MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis 05ZYH33 chromosome

Total Repeats: 42566

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41005	NC_009442	TGA	2	6	2018154	2018159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319767
41006	NC_009442	GGTC	2	8	2018181	2018188	0 %	25 %	50 %	25 %	146319767
41007	NC_009442	GTC	2	6	2018229	2018234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319767
41008	NC_009442	CGAC	2	8	2018330	2018337	25 %	0 %	25 %	50 %	146319767
41009	NC_009442	ATC	2	6	2018470	2018475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319767
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41011	NC_009442	GACA	2	8	2018601	2018608	50 %	0 %	25 %	25 %	146319767
41012	NC_009442	GCC	2	6	2018692	2018697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146319767
41013	NC_009442	GAC	2	6	2018740	2018745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319767
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41015	NC_009442	TTGA	2	8	2018905	2018912	25 %	50 %	25 %	0 %	146319767
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41017	NC_009442	GCC	2	6	2019019	2019024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146319767
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41024	NC_009442	T	6	6	2019409	2019414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41025	NC_009442	A	8	8	2019469	2019476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41026	NC_009442	TAT	2	6	2019481	2019486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41027	NC_009442	ATAA	2	8	2019493	2019500	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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41029	NC_009442	CACC	2	8	2019627	2019634	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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41034	NC_009442	T	7	7	2019821	2019827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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41053	NC_009442	CTCG	2	8	2020807	2020814	0 %	25 %	25 %	50 %	146319769
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41118	NC_009442	CACC	2	8	2025166	2025173	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
41119	NC_009442	TAAC	2	8	2025187	2025194	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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41240	NC_009442	AGA	2	6	2031809	2031814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319780
41241	NC_009442	CTT	2	6	2031822	2031827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319780
41242	NC_009442	CCA	2	6	2031876	2031881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319780
41243	NC_009442	CG	3	6	2031922	2031927	0 %	0 %	50 %	50 %	146319780
41244	NC_009442	CGA	2	6	2032058	2032063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319780
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41250	NC_009442	ATACGC	2	12	2032349	2032360	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	146319780
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41252	NC_009442	TGT	2	6	2032475	2032480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319780
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41258	NC_009442	T	7	7	2032716	2032722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41259	NC_009442	CAA	2	6	2032761	2032766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41260	NC_009442	AT	3	6	2032812	2032817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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41333	NC_009442	AT	3	6	2035983	2035988	50 %	50 %	0 %	0 %	146319786
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41340	NC_009442	TA	3	6	2036261	2036266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41341	NC_009442	AT	3	6	2036343	2036348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41342	NC_009442	A	7	7	2036351	2036357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41343	NC_009442	T	7	7	2036366	2036372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41344	NC_009442	A	7	7	2036379	2036385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41345	NC_009442	CA	3	6	2036478	2036483	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41346	NC_009442	GAA	2	6	2036504	2036509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41347	NC_009442	CTT	2	6	2036541	2036546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319787
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41475	NC_009442	TTCA	2	8	2043739	2043746	25 %	50 %	0 %	25 %	146319792
41476	NC_009442	AATT	2	8	2043749	2043756	50 %	50 %	0 %	0 %	146319792
41477	NC_009442	AAT	2	6	2043769	2043774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319792
41478	NC_009442	TTC	2	6	2043845	2043850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319792
41479	NC_009442	GAA	2	6	2043868	2043873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319792
41480	NC_009442	ATC	2	6	2043889	2043894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319792
41481	NC_009442	TCC	2	6	2043957	2043962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146319792
41482	NC_009442	AGA	2	6	2044020	2044025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319792
41483	NC_009442	T	8	8	2044133	2044140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41484	NC_009442	A	7	7	2044149	2044155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41485	NC_009442	GTT	2	6	2044312	2044317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319793
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41487	NC_009442	CAGT	2	8	2044541	2044548	25 %	25 %	25 %	25 %	146319793
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41490	NC_009442	TCT	2	6	2044629	2044634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319793
41491	NC_009442	TAA	2	6	2044653	2044658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41492	NC_009442	AAT	2	6	2044739	2044744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319794
41493	NC_009442	ATA	2	6	2044794	2044799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319794
41494	NC_009442	TGA	2	6	2044828	2044833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319794
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41498	NC_009442	GCCA	2	8	2045047	2045054	25 %	0 %	25 %	50 %	146319794
41499	NC_009442	CATAAT	2	12	2045075	2045086	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	146319794
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