MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis 98HAH33

Total Repeats: 42515

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29002	NC_009443	ACC	2	6	1417997	1418002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146321336
29003	NC_009443	TGGTC	2	10	1418032	1418041	0 %	40 %	40 %	20 %	146321336
29004	NC_009443	ACC	2	6	1418090	1418095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146321336
29005	NC_009443	TCC	2	6	1418109	1418114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146321336
29006	NC_009443	CGC	2	6	1418320	1418325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146321336
29007	NC_009443	GCT	2	6	1418331	1418336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321336
29008	NC_009443	TCT	2	6	1418337	1418342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321336
29009	NC_009443	T	6	6	1418382	1418387	0 %	100 %	0 %	0 %	146321336
29010	NC_009443	TAAA	2	8	1418437	1418444	75 %	25 %	0 %	0 %	146321336
29011	NC_009443	AAT	2	6	1418486	1418491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146321336
29012	NC_009443	A	6	6	1418552	1418557	100 %	0 %	0 %	0 %	146321336
29013	NC_009443	A	6	6	1418586	1418591	100 %	0 %	0 %	0 %	146321336
29014	NC_009443	ACC	2	6	1418643	1418648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146321337
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29017	NC_009443	CT	3	6	1418770	1418775	0 %	50 %	0 %	50 %	146321337
29018	NC_009443	CTAT	2	8	1418830	1418837	25 %	50 %	0 %	25 %	146321337
29019	NC_009443	AGAGC	2	10	1418906	1418915	40 %	0 %	40 %	20 %	146321337
29020	NC_009443	CAAGG	2	10	1418983	1418992	40 %	0 %	40 %	20 %	146321337
29021	NC_009443	CTGC	2	8	1419006	1419013	0 %	25 %	25 %	50 %	146321338
29022	NC_009443	TAA	2	6	1419148	1419153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146321338
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29024	NC_009443	TAA	2	6	1419188	1419193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146321338
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29034	NC_009443	CTG	2	6	1419756	1419761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321339
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29051	NC_009443	CTT	2	6	1420515	1420520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29052	NC_009443	TA	3	6	1420524	1420529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29053	NC_009443	GTTTG	2	10	1420578	1420587	0 %	60 %	40 %	0 %	146321340
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29100	NC_009443	T	7	7	1422984	1422990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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29113	NC_009443	TAT	2	6	1423510	1423515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29114	NC_009443	ATA	2	6	1423543	1423548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29115	NC_009443	CA	3	6	1423655	1423660	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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29119	NC_009443	AAT	2	6	1423732	1423737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146321343
29120	NC_009443	GTGA	2	8	1423795	1423802	25 %	25 %	50 %	0 %	146321343
29121	NC_009443	TCAA	2	8	1423829	1423836	50 %	25 %	0 %	25 %	146321343
29122	NC_009443	CAA	2	6	1423936	1423941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146321343
29123	NC_009443	ACC	2	6	1423960	1423965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146321343
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29125	NC_009443	TTC	2	6	1424038	1424043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321343
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29128	NC_009443	TTC	2	6	1424362	1424367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321343
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29132	NC_009443	CAA	2	6	1424409	1424414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146321343
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29171	NC_009443	AT	3	6	1426359	1426364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29172	NC_009443	CCATCG	2	12	1426372	1426383	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
29173	NC_009443	TCA	2	6	1426386	1426391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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29176	NC_009443	TCC	2	6	1426598	1426603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29177	NC_009443	ATCTC	2	10	1426607	1426616	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
29178	NC_009443	TGG	2	6	1426851	1426856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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29182	NC_009443	TTC	2	6	1426976	1426981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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29220	NC_009443	T	8	8	1428881	1428888	0 %	100 %	0 %	0 %	146321348
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29222	NC_009443	GA	3	6	1428941	1428946	50 %	0 %	50 %	0 %	146321348
29223	NC_009443	T	6	6	1428952	1428957	0 %	100 %	0 %	0 %	146321348
29224	NC_009443	TCA	2	6	1429009	1429014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321348
