MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis 05ZYH33 chromosome

Total Repeats: 42566

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42119	NC_009442	ATT	2	6	2076172	2076177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319828
42120	NC_009442	A	6	6	2076183	2076188	100 %	0 %	0 %	0 %	146319828
42121	NC_009442	TCA	2	6	2076189	2076194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319828
42122	NC_009442	CTT	2	6	2076224	2076229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319828
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42128	NC_009442	A	6	6	2076411	2076416	100 %	0 %	0 %	0 %	146319829
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42134	NC_009442	TCA	2	6	2076825	2076830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319829
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42182	NC_009442	GTA	2	6	2078911	2078916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319832
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42186	NC_009442	CTT	2	6	2079049	2079054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319832
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42193	NC_009442	CT	4	8	2079348	2079355	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42194	NC_009442	TCA	2	6	2079361	2079366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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42197	NC_009442	CAA	2	6	2079631	2079636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319833
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42201	NC_009442	CCAA	2	8	2079835	2079842	50 %	0 %	0 %	50 %	146319833
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42204	NC_009442	GAT	2	6	2080113	2080118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319833
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42219	NC_009442	CAATC	2	10	2080799	2080808	40 %	20 %	0 %	40 %	146319834
42220	NC_009442	TA	3	6	2080847	2080852	50 %	50 %	0 %	0 %	146319834
42221	NC_009442	ATT	2	6	2080866	2080871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319834
42222	NC_009442	TGAA	2	8	2080896	2080903	50 %	25 %	25 %	0 %	146319834
42223	NC_009442	T	6	6	2080912	2080917	0 %	100 %	0 %	0 %	146319834
42224	NC_009442	TTC	3	9	2080929	2080937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319834
42225	NC_009442	AGT	2	6	2080963	2080968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319834
42226	NC_009442	A	6	6	2081042	2081047	100 %	0 %	0 %	0 %	146319834
42227	NC_009442	CTTT	2	8	2081080	2081087	0 %	75 %	0 %	25 %	146319834
42228	NC_009442	ATAA	2	8	2081101	2081108	75 %	25 %	0 %	0 %	146319834
42229	NC_009442	ACC	2	6	2081179	2081184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319834
42230	NC_009442	TGCCT	2	10	2081215	2081224	0 %	40 %	20 %	40 %	146319834
42231	NC_009442	T	6	6	2081237	2081242	0 %	100 %	0 %	0 %	146319834
42232	NC_009442	TGA	2	6	2081266	2081271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319834
42233	NC_009442	AT	3	6	2081363	2081368	50 %	50 %	0 %	0 %	146319834
42234	NC_009442	CTG	2	6	2081417	2081422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319834
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42236	NC_009442	A	6	6	2081483	2081488	100 %	0 %	0 %	0 %	146319834
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42356	NC_009442	TCT	2	6	2087449	2087454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319840
42357	NC_009442	ATT	2	6	2087467	2087472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319840
42358	NC_009442	AGA	2	6	2087484	2087489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319840
42359	NC_009442	TGA	2	6	2087579	2087584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319840
42360	NC_009442	TGA	2	6	2087637	2087642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319840
42361	NC_009442	GTT	2	6	2087656	2087661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319840
42362	NC_009442	ATG	2	6	2087720	2087725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319840
42363	NC_009442	TTCT	2	8	2087767	2087774	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42364	NC_009442	TCGCT	2	10	2087835	2087844	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
42365	NC_009442	ATT	2	6	2087858	2087863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42370	NC_009442	GAAG	2	8	2088124	2088131	50 %	0 %	50 %	0 %	146319841
42371	NC_009442	TGA	2	6	2088139	2088144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319841
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42403	NC_009442	CAA	2	6	2089661	2089666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319842
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42445	NC_009442	CAAA	2	8	2091581	2091588	75 %	0 %	0 %	25 %	146319843
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42450	NC_009442	A	8	8	2091798	2091805	100 %	0 %	0 %	0 %	146319843
42451	NC_009442	CAA	2	6	2091820	2091825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319843
42452	NC_009442	CTTTCT	2	12	2091855	2091866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319843
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42459	NC_009442	AAACT	2	10	2092191	2092200	60 %	20 %	0 %	20 %	146319843
42460	NC_009442	TCTA	2	8	2092227	2092234	25 %	50 %	0 %	25 %	146319843
42461	NC_009442	TAT	2	6	2092295	2092300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319843
42462	NC_009442	T	6	6	2092332	2092337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42463	NC_009442	A	6	6	2092343	2092348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42464	NC_009442	CAT	2	6	2092419	2092424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42465	NC_009442	GAA	2	6	2092463	2092468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42466	NC_009442	CCG	2	6	2092499	2092504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42467	NC_009442	TTTG	2	8	2092577	2092584	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42468	NC_009442	T	6	6	2092593	2092598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42469	NC_009442	T	6	6	2092601	2092606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42470	NC_009442	TAAAA	2	10	2092636	2092645	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42471	NC_009442	CTG	2	6	2092715	2092720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42472	NC_009442	ACCT	2	8	2092732	2092739	25 %	25 %	0 %	50 %	146319844
42473	NC_009442	T	6	6	2092750	2092755	0 %	100 %	0 %	0 %	146319844
42474	NC_009442	TAAT	2	8	2092770	2092777	50 %	50 %	0 %	0 %	146319844
42475	NC_009442	AT	3	6	2092776	2092781	50 %	50 %	0 %	0 %	146319844
42476	NC_009442	TTC	2	6	2092814	2092819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319844
42477	NC_009442	ATG	2	6	2092845	2092850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319844
42478	NC_009442	AGC	2	6	2092946	2092951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319844
42479	NC_009442	TCA	3	9	2092969	2092977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319844
42480	NC_009442	GA	3	6	2093079	2093084	50 %	0 %	50 %	0 %	146319844
42481	NC_009442	TAGT	2	8	2093089	2093096	25 %	50 %	25 %	0 %	146319844
42482	NC_009442	CAT	2	6	2093111	2093116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319844
42483	NC_009442	ACT	2	6	2093120	2093125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319844
42484	NC_009442	TGTT	2	8	2093144	2093151	0 %	75 %	25 %	0 %	146319844
42485	NC_009442	CTT	2	6	2093163	2093168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319844
42486	NC_009442	A	6	6	2093180	2093185	100 %	0 %	0 %	0 %	146319844
42487	NC_009442	A	6	6	2093198	2093203	100 %	0 %	0 %	0 %	146319844
42488	NC_009442	A	6	6	2093253	2093258	100 %	0 %	0 %	0 %	146319844
42489	NC_009442	ACC	2	6	2093303	2093308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319844
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42491	NC_009442	CTG	2	6	2093453	2093458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229577505
42492	NC_009442	TCA	2	6	2093536	2093541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229577505
42493	NC_009442	T	7	7	2093554	2093560	0 %	100 %	0 %	0 %	229577505
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42499	NC_009442	T	6	6	2093785	2093790	0 %	100 %	0 %	0 %	229577505
42500	NC_009442	CTT	2	6	2093857	2093862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229577505

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