MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis 05ZYH33 chromosome

Total Repeats: 42566

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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40002	NC_009442	TCA	2	6	1966018	1966023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319718
40003	NC_009442	TTCA	2	8	1966032	1966039	25 %	50 %	0 %	25 %	146319718
40004	NC_009442	TTA	2	6	1966096	1966101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319718
40005	NC_009442	GCTG	2	8	1966119	1966126	0 %	25 %	50 %	25 %	146319718
40006	NC_009442	ATA	2	6	1966152	1966157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319718
40007	NC_009442	CAT	2	6	1966238	1966243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319718
40008	NC_009442	TTC	2	6	1966326	1966331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319718
40009	NC_009442	TCTG	2	8	1966373	1966380	0 %	50 %	25 %	25 %	146319718
40010	NC_009442	TTG	2	6	1966407	1966412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319718
40011	NC_009442	AAC	2	6	1966426	1966431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319718
40012	NC_009442	CAC	2	6	1966632	1966637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319719
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40015	NC_009442	CTT	2	6	1966779	1966784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319719
40016	NC_009442	GTA	2	6	1966789	1966794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319719
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40019	NC_009442	TCG	2	6	1966901	1966906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319719
40020	NC_009442	TTC	2	6	1966960	1966965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319719
40021	NC_009442	GCT	2	6	1966979	1966984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319719
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40042	NC_009442	GTC	3	9	1968160	1968168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319719
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40050	NC_009442	T	6	6	1968610	1968615	0 %	100 %	0 %	0 %	146319719
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40063	NC_009442	AATA	2	8	1969233	1969240	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40064	NC_009442	CTT	2	6	1969248	1969253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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40088	NC_009442	TATT	2	8	1970322	1970329	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40089	NC_009442	TA	3	6	1970452	1970457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40090	NC_009442	A	6	6	1970480	1970485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40091	NC_009442	CAAT	2	8	1970503	1970510	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40092	NC_009442	GCTTA	2	10	1970589	1970598	20 %	40 %	20 %	20 %	146319721
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40107	NC_009442	GAC	2	6	1971250	1971255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319721
40108	NC_009442	CACCT	2	10	1971256	1971265	20 %	20 %	0 %	60 %	146319721
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40113	NC_009442	CTT	2	6	1971367	1971372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319722
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40474	NC_009442	AAC	2	6	1990250	1990255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319740
40475	NC_009442	ACC	2	6	1990265	1990270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319740
40476	NC_009442	TTC	2	6	1990296	1990301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319740
40477	NC_009442	GAT	2	6	1990355	1990360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319740
40478	NC_009442	GAG	2	6	1990420	1990425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146319740
40479	NC_009442	AGC	2	6	1990448	1990453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319740
40480	NC_009442	CAT	2	6	1990468	1990473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319740
40481	NC_009442	GTG	2	6	1990474	1990479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146319740
40482	NC_009442	CTTT	2	8	1990494	1990501	0 %	75 %	0 %	25 %	146319740
40483	NC_009442	ATC	2	6	1990541	1990546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319740
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40487	NC_009442	CATC	2	8	1990699	1990706	25 %	25 %	0 %	50 %	146319740
40488	NC_009442	TCT	2	6	1990753	1990758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319740
40489	NC_009442	TACA	2	8	1990850	1990857	50 %	25 %	0 %	25 %	146319740
40490	NC_009442	TCT	2	6	1990866	1990871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146319740
40491	NC_009442	CTG	2	6	1990873	1990878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319740
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40498	NC_009442	TA	3	6	1991094	1991099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40499	NC_009442	A	7	7	1991113	1991119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40500	NC_009442	T	6	6	1991144	1991149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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