MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. WH 7803 chromosome

Total Repeats: 50037

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_009481	ATC	2	6	652820	652825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238987
14002	NC_009481	TGC	2	6	652840	652845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238988
14003	NC_009481	TGA	2	6	652985	652990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238988
14004	NC_009481	ATC	2	6	653053	653058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238988
14005	NC_009481	CCA	2	6	653135	653140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238988
14006	NC_009481	T	6	6	653184	653189	0 %	100 %	0 %	0 %	148238988
14007	NC_009481	CCT	2	6	653338	653343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238988
14008	NC_009481	TCACCT	2	12	653357	653368	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	148238988
14009	NC_009481	CTT	2	6	653381	653386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148238988
14010	NC_009481	GCT	2	6	653393	653398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238988
14011	NC_009481	CACT	2	8	653545	653552	25 %	25 %	0 %	50 %	148238988
14012	NC_009481	GCC	2	6	653577	653582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238988
14013	NC_009481	CGT	2	6	653643	653648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238988
14014	NC_009481	TCG	2	6	653665	653670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238988
14015	NC_009481	AGC	2	6	653673	653678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238988
14016	NC_009481	TCA	2	6	653692	653697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238988
14017	NC_009481	CGCTG	2	10	653714	653723	0 %	20 %	40 %	40 %	148238988
14018	NC_009481	CTG	2	6	653739	653744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238988
14019	NC_009481	GCC	2	6	653802	653807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238988
14020	NC_009481	ATC	2	6	653811	653816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238988
14021	NC_009481	TCA	2	6	653818	653823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238988
14022	NC_009481	GCTG	2	8	653872	653879	0 %	25 %	50 %	25 %	148238988
14023	NC_009481	GGA	2	6	653881	653886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238988
14024	NC_009481	GCT	2	6	653941	653946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238988
14025	NC_009481	GCC	3	9	653956	653964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238988
14026	NC_009481	CTT	2	6	653969	653974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148238988
14027	NC_009481	CTC	2	6	654000	654005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238988
14028	NC_009481	TTC	2	6	654037	654042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14029	NC_009481	CGT	2	6	654120	654125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14030	NC_009481	CGA	2	6	654192	654197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238989
14031	NC_009481	GGC	2	6	654221	654226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238989
14032	NC_009481	AGC	2	6	654280	654285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238989
14033	NC_009481	GGA	2	6	654537	654542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238989
14034	NC_009481	TGC	2	6	654553	654558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238989
14035	NC_009481	TGC	2	6	654604	654609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238989
14036	NC_009481	GTG	2	6	654625	654630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238989
14037	NC_009481	TGCA	2	8	654679	654686	25 %	25 %	25 %	25 %	148238989
14038	NC_009481	TCG	2	6	654730	654735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238989
14039	NC_009481	GACTC	2	10	654757	654766	20 %	20 %	20 %	40 %	148238989
14040	NC_009481	CAG	3	9	654836	654844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238989
14041	NC_009481	CG	3	6	654862	654867	0 %	0 %	50 %	50 %	148238989
14042	NC_009481	CGA	2	6	654872	654877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238989
14043	NC_009481	CT	3	6	654878	654883	0 %	50 %	0 %	50 %	148238989
14044	NC_009481	ACC	2	6	654900	654905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238989
14045	NC_009481	CAG	2	6	654932	654937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238989
14046	NC_009481	GTCG	2	8	655029	655036	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14047	NC_009481	GGT	2	6	655404	655409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238990
14048	NC_009481	TTG	2	6	655432	655437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238990
14049	NC_009481	GTG	2	6	655516	655521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238990
14050	NC_009481	GAG	2	6	655588	655593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238990
14051	NC_009481	CAA	2	6	655605	655610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148238990
14052	NC_009481	CGC	2	6	655659	655664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238990
14053	NC_009481	GAAG	2	8	655680	655687	50 %	0 %	50 %	0 %	148238990
14054	NC_009481	GCT	2	6	655768	655773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238990
14055	NC_009481	CT	3	6	655778	655783	0 %	50 %	0 %	50 %	148238990
14056	NC_009481	GAT	2	6	655862	655867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14057	NC_009481	CCA	2	6	655876	655881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14058	NC_009481	CA	3	6	655908	655913	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14059	NC_009481	GCC	2	6	655966	655971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238991
14060	NC_009481	TG	3	6	656025	656030	0 %	50 %	50 %	0 %	148238991
14061	NC_009481	CTC	2	6	656042	656047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238991
14062	NC_009481	TGG	2	6	656051	656056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238991
14063	NC_009481	CGC	2	6	656155	656160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238991
14064	NC_009481	GGC	2	6	656218	656223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238991
14065	NC_009481	CTG	2	6	656254	656259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238991
14066	NC_009481	CCTGG	2	10	656286	656295	0 %	20 %	40 %	40 %	148238991
14067	NC_009481	CAC	2	6	656304	656309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238991
14068	NC_009481	CA	3	6	656320	656325	50 %	0 %	0 %	50 %	148238991
14069	NC_009481	AAC	2	6	656353	656358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148238991
14070	NC_009481	AAG	2	6	656383	656388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148238991
14071	NC_009481	TGG	2	6	656576	656581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238991
14072	NC_009481	TGA	2	6	656645	656650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238991
14073	NC_009481	G	6	6	656716	656721	0 %	0 %	100 %	0 %	148238991
14074	NC_009481	TTG	2	6	656723	656728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238991
14075	NC_009481	TTC	2	6	656731	656736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148238991
14076	NC_009481	GAT	2	6	656754	656759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238991
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14078	NC_009481	CAA	2	6	656865	656870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148238991
14079	NC_009481	CAC	2	6	656925	656930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238991
