MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. WH 7803 chromosome

Total Repeats: 50037

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_009481	CTGGTG	2	12	307422	307433	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148238619
7003	NC_009481	GC	3	6	307493	307498	0 %	0 %	50 %	50 %	148238619
7004	NC_009481	GGC	2	6	307574	307579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238619
7005	NC_009481	TTC	2	6	307582	307587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148238619
7006	NC_009481	GT	3	6	307717	307722	0 %	50 %	50 %	0 %	148238619
7007	NC_009481	GAC	2	6	307869	307874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238619
7008	NC_009481	GTG	2	6	307879	307884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238619
7009	NC_009481	G	6	6	307921	307926	0 %	0 %	100 %	0 %	148238619
7010	NC_009481	GAAG	2	8	307931	307938	50 %	0 %	50 %	0 %	148238619
7011	NC_009481	TCG	2	6	307941	307946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238619
7012	NC_009481	CTG	2	6	307966	307971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238619
7013	NC_009481	ATC	2	6	308013	308018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148238619
7014	NC_009481	TGG	3	9	308041	308049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238619
7015	NC_009481	CGG	2	6	308057	308062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238619
7016	NC_009481	TCG	2	6	308104	308109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238619
7017	NC_009481	TGA	2	6	308111	308116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238619
7018	NC_009481	GAG	2	6	308124	308129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238619
7019	NC_009481	CTG	2	6	308271	308276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238619
7020	NC_009481	GCA	2	6	308285	308290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238619
7021	NC_009481	TCCCC	2	10	308293	308302	0 %	20 %	0 %	80 %	148238619
7022	NC_009481	TGC	2	6	308383	308388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238619
7023	NC_009481	AGG	2	6	308395	308400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238619
7024	NC_009481	AGA	2	6	308426	308431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148238619
7025	NC_009481	CCG	2	6	308452	308457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7026	NC_009481	TGA	2	6	308497	308502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238620
7027	NC_009481	CTG	2	6	308580	308585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238620
7028	NC_009481	CCA	2	6	308732	308737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238620
7029	NC_009481	TTGA	2	8	308778	308785	25 %	50 %	25 %	0 %	148238620
7030	NC_009481	AGG	3	9	308806	308814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238620
7031	NC_009481	TGAT	2	8	308824	308831	25 %	50 %	25 %	0 %	148238620
7032	NC_009481	GCC	2	6	308832	308837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238620
7033	NC_009481	GGC	2	6	308844	308849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238620
7034	NC_009481	GCTT	2	8	308851	308858	0 %	50 %	25 %	25 %	148238620
7035	NC_009481	GTG	2	6	308910	308915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238620
7036	NC_009481	GAG	2	6	308922	308927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238620
7037	NC_009481	CGT	2	6	308946	308951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238620
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7039	NC_009481	TGA	2	6	309001	309006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238620
7040	NC_009481	CGATCT	2	12	309011	309022	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148238620
7041	NC_009481	GGT	2	6	309047	309052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238620
7042	NC_009481	TCG	2	6	309081	309086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238620
7043	NC_009481	CGAT	2	8	309091	309098	25 %	25 %	25 %	25 %	148238620
7044	NC_009481	TGGTG	2	10	309128	309137	0 %	40 %	60 %	0 %	148238620
7045	NC_009481	TGG	2	6	309208	309213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238620
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7052	NC_009481	GT	3	6	309374	309379	0 %	50 %	50 %	0 %	148238620
7053	NC_009481	GCA	2	6	309410	309415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238620
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7055	NC_009481	TTCAG	2	10	309528	309537	20 %	40 %	20 %	20 %	148238621
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7057	NC_009481	TCAGG	2	10	309657	309666	20 %	20 %	40 %	20 %	148238621
7058	NC_009481	CAC	2	6	309706	309711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238621
7059	NC_009481	GTC	2	6	309724	309729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238621
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7061	NC_009481	GAG	2	6	309826	309831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238621