29225	NC_009443	AAAT	2	8	1429034	1429041	75 %	25 %	0 %	0 %	146321348
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29227	NC_009443	GCA	2	6	1429063	1429068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321348
29228	NC_009443	GCT	2	6	1429093	1429098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321348
29229	NC_009443	TAAA	2	8	1429105	1429112	75 %	25 %	0 %	0 %	146321348
29230	NC_009443	GA	3	6	1429128	1429133	50 %	0 %	50 %	0 %	146321348
29231	NC_009443	CAA	2	6	1429172	1429177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146321348
29232	NC_009443	ACC	3	9	1429191	1429199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146321348
29233	NC_009443	TGC	2	6	1429206	1429211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321348
29234	NC_009443	T	6	6	1429221	1429226	0 %	100 %	0 %	0 %	146321348
29235	NC_009443	TTTGT	2	10	1429304	1429313	0 %	80 %	20 %	0 %	146321348
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29355	NC_009443	TTC	2	6	1434955	1434960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321352
29356	NC_009443	A	6	6	1434995	1435000	100 %	0 %	0 %	0 %	146321352
29357	NC_009443	ATC	2	6	1435045	1435050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321352
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29359	NC_009443	CAAA	2	8	1435104	1435111	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29360	NC_009443	T	6	6	1435118	1435123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29361	NC_009443	TTCA	2	8	1435132	1435139	25 %	50 %	0 %	25 %	146321353
29362	NC_009443	TCTTCA	2	12	1435151	1435162	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	146321353
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29373	NC_009443	CAA	2	6	1435734	1435739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146321353
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29375	NC_009443	GAAG	2	8	1435925	1435932	50 %	0 %	50 %	0 %	146321353
29376	NC_009443	TCCA	2	8	1436060	1436067	25 %	25 %	0 %	50 %	146321353
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29384	NC_009443	ATCA	2	8	1436400	1436407	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29385	NC_009443	CTAT	2	8	1436432	1436439	25 %	50 %	0 %	25 %	146321354
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29426	NC_009443	ATC	2	6	1438573	1438578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321357
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29472	NC_009443	AGT	2	6	1440901	1440906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321361
29473	NC_009443	GTC	2	6	1440910	1440915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321361
29474	NC_009443	CTC	2	6	1440962	1440967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146321361
29475	NC_009443	CAA	2	6	1441003	1441008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146321361
29476	NC_009443	ACT	2	6	1441014	1441019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321361
29477	NC_009443	TAC	2	6	1441044	1441049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321361
29478	NC_009443	ATC	2	6	1441054	1441059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321361
29479	NC_009443	A	6	6	1441064	1441069	100 %	0 %	0 %	0 %	146321361
29480	NC_009443	CA	3	6	1441099	1441104	50 %	0 %	0 %	50 %	146321361
29481	NC_009443	GAA	2	6	1441123	1441128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146321361
29482	NC_009443	AGA	2	6	1441170	1441175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146321361
29483	NC_009443	A	7	7	1441175	1441181	100 %	0 %	0 %	0 %	146321361
29484	NC_009443	CCTT	2	8	1441195	1441202	0 %	50 %	0 %	50 %	146321361
29485	NC_009443	A	6	6	1441207	1441212	100 %	0 %	0 %	0 %	146321361
29486	NC_009443	ATA	2	6	1441265	1441270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29487	NC_009443	T	6	6	1441310	1441315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29488	NC_009443	CATT	2	8	1441352	1441359	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29489	NC_009443	CTTT	2	8	1441369	1441376	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29490	NC_009443	AAATAA	2	12	1441415	1441426	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29491	NC_009443	ATA	2	6	1441432	1441437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29492	NC_009443	CCT	2	6	1441470	1441475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146321362
29493	NC_009443	GAA	2	6	1441480	1441485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146321362
29494	NC_009443	T	7	7	1441518	1441524	0 %	100 %	0 %	0 %	146321362
29495	NC_009443	TCC	2	6	1441542	1441547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146321362
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29497	NC_009443	ATG	2	6	1441641	1441646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321362
29498	NC_009443	CGTC	2	8	1441661	1441668	0 %	25 %	25 %	50 %	146321362
29499	NC_009443	CATC	2	8	1441708	1441715	25 %	25 %	0 %	50 %	146321362
29500	NC_009443	GAT	2	6	1441756	1441761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321362

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