MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis 05ZYH33 chromosome

Total Repeats: 42566

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
42501	NC_009442	TTTC	2	8	2093872	2093879	0 %	75 %	0 %	25 %	229577505
42502	NC_009442	ATTTT	2	10	2093899	2093908	20 %	80 %	0 %	0 %	229577505
42503	NC_009442	AAT	2	6	2093914	2093919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42504	NC_009442	GATT	2	8	2094018	2094025	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42505	NC_009442	AAGA	2	8	2094049	2094056	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42506	NC_009442	A	6	6	2094106	2094111	100 %	0 %	0 %	0 %	146319846
42507	NC_009442	T	6	6	2094145	2094150	0 %	100 %	0 %	0 %	146319846
42508	NC_009442	TTC	2	6	2094181	2094186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319846
42509	NC_009442	CAA	2	6	2094199	2094204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319846
42510	NC_009442	ATA	2	6	2094242	2094247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319846
42511	NC_009442	CCA	2	6	2094257	2094262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319846
42512	NC_009442	TGT	2	6	2094291	2094296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319846
42513	NC_009442	TTA	2	6	2094302	2094307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319846
42514	NC_009442	CAA	2	6	2094324	2094329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319846
42515	NC_009442	ATC	2	6	2094360	2094365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319846
42516	NC_009442	A	6	6	2094409	2094414	100 %	0 %	0 %	0 %	146319846
42517	NC_009442	TTA	2	6	2094452	2094457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319846
42518	NC_009442	A	6	6	2094497	2094502	100 %	0 %	0 %	0 %	146319846
42519	NC_009442	TTG	2	6	2094515	2094520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319846
42520	NC_009442	CAG	2	6	2094560	2094565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319846
42521	NC_009442	CTG	2	6	2094575	2094580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319846
42522	NC_009442	TAT	2	6	2094681	2094686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319846
42523	NC_009442	ACAA	2	8	2094729	2094736	75 %	0 %	0 %	25 %	146319846
42524	NC_009442	ATG	2	6	2094908	2094913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319846
42525	NC_009442	TAT	2	6	2094921	2094926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319846
42526	NC_009442	A	6	6	2094938	2094943	100 %	0 %	0 %	0 %	146319846
42527	NC_009442	GAC	2	6	2094990	2094995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319846
42528	NC_009442	GTA	2	6	2095054	2095059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319846
42529	NC_009442	TTA	2	6	2095115	2095120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319846
42530	NC_009442	CT	3	6	2095169	2095174	0 %	50 %	0 %	50 %	146319846
42531	NC_009442	TTA	2	6	2095209	2095214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319846
42532	NC_009442	AAT	2	6	2095219	2095224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319846
42533	NC_009442	AAAC	2	8	2095228	2095235	75 %	0 %	0 %	25 %	146319846
42534	NC_009442	AGA	2	6	2095263	2095268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319846
42535	NC_009442	AAT	2	6	2095277	2095282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319846
42536	NC_009442	T	8	8	2095318	2095325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42537	NC_009442	AT	3	6	2095338	2095343	50 %	50 %	0 %	0 %	146319847
42538	NC_009442	GAA	2	6	2095345	2095350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319847
42539	NC_009442	ATCC	2	8	2095375	2095382	25 %	25 %	0 %	50 %	146319847
42540	NC_009442	TGA	2	6	2095410	2095415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319847
42541	NC_009442	GCTC	2	8	2095431	2095438	0 %	25 %	25 %	50 %	146319847
42542	NC_009442	ATT	2	6	2095471	2095476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319847
42543	NC_009442	TCT	2	6	2095486	2095491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319847
42544	NC_009442	ATT	2	6	2095506	2095511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319847
42545	NC_009442	AAG	2	6	2095521	2095526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319847
42546	NC_009442	GACT	2	8	2095550	2095557	25 %	25 %	25 %	25 %	146319847
42547	NC_009442	CAG	2	6	2095565	2095570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319847
42548	NC_009442	ACTG	2	8	2095581	2095588	25 %	25 %	25 %	25 %	146319847
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42552	NC_009442	TAG	2	6	2095680	2095685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319847
42553	NC_009442	ATG	2	6	2095697	2095702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319847
42554	NC_009442	AT	3	6	2095734	2095739	50 %	50 %	0 %	0 %	146319847
42555	NC_009442	CTA	2	6	2095756	2095761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319847
42556	NC_009442	ATC	2	6	2095767	2095772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319847
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42565	NC_009442	ATTT	2	8	2096119	2096126	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42566	NC_009442	T	6	6	2096261	2096266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.