7062	NC_009481	CAG	2	6	309877	309882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238621
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7064	NC_009481	GTG	2	6	309943	309948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238621
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7069	NC_009481	CAG	2	6	310227	310232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238621
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7093	NC_009481	GACT	2	8	311374	311381	25 %	25 %	25 %	25 %	148238621
7094	NC_009481	GC	3	6	311382	311387	0 %	0 %	50 %	50 %	148238621
7095	NC_009481	GCCAG	2	10	311466	311475	20 %	0 %	40 %	40 %	148238621
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7104	NC_009481	GGGA	2	8	311992	311999	25 %	0 %	75 %	0 %	148238621
7105	NC_009481	GCG	2	6	312029	312034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238621
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7107	NC_009481	TGAA	2	8	312191	312198	50 %	25 %	25 %	0 %	148238621
7108	NC_009481	GCC	2	6	312200	312205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148238621
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7110	NC_009481	CAC	2	6	312313	312318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148238621
7111	NC_009481	TGT	2	6	312336	312341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238621
7112	NC_009481	GCA	2	6	312408	312413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238621
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7118	NC_009481	TCG	3	9	312796	312804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238622
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7120	NC_009481	CGG	2	6	312877	312882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238622
7121	NC_009481	GGTGT	2	10	312989	312998	0 %	40 %	60 %	0 %	148238622
7122	NC_009481	CTG	2	6	313061	313066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238622
7123	NC_009481	TGG	2	6	313101	313106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238622
7124	NC_009481	GC	3	6	313127	313132	0 %	0 %	50 %	50 %	148238622
7125	NC_009481	CTCC	2	8	313312	313319	0 %	25 %	0 %	75 %	148238622
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7153	NC_009481	TGC	2	6	314861	314866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7156	NC_009481	CAC	2	6	314955	314960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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7233	NC_009481	TGC	2	6	318690	318695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238629
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7240	NC_009481	GCCTT	2	10	318832	318841	0 %	40 %	20 %	40 %	148238629
7241	NC_009481	GGC	2	6	318882	318887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238629
7242	NC_009481	GGCT	2	8	318906	318913	0 %	25 %	50 %	25 %	148238629
7243	NC_009481	GGAA	2	8	318938	318945	50 %	0 %	50 %	0 %	148238629
7244	NC_009481	CAA	2	6	318954	318959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148238629
7245	NC_009481	AGC	2	6	318975	318980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238629
7246	NC_009481	CGGC	2	8	319036	319043	0 %	0 %	50 %	50 %	148238629
7247	NC_009481	TGT	2	6	319047	319052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238629
7248	NC_009481	G	6	6	319147	319152	0 %	0 %	100 %	0 %	148238629
7249	NC_009481	GTG	2	6	319222	319227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238629
7250	NC_009481	CCCA	2	8	319296	319303	25 %	0 %	0 %	75 %	148238629
7251	NC_009481	TGC	2	6	319314	319319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238629
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7253	NC_009481	CTG	2	6	319354	319359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238629
7254	NC_009481	TGA	2	6	319371	319376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238629
7255	NC_009481	CGG	2	6	319388	319393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238629
7256	NC_009481	AGCG	2	8	319411	319418	25 %	0 %	50 %	25 %	148238629
7257	NC_009481	TGA	2	6	319440	319445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238629
7258	NC_009481	GGTT	2	8	319548	319555	0 %	50 %	50 %	0 %	148238629
7259	NC_009481	CTT	2	6	319620	319625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148238629
7260	NC_009481	TGA	2	6	319632	319637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238629
7261	NC_009481	GGC	2	6	319650	319655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238629
7262	NC_009481	GCA	2	6	319656	319661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238629
7263	NC_009481	TGC	2	6	319745	319750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238629
7264	NC_009481	GCT	2	6	319797	319802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7265	NC_009481	TGA	2	6	319851	319856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238630
7266	NC_009481	TGA	2	6	319899	319904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238630
7267	NC_009481	GAG	2	6	319982	319987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238630
