MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. WH 7803 chromosome

Total Repeats: 50037

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009481	CGTGC	2	10	21188	21197	0 %	20 %	40 %	40 %	148238354
502	NC_009481	GAG	2	6	21211	21216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238354
503	NC_009481	TG	3	6	21254	21259	0 %	50 %	50 %	0 %	148238354
504	NC_009481	TGC	2	6	21300	21305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238354
505	NC_009481	TGGTGA	2	12	21321	21332	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	148238354
506	NC_009481	GT	3	6	21354	21359	0 %	50 %	50 %	0 %	148238354
507	NC_009481	CCA	2	6	21375	21380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238354
508	NC_009481	CGT	2	6	21390	21395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238354
509	NC_009481	TTG	2	6	21431	21436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238354
510	NC_009481	GAG	2	6	21506	21511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238354
511	NC_009481	CGTGC	2	10	21557	21566	0 %	20 %	40 %	40 %	148238354
512	NC_009481	GAG	2	6	21580	21585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238354
513	NC_009481	TG	3	6	21623	21628	0 %	50 %	50 %	0 %	148238354
514	NC_009481	TGT	2	6	21649	21654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238354
515	NC_009481	TGC	2	6	21669	21674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238354
516	NC_009481	TGGTGA	2	12	21690	21701	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	148238354
517	NC_009481	GT	3	6	21723	21728	0 %	50 %	50 %	0 %	148238354
518	NC_009481	CCA	2	6	21744	21749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238354
519	NC_009481	CGT	2	6	21759	21764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238354
520	NC_009481	CGT	2	6	21795	21800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238354
521	NC_009481	GAG	2	6	21875	21880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238354
522	NC_009481	CGTGC	2	10	21926	21935	0 %	20 %	40 %	40 %	148238354
523	NC_009481	GAG	2	6	21949	21954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238354
524	NC_009481	TG	3	6	21992	21997	0 %	50 %	50 %	0 %	148238354
525	NC_009481	TGT	2	6	22018	22023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238354
526	NC_009481	TGC	2	6	22038	22043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238354
527	NC_009481	TGGTGA	2	12	22059	22070	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	148238354
528	NC_009481	GT	3	6	22092	22097	0 %	50 %	50 %	0 %	148238354
529	NC_009481	CCA	2	6	22113	22118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238354
530	NC_009481	CGT	2	6	22128	22133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238354
531	NC_009481	TGC	2	6	22140	22145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238354
532	NC_009481	GCT	2	6	22201	22206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238354
533	NC_009481	TTG	2	6	22249	22254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238354
534	NC_009481	ATC	2	6	22255	22260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238354
535	NC_009481	CCA	2	6	22299	22304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238354
536	NC_009481	TGG	2	6	22398	22403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238354
537	NC_009481	CCT	2	6	22431	22436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238354
538	NC_009481	ATCA	2	8	22492	22499	50 %	25 %	0 %	25 %	148238354
539	NC_009481	AAAGAG	2	12	22574	22585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148238354
540	NC_009481	CGC	2	6	22629	22634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238354
541	NC_009481	GAG	2	6	22681	22686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238354
542	NC_009481	GTC	2	6	22702	22707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238354
543	NC_009481	TGT	2	6	22730	22735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238354
544	NC_009481	CAT	2	6	22767	22772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238354
545	NC_009481	GAGG	2	8	22813	22820	25 %	0 %	75 %	0 %	148238354
546	NC_009481	TGA	3	9	22872	22880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238354
547	NC_009481	AAAGAG	2	12	22988	22999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148238354
548	NC_009481	CGC	2	6	23043	23048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238354
549	NC_009481	GAG	2	6	23095	23100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238354
550	NC_009481	GTC	2	6	23116	23121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238354
551	NC_009481	TGT	2	6	23144	23149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238354
552	NC_009481	CAT	2	6	23181	23186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238354
553	NC_009481	GAGG	2	8	23227	23234	25 %	0 %	75 %	0 %	148238354
554	NC_009481	TGA	3	9	23286	23294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238354
555	NC_009481	AAAGAG	2	12	23402	23413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148238354
556	NC_009481	CGC	2	6	23457	23462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238354
557	NC_009481	GAG	2	6	23509	23514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238354
558	NC_009481	GTC	2	6	23530	23535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238354
559	NC_009481	TGT	2	6	23558	23563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238354
560	NC_009481	CAT	2	6	23595	23600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238354
561	NC_009481	TGA	2	6	23700	23705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_009481	CTT	2	6	23736	23741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_009481	GTTGT	2	10	23744	23753	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
564	NC_009481	CAA	2	6	23757	23762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_009481	GA	3	6	23765	23770	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
