MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. WH 7803 chromosome

Total Repeats: 50037

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_009481	AGC	2	6	604090	604095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238936
13002	NC_009481	C	6	6	604104	604109	0 %	0 %	0 %	100 %	148238936
13003	NC_009481	CGG	2	6	604190	604195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238936
13004	NC_009481	CCAG	2	8	604244	604251	25 %	0 %	25 %	50 %	148238936
13005	NC_009481	CTG	2	6	604262	604267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238936
13006	NC_009481	CGA	2	6	604343	604348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238936
13007	NC_009481	AACG	2	8	604446	604453	50 %	0 %	25 %	25 %	148238936
13008	NC_009481	CG	3	6	604452	604457	0 %	0 %	50 %	50 %	148238936
13009	NC_009481	CAG	2	6	604467	604472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238936
13010	NC_009481	CAC	2	6	604593	604598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238937
13011	NC_009481	TGC	2	6	604661	604666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238937
13012	NC_009481	CAC	2	6	604704	604709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238937
13013	NC_009481	CCA	2	6	604724	604729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238937
13014	NC_009481	GCC	2	6	604740	604745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238937
13015	NC_009481	TCG	2	6	604771	604776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238937
13016	NC_009481	AGG	2	6	604893	604898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13017	NC_009481	CTG	2	6	604907	604912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238938
13018	NC_009481	ACG	2	6	604922	604927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238938
13019	NC_009481	TGG	2	6	604934	604939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238938
13020	NC_009481	CAGGCT	2	12	604992	605003	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148238938
13021	NC_009481	GCT	3	9	605001	605009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238938
13022	NC_009481	TGC	2	6	605046	605051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238938
13023	NC_009481	AAC	2	6	605056	605061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148238938
13024	NC_009481	C	6	6	605102	605107	0 %	0 %	0 %	100 %	148238938
13025	NC_009481	CGT	2	6	605156	605161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238938
13026	NC_009481	GCGGCA	2	12	605283	605294	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148238938
13027	NC_009481	TGGAG	2	10	605330	605339	20 %	20 %	60 %	0 %	148238938
13028	NC_009481	GA	3	6	605351	605356	50 %	0 %	50 %	0 %	148238938
13029	NC_009481	TGA	2	6	605375	605380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238938
13030	NC_009481	CGC	2	6	605409	605414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238938
13031	NC_009481	TGC	2	6	605465	605470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238938
13032	NC_009481	GATT	2	8	605574	605581	25 %	50 %	25 %	0 %	148238938
13033	NC_009481	GTCAG	2	10	605603	605612	20 %	20 %	40 %	20 %	148238938
13034	NC_009481	GGT	2	6	605641	605646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238938
13035	NC_009481	GCT	2	6	605655	605660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238938
13036	NC_009481	TGGT	2	8	605719	605726	0 %	50 %	50 %	0 %	148238938
13037	NC_009481	CAG	2	6	605874	605879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238938
13038	NC_009481	TGC	2	6	605948	605953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238938
13039	NC_009481	TTCC	2	8	606043	606050	0 %	50 %	0 %	50 %	148238938
13040	NC_009481	TGGC	2	8	606083	606090	0 %	25 %	50 %	25 %	148238938
13041	NC_009481	ATC	2	6	606103	606108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238938
13042	NC_009481	CGG	2	6	606123	606128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238938
13043	NC_009481	GTG	2	6	606151	606156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238938
13044	NC_009481	CTG	2	6	606184	606189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238938
13045	NC_009481	GTT	2	6	606245	606250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238938
13046	NC_009481	CGG	2	6	606269	606274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238938
13047	NC_009481	CCT	2	6	606305	606310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238938
13048	NC_009481	GCTG	2	8	606385	606392	0 %	25 %	50 %	25 %	148238938
13049	NC_009481	CGG	2	6	606404	606409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238939
13050	NC_009481	GCT	2	6	606414	606419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238939
13051	NC_009481	CAC	2	6	606421	606426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238939
13052	NC_009481	CAGGGC	2	12	606436	606447	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148238939
13053	NC_009481	AGA	2	6	606473	606478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148238939