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7272	NC_009481	GTT	2	6	320110	320115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148238630
7273	NC_009481	CTG	2	6	320129	320134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238630
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7282	NC_009481	GTC	2	6	320541	320546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238631
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7285	NC_009481	CGT	2	6	320599	320604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238631
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7315	NC_009481	CAG	2	6	322017	322022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238632
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7317	NC_009481	GCT	2	6	322103	322108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238632
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7320	NC_009481	CGA	3	9	322222	322230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7321	NC_009481	A	8	8	322294	322301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7322	NC_009481	GAT	2	6	322457	322462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238633
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7328	NC_009481	TGA	2	6	322804	322809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148238633
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7332	NC_009481	AGC	2	6	323058	323063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238633
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7342	NC_009481	CGA	2	6	323425	323430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238633
7343	NC_009481	CGAACA	2	12	323488	323499	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	148238633
7344	NC_009481	GCG	2	6	323592	323597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148238633
7345	NC_009481	GA	3	6	323679	323684	50 %	0 %	50 %	0 %	148238633
7346	NC_009481	CCGAGA	2	12	323694	323705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238633
7347	NC_009481	CCT	2	6	323803	323808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238633
7348	NC_009481	AGT	2	6	323936	323941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7349	NC_009481	AG	3	6	324006	324011	50 %	0 %	50 %	0 %	148238634
7350	NC_009481	GCA	2	6	324090	324095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238634
7351	NC_009481	CAGG	2	8	324190	324197	25 %	0 %	50 %	25 %	148238634
7352	NC_009481	GGT	2	6	324262	324267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238634
7353	NC_009481	CAGTG	2	10	324283	324292	20 %	20 %	40 %	20 %	148238634
7354	NC_009481	GGT	2	6	324307	324312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238634
7355	NC_009481	GATC	2	8	324342	324349	25 %	25 %	25 %	25 %	148238634
7356	NC_009481	TC	3	6	324432	324437	0 %	50 %	0 %	50 %	148238634
7357	NC_009481	GCT	2	6	324441	324446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238634
7358	NC_009481	GCAG	2	8	324450	324457	25 %	0 %	50 %	25 %	148238634
7359	NC_009481	CCCA	2	8	324509	324516	25 %	0 %	0 %	75 %	148238634
7360	NC_009481	GGCGCA	2	12	324594	324605	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148238634
7361	NC_009481	CACG	2	8	324664	324671	25 %	0 %	25 %	50 %	148238634
7362	NC_009481	TCC	2	6	324677	324682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238634
7363	NC_009481	AGGAG	2	10	324747	324756	40 %	0 %	60 %	0 %	148238634
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7485	NC_009481	GTG	2	6	330898	330903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238641
7486	NC_009481	GC	4	8	330915	330922	0 %	0 %	50 %	50 %	148238641
7487	NC_009481	GGA	2	6	330961	330966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238641
7488	NC_009481	CTC	2	6	331009	331014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238641
7489	NC_009481	GGT	2	6	331015	331020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148238641
7490	NC_009481	CTC	2	6	331068	331073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148238641
7491	NC_009481	CTG	2	6	331075	331080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148238641
7492	NC_009481	GAG	2	6	331081	331086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238641
7493	NC_009481	CATCC	2	10	331261	331270	20 %	20 %	0 %	60 %	148238641
7494	NC_009481	CTGAAG	2	12	331379	331390	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148238641
7495	NC_009481	AGC	2	6	331435	331440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148238642
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7497	NC_009481	GAG	2	6	331672	331677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238642
7498	NC_009481	CACG	2	8	331830	331837	25 %	0 %	25 %	50 %	148238642
7499	NC_009481	GCCA	2	8	331894	331901	25 %	0 %	25 %	50 %	148238642
7500	NC_009481	GGA	2	6	332073	332078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148238642

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