566	NC_009481	GCT	2	6	23799	23804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_009481	ATC	2	6	23830	23835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_009481	CTG	2	6	23927	23932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_009481	CCAG	2	8	23945	23952	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
570	NC_009481	AG	3	6	24025	24030	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
571	NC_009481	ATG	2	6	24032	24037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_009481	CCAGA	2	10	24042	24051	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
573	NC_009481	TGAT	2	8	24066	24073	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
574	NC_009481	CTC	2	6	24087	24092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
575	NC_009481	GA	3	6	24124	24129	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
576	NC_009481	AAAT	2	8	24184	24191	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_009481	CG	3	6	24204	24209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
578	NC_009481	TGAT	2	8	24244	24251	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
579	NC_009481	AT	4	8	24250	24257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_009481	TAG	2	6	24259	24264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_009481	TGT	2	6	24282	24287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_009481	AGC	2	6	24328	24333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_009481	CTG	2	6	24355	24360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_009481	CAG	2	6	24409	24414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238355
585	NC_009481	GCC	2	6	24430	24435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238355
586	NC_009481	CAC	3	9	24436	24444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238355
587	NC_009481	ATC	2	6	24446	24451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238355
588	NC_009481	GCA	2	6	24588	24593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238355
589	NC_009481	CAG	2	6	24619	24624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238355
590	NC_009481	CG	3	6	24645	24650	0 %	0 %	50 %	50 %	148238355
591	NC_009481	ATG	2	6	24671	24676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238355
592	NC_009481	GTGA	2	8	24737	24744	25 %	25 %	50 %	0 %	148238355
593	NC_009481	GGCGGT	2	12	24766	24777	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	148238355
594	NC_009481	ATCA	2	8	24823	24830	50 %	25 %	0 %	25 %	148238355
595	NC_009481	CGG	2	6	24833	24838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238355
596	NC_009481	GTA	2	6	24853	24858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238355
597	NC_009481	CAG	2	6	24883	24888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238355
598	NC_009481	TGC	2	6	24907	24912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238355
599	NC_009481	GCA	2	6	24921	24926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238355
600	NC_009481	CCA	2	6	24939	24944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238355
601	NC_009481	CGC	2	6	25152	25157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238355
602	NC_009481	CCA	2	6	25173	25178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238355
603	NC_009481	CGG	2	6	25263	25268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238355
604	NC_009481	CTT	2	6	25276	25281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148238355
605	NC_009481	CTG	2	6	25297	25302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238355
606	NC_009481	CCA	2	6	25347	25352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238355
607	NC_009481	GAA	2	6	25428	25433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148238355
608	NC_009481	GGTTG	2	10	25483	25492	0 %	40 %	60 %	0 %	148238355
609	NC_009481	GATT	2	8	25504	25511	25 %	50 %	25 %	0 %	148238355
610	NC_009481	GTT	2	6	25536	25541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238355
611	NC_009481	T	6	6	25540	25545	0 %	100 %	0 %	0 %	148238355
612	NC_009481	CTT	2	6	25585	25590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148238355
613	NC_009481	GTG	2	6	25632	25637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
614	NC_009481	T	6	6	25648	25653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_009481	CGT	2	6	25691	25696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_009481	TGCT	2	8	25743	25750	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
617	NC_009481	CTT	2	6	25758	25763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_009481	TTTG	2	8	25868	25875	0 %	75 %	25 %	0 %	148238356
619	NC_009481	GT	3	6	25994	25999	0 %	50 %	50 %	0 %	148238356
620	NC_009481	CCGA	2	8	26025	26032	25 %	0 %	25 %	50 %	148238356
621	NC_009481	TGC	2	6	26051	26056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238356
622	NC_009481	GGC	2	6	26057	26062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238356
623	NC_009481	CCA	2	6	26084	26089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238356
624	NC_009481	TTG	2	6	26121	26126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238356
625	NC_009481	G	7	7	26130	26136	0 %	0 %	100 %	0 %	148238356
626	NC_009481	CCA	2	6	26144	26149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238356
627	NC_009481	CAG	2	6	26213	26218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238356
628	NC_009481	CCA	2	6	26261	26266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238356
629	NC_009481	GCT	2	6	26293	26298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238356
630	NC_009481	TGAT	2	8	26422	26429	25 %	50 %	25 %	0 %	148238356
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1000	NC_009481	ATGG	2	8	43251	43258	25 %	25 %	50 %	0 %	148238375

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