13054	NC_009481	AGC	2	6	606533	606538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238939
13055	NC_009481	CGG	2	6	606591	606596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238939
13056	NC_009481	TCA	2	6	606624	606629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238939
13057	NC_009481	GC	3	6	606742	606747	0 %	0 %	50 %	50 %	148238939
13058	NC_009481	CAG	2	6	606772	606777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238939
13059	NC_009481	ACGATG	2	12	606788	606799	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148238939
13060	NC_009481	GCA	2	6	606864	606869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238939
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13062	NC_009481	ACA	2	6	606975	606980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148238939
13063	NC_009481	CAG	2	6	607009	607014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238939
13064	NC_009481	CGG	2	6	607019	607024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238939
13065	NC_009481	GAC	2	6	607139	607144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238940
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13068	NC_009481	CAGG	2	8	607390	607397	25 %	0 %	50 %	25 %	148238940
13069	NC_009481	CAG	2	6	607426	607431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238940
13070	NC_009481	GCA	2	6	607563	607568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238941
13071	NC_009481	CGA	2	6	607603	607608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238941
13072	NC_009481	AACTC	2	10	607638	607647	40 %	20 %	0 %	40 %	148238941
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13078	NC_009481	CGA	2	6	607882	607887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238941
13079	NC_009481	GAC	2	6	607910	607915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238941
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13083	NC_009481	ATC	2	6	608063	608068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238941
13084	NC_009481	TTG	2	6	608112	608117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238941
13085	NC_009481	CCT	2	6	608152	608157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13086	NC_009481	T	8	8	608193	608200	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13087	NC_009481	TGT	2	6	608252	608257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238942
13088	NC_009481	CAAGC	2	10	608332	608341	40 %	0 %	20 %	40 %	148238942
13089	NC_009481	AGCC	2	8	608351	608358	25 %	0 %	25 %	50 %	148238942
13090	NC_009481	GGC	2	6	608361	608366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238942
13091	NC_009481	GAT	2	6	608397	608402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238942
13092	NC_009481	CGAAGC	2	12	608465	608476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238942
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13095	NC_009481	GCA	2	6	608556	608561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238942
13096	NC_009481	TTCC	2	8	608657	608664	0 %	50 %	0 %	50 %	148238942
13097	NC_009481	GACG	2	8	608697	608704	25 %	0 %	50 %	25 %	148238942
13098	NC_009481	TGA	2	6	608719	608724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238942
13099	NC_009481	GT	3	6	608759	608764	0 %	50 %	50 %	0 %	148238942
13100	NC_009481	AAGC	2	8	608808	608815	50 %	0 %	25 %	25 %	148238942
13101	NC_009481	GGT	2	6	608822	608827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238942
13102	NC_009481	TC	3	6	608830	608835	0 %	50 %	0 %	50 %	148238942
13103	NC_009481	ATG	2	6	608879	608884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238942
13104	NC_009481	ATC	2	6	608889	608894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238942
13105	NC_009481	CCA	2	6	608903	608908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238942
13106	NC_009481	GCTT	2	8	608972	608979	0 %	50 %	25 %	25 %	148238942
13107	NC_009481	G	6	6	609006	609011	0 %	0 %	100 %	0 %	148238942
13108	NC_009481	CAT	2	6	609075	609080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238942
13109	NC_009481	AGCA	2	8	609102	609109	50 %	0 %	25 %	25 %	148238942
13110	NC_009481	CGTC	2	8	609164	609171	0 %	25 %	25 %	50 %	148238942
13111	NC_009481	GCT	2	6	609179	609184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238942
13112	NC_009481	TTC	2	6	609267	609272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13113	NC_009481	TGG	2	6	609287	609292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13114	NC_009481	TG	3	6	609338	609343	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13115	NC_009481	CGT	2	6	609392	609397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238943
13116	NC_009481	TGC	2	6	609398	609403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238943
13117	NC_009481	GCT	2	6	609420	609425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238943
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13119	NC_009481	GCG	2	6	609494	609499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238943
13120	NC_009481	GT	3	6	609580	609585	0 %	50 %	50 %	0 %	148238943
