MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis 98HAH33

Total Repeats: 42515

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25003	NC_009443	TA	3	6	1219812	1219817	50 %	50 %	0 %	0 %	146321140
25004	NC_009443	AT	3	6	1219865	1219870	50 %	50 %	0 %	0 %	146321140
25005	NC_009443	GATAA	2	10	1219894	1219903	60 %	20 %	20 %	0 %	146321140
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25016	NC_009443	TAT	2	6	1220333	1220338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146321141
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25028	NC_009443	TCCA	2	8	1220676	1220683	25 %	25 %	0 %	50 %	146321141
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25100	NC_009443	ATA	2	6	1223413	1223418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25101	NC_009443	TAA	2	6	1223527	1223532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25120	NC_009443	ATA	2	6	1224253	1224258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146321145
25121	NC_009443	TTG	2	6	1224275	1224280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146321145
25122	NC_009443	T	6	6	1224303	1224308	0 %	100 %	0 %	0 %	146321145
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25131	NC_009443	T	6	6	1224561	1224566	0 %	100 %	0 %	0 %	146321146
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25153	NC_009443	AT	3	6	1225548	1225553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25154	NC_009443	TAA	2	6	1225565	1225570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25155	NC_009443	TAA	2	6	1225575	1225580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25156	NC_009443	TCTG	2	8	1225590	1225597	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25157	NC_009443	TTTAT	2	10	1225615	1225624	20 %	80 %	0 %	0 %	146321147
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25232	NC_009443	AAATA	2	10	1228563	1228572	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25233	NC_009443	T	6	6	1228587	1228592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25234	NC_009443	ATT	2	6	1228626	1228631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146321151
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25239	NC_009443	TTGA	2	8	1228877	1228884	25 %	50 %	25 %	0 %	146321151
25240	NC_009443	TTG	2	6	1228921	1228926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146321151
25241	NC_009443	T	6	6	1228940	1228945	0 %	100 %	0 %	0 %	146321151
25242	NC_009443	CAT	2	6	1228978	1228983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321151
25243	NC_009443	A	6	6	1228995	1229000	100 %	0 %	0 %	0 %	146321151
25244	NC_009443	CAG	2	6	1229008	1229013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321151
25245	NC_009443	TGA	2	6	1229044	1229049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321151
25246	NC_009443	GTCT	2	8	1229063	1229070	0 %	50 %	25 %	25 %	146321151
25247	NC_009443	CAA	2	6	1229104	1229109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146321151
25248	NC_009443	TAA	2	6	1229116	1229121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146321151
25249	NC_009443	TC	3	6	1229122	1229127	0 %	50 %	0 %	50 %	146321151
25250	NC_009443	CAT	2	6	1229146	1229151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321151
25251	NC_009443	GAAT	2	8	1229155	1229162	50 %	25 %	25 %	0 %	146321151
25252	NC_009443	TATG	2	8	1229174	1229181	25 %	50 %	25 %	0 %	146321151
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25255	NC_009443	T	6	6	1229323	1229328	0 %	100 %	0 %	0 %	146321152
25256	NC_009443	TCA	2	6	1229363	1229368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321152
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25261	NC_009443	TTCT	2	8	1229773	1229780	0 %	75 %	0 %	25 %	146321152
25262	NC_009443	AAT	2	6	1229932	1229937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146321152
25263	NC_009443	CAT	2	6	1229956	1229961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321152
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25265	NC_009443	TTCCA	2	10	1230014	1230023	20 %	40 %	0 %	40 %	146321152
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25274	NC_009443	TTG	2	6	1230331	1230336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146321152
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25278	NC_009443	T	8	8	1230454	1230461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25279	NC_009443	CTTTT	2	10	1230492	1230501	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
25280	NC_009443	TAA	2	6	1230547	1230552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25281	NC_009443	ATA	2	6	1230565	1230570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25282	NC_009443	TAA	2	6	1230611	1230616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146321153
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25285	NC_009443	A	6	6	1230720	1230725	100 %	0 %	0 %	0 %	146321153
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25297	NC_009443	ACAA	2	8	1231336	1231343	75 %	0 %	0 %	25 %	146321153
25298	NC_009443	TCT	2	6	1231397	1231402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321154
25299	NC_009443	T	6	6	1231411	1231416	0 %	100 %	0 %	0 %	146321154
25300	NC_009443	ATT	2	6	1231418	1231423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146321154
25301	NC_009443	TAT	2	6	1231424	1231429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146321154
25302	NC_009443	TCC	2	6	1231461	1231466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146321154
25303	NC_009443	AACT	2	8	1231526	1231533	50 %	25 %	0 %	25 %	146321154
25304	NC_009443	TATT	2	8	1231570	1231577	25 %	75 %	0 %	0 %	146321154
25305	NC_009443	TTGA	2	8	1231596	1231603	25 %	50 %	25 %	0 %	146321154
25306	NC_009443	GTG	2	6	1231609	1231614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146321154
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25312	NC_009443	TA	3	6	1231848	1231853	50 %	50 %	0 %	0 %	146321154