14080	NC_009481	CT	3	6	656976	656981	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14081	NC_009481	GCT	2	6	657005	657010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238992
14082	NC_009481	AGC	2	6	657040	657045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238992
14083	NC_009481	GC	3	6	657069	657074	0 %	0 %	50 %	50 %	148238992
14084	NC_009481	TCA	2	6	657104	657109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238992
14085	NC_009481	CG	3	6	657125	657130	0 %	0 %	50 %	50 %	148238992
14086	NC_009481	GAG	2	6	657138	657143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238992
14087	NC_009481	CG	3	6	657182	657187	0 %	0 %	50 %	50 %	148238992
14088	NC_009481	CGA	2	6	657233	657238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238992
14089	NC_009481	CGTGC	2	10	657315	657324	0 %	20 %	40 %	40 %	148238992
14090	NC_009481	GGGAC	2	10	657344	657353	20 %	0 %	60 %	20 %	148238992
14091	NC_009481	GAAA	2	8	657356	657363	75 %	0 %	25 %	0 %	148238992
14092	NC_009481	CGG	2	6	657395	657400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238992
14093	NC_009481	CAT	2	6	657566	657571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238992
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14097	NC_009481	ACCGG	2	10	657744	657753	20 %	0 %	40 %	40 %	148238992
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14099	NC_009481	TGG	2	6	657800	657805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238992
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14101	NC_009481	TCT	2	6	657872	657877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148238992
14102	NC_009481	GA	3	6	657899	657904	50 %	0 %	50 %	0 %	148238992
14103	NC_009481	TGA	2	6	657944	657949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238992
14104	NC_009481	TGC	2	6	658049	658054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238993
14105	NC_009481	GGC	2	6	658109	658114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238993
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14107	NC_009481	CAA	2	6	658253	658258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148238993
14108	NC_009481	CTTG	2	8	658283	658290	0 %	50 %	25 %	25 %	148238993
14109	NC_009481	GAT	2	6	658316	658321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238993
14110	NC_009481	GCT	2	6	658356	658361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238993
14111	NC_009481	TGG	2	6	658385	658390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238993
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14115	NC_009481	G	6	6	658441	658446	0 %	0 %	100 %	0 %	148238993
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14118	NC_009481	GCCA	2	8	658767	658774	25 %	0 %	25 %	50 %	148238994
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14120	NC_009481	TGC	2	6	658939	658944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238994
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14129	NC_009481	CAT	3	9	659318	659326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238994
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14152	NC_009481	GTC	2	6	660499	660504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238996
14153	NC_009481	GAG	2	6	660594	660599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238996
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14155	NC_009481	GCG	2	6	660720	660725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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14174	NC_009481	GCT	2	6	661368	661373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238997
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14177	NC_009481	CCAAAC	2	12	661473	661484	50 %	0 %	0 %	50 %	148238997
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14239	NC_009481	ACG	2	6	664408	664413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148239000
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14241	NC_009481	CGA	2	6	664470	664475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148239000
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14245	NC_009481	TGC	2	6	664609	664614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14247	NC_009481	ACA	2	6	664628	664633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14248	NC_009481	CTG	2	6	664655	664660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14357	NC_009481	GCCT	2	8	670125	670132	0 %	25 %	25 %	50 %	148239008
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14362	NC_009481	TGC	2	6	670279	670284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148239008
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14372	NC_009481	TCCA	2	8	670564	670571	25 %	25 %	0 %	50 %	148239008
14373	NC_009481	CTG	2	6	670576	670581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148239008
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14393	NC_009481	TGAAG	2	10	671530	671539	40 %	20 %	40 %	0 %	148239009
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14476	NC_009481	CGG	2	6	675672	675677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148239014
14477	NC_009481	GCCC	2	8	675696	675703	0 %	0 %	25 %	75 %	148239014
14478	NC_009481	CGA	2	6	675720	675725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148239014
14479	NC_009481	GGT	3	9	675742	675750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148239014
14480	NC_009481	TGC	2	6	675783	675788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148239014
14481	NC_009481	GCCG	2	8	675832	675839	0 %	0 %	50 %	50 %	148239014
14482	NC_009481	AG	3	6	675852	675857	50 %	0 %	50 %	0 %	148239014
14483	NC_009481	AGTTCG	2	12	675932	675943	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148239014
14484	NC_009481	CCG	2	6	676101	676106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148239015
14485	NC_009481	CAT	2	6	676142	676147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148239015
14486	NC_009481	TCG	2	6	676168	676173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148239015
14487	NC_009481	CTT	2	6	676229	676234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148239015
14488	NC_009481	GTT	2	6	676254	676259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148239015
14489	NC_009481	GTGA	2	8	676260	676267	25 %	25 %	50 %	0 %	148239015
14490	NC_009481	ACC	2	6	676297	676302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148239015
14491	NC_009481	TCG	2	6	676312	676317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148239015
14492	NC_009481	ACG	2	6	676321	676326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148239015
14493	NC_009481	T	6	6	676424	676429	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14494	NC_009481	CTTCA	2	10	676447	676456	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
14495	NC_009481	CGA	2	6	676457	676462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14496	NC_009481	ACC	2	6	676529	676534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148239016
14497	NC_009481	AAG	2	6	676541	676546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148239016
14498	NC_009481	GCT	2	6	676619	676624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148239016
14499	NC_009481	GCC	2	6	676625	676630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148239016
14500	NC_009481	GCT	2	6	676649	676654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148239016

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