13121	NC_009481	CAG	2	6	609699	609704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238943
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13152	NC_009481	CG	3	6	611553	611558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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13240	NC_009481	GGC	2	6	615606	615611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238948
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13243	NC_009481	CTGT	2	8	615855	615862	0 %	50 %	25 %	25 %	148238948
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13271	NC_009481	TTC	2	6	617061	617066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148238949
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13273	NC_009481	GTGG	2	8	617133	617140	0 %	25 %	75 %	0 %	148238949
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13304	NC_009481	ACAGG	2	10	618819	618828	40 %	0 %	40 %	20 %	148238952
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13307	NC_009481	GCT	2	6	618912	618917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238952
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13321	NC_009481	GCAG	3	12	619532	619543	25 %	0 %	50 %	25 %	148238954
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13329	NC_009481	TGC	2	6	620002	620007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238954
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13333	NC_009481	C	8	8	620170	620177	0 %	0 %	0 %	100 %	148238954
13334	NC_009481	CTT	2	6	620211	620216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148238954
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13343	NC_009481	GATTT	2	10	620568	620577	20 %	60 %	20 %	0 %	148238955
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13345	NC_009481	CAG	3	9	620707	620715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238955
13346	NC_009481	TTTG	2	8	620775	620782	0 %	75 %	25 %	0 %	148238955
13347	NC_009481	GTC	2	6	620804	620809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238955
13348	NC_009481	TG	3	6	620820	620825	0 %	50 %	50 %	0 %	148238955
13349	NC_009481	GC	3	6	620885	620890	0 %	0 %	50 %	50 %	148238955
13350	NC_009481	TGG	2	6	620905	620910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238955
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13355	NC_009481	TCA	2	6	621108	621113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238955
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13357	NC_009481	CTG	3	9	621143	621151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238955
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13359	NC_009481	CAC	2	6	621206	621211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238955
13360	NC_009481	GGATC	2	10	621356	621365	20 %	20 %	40 %	20 %	148238956
13361	NC_009481	CCA	2	6	621368	621373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238956
13362	NC_009481	CGATGG	2	12	621407	621418	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148238956
13363	NC_009481	TCC	2	6	621475	621480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238956
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13371	NC_009481	GGTC	2	8	621870	621877	0 %	25 %	50 %	25 %	148238956
13372	NC_009481	GGA	2	6	621918	621923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238956
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13375	NC_009481	TCG	2	6	622087	622092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238956
13376	NC_009481	ATCC	2	8	622104	622111	25 %	25 %	0 %	50 %	148238956
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13379	NC_009481	GGT	2	6	622310	622315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238956
13380	NC_009481	CCA	2	6	622415	622420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238956
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13383	NC_009481	C	6	6	622531	622536	0 %	0 %	0 %	100 %	148238956
13384	NC_009481	ACC	2	6	622546	622551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238956
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13387	NC_009481	TC	3	6	622680	622685	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13388	NC_009481	GCC	2	6	622766	622771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238957
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13392	NC_009481	GTG	2	6	623072	623077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238957
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13395	NC_009481	GGTG	2	8	623225	623232	0 %	25 %	75 %	0 %	148238958
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13480	NC_009481	TGGA	2	8	627212	627219	25 %	25 %	50 %	0 %	148238962
13481	NC_009481	TC	3	6	627274	627279	0 %	50 %	0 %	50 %	148238963
13482	NC_009481	TTC	2	6	627387	627392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148238963
13483	NC_009481	TCC	2	6	627580	627585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238963
13484	NC_009481	GCG	2	6	627591	627596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238963
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