10	727631	727640	20 %	40 %	40 %	0 %	148239077
15490	NC_009481	GTC	2	6	727678	727683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148239077
15491	NC_009481	AGCC	2	8	727689	727696	25 %	0 %	25 %	50 %	148239077
15492	NC_009481	GAAC	2	8	727728	727735	50 %	0 %	25 %	25 %	148239077
15493	NC_009481	AAGT	2	8	727736	727743	50 %	25 %	25 %	0 %	148239077
15494	NC_009481	GCGGG	2	10	727817	727826	0 %	0 %	80 %	20 %	148239077
15495	NC_009481	CGA	2	6	727827	727832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148239077
15496	NC_009481	CTC	2	6	727841	727846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148239077
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15498	NC_009481	TCCTG	2	10	727970	727979	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
15499	NC_009481	GA	3	6	727987	727992	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15500	NC_009481	GC	3	6	728079	728084	0 %	0 %	50 %	50 %	148239078

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