25313	NC_009443	TAA	2	6	1231858	1231863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146321154
25314	NC_009443	TAA	2	6	1231880	1231885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146321154
25315	NC_009443	GTC	2	6	1231890	1231895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146321154
25316	NC_009443	AT	3	6	1231906	1231911	50 %	50 %	0 %	0 %	146321154
25317	NC_009443	ACT	2	6	1231918	1231923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321154
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25319	NC_009443	ACAA	2	8	1232069	1232076	75 %	0 %	0 %	25 %	146321154
25320	NC_009443	GAAT	2	8	1232102	1232109	50 %	25 %	25 %	0 %	146321154
25321	NC_009443	GGT	2	6	1232226	1232231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146321154
25322	NC_009443	TAT	2	6	1232278	1232283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146321154
25323	NC_009443	CAG	2	6	1232304	1232309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321154
25324	NC_009443	CA	3	6	1232315	1232320	50 %	0 %	0 %	50 %	146321154
25325	NC_009443	A	6	6	1232348	1232353	100 %	0 %	0 %	0 %	146321154
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25327	NC_009443	TAA	2	6	1232435	1232440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146321154
25328	NC_009443	T	6	6	1232447	1232452	0 %	100 %	0 %	0 %	146321154
25329	NC_009443	TAG	2	6	1232471	1232476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146321154
25330	NC_009443	CAC	2	6	1232482	1232487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146321154
25331	NC_009443	ATCG	2	8	1232493	1232500	25 %	25 %	25 %	25 %	146321154
25332	NC_009443	TGGC	2	8	1232501	1232508	0 %	25 %	50 %	25 %	146321154
25333	NC_009443	TGT	2	6	1232582	1232587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146321154
25334	NC_009443	GAA	2	6	1232622	1232627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146321154
25335	NC_009443	CTTT	2	8	1232737	1232744	0 %	75 %	0 %	25 %	146321154
25336	NC_009443	AAT	2	6	1232835	1232840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146321154
25337	NC_009443	ACA	2	6	1232907	1232912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146321154
25338	NC_009443	ATCCGA	2	12	1232954	1232965	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	146321154
25339	NC_009443	CAA	2	6	1232991	1232996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146321154
25340	NC_009443	ATA	2	6	1233052	1233057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146321154
25341	NC_009443	CAA	2	6	1233063	1233068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146321154
25342	NC_009443	ACAA	2	8	1233136	1233143	75 %	0 %	0 %	25 %	146321154
25343	NC_009443	ATC	2	6	1233206	1233211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25344	NC_009443	A	6	6	1233220	1233225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25345	NC_009443	TTG	2	6	1233332	1233337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146321155
25346	NC_009443	CT	3	6	1233350	1233355	0 %	50 %	0 %	50 %	146321155
25347	NC_009443	T	6	6	1233369	1233374	0 %	100 %	0 %	0 %	146321155
25348	NC_009443	CTT	2	6	1233464	1233469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321155
25349	NC_009443	GCA	2	6	1233522	1233527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146321155
25350	NC_009443	ATT	2	6	1233548	1233553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146321155
25351	NC_009443	T	6	6	1233682	1233687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25352	NC_009443	TACCTG	2	12	1233715	1233726	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25353	NC_009443	TCT	2	6	1233907	1233912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321156
25354	NC_009443	TTAA	2	8	1233941	1233948	50 %	50 %	0 %	0 %	146321156
25355	NC_009443	TTG	2	6	1233962	1233967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146321156
25356	NC_009443	TTA	2	6	1234001	1234006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146321156
25357	NC_009443	TTA	2	6	1234016	1234021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146321156
25358	NC_009443	TAA	2	6	1234116	1234121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146321156
25359	NC_009443	TTGC	2	8	1234133	1234140	0 %	50 %	25 %	25 %	146321156
25360	NC_009443	CT	3	6	1234157	1234162	0 %	50 %	0 %	50 %	146321156
25361	NC_009443	CAT	2	6	1234176	1234181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146321156
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25389	NC_009443	CTGA	2	8	1235091	1235098	25 %	25 %	25 %	25 %	146321156
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25445	NC_009443	AGTT	2	8	1237190	1237197	25 %	50 %	25 %	0 %	146321157
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25463	NC_009443	CTT	2	6	1237973	1237978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146321157
25464	NC_009443	GTTGA	2	10	1238029	1238038	20 %	40 %	40 %	0 %	146321158
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25467	NC_009443	TGCT	2	8	1238178	1238185	0 %	50 %	25 %	25 %	146321158
25468	NC_009443	CCA	2	6	1238192	1238197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146321158
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25471	NC_009443	TAA	2	6	1238836	1238841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25472	NC_009443	TAA	2	6	1238849	1238854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146321160
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25474	NC_009443	CCA	2	6	1238904	1238909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146321160
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25476	NC_009443	CCAA	2	8	1238979	1238986	50 %	0 %	0 %	50 %	146321160
25477	NC_009443	TTGC	2	8	1239001	1239008	0 %	50 %	25 %	25 %	146321160
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25480	NC_009443	T	6	6	1239080	1239085	0 %	100 %	0 %	0 %	